Staphylococcus hominis: EGX58_01990
Help
Entry
EGX58_01990 CDS
T06045
Symbol
addB
Name
(GenBank) helicase-exonuclease AddAB subunit AddB
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
shom
Staphylococcus hominis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shom00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
shom03400
]
EGX58_01990 (addB)
Enzymes [BR:
shom01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
EGX58_01990 (addB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
shom03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
EGX58_01990 (addB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
UvrD_C
AAA_30
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYY65750
LinkDB
All DBs
Position
complement(373238..376726)
Genome browser
AA seq
1162 aa
AA seq
DB search
MELNTYLGRAGTGKSYHMIKNIKQQMKENPLGDPIILIAPTQSTFQLEQSFVNDRELNGS
LRTEVLHFERLSYRIFQELGGLTETRLTKAAIEMMIFNIVQQHKSEMKLYQSQADYYGFS
EKLSEQIQDFKKYSVTPHQLDLFLEDNELQTRTRHKLEDISLIYHYFEERLNGEFITAED
SLNYFIEIMHKSEWIKHADIYIDGFYNFSTLEYQIIKALVQNAKQVTILLTTNGNEDHFS
MFRKPSDVLIHLKEIANELHIPLNEHYFTTPYRFKNKDLLQLEQQFDALQVNPTQSHGYI
DLLESSNMREEVNEIARRIIKDTRDKHFRYQDIAILYRDETYAYLFESILPQYDIPYNID
TKKSMTHHPIMEMIRSLLEVIQSNMGLSPMMRLFKTNILSNQFKNSSYLIDLLENFVIER
GIYGKKWLDDKLFNIDNFTKMGRKAHQLTEEEKEAFEDVVRLKDDVVNKILRFEKAMLHS
KNVRDYATAFYETMEAFDLPKYLMAHRDELDLKGDHEKAEEIDQLWNGLIQILDDLVTVF
EEEEMSLNRFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKKHVYMVGMNDGVMP
QPLSSSSLITDEEKRLLEERGSVELSPTSDILQMDEAFVCYIAMTRACEQMTFSYSLMGM
QGDEKEKSPFLNQIQALFSNLDIKNIHYLHHAYPLTLMEHPHQTKIHLFEALKSWLEEEA
VADTWLDAYKVISENEELNDSINYLSTALTYDNETIQLTPQLSEALYGTSINASVSRFEG
YNDCPFQHYATYGLRLNERTKYQLESFDLGNIFHNALKYISDKVNGEFSQLDNQKIHALT
EEALQHVLPQVQFNLMDSNAYYRYVSKRIGVIVESTLKALRYQNENTKFRPKRFETAFRK
KPRTEEELIAHPLMTTQGIPIHIRGQIDRIDAYTKNNTSFVNIIDYKSSNHSANLNLKKV
YYGKQMQMMTYMDIVLQNSERLGLSSEVKPGGLLYFHIHDERLKFEKWGDLTEEALNKEN
INQAILKEYKLKGLINSDAEVIDAMDIRLNEISKSDIVPVTLKKDGGISARGSQVADETT
IHKFIQHNKNNFIETASNIMDGHTEVAPLKFEDKLPCEFCSFQSVCHVDSLIDSKHYRHV
DESINPIQAIQEVELESGEDNE
NT seq
3489 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaattaaatacatatcttggaagagctggtaccggtaaatcgtatcatatgattaaa
aatattaaacaacaaatgaaagaaaatcctcttggagatcctatcattttaattgcacct
acccaaagtacgtttcaattggagcaatctttcgtaaatgatcgagagttaaatgggagt
ttaagaacggaagttttacattttgagcgtttgagctatagaatctttcaagaactcgga
ggattaactgaaacacgtttaactaaagcagctattgaaatgatgatattcaatatcgtt
caacaacacaaatcagaaatgaaattatatcaatctcaagcagattattatggttttagt
gaaaaattaagtgaacaaatccaagattttaagaaatattctgtaacacctcatcaactt
gatttatttttagaagataatgaattacaaacaagaacccgacataaactagaagatatt
tcgcttatttatcattattttgaagaacgattaaatggagaatttattaccgctgaagac
agtcttaattattttattgaaataatgcacaaatctgagtggattaagcatgctgatatt
tatatagatggattttataacttttcaacgcttgaatatcaaattattaaagcattagta
caaaatgctaaacaagttactatattattaactacaaatggtaatgaagatcactttagt
atgtttagaaaaccttctgacgtacttattcacttaaaagaaattgcaaatgaattacat
atacctttaaatgaacattattttacaacaccatatcgtttcaaaaataaggatttatta
caattagaacaacaatttgacgcacttcaagttaatccaactcaatcccatggttatatt
gatttacttgagtcatcgaatatgagagaagaagttaatgaaatagcacgacgtattatt
aaagatacacgtgataaacactttagatatcaagatattgcaattttatatagagatgaa
acatatgcctatctatttgaatctattttgccacaatatgatattccttataatattgat
actaaaaaatcgatgacacatcatcctataatggaaatgatacgttctttattagaagtt
atccaaagtaatatgggacttagtccaatgatgagactatttaaaaccaatattttatct
aatcaatttaaaaatagtagttacttaattgatctattagaaaactttgtcattgaacga
ggtatttacggtaaaaaatggttagatgataaattgtttaatatcgataattttacaaaa
atgggacgtaaagcgcatcaattaactgaagaagaaaaagaagcatttgaagacgtcgta
cgcttaaaggatgatgttgtaaataaaatacttcgttttgagaaagccatgcttcactct
aaaaatgttagagattatgcaactgcattttatgaaacaatggaagcttttgatttgcct
aaatatttaatggcccaccgtgatgaactagacttaaaaggagaccatgagaaagcagaa
gaaattgaccaattatggaatggattaatacaaatattagatgatttagtcacagtattt
gaagaagaagaaatgagtttaaatcgattcttagaagtatttgacattggacttgagcaa
cttgaatttgtaatgattcctcaaacattggatcaagttagcatagggactatggattta
gcaaaagttgataataaaaaacatgtttatatggttgggatgaatgatggagtgatgcca
cagcccttgtcatcttcaagcttaatcactgatgaagaaaaacgtttgttagaggaacgg
ggaagtgttgaattaagtccaacctctgatatcttacaaatggatgaagcatttgtatgc
tacattgctatgacacgtgcatgtgaacaaatgactttttcatatagtcttatggggatg
caaggagatgaaaaagagaaaagtccatttttaaatcagattcaagcactgttcagtaat
ttggatatcaaaaatattcattatcttcatcatgcttatcctcttacattaatggaacat
ccacatcaaactaaaattcatttatttgaagcattgaaatcgtggttggaagaagaagcg
gtagcagatacgtggcttgatgcttataaagttataagtgaaaatgaagaattaaatgac
agtataaactatttatcaacagctttaacatatgataatgaaaccattcaactcacacca
caattgtcagaagcattatatggaacgtctattaatgctagtgtttcacgatttgaaggt
tataatgattgcccattccaacattatgctacttacggccttcgtctaaatgaacgtacc
aaatatcaacttgaaagttttgatttaggtaatatttttcataatgctttaaaatatatt
tcggataaagtaaatggagaatttagtcaattggataatcagaaaatccatgcacttact
gaagaagctctacaacatgtcttaccacaagtgcaatttaatttaatggattccaatgca
tattatcgttatgtatctaaacgtataggtgtcattgttgaaagtacgttaaaggcactt
cgttatcaaaatgagaatacaaaatttagaccaaaacgttttgaaactgcttttagaaag
aaaccaagaacggaagaagagttgattgcacatcccttaatgacgacacaagggataccg
attcatattcgtggacaaattgatcgtatcgatgcttatacaaaaaataatacaagtttt
gtaaatattatagattataaatcatctaatcatagcgccaatttaaatttgaaaaaagtt
tattatggtaaacagatgcaaatgatgacgtatatggatatcgtattacaaaattcagag
cggcttggtttaagttcagaggttaaaccaggtggattgttatatttccacattcatgat
gaacgtttgaaatttgaaaaatggggcgatttaactgaagaggcattgaataaggaaaat
attaatcaagctattctaaaagaatataaattaaaaggattaatcaatagtgatgctgaa
gttatagatgctatggatataagacttaacgagatatctaaatcagatattgtacccgtg
acattaaaaaaagatggaggtattagtgcacggggaagccaagttgctgatgaaacaacg
attcataaatttattcaacacaataaaaataattttattgagactgcttcaaatattatg
gatggtcacacagaagtagctccacttaaatttgaagacaaattaccatgtgaattttgt
agtttccagtcagtatgtcacgtagatagtcttattgatagtaaacattatcgccatgta
gatgaatcgattaatccaattcaagcaattcaagaggtcgaattagaaagcggtgaggac
aatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system