Shouchella hunanensis: PQ477_17990
Help
Entry
PQ477_17990 CDS
T09126
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
shua
Shouchella hunanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
CBM_5_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WDF03362
UniProt:
A0ABY7W329
LinkDB
All DBs
Position
3493683..3498155
Genome browser
AA seq
1490 aa
AA seq
DB search
MSYFEECSNYQRFRRTSTNGRVLFNNSFPISITGATGATGATGIGLTGVVNYDPVLATNY
QIGQVVIYEGGTYLVVSSPPSGIPSESNDYLLLAAPGNTGATGAGFEGTVPYDPARVFDY
KIGQVVTFEGSAYIVNTTPPIGLPSTSSDYTLLVSRGATGIGFDSGIVDYNPTLVSDYAV
GQLVSFRGSLYVVNTAPPTGEPGTSADYSLVAERGVTGATGVTGVTGPTGATGATGVTGA
TGVTGATGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGVTGATGVTGATGV
TGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGITGVTGVTGVTGATGVTGVTGA
TGVTGVTGATGATGVTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATGATGPTGATGVTGATGVTGA
TGVTGVTGVTGVTGSTGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGITGVTGV
TGVTGATGVTGVTGATGVTGVTGATGATGVTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATGATGP
TGATGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGVTGSTGVTGVTGATGPTGSTGVTGATGPTGATGV
TGATGVTGVTGATGVTGSTGPTGVTGVIGSTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGVTGV
TGATGVTGATGVTGSTGSTGVTGVTGSTGATGVTGATGITGATGVTGATGVTGATGVTGV
TGATGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGV
TGSTGVTGVTGATGVTGATGVTGATGATGATGPTGATGVTGATGATGVTGVTGVTGATGA
TGVTGATGATGATGVTGVTGVTGVTGSTGPTGVTGVTGVTGVTGVTGATGVTGANGVTGV
TGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGVTGSTGPTGV
TGVTGSTGATGVTGATGVTGVTGATGATGVTGATGVTGVTGATGVTGFTGVTGATGSTGP
TGVTGATGVTGSTGVTGSTGVTGATGVTGPTGVTGATGVTGATGATGATGITGATGVTGS
TGVTGATGVTGATGVTGSTGVTGATGVTGATGVTGATGVTGATGPTGVTGATGVTGATGV
TGVTGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGATGATGVTGATGATGVTGATGATGVTGATGATGV
TGATGVTGVTGVTGATGVTGVTGATGVTGVAGVTGVTGATGVTGATGVTGVTGVTGATGV
TGVTGATGVTGVAGVTGVTGATGVTGATGVTGVAGVTGATGVTGVTGATGVTGVAGVTGV
TGVTGATGVTGPTGVTGATGVTGVSSLQPFFNSNVQAQTVAAGGPINLLTPGAYSGFGFV
PGIGLITIVTPGMYYISVGLNKAAGTTVGAVFGLTINGVASPSAPIACSDTGGLSLVIRV
QNYNAGDTIQITNFSTFPVVLANAPNQANSAGHVTIHRYASGPSGTLITI
NT seq
4473 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagttattttgaagagtgttcaaattatcaacgatttaggcgtacttcaacaaacggt
agagttttatttaataattcctttccaatcagtataacaggagccactggtgcaaccgga
gcaactggaattggattaacgggggttgtaaattacgaccctgtacttgctacaaattat
caaattggtcaagttgtaatttatgaaggtgggacgtatcttgtagttagttccccacca
tcaggaatacctagcgaatcgaatgattatttactgttagcggctccaggcaacacgggg
gctaccggtgcaggctttgaaggtactgtgccttacgaccctgctcgtgtgtttgactat
aagattggtcaagttgtgacgttcgaaggtagtgcttacatagtaaacactaccccacca
attggtttgccatcgacatcttctgattacactctacttgttagtagaggagcaacagga
atcggatttgatagtgggatagtggactacaatccaacacttgtttcagactatgcagtt
ggtcagctagtaagttttagaggaagtctgtatgtagtaaacacggcaccgccgacagga
gaaccagggacatcagcggactatagcttagtcgcagaacgaggcgtaactggagcaaca
ggagttacgggtgttactggtcctactggagcgactggggctaccggagtaacaggagct
actggagttacaggagctactggagccactggcgtcaccggtgctactggggtaacggga
gtaacaggagctactggggtaacgggagccacaggtgttacaggagccactggcgttact
ggagcaacaggtcctactggagttactggtgccacaggtgttaccggggctacaggagta
acaggagtaacaggagtaacaggagctacaggtgttacaggagctactggagttactggt
gctactggagtaacgggagttacaggagcgactggagtaaccggagccactggcattact
ggagttactggagttactggtgttacaggagcgactggagtaactggagttactggtgct
acaggagtaacgggagttacaggagctacaggagccactggagtaaccggtgctactggg
gtaacgggagtaactggagttactggtgccactggagttacaggagctactggtgccacc
ggggctactggtcctactggtgccactggcgtcactggggctactggcgtcactggagca
acaggagttacgggtgttacaggagtaacaggagtaacaggatctacaggggtaacagga
gtaacaggagctacaggtgttacaggagctactggagttactggtgctactggagtaacg
ggagttacaggagcgactggagtaaccggagccactggcattactggagttactggagtt
actggtgttacaggagcgactggagtaactggagttactggtgctactggagtaacggga
gttacaggagctacaggagccactggagtaaccggtgctactggggtaacgggagtaact
ggagttactggtgccactggagttacaggagctactggtgccaccggggctactggtcct
actggtgccactggcgtcactggggctactggcgtcactggagcaacaggagttacgggt
gttacaggagtaacaggagtaacaggatctacaggggtaacaggagttacaggggctaca
ggtcctaccggatctactggagttacaggagctactggtcctactggagctactggcgtc
actggagcaacaggagttacgggtgttactggtgctactggggttaccggatctactggt
cctacgggagtaacgggagttatcggatctacaggagccactggagtaaccggtgctacc
ggggtaacgggagtaactggagccactggtgttactggtgctaccggggtaacgggagta
actggagccactggagtaactggtgctacaggggttaccggatctactggttctacggga
gtaacgggagttaccggatctactggagccactggagtaaccggagccactggcattact
ggagctactggcgtcaccggtgctactggtgttacaggagcaacaggagttactggtgtt
acaggagccactggcgtcaccggtgctactggcgtaactggagcaacaggagttacgggt
gttactggtgttacaggagtaacaggagctaccggggtaacgggtgccactggcgttaca
ggagttactggggtaaccggagctactggggtaactggtgttactggcgctacaggagta
acaggatctacaggggtaacaggtgtcactggagctaccggtgtaactggagccactggc
gtcactggggctactggggctactggcgctacaggacctactggagccactggggttacc
ggggctacaggagcgactggagtaacaggtgttactggagtaacaggtgctactggagct
actggagtaacaggtgctacaggagctactggagctactggtgtaactggagttactggt
gttactggggttaccggatctactggtcctacgggagtaacgggagtaacgggagtaacg
ggagtaacgggagttacaggagccactggagtaaccggtgctaatggggtaacgggagtt
acaggagccactggagtaacaggtgctacaggagtaactggagccactggtgttactggc
gtcaccggcgctacaggagtaactggagccactggtgttacaggagctactggtgttaca
ggagccactggtgttacaggagctactggggttaccggatctactggtcctacgggagta
acgggagttaccggatctactggagccactggtgtcaccggtgctacaggggtaacggga
gtaactggtgctactggtgctactggtgttactggagcaacaggggttactggagtcact
ggtgctactggtgttactgggtttactggtgttactggtgctaccggatctactggtcct
acgggagtaacgggtgctactggtgttactggctctactggagtaacaggatctacaggg
gtaacaggtgctactggtgtaactggtcctacaggagttactggtgccactggtgttact
ggggctaccggggctaccggagctactggcattaccggagctactggagtaacaggatct
acaggggtaacaggagctactggggtaactggcgctacaggagtaacaggatctacaggg
gtaacaggagctactggggtaactggcgctacaggagtaaccggagccactggcgttact
ggagcgactggtcctacaggagtaaccggggctactggtgtcaccggggctactggggta
acgggggtaacgggagtaacgggagtaactggagtaactggagctactggggtaacggga
gtcactggtgctactggagctactggagctactggagtcactggggctactggagctact
ggagtcactggggctactggagctactggagtcactggtgctactggagcgactggtgtt
actggcgctacaggagtaaccggagtcactggcgtcaccggtgctactggggtaacggga
gtaacgggtgctactggagttactggagttgctggagtaactggagtaactggagccact
ggtgttactggcgctacaggagtaaccggagtcactggcgtcaccggtgctactggggta
acgggagtaacgggtgctactggagttactggagttgctggagtaactggagtaactgga
gccactggtgttactggcgctacaggagtaaccggagtcgctggcgtcaccggtgctaca
ggggtaacgggagtaacgggtgctactggagttactggagttgctggagtaactggagta
actggagtaactggagccactggtgttacaggacctactggagtaacaggtgccacaggt
gtcactggagtatcctcacttcaaccgttttttaacagtaatgttcaagctcaaacggta
gcagcgggtggtcctataaatttattaacgcctggtgcatactcaggattcggattcgtt
ccaggtattggtttgattactattgtaacaccaggtatgtactatataagtgttggtctt
aataaagcagcggggacaacggtaggggcggtttttggtttaacaataaacggtgttgcc
tcaccgagcgctccgattgcttgctctgatacaggagggttatctttagttattcgagtt
caaaattacaatgcaggggatacaattcagatcacgaatttctctacattcccagtcgtc
cttgctaatgctccaaaccaagctaatagtgcaggtcacgtaaccattcatcgttatgca
agtggaccatctggaactttaattacaatttag
DBGET
integrated database retrieval system