Sphingobacterium sp. ML3W: KO02_08825
Help
Entry
KO02_08825 CDS
T03258
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16092
vitamin B12 transporter
Organism
sht
Sphingobacterium sp. ML3W
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sht00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sht02000
]
KO02_08825
Transporters [BR:
sht02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
KO02_08825
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIM36791
UniProt:
A0A088EWE8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1966718..1968613)
Genome browser
AA seq
631 aa
AA seq
DB search
MNKKFTLLTLSLIGYSYAFSQISERQASTLKDTTNLGEVIINQNRLQIPFSKQTRNIQII
TQEDIKRLPARSVNELLSYINGVDVRQRGPFGSQADVTIDGGSFEQTLILLNGAKISDPQ
TAHHSLNLPIPTDAIERIEIIKGPASRIYGINSLTGAINIVTKKAVNNLVSAQIYGGSSF
QNSEDTHTGKYYGKGFQLGITNKVGKLEQQLYLGHEDSNGQRYNTASRNNKIYYQGSYAP
NDQNNISTSVGFIDNQFGANGYYASPGDKESYELVKTAFATVQSKHKITNALTISPRISN
RYNEDDYQYFRHDLNNARSLHYNNAFMAELNATYEKNFGSFGIGMESRFENINSSNIGRH
NRENYGGYLEFKTESIPNLFVNLGTYLNYNSDYSWQMFPGIDLGYDINNHWKLIFNAGSS
QRIPSFTDLYINQRPANIGNPQLQAERARQVEGAIKYTSNHIIAQAGYFYRTITDFIDWT
RSQSTEPWQPQNMDNNEVQGFNVNFRVNLNALDSNTKYYATMGYSYLHPKINDNTAENNV
SKYAIESLRNQINLNFTISHMAWSLTTANRFNERLSYKSYFISDLRFAHQLDKLNLYADA
QNLFNVKYIEAGAVPMPGTWYTLGAKYTIGY
NT seq
1896 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataaaaaatttacactattaacattatcattaatcgggtattcttatgctttcagt
caaatttcagagaggcaagcatccacattaaaagataccaccaatttaggtgaagttatt
attaatcaaaatcgtttgcagattcctttttctaaacaaactagaaatattcagattata
acacaggaagatatcaagagactaccagcacgttccgttaatgagctgctaagttacatc
aacggtgtagatgtgcgccagagaggcccatttggctcacaagcagatgtaactattgac
gggggatcctttgaacaaacacttatattattgaatggagctaaaatatcagatccacag
acagcccatcattcacttaacctaccaattcctacagatgcaatagaaaggatagaaatt
atcaaggggccagcttcacgtatttatggaattaatagtttaacaggagctattaatatt
gtcacaaaaaaagcggtaaataatcttgtaagtgcccaaatatatggcggtagctctttt
caaaatagcgaagacacacatactggaaagtactatggaaagggatttcaacttggcatc
acaaataaagtaggaaaacttgaacaacagctctatttagggcatgaggattccaatggt
caacgctacaataccgcttcgagaaacaacaaaatatactatcagggaagctatgctcca
aacgatcaaaataacatatcaacatctgttggatttattgataatcaatttggtgccaat
ggttactatgctagtccaggagataaggaatcctatgaattggttaaaacagcattcgca
acggtacagtccaaacataaaataactaatgccttaaccatttcgccaagaatttctaat
cggtacaatgaagacgactatcaatattttaggcatgacttaaacaatgccagaagcctt
cattataataacgcatttatggccgaattaaatgccacttatgagaaaaactttggttca
tttggtattgggatggaaagtcgtttcgaaaatattaacagttcaaacataggtagacat
aatcgagagaattatggtggttatttagagttcaaaacggaatcaattcccaacttattt
gtaaatttaggaacctacttaaattataacagtgactacagctggcaaatgtttcctggt
atagatttgggttatgatatcaataatcactggaaattaatttttaacgctggttccagt
caaagaatcccatcgtttacggacttatatataaatcaaagaccagctaatattgggaat
ccgcaattacaagctgagcgtgccagacaagttgaaggtgctataaagtataccagtaac
catatcattgcgcaagcgggttatttctaccgaacaataactgactttatcgattggacg
cgctcccagagcacggaaccctggcagccacaaaatatggataacaatgaggtgcaagga
tttaatgtgaatttccgcgtgaatctgaatgcactggactcgaacacgaaatattatgcg
acaatgggttatagctacttacatcccaaaataaatgataataccgctgaaaacaatgtg
tcaaaatatgctattgaaagtcttagaaatcaaataaacctaaactttacaattagccac
atggcttggagtctaacgactgccaatcgctttaatgaacgtttatcctataaatcttat
tttatttcagatctgcgttttgcacatcaactcgacaaattgaacctctatgccgacgcg
caaaatctatttaatgtgaagtatatcgaggcaggagctgtaccaatgcctggtacttgg
tatacattgggagctaagtatactattggttattaa
DBGET
integrated database retrieval system