Staphylococcus hyicus: SHYC_07065
Help
Entry
SHYC_07065 CDS
T03578
Symbol
cna
Name
(GenBank) collagen adhesin precursor
Organism
shu
Staphylococcus hyicus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cna_B
SpaA
Polyketide_cyc2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJC96154
LinkDB
All DBs
Position
1432180..1436514
Genome browser
AA seq
1444 aa
AA seq
DB search
MNKKILVFMVFVLLLNVLAPIFQSSNVTAASDISSTNVTSLTVSPSQINDGGNTKVRVDF
SDTNGPIKNGDIITVSWPTTGNLKVEGYIKSLPLTVNEQVVGQVLINSDGATITFNQNVE
KLKDVSGFAEFEVQGRNLTNTTQQNTQNGSITSGTKSAELSVTKSEAGTGGVFYYKTGDM
QPSEPDYVRWFLNINTQKAYVIKDLTIHDQIQGGQKIDLSTLNIQVEGSHPNNITGPTAI
KEFQEKYPGSNLTVDESNNTINIFIPQGYASKNNFIVSYKTKITNETQPEFVNKTQAWYQ
EHNQPEVAGQSFDYSVQNISANAGIQGTVKGELKIQKVDKDTKLPIPDVKFTLAKSDGSV
IKNGQTSIELTTDDKGIANIKELPSGSYIIKEIDAPAPYTFDKNQTYPFELKDSDTKGYF
IQIDNSKAAEKTKDVTAKKVWKDTKANHPTVYFKLFQKDTNGGETAVPNTEVKTLENGTT
EVTWNGLPEVDKDGKAIDYVVKEVDAQGNDTTPEGYTKKEEGLTVTNTEKPLETTSISGE
KKWDDKNNQDGKRPDVVTINLLKDGKVIKTTEASAANGWTYEFKDLPKEENGKTIDYKVS
EKAVEGYKSTVEGTTITNHYTPETTKVTGEKVWDDKNDQDGKRPNSVAVNLLANGEKVQS
KTVTKDTDWKYEFTNLPKYENGKVIEYTVTEDHVENYSTTINDTTITNKYTPGKTSATVT
KNWEDANNQDGKRPANIQVELLADGVPTGKTVTLNSENEWTYTWQNLDEKAQGKTITYTV
KEISKVNAYTSSIDNSNMGNLIITNHYTPETTEVNGTKVWNDKDNQDGKRPESVTVNLLK
NGEKVDSQNVNAASNWHYAFSDLPKYENGQMVDYTVTEDHVSDYTTTIDGTTITNTYTPG
KTSATVTKNWEDANNQDGHRPESIEVELYANDKATGQKATLSESNNWTHTWQDLDEKTQG
KNITYTVKELSNVKGYTSKIDDSNIGNVILTNTHTPELTKVEGKKVWDDKDNQDGKRPKS
VTINLLKNGEKIESQTVNASSNWTYSFDHLPKYDNGKEVQYTVTEDHVEDYSTTIDGTTI
TNQYTPGKTSATVTKNWEDHNNQDGHRPKSIDVELLANGEATGKTATLESDNDWTHTWQD
LDEKSNGKTIQYTVKETTAVKGYETSVNNDNIGNLVITNAYTPETTKVEGKKVWKDNDNQ
DGKRPNQIKVNLLKNGEEVDSTTVDATSDWTYAFNQLPKYENGKEINYSVTEDHVDHYST
SIDGTTITNSYTPGKTSATVTKHWEDHQNMNKQRPESIEVELLADGKATGETVSLNDKNK
WTHTWKDLEEKAKGKNITYTVKERTQLEHYHVSVNNDDMGNLIITNTFIDPTKPSEPNNP
KEEKPNEPGTPSENPKTSEQPKPGIPKFISELPNTGKALMQSWITWVVIGCIVLGIYFIF
RKRK
NT seq
4335 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaaaaaaatattggtatttatggtctttgtactattattaaatgttttagcacca
atatttcaaagtagtaacgttacagcagcaagtgacatttcttctacaaacgttacaagt
ttaactgtatctccatcgcaaataaatgatggtggaaatactaaagtaagggtagatttt
agtgacacaaatggtcctatcaaaaatggtgatataattacagtttcatggccaactaca
ggtaatttaaaagtcgaaggatacattaaatcattaccattaactgttaatgaacaagtg
gttggacaggtgctaataaactctgatggggccaccattacttttaatcaaaatgtcgaa
aaattaaaagatgtctctggttttgctgaatttgaagttcaaggacgtaatctaactaat
acaacacagcagaatacccaaaacgggtctattacatctggtactaaaagtgcggaatta
tcagtaacaaaaagtgaagcgggaacaggaggagtcttttattataaaacgggagatatg
caaccaagtgagcctgattatgttagatggtttttaaatatcaatactcaaaaggcttat
gttattaaagatttaacgattcatgaccaaatacaaggtggtcaaaaaattgatttaagt
acattaaatatacaagtggaaggctctcatcctaataatataactggcccaacagctata
aaggaatttcaagaaaaatacccaggatcaaatttaacagtagacgagagtaataataca
ataaacatttttataccccaagggtatgcttcaaaaaacaactttatagtaagctataaa
acaaaaatcacaaatgaaacacaacctgagtttgtaaataaaacacaagcttggtatcaa
gaacacaatcaaccagaggtagcgggtcaatcatttgattattcagttcagaatattagc
gctaatgctggtattcaaggtaccgttaaaggtgaattaaaaattcaaaaagttgataaa
gatactaaattaccgattccagatgttaaatttaccttagcaaaatcggatggaagtgtt
attaaaaatggacaaacgtctattgaattaacaactgacgataaaggtatagcaaatata
aaagaactacctagcggaagctatattattaaagaaattgatgccccagctccttatacc
tttgataaaaatcaaacatatccttttgaattaaaagattcggatactaaaggttatttt
attcaaatagacaactctaaagcagcagagaaaacgaaagacgtaacagctaaaaaagtt
tggaaagatactaaagcgaatcatccgactgtttattttaaattattccaaaaagacacg
aatggtggagaaacagctgttccaaatacagaagttaaaacattagaaaacggaacaacg
gaagtaacatggaatggtttaccagaagtagataaagatggtaaagctatagactatgtt
gtaaaagaagttgacgcgcaaggtaacgacactacaccagagggctatactaaaaaagaa
gaaggtttaacagtcacaaatactgaaaagcctcttgaaacgacttcaatttctggtgaa
aagaagtgggacgataaaaacaatcaagacggcaaacgtcccgatgttgtaacaattaat
ttacttaaagacggaaaagtcattaaaacaactgaagcttctgccgctaatgggtggaca
tatgaatttaaagatttacctaaagaagaaaatggaaaaaccattgattacaaagtatct
gaaaaggcagtagagggttataaatctacagttgaaggtacaacaatcacgaaccattac
acacctgaaacaactaaagttactggtgaaaaagtatgggacgacaaaaatgatcaagac
ggtaaacgtccaaattctgtagccgttaatttacttgcgaatggtgaaaaagtacagtct
aaaactgttacgaaagataccgattggaagtatgaatttactaacttaccaaagtatgaa
aatggtaaagtgatagaatatacagttacagaagatcatgttgagaattattcgactacg
attaacgatactacaattacaaacaaatatacacctggcaaaacgtctgctacggtcact
aaaaactgggaagatgctaacaaccaagatggcaagcgcccagctaacattcaagttgaa
cttctagcagatggcgtgccaactggaaaaacagtaacattaaattcagaaaatgaatgg
acgtatacatggcaaaatctggatgaaaaagcacaaggtaaaacgattacttatactgtg
aaagaaatttctaaggtcaatgcgtatacttcatctattgataatagtaatatgggtaac
ttgattattacgaatcactatacacctgaaactacagaagtaaacggtacaaaagtctgg
aacgataaagataatcaagatggtaaacgtccagaatctgtaactgttaatttattgaaa
aatggtgaaaaagtcgattctcaaaatgttaatgccgcatctaattggcattatgcattc
tccgatttaccaaagtatgaaaatggacaaatggttgattatacagtaacagaagaccac
gtctctgattacacaacgactatcgatggcacaacaattacgaacacgtatacgccgggg
aaaacgtctgctacggtcactaaaaactgggaagatgctaacaatcaagatggtcatcgt
cctgaatcaatcgaagtggaattatacgcaaatgataaagccacaggtcaaaaagctaca
ttatctgaaagtaacaattggactcacacatggcaagatcttgatgaaaaaacacaaggt
aagaacatcacttatactgtaaaagaactttctaacgtaaaaggatatacatctaaaatt
gatgattccaatatcggcaatgtaatacttacgaatacacatacacccgaattaactaag
gtagaaggtaaaaaagtctgggatgataaagataatcaagatggcaaacgtcctaaatca
gtgacgatcaatttactcaaaaacggagaaaaaattgaatcgcaaactgtaaatgcttct
tcaaattggacttattcatttgatcatttaccaaaatatgacaatggaaaagaagttcaa
tatactgtcacggaagatcacgttgaagattattcaactactatcgatggcacgacaatt
acaaatcaatatacaccaggtaagacgtctgcaaccgtaactaaaaattgggaagatcat
aataaccaagatggtcatcgaccgaagtctattgatgtagaacttttagcgaacggtgaa
gctactggtaaaactgcaacgttagaatctgacaatgattggacacatacatggcaagat
cttgatgaaaaatcaaatggcaaaactattcaatatacagtaaaagaaacaactgcagtt
aaaggatatgaaacttcagttaacaatgacaatattggaaacttagtcattacaaatgct
tatacgccagaaacgacaaaagttgaaggcaaaaaggtatggaaagacaatgacaaccaa
gatggtaaacgtcctaatcaaattaaagtaaatttattgaaaaatggtgaagaagttgat
tcgacaacggtggatgcaacttcagactggacatacgcatttaatcaattgccgaaatat
gaaaacggtaaagaaatcaattacagcgtaacagaagatcatgtcgatcattattcaaca
tcaattgatggcacgaccattacaaattcgtatacacctggtaaaacttctgcaacggtg
acgaagcattgggaagatcatcaaaatatgaataaacaacgtcctgaatcaattgaagtg
gagttactggctgatggtaaagctactggtgaaactgtttctttaaatgataaaaataaa
tggacacatacgtggaaagatcttgaagaaaaagcgaaaggtaaaaacatcacttatact
gtgaaagagcgtacgcaacttgagcattatcatgtatctgtaaataacgatgatatgggg
aatttaatcattacaaatacatttattgaccctacaaaaccatcggaaccaaataatcca
aaagaagagaaaccaaatgaacctggtacaccttctgaaaatcctaaaacatcagaacag
ccgaaaccaggcattccgaaattcattagtgaattaccaaacacaggtaaagcgttaatg
caatcatggataacatgggttgtaatagggtgtatcgttctaggaatttacttcatcttt
agaaaaagaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system