KEGG   Shouchella hunanensis: PQ477_17990
Entry
PQ477_17990       CDS       T09126                                 
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
shua  Shouchella hunanensis
SSDB
Motif
Pfam: Collagen CBM_5_12
Other DBs
NCBI-ProteinID: WDF03362
UniProt: A0ABY7W329
LinkDB
Position
3493683..3498155
AA seq 1490 aa
MSYFEECSNYQRFRRTSTNGRVLFNNSFPISITGATGATGATGIGLTGVVNYDPVLATNY
QIGQVVIYEGGTYLVVSSPPSGIPSESNDYLLLAAPGNTGATGAGFEGTVPYDPARVFDY
KIGQVVTFEGSAYIVNTTPPIGLPSTSSDYTLLVSRGATGIGFDSGIVDYNPTLVSDYAV
GQLVSFRGSLYVVNTAPPTGEPGTSADYSLVAERGVTGATGVTGVTGPTGATGATGVTGA
TGVTGATGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGVTGATGVTGATGV
TGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGITGVTGVTGVTGATGVTGVTGA
TGVTGVTGATGATGVTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATGATGPTGATGVTGATGVTGA
TGVTGVTGVTGVTGSTGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGITGVTGV
TGVTGATGVTGVTGATGVTGVTGATGATGVTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATGATGP
TGATGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGVTGSTGVTGVTGATGPTGSTGVTGATGPTGATGV
TGATGVTGVTGATGVTGSTGPTGVTGVIGSTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGVTGV
TGATGVTGATGVTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGATGITGATGVTGATGVTGATGVTGV
TGATGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGV
TGSTGVTGVTGATGVTGATGVTGATGATGATGPTGATGVTGATGATGVTGVTGVTGATGA
TGVTGATGATGATGVTGVTGVTGVTGSTGPTGVTGVTGVTGVTGVTGATGVTGANGVTGV
TGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGSTGPTGV
TGVTGSTGATGVTGATGVTGVTGATGATGVTGATGVTGVTGATGVTGFTGVTGATGSTGP
TGVTGATGVTGSTGVTGSTGVTGATGVTGPTGVTGATGVTGATGATGATGITGATGVTGS
TGVTGATGVTGATGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGVTGATGVTGATGV
TGVTGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGATGATGVTGATGATGVTGATGATGVTGATGATGV
TGATGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGVTGVAGVTGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGATGV
TGVTGATGVTGVAGVTGVTGATGVTGATGVTGVAGVTGATGVTGVTGATGVTGVAGVTGV
TGVTGATGVTGPTGVTGATGVTGVSSLQPFFNSNVQAQTVAAGGPINLLTPGAYSGFGFV
PGIGLITIVTPGMYYISVGLNKAAGTTVGAVFGLTINGVASPSAPIACSDTGGLSLVIRV
QNYNAGDTIQITNFSTFPVVLANAPNQANSAGHVTIHRYASGPSGTLITI
NT seq 4473 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgagttattttgaagagtgttcaaattatcaacgatttaggcgtacttcaacaaacggt
agagttttatttaataattcctttccaatcagtataacaggagccactggtgcaaccgga
gcaactggaattggattaacgggggttgtaaattacgaccctgtacttgctacaaattat
caaattggtcaagttgtaatttatgaaggtgggacgtatcttgtagttagttccccacca
tcaggaatacctagcgaatcgaatgattatttactgttagcggctccaggcaacacgggg
gctaccggtgcaggctttgaaggtactgtgccttacgaccctgctcgtgtgtttgactat
aagattggtcaagttgtgacgttcgaaggtagtgcttacatagtaaacactaccccacca
attggtttgccatcgacatcttctgattacactctacttgttagtagaggagcaacagga
atcggatttgatagtgggatagtggactacaatccaacacttgtttcagactatgcagtt
ggtcagctagtaagttttagaggaagtctgtatgtagtaaacacggcaccgccgacagga
gaaccagggacatcagcggactatagcttagtcgcagaacgaggcgtaactggagcaaca
ggagttacgggtgttactggtcctactggagcgactggggctaccggagtaacaggagct
actggagttacaggagctactggagccactggcgtcaccggtgctactggggtaacggga
gtaacaggagctactggggtaacgggagccacaggtgttacaggagccactggcgttact
ggagcaacaggtcctactggagttactggtgccacaggtgttaccggggctacaggagta
acaggagtaacaggagtaacaggagctacaggtgttacaggagctactggagttactggt
gctactggagtaacgggagttacaggagcgactggagtaaccggagccactggcattact
ggagttactggagttactggtgttacaggagcgactggagtaactggagttactggtgct
acaggagtaacgggagttacaggagctacaggagccactggagtaaccggtgctactggg
gtaacgggagtaactggagttactggtgccactggagttacaggagctactggtgccacc
ggggctactggtcctactggtgccactggcgtcactggggctactggcgtcactggagca
acaggagttacgggtgttacaggagtaacaggagtaacaggatctacaggggtaacagga
gtaacaggagctacaggtgttacaggagctactggagttactggtgctactggagtaacg
ggagttacaggagcgactggagtaaccggagccactggcattactggagttactggagtt
actggtgttacaggagcgactggagtaactggagttactggtgctactggagtaacggga
gttacaggagctacaggagccactggagtaaccggtgctactggggtaacgggagtaact
ggagttactggtgccactggagttacaggagctactggtgccaccggggctactggtcct
actggtgccactggcgtcactggggctactggcgtcactggagcaacaggagttacgggt
gttacaggagtaacaggagtaacaggatctacaggggtaacaggagttacaggggctaca
ggtcctaccggatctactggagttacaggagctactggtcctactggagctactggcgtc
actggagcaacaggagttacgggtgttactggtgctactggggttaccggatctactggt
cctacgggagtaacgggagttatcggatctacaggagccactggagtaaccggtgctacc
ggggtaacgggagtaactggagccactggtgttactggtgctaccggggtaacgggagta
actggagccactggagtaactggtgctacaggggttaccggatctactggttctacggga
gtaacgggagttaccggatctactggagccactggagtaaccggagccactggcattact
ggagctactggcgtcaccggtgctactggtgttacaggagcaacaggagttactggtgtt
acaggagccactggcgtcaccggtgctactggcgtaactggagcaacaggagttacgggt
gttactggtgttacaggagtaacaggagctaccggggtaacgggtgccactggcgttaca
ggagttactggggtaaccggagctactggggtaactggtgttactggcgctacaggagta
acaggatctacaggggtaacaggtgtcactggagctaccggtgtaactggagccactggc
gtcactggggctactggggctactggcgctacaggacctactggagccactggggttacc
ggggctacaggagcgactggagtaacaggtgttactggagtaacaggtgctactggagct
actggagtaacaggtgctacaggagctactggagctactggtgtaactggagttactggt
gttactggggttaccggatctactggtcctacgggagtaacgggagtaacgggagtaacg
ggagtaacgggagttacaggagccactggagtaaccggtgctaatggggtaacgggagtt
acaggagccactggagtaacaggtgctacaggagtaactggagccactggtgttactggc
gtcaccggcgctacaggagtaactggagccactggtgttacaggagctactggtgttaca
ggagccactggtgttacaggagctactggggttaccggatctactggtcctacgggagta
acgggagttaccggatctactggagccactggtgtcaccggtgctacaggggtaacggga
gtaactggtgctactggtgctactggtgttactggagcaacaggggttactggagtcact
ggtgctactggtgttactgggtttactggtgttactggtgctaccggatctactggtcct
acgggagtaacgggtgctactggtgttactggctctactggagtaacaggatctacaggg
gtaacaggtgctactggtgtaactggtcctacaggagttactggtgccactggtgttact
ggggctaccggggctaccggagctactggcattaccggagctactggagtaacaggatct
acaggggtaacaggagctactggggtaactggcgctacaggagtaacaggatctacaggg
gtaacaggagctactggggtaactggcgctacaggagtaaccggagccactggcgttact
ggagcgactggtcctacaggagtaaccggggctactggtgtcaccggggctactggggta
acgggggtaacgggagtaacgggagtaactggagtaactggagctactggggtaacggga
gtcactggtgctactggagctactggagctactggagtcactggggctactggagctact
ggagtcactggggctactggagctactggagtcactggtgctactggagcgactggtgtt
actggcgctacaggagtaaccggagtcactggcgtcaccggtgctactggggtaacggga
gtaacgggtgctactggagttactggagttgctggagtaactggagtaactggagccact
ggtgttactggcgctacaggagtaaccggagtcactggcgtcaccggtgctactggggta
acgggagtaacgggtgctactggagttactggagttgctggagtaactggagtaactgga
gccactggtgttactggcgctacaggagtaaccggagtcgctggcgtcaccggtgctaca
ggggtaacgggagtaacgggtgctactggagttactggagttgctggagtaactggagta
actggagtaactggagccactggtgttacaggacctactggagtaacaggtgccacaggt
gtcactggagtatcctcacttcaaccgttttttaacagtaatgttcaagctcaaacggta
gcagcgggtggtcctataaatttattaacgcctggtgcatactcaggattcggattcgtt
ccaggtattggtttgattactattgtaacaccaggtatgtactatataagtgttggtctt
aataaagcagcggggacaacggtaggggcggtttttggtttaacaataaacggtgttgcc
tcaccgagcgctccgattgcttgctctgatacaggagggttatctttagttattcgagtt
caaaattacaatgcaggggatacaattcagatcacgaatttctctacattcccagtcgtc
cttgctaatgctccaaaccaagctaatagtgcaggtcacgtaaccattcatcgttatgca
agtggaccatctggaactttaattacaatttag

DBGET integrated database retrieval system