Sphingobacterium sp. ML3W: KO02_04855
Help
Entry
KO02_04855 CDS
T03258
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
sht
Sphingobacterium sp. ML3W
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sht00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sht02000
]
KO02_04855
Transporters [BR:
sht02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KO02_04855
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
TTR_TEN1-4
MetallophosN
CooC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIM36096
UniProt:
A0A088EUK4
LinkDB
All DBs
Position
1071440..1074448
Genome browser
AA seq
1002 aa
AA seq
DB search
MKQTLLSFFVGSMILTSVAFAQEKKVSGRVTAADGKPLVGVTIAVQGSNLATQTDANGNY
SFSVPTGKIIVFRSVGYTDKTLIVKEDQSAFNVTLDGSENALNEVVVVGYGTQLRRNLTT
SISTVGANDLKEIPVPNIQQALQGKAAGVQVTSGGGRPGAPMSVQIRGRSSINAGNNPLY
VVDGVIMPSNNTFTPNDAGAGISPLANLNPEDITSVEILKDAAAASIYGSRGSNGVVIIT
TKGGSTSGKSIIGASTYTGWQSLTKKKDLLNASEYRSLYNEAAVNASLPQVFTNDQVTNP
ENNVNWLDEILSNNSRVNSAQVSVTSGGNEKTQFYTSFNYFDQDGALLNGGFKRYAIRAN
LTHHINDFIRFGSNTALSRTERAETPVDNSIFSPFPRALVARPDQPIFNPDGTFATNSYN
NPVHMFQSENYVNLSNVFNSSYLEFDIISGLKFKTAVGVDFSYLDQRLYNPLTSLSGGGS
NGSGASGYVQTRNLLATQTLSYDKSFYGDRLDLNAIAVYEYQKNQRENNRVDGSNFPSDL
TPYITSAASITGGTANFTEYAMASSLARVNLGWEGKYLFSASIRRDGSSKFPEAGRIGYF
PSVSAGWVVSQENFLKSVEAISLLKVRASYGSTGNQEGIGNFAYRRAIGGGFNYLDSPGF
GLSVIGSPDLKWESTDQIDIGIDLGLFNNRLEISADYYNKKTKDLLLNRPIPTTTGFSTI
LENIGNLKGSGFDFQITSKNFNGSDFTWSTSLNLSTYKNEVTKLFNDQPIDQGFVVRHAV
GQPLGSFFLIKSLGVDSETGDMKYEDIDGSESITSSDRQFLGNPLPKFHGGITNNLSYKN
FDLNVFFQYSYGNDIYNLGAEGTGGYGSMGGVVSATAPATNMFKEYYDERWTPENTDAKY
PRAVGGTRGTYNTQRSSRFLEDGSYLRLKTITLGYNLPKSVAQKAKFSNVRIYASAYNLL
TFTKYTGFDPEVSSELTVSNLGVDQGAIPQFKTFMLGINLGL
NT seq
3009 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaacattactcagtttttttgtgggtagtatgatcctgacctctgttgccttt
gcgcaagagaaaaaggtaagtggtcgtgtgactgcagctgatggtaaaccattggttggt
gtgacgattgctgttcaaggatcaaacctagctacccaaacagatgcgaatggaaattat
tcattctctgtcccaacaggcaaaattatcgttttccgttccgttggctatactgacaag
acattaattgtcaaggaagatcaatcggcttttaatgtaactttggacggttcggaaaat
gctctgaatgaagttgtcgttgttggctatggaactcaacttagaagaaatttaacaacc
tctatatcaacagttggtgcaaatgatttaaaagaaatacctgtgccaaatattcagcaa
gctctgcaaggcaaggctgctggtgttcaagttacttcagggggaggaagacctggagct
cctatgtctgtgcaaattcgtggacgctcgtctattaacgcaggaaacaatccattatat
gtggttgatggggttataatgccttcaaataatacatttacacctaacgatgctggggct
ggaatttctcctttagcaaacttgaatcctgaagatattacttctgtagaaattttaaaa
gatgctgctgcagcttcaatttatggttctcggggatcaaatggagtggtgataattacc
accaaaggtggaagtacgtctggtaaatcaattataggtgcttctacatataccggatgg
caatcattgaccaaaaagaaagatttacttaatgcatctgaataccgttctctttataac
gaggcagcagtaaatgctagtctccctcaagtttttaccaatgatcaagttacaaatccg
gaaaataatgtaaactggttagatgaaattctttctaataactcaagagtaaattctgct
caagtatcagtaacttcaggtggaaatgaaaagacacaattttacacatcatttaattat
tttgatcaagatggagctcttttaaacggaggatttaaaaggtatgctattagagctaat
cttacacatcatataaatgactttattagatttggttcaaataccgcactttcgcgcact
gaaagagcagaaacaccagttgataatagtattttttcaccatttcctcgtgcattagtt
gctagacctgatcagccaatttttaatccagacggaacattcgcgacaaacagttataat
aatccagtacacatgtttcaatctgaaaactatgtgaacctttccaatgtgtttaattca
tcatatttagaatttgatatcatatcaggactgaaatttaaaactgcagttggtgtggat
ttttcatatttagatcaacgtttatataatccattaacatctttatcaggaggtggtagt
aatggttctggtgcttctggatacgttcagacacgtaatttacttgctacacaaacatta
tcctatgataaatcattttatggtgatcgtttggatttaaacgctattgccgtttatgag
tatcaaaaaaatcaacgtgaaaacaatcgagttgatgggtctaattttccatctgattta
acaccttatataacatctgcagcatctatcacaggagggacagcaaattttacggaatat
gcgatggcttcttctttagcgcgtgtaaatttaggatgggaaggtaaatatctattctct
gcatccataagaagagatggttcatctaaatttcctgaagctggtcgtattggatatttc
ccatcagtatcagctggatgggtggtatcacaagagaatttcttgaaaagtgttgaagcg
ataagcttgttgaaagttagagcttcttatggatcaacaggtaatcaagagggaattgga
aactttgcatatcgtagagccatcggtggtggctttaactatttagattctccaggattt
ggattgtccgttataggtagccctgatctgaagtgggaatctactgatcaaatagatata
ggtattgatttaggattatttaataatagattagaaatttctgcagattactacaataag
aaaacaaaagacttattgctaaatagaccgattcctactactactggattttctactatt
ttagaaaatataggtaatcttaaaggatctggatttgatttccaaattacttcgaaaaat
ttcaatggaagtgactttacttggtcaacatctttaaatctttcaacttacaaaaatgaa
gttacaaagttgtttaatgatcagccaattgatcaaggatttgtagtgcgacatgcggta
ggtcaacctttgggttcattctttttaatcaaatcattaggagtagattcggaaacagga
gatatgaaatatgaagatattgatggatcagaatcaattacttcttcggatagacaattt
ttaggaaatcctttgcctaaatttcatggaggtattaccaataatttatcatataagaat
tttgatttaaatgtgtttttccaatatagctatggtaatgacatttataatttaggtgca
gaaggtacaggtggatatggaagtatgggaggagttgtgagtgcaacagccccagcaaca
aatatgttcaaagaatattatgatgagcgctggactccagaaaatacagatgcaaaatat
cctcgtgctgttggaggaactagagggacttacaatacacaacgttcttcgagatttttg
gaagatggatcataccttcgtttaaaaacaataacattaggatataaccttccaaaatct
gtggctcaaaaagcaaaatttagtaatgtacgcatttatgctagtgcttataatttgcta
acatttacgaagtatactggatttgaccctgaagtgagctcagagttaactgtttccaac
ttgggggtagatcaaggagcaattcctcaatttaaaacatttatgttgggtataaatttg
ggactataa
DBGET
integrated database retrieval system