Staphylococcus hsinchuensis: QQM35_01925
Help
Entry
QQM35_01925 CDS
T10123
Name
(GenBank) AraC family transcriptional regulator
Organism
shsi Staphylococcus hsinchuensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_18
HTH_AraC
HTH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XAF70900
LinkDB
All DBs
Position
359848..361956
Genome browser
AA seq
702 aa
AA seq
DB search
MINTTTLTLRNNYTSLLTRNINKIIILIPLGKPCNINLNGKSLTISEGLIINNTDLYQYE
KVEQLIELAIPLQLLCEKASNLNYIYYDFKQIVNFTSFKRLITHDLFEAYCHNKNIHAYI
KEVIQYLLDYAKVQLNNTYLPAYYTKHPLLRKIVDYINSHIDTALTTKDLADAFYISQSY
ISILFSKHMSINYKSYINSLRISLSIYDLINNQYSISNIAVKYNFNNVAIFTKHFKFYLK
IPPKEYKYQYRATSDTYNYKLKVLDKELVVFLKSYNQTQALTKPNDDVLKIDLTKLKPNI
HINGHYVIIHLNSLYDLLVVADQQLENRILQHFSNINFLIKNTNVEHFNVLDSQKLFNAI
VTLIQKQYHLTFNIHSLDSFQLFEHKILKLIKAHDKEQSLIRQLCLLFEPSQLITTENYN
LIHSVLQPYQGLKTALVIDHFIEKRQNLTDIISHIHSIQVDYYYINMDLIQLSTYISLKS
KHNNHHAFEIKQQLKHLIELCGRTMTQKLVFNNITHPALIKYFKHTICASHIYFTQFLID
FDYPIAGLGYPLYSIDENQLMVIDHNQSLMPMVHVYNMLQPFMNQNVTLINNGIIFQQDK
RFHILLYHHRATETQSNHLKIEIAHHINRDFPIFSRLLNNQHGNIKCLISSSLYRTSINT
TMLNHINHSNYPFATYNKHNHHKAINLSLDDASIHYLMINYE
NT seq
2109 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgattaatacgactacactaactttaagaaacaactatacatccttattaacgcgaaat
attaataaaatcatcatactcattcctttaggtaagccatgtaatataaatttaaacggc
aagtcgctaactatttctgaaggtttaattataaacaatacagatctctatcaatacgaa
aaggtagaacagctcattgaacttgctatcccgttacagttgttgtgtgaaaaagcatca
aacttaaattatatatactacgactttaaacaaatcgtaaacttcacatcatttaaacgc
cttatcactcatgatttatttgaagcttattgtcacaataagaatatacatgcctatatc
aaagaagttattcaatatttactcgactatgctaaggtacaattaaacaatacatattta
cctgcttactatactaaacatccattactacgcaagattgtcgattatattaatagtcat
attgatacagcactgactactaaagatttagctgatgctttttatatatcacagtcgtac
atttctatactattttctaaacatatgtctatcaattataaatcgtatatcaattcatta
agaatttctttatctatttatgatttaattaacaatcaatatagtattagtaatattgca
gtcaaatataatttcaacaacgtggctatatttacgaaacattttaaattttatttaaaa
atacctcctaaagaatataaatatcaatatagagcgactagcgacacatataattacaaa
ttaaaagttttagataaagaattagtagtatttttaaaaagttataatcaaacacaagcc
cttacgaaaccgaatgatgatgtactcaaaattgatttaactaaacttaaacctaacatc
catatcaatgggcattatgtcattatccacctgaatagcctttatgatttacttgtcgtg
gctgaccaacaactagagaatcgtattttacaacatttctcaaatatcaattttctaatt
aagaatacaaatgtagagcattttaatgttctagatagtcagaaacttttcaatgctatc
gttacgttgattcaaaagcaatatcatttaacttttaacattcattctctcgatagcttt
cagttattcgagcataaaattttgaaattgattaaagcacatgacaaagaacaatcactt
atccgacaactttgtttgttattcgaaccatcccaattgattacgacagaaaattataat
ttaattcattcggttctccagccgtatcaagggttgaaaacggcactcgttattgatcat
tttattgaaaaacgacaaaacttaactgatatcatttcacacattcattcgatacaagtc
gattattactacatcaatatggaccttattcagttatcgacatatatcagtttgaagtca
aagcataacaaccatcatgcatttgaaatcaaacaacaacttaagcatttaattgaatta
tgtggtaggacgatgactcagaaacttgtgtttaataacattacacaccctgcacttatt
aagtattttaaacatacaatttgtgccagccatatttatttcacacaatttctgatagat
tttgattatcccatagcgggacttggttaccctctctattctattgatgagaatcaatta
atggtaatagatcataatcaaagtttgatgcctatggttcatgtttataacatgttacaa
ccatttatgaatcagaatgtcacgttaattaataacggcatcatatttcaacaagacaaa
cgatttcacatattgttatatcatcatcgtgctacagaaactcaatctaaccatttaaaa
atagagatagcccaccatattaatagagattttccaatcttttctcgtttattgaataat
cagcatggtaatattaagtgtttgatttcgtctagtttatatagaacatccatcaacaca
acaatgttaaatcacattaatcattcgaattatccatttgcaacttataataaacacaat
catcacaaagcgattaatttaagcttagatgatgcttcaatacattatttaatgatcaat
tacgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
