Shewanella putrefaciens 200: Sput200_3604
Help
Entry
Sput200_3604 CDS
T02015
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
shp
Shewanella putrefaciens 200
Pathway
shp02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shp00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
Sput200_3604
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_5
Cadherin_4
HemolysinCabind
Big_11
CshA_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADV55984
UniProt:
E6XQR8
LinkDB
All DBs
Position
4092086..4098124
Genome browser
AA seq
2012 aa
AA seq
DB search
MGSVITSKKGLLKLVKGQINIEVDGTNQPAKDGEQLPKGAVLHIGENATYEITFDDGTKL
SNEDVPNTATATPPSTASEATLDEIQALQDLIASGEDPTQSLPETAAGNTPGSDGNSGYV
TLARSGSETLASSGYSTTGQAPTTIAPNELSQTIATDSPSILANDTNTIDEDTIATGNVL
DNDSDADSELTVASFEVEGTSYAAGTEVTLESGVLIINADGSYTFTPSENWNGQVPVITY
TTNTGASATLTLNVTPVNDPSVATGDTQGSGAEDAGVISGTLSATDVDGLTNGNVFSITG
AAANGTASIDPVTGAWSYTPVADWNGTDSFTVTITDDDGNTTTQVINVTVTPVADIVADT
MTTNEDTAVTLNLLANDSFENADAAVTAVTNGANGTVIINADGTVTYTPNANFHGSDSFT
YTVTSGGVTETTTVNVTVGQVDDPTTITGDTQGSGAEDAGVISGTLSATDVDGLTNGNVF
SITGAAANGTASIDPVTGAWSYTPVADWNGTDSFTVTITDDDGNTTTQVINVTVTPVADI
VADTMTTNEDTAVTLNLLANDSFENADAAVTAVTNGANGTVIINADGTVTYTPNANFHGS
DSFTYTVTSGGVTETTTVNVTVLDITPPPAPTVWIVDDGVPGDGLLTQSEINSNGVGIQL
QVTVSHAELLIGGVVTINVNNGGDLSTYTLKLIDGALLFSDNTSATGFSYNNGVISWTED
VPVAGQNITVTATQTDSTGNTSTQAYDTAEIYQPNNQQITVNESDLRDNIPNVVASNISF
TAGNQALTQFRFNESAINAATNLAAGVSIVWAIAANGALIGSIDGVDVIKLTLTGGVIAA
GTTANITVNVELLDNIKHMNALDGTNLNSLIDGIVIEAIGADGSVLTGNLSIVINDDLIS
IDPVSGSGVNSSSAANIIGALNILGADGNDHDLNDDYSISLTANITGWNGTTTTFANSGI
TSEGLTIFYYVDPAHPNVLIAYTDTNATPSAYTGAANQALIFTLTTDPHSDQYTFDINQS
IDQLSTIQIAGLVGGQGGIGNAVYVTTNNSPAGYGIYNDITKIPAGEDIAFTLTARAENG
SVGRVNGTNNGFGVDNPHVSGKEILIIDYLEDAATASFNFTGATSIYFKAYDEQGNLIGE
GNITSGQVIQNLGSIAYVELSALAGTSFQFTGTTAQTIVSSTQNVDLHFDVTVTDSDGDT
NTGGFNIHLEAPNTTPIAPVALTTNAIASLNEADLQAGAPDMSVQTLSFKSGSNSIGSFQ
FGDFSNISVTGINAHIHWAVNTAGQLIGTVFGREALRLTLDWDRINAGEQGDVTVTAELL
TNLPHSVNVDSLTINGIKVVAIDGAGNTAQSTVTVTVADDVDIAKNDTAQLDVVVDSFKF
SGVVANWQSTIGGTNITKYDGPDNDTGLDQIRWGDPSSWYGNQSGYGFMDNDAGLNGALS
LNQDIVLGTFTHYNYSITSGTSITAATMKVTFNVTDAYGVTTPVTLTLNFSHNETPNTND
PIASRDIVTVGQTSVTFNYEGQIYTMQVIGFKDNNGNVVTSIYTNEDAATSYELVVRMVA
GNGYSLPNTEGNVLTNDVVGADGPLTIIGVAKGDFTNTGGVSGQVGSTITGLYGTLILNA
DGTYKYQLTANASQLPTTGAIETFTYTIRDSDGDVSSATLKINVNPVNSDGINIADANLI
TTQGSSLNDTMVVVNGENANNPNQKILNVSFGGGQSGIITNSNGKEVVASGANNKSYSTT
DAQFVNGGDGNDHIETGKGNDVIYAGRTGSTGYGSDDALELSVNTLLNHHIMTGELTGAN
RMVDSNGLLLANDVASHKADIVNGGSGDDRIYGQSGSDILYGHTGNDYIDGGSHNDALRG
GEGNDTLIGGLGDDVLRGDSGADTFVWRYAEFGTDHIMDFKVTEDKLDLSDLLQGESANN
LDSYLNFSLDSTGSTVIDIDANLDGVYEQHIILDGVNLFTTYGATNDAGVINGLLGTNGN
GPLIIDTQPITPETPQGVTPLNDPHNNGTMIP
NT seq
6039 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggatcggtcattacatcaaaaaaaggtttgctaaagttagttaaagggcaaatcaat
atcgaagttgatggtacaaatcaacccgctaaggatggcgagcaactcccgaaaggtgca
gtcctccatattggcgaaaatgcaacatatgaaatcaccttcgatgatggcactaaatta
tcgaacgaagacgtaccgaataccgctacagcgacaccgccaagtaccgccagtgaagcg
acgctagatgaaatccaagcactacaagatctcatcgcttctggagaagatccaactcaa
agcctgccagaaaccgcagcaggtaatacccctggtagtgatggtaactcaggttatgta
acattagcccgtagcggcagtgaaacccttgcgtcctcaggctactcaacaacaggtcaa
gcgccaacaaccattgcacccaatgagttaagccaaaccattgccactgactcgccatcc
atactcgcgaatgacactaatactattgatgaagatacaattgccacaggcaatgtactc
gacaatgacagcgatgcagattctgaattaacggtagccagctttgaggttgaaggcaca
agttatgccgcaggaactgaagtgactcttgaaagcggtgtattaattatcaacgctgat
ggctcttatacttttacacccagtgaaaactggaatggccaagttccagttattacctac
accaccaatacaggcgcaagtgcaacactgactctaaatgtcactccagtcaacgacccg
agtgttgccacaggcgacacccaaggcagtggcgctgaggacgctggcgtgatcagtggc
accctcagtgccaccgatgttgacggcctcaccaatggcaatgtctttagcatcacaggc
gctgccgccaacggcaccgccagcatcgaccctgtcaccggcgcgtggagctacacccct
gtggcggactggaatggcaccgacagctttaccgtgaccatcaccgatgatgacggcaac
accaccacccaggtcatcaatgtgaccgtgactccggttgccgatatcgtcgctgacacc
atgaccaccaacgaagataccgcggtcacgctgaacctgctggccaatgacagctttgaa
aatgccgacgccgccgtgactgcagtgaccaatggcgccaacggcaccgtgatcatcaat
gccgacggcacggtcacttacacgcctaatgcaaacttccatggcagtgacagctttacc
tacaccgtcacctctggcggcgtcaccgaaacgacgacggtcaatgtgacggtaggtcaa
gtcgatgaccccaccaccatcacaggcgacacccaaggcagtggcgctgaggacgctggc
gtgatcagtggcaccctcagtgccaccgatgttgacggcctcaccaatggcaatgtcttt
agcatcacaggcgctgccgccaacggcaccgccagcatcgaccctgtcaccggcgcgtgg
agctacacccctgtggcggactggaatggcaccgacagctttaccgtgaccatcaccgat
gatgacggcaacaccaccacccaggtcatcaatgtgaccgtgactccggttgccgatatc
gtcgctgacaccatgaccaccaacgaagataccgcggtcacgctgaacctgctggccaat
gacagctttgaaaatgccgacgccgcggtgactgcagtgaccaatggcgccaacggcacc
gtgatcatcaatgccgacggcacggtcacttacacgcctaatgcaaacttccatggcagt
gacagctttacctacaccgtcacctctggcggcgtcaccgaaacgacgacggtcaatgtg
acggttttggatattacccccccaccagcgccaaccgtctggatcgtggatgatggtgta
ccgggagatggtctgctcacccaaagtgaaatcaacagtaacggtgtaggcattcagctt
caggttacagtgagccatgcggaacttttaatcggaggtgtagtcactattaacgtcaat
aacggcggagatttaagcacctatacacttaagctcatcgatggtgcattactctttagt
gataacacatcagcaacaggtttcagctataacaatggtgtaatcagttggacagaagac
gtacctgtggcagggcaaaacattaccgttacagcaactcaaactgactcaactggtaat
acatcaacacaagcatatgatacagcagagatttaccaacctaacaatcagcagataacg
gttaatgaaagtgacctgcgtgacaatattcctaatgttgttgcaagtaatattagcttt
accgcaggtaaccaagcactgacgcaattccgctttaatgagtcagccattaatgctgcg
acaaatctcgcagcaggagtgagcatcgtttgggcgatagccgcaaatggagcactaata
ggttccattgatggggttgatgtcatcaagctcactttaacaggtggagtgattgccgca
ggtacaactgcgaatattactgtgaatgttgaattgcttgataatatcaaacatatgaat
gctctagatggcacaaatctaaattcactgatcgatggcattgtcattgaagctattggc
gccgatggtagcgttttgaccggtaatttaagcatcgtcattaatgatgatctgatctct
atcgatcctgtcagtggctctggcgtaaatagctctagcgctgccaatatcataggtgct
cttaatattttaggagccgatggtaatgatcatgatcttaatgatgattacagcataagt
ctgacagcgaatatcacagggtggaatggaacaaccactacgtttgctaactcaggtata
acctcggaagggctaaccatattttactacgtagaccctgctcatcccaatgtgcttatt
gcatatacggataccaatgctaccccctcagcctatactggcgcggcgaaccaagcatta
atcttcacgttgacaaccgatccgcatagcgaccaatacactttcgatatcaatcaaagc
attgatcaactttcaactatccaaattgcaggtttagttggaggccaaggcggcattggt
aacgcggtatatgttacaactaataattccccagcgggttatggtatctacaatgatata
actaaaattcctgctggtgaggatattgctttcacattaaccgcacgcgctgaaaatggc
agtgtaggccgcgtcaatggtaccaacaacggcttcggagtggacaacccacatgttagt
ggtaaagaaattctcatcattgattatttagaagatgcagcaacagcaagctttaacttt
actggcgcgacgtccatctattttaaagcctatgatgagcaaggtaatttaatcggtgaa
ggaaatataacaagtggtcaagttattcaaaatttaggttctatagcctatgttgaatta
tccgccttagcaggtaccagtttccaatttactggcactacggcacaaaccattgtgagc
tccactcaaaatgtcgacttacattttgatgtaacggttaccgatagtgatggtgatacg
aatacaggcggatttaacatccatcttgaggcaccaaatacaacgccaatagcacctgtt
gcgctcactactaacgccattgcaagccttaatgaagcagacttgcaggctggcgctccc
gatatgagtgtacaaacacttagctttaaatctggtagtaactcgattggtagcttccaa
tttggtgattttagtaatatttccgtcacaggtattaatgcgcacattcattgggccgtt
aatactgcgggccaattaataggtaccgtgtttggccgtgaagctcttcgcttaacctta
gactgggatcgaattaatgcgggagaacaaggtgatgtgacagttactgccgaattactg
actaatttaccccatagcgttaatgtggatagccttacgataaatggcattaaagtcgtg
gctattgatggtgctggtaatacagcccagtcaactgtcacggttactgttgccgatgat
gttgatatcgctaaaaatgatacagcgcaactcgatgttgttgtcgactcatttaagttt
tctggagtagttgctaattggcaaagtactattggtggtacaaatatcactaaatatgat
ggtccagataacgatacaggtttagatcaaattcgttggggagatccatctagttggtat
ggaaaccaatcaggttatggttttatggacaacgatgcaggacttaatggagcattgtca
cttaaccaagatatcgttttgggtacatttacccactacaattattcaattacgtcaggt
acatctattactgccgccacaatgaaagtgacctttaacgtcacagatgcatatggagta
accacacctgtaacgttaactctcaactttagccataacgaaacacctaatacaaacgac
ccaatagcttctcgcgacattgtcaccgtaggccaaaccagtgtcaccttcaactatgaa
ggccaaatttacacaatgcaagtgattggttttaaagataataatggtaatgttgtcaca
tctatctacactaatgaggatgctgcgaccagttatgaactagtagttcgtatggttgct
ggtaatggatattccttaccaaacactgaaggcaatgtgttgacaaatgatgtcgttgga
gctgatggtccattgaccattattggggtagctaagggcgattttaccaataccggcggt
gtatctgggcaagtagggtcaaccataactggcctatatggcactctgatactaaacgcc
gatggaacctataaataccaacttacagcaaatgcaagccaattgcctacaaccggagca
atagaaacctttacttataccatccgtgatagtgatggcgatgtatccagtgcaaccttg
aaaatcaacgttaatcccgtcaatagcgatggtattaatattgcggacgccaaccttatt
accactcaaggttctagcctgaatgacactatggtcgtggttaatggtgaaaatgctaat
aacccaaatcaaaaaatattgaacgtcagttttggtggcggccaaagcggtatcatcaca
aacagtaacggaaaagaggttgttgcttcaggagctaacaataagagctatagcactacg
gatgctcaattcgttaatggcggcgatggtaatgatcatattgaaacaggcaaaggcaac
gatgttatctatgcgggtagaacaggctcgactggatatggttccgatgatgcacttgag
ctatcagtcaatacgctcctaaatcaccatattatgacgggtgaattaactggcgctaac
agaatggttgatagtaacggcctattattggctaatgatgtcgcttcgcataaagcggat
attgtaaatggtggcagcggtgatgaccgaatttatggtcaatctggctctgacattctc
tatggtcatacaggtaatgattatattgatggtggtagccacaacgatgcactccgtggt
ggagagggcaacgatactctcatcggtggccttggtgatgatgtccttcgtggtgatagc
ggcgctgataccttcgtctggcgatatgcggagtttggcactgaccacattatggacttt
aaagtcacagaagataagttagacctgagtgacttactccaaggcgaatcggcaaataat
ttggacagttacttaaactttagcttagacagcactggctctaccgtcatcgatattgat
gccaatcttgatggtgtatatgaacagcacatcattcttgatggcgtgaatttattcacc
acttatggcgcaacaaatgatgccggagtgattaatggtctactgggtaccaatggtaat
ggtccattaattatcgatactcagcctatcactccagagacaccacagggagtaacacca
cttaatgatcctcataacaatggcactatgatcccttaa
DBGET
integrated database retrieval system
