Shewanella putrefaciens 200: Sput200_1066
Help
Entry
Sput200_1066 CDS
T02015
Name
(GenBank) type IV pili-associated adhesin, PilY
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
shp
Shewanella putrefaciens 200
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shp00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
shp02044
]
Sput200_1066
02035 Bacterial motility proteins [BR:
shp02035
]
Sput200_1066
Secretion system [BR:
shp02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
Sput200_1066
Bacterial motility proteins [BR:
shp02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
Sput200_1066
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
Death_Lrrd1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV53539
UniProt:
E6XN18
LinkDB
All DBs
Position
1187955..1191452
Genome browser
AA seq
1165 aa
AA seq
DB search
MLNKCLIGLLTALIIMLDAVYADDTELYLIDSTVRSGKRPQVLFIFDNSGSMSTIEENAV
TSYCSEAGKAAGTCSYPTGFDNFLSGYSGYINNKGTYWNAGGIDNTNNMPTPDKPNDGRR
FYLDNNNCNTAAKALVDKGRYTGYLREFSSNRNTWNNLADNNGFNQNDIVDCYEDILNGD
PVNPGKLKGVAFKNGYPINNKSMYTTGSGEADRLSSLSNTQFGSGQPVTLYSAHYLVWHK
WATTTEEGKSSGGVGTRLDVAKSALISALESLAIPIDAGLAIFNLNYPNEGDADGGRIVY
DLTEMNSINKVNLTSLIKNMPAKTNTPLCETLYEAYQYFSGGQVTFGNKDKNGTGNNKID
GYTPNNPPSILTSGSYTTPFKKCPDTAYIIYITDGAPTLDKSADTLINGLVANAKNQAAN
YAAFSFTNAGNKTETSYMPALAAYMYNNDIVIGNKDSLGIDNKQNIRVFTIGFSDGADEA
AALLEETAFRGGNPRGSNNISKGYYVAKNGLDLVSALEDALKSILTIDSSFTSPSIASNN
FDKTQTYNSAYYAMFLPGNGPRWSGNLKKLKVNAAGEIVGPGGNNKAIDSNGNIANDVCT
YWNTCSESNDGNKVLFGGVLPSLRAKLKNRTIYTNNGSSLINFSSSSFISGHSQADFDWL
YGVDVDDENNNNNTSDAREDVMGDPLHSKPLAINYGSTTNLDVRILVGTNQGLVHMFKDS
DTGNNDYSVGSVEESWAFIPNELWGNIPLLRQNPATGVHSIYGMDLSPVAYTESDATGKL
TKAWVYLGMRSGGASYYALDITAVDAPTFKWMINSDSTSFEDLGQTWSEPVVTYIPGVKD
PILIFGGGMASSDGSGAAVYIVNADTGAFITKFTADDMGSVVTKVAVLDSDNDGATDRIY
ASDITGNVWRIDLASTTQSEWTIFKFASIAGESPNNRMFFAEPVVAQTQFNNVHSESGVL
SYQKIPYDAVTIGTGNRNHPLDMTTNDMFYVFQDRNVVTQIFEEKPSVLTINDLYDVSSS
SPVSESDNVAFGKTRGWYYDFTANGEKSLSASLIFDGKVYFTSFVPPTNQAVDLDAGVCG
FSGQGRLYVFDLHKGTRTYNQVYYEVGERVPDTPQIVIPKPEDGEEVKAYIIGVGKGECE
NGECKGTIELGSGLGANKIYYHINE
NT seq
3498 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaataagtgcttaataggtcttttgactgcattaattattatgttagatgcagta
tatgccgatgatactgaactatatcttattgattctacagtccgttcaggtaagcgacca
caagtgttatttattttcgataactctggcagcatgtcgacaattgaagagaatgccgtg
acgtcttactgttctgaagcaggtaaagctgcggggacttgtagttatcctactggattt
gataatttcctctcgggttattctggttatatcaataataaagggacctattggaatgcg
ggtggtatagataatactaataatatgccaacaccggataagcctaatgatggtcgacgc
ttctatttagataataataactgtaatacagcagcaaaagcattagtggataaaggacgt
tatacaggttatttacgagagtttagcagcaaccgaaatacttggaataatctagcggat
aataatggatttaatcagaatgatatagtggattgttatgaagatattcttaatggagat
cctgttaatccaggtaaactaaaaggtgtagcttttaaaaatggatatccaataaataat
aaatcaatgtataccacagggagtggtgaagcagatcgtttgtcgagtttgagtaatact
caatttggttctggtcagcctgttaccttatatagtgcacattatcttgtttggcataaa
tgggcgacgacaacagaagaaggtaaaagtagtggtggtgtcggtactcggcttgatgtt
gccaaaagtgcgttgatttctgcactagaatcgctagcaattcctattgatgctggactt
gcaatttttaatttaaattaccctaatgagggtgatgctgacggtggtcgaatcgtttat
gatctaactgagatgaacagcattaataaagtgaatctgacttcacttattaaaaatatg
ccagcaaaaactaatacaccactttgcgaaacactttatgaagcatatcagtattttagt
ggtgggcaagtgacttttggcaataaagataaaaatggcacagggaataataaaattgat
ggatatactccaaataatcctccaagtatattaacctctgggagttatacgacgccattt
aaaaaatgtcccgataccgcttatattatctatattaccgatggcgcgccaacattagat
aaatcggcagatacgcttattaatggtttagttgcaaacgccaaaaaccaagctgctaac
tatgctgcattctcgtttactaatgctggaaataagacagaaacaagctacatgcctgca
ctcgctgcttatatgtataacaatgatattgttattggaaataaagactctttaggtatt
gataataaacaaaatatacgggtgtttactatcggtttttctgatggtgcagatgaggcc
gcagctctgttagaagagactgcttttaggggagggaatcctcgtggaagtaataatatc
tctaagggatattatgtcgctaaaaatgggctcgatttagtttcagcgttagaagatgct
ttgaaatcaattttgacaatagattcatcttttacctcgccaagtattgcgagtaataac
tttgataagactcaaacctataattcagcatattatgcaatgtttttacccggcaatgga
cctcgatggagtggtaatcttaaaaaactaaaagtcaatgcggcaggcgaaattgtaggc
cctggtggaaataataaagcaattgattcaaatggtaatattgcaaatgatgtttgcaca
tattggaatacttgctccgaatcaaatgatggtaataaagttctttttggaggagtctta
ccttcgttgagagctaagcttaaaaatcgaactatttataccaataatggttcaagtttg
attaatttttccagttcttcttttatctcagggcattctcaggcggattttgattggtta
tatggtgtggatgttgatgatgaaaataacaacaacaatacatcagacgctagagaagac
gttatgggcgatccacttcactctaaacccttagctatcaattatggtagtacaacaaat
ttggatgtacggattcttgtgggcactaaccaagggttagtgcatatgtttaaggattca
gatacaggtaataatgattatagtgtgggttctgttgaggagtcatgggcatttattcct
aatgaactttggggcaatattccgctattaaggcaaaatccagcgaccggggtgcattca
atatatggtatggatctatcacctgtggcatacactgaaagcgatgcaacaggtaagctc
actaaggcttgggtgtatttaggtatgcgaagtggcggtgcatcctactacgctttagat
attacagccgttgatgccccaacatttaaatggatgattaactcggatagcacttccttt
gaggatctaggccaaacatggtctgaacctgtagtgacttacattcccggagtcaaggac
cctatattgatattcggtgggggaatggcatcatctgatggttctggtgctgcagtttat
attgttaatgcggatactggtgcatttatcactaaatttactgctgacgatatggggagt
gttgttaccaaagtggcagtgctagacagtgacaacgatggtgcaacggatcgtatatat
gccagtgatattacgggtaatgtatggcgtattgatttggctagcacgactcaaagtgaa
tggactatttttaaatttgcttccattgcgggtgagtcccctaacaatcgaatgttcttt
gctgagcctgtcgtcgcacaaactcaatttaataatgttcattcagagagtggtgtctta
agttatcaaaaaataccttatgatgcggtcactataggaacaggaaaccgcaaccatcct
ttagatatgacgacaaacgatatgttttatgtctttcaagatagaaatgttgtcacgcaa
atttttgaagaaaaaccttcagtactaaccattaacgatctttacgacgttagcagtagt
tccccagttagtgagtcagataatgttgcttttggtaaaacgaggggctggtattacgat
tttactgccaacggagaaaaaagcttatctgcttcacttatttttgatggcaaagtttat
tttacatcctttgtgccccccacaaatcaagcggtagatttagatgccggcgtttgtggt
ttttctggtcaagggcgattatatgtatttgatttacataagggcactcgtacctataat
caggtttattatgaggttggtgagcgggtacctgatacacctcaaatcgtcattccaaaa
cctgaggacggtgaggaggttaaagcatatatcatcggtgttggtaaaggtgagtgtgaa
aatggtgaatgtaaaggtacgattgagttaggtagcggcttgggtgctaataaaatttac
taccatattaatgagtga
DBGET
integrated database retrieval system