Shouchella hunanensis: PQ477_18295
Help
Entry
PQ477_18295 CDS
T09126
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
shua
Shouchella hunanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WDF03421
LinkDB
All DBs
Position
complement(3565904..3572110)
Genome browser
AA seq
2068 aa
AA seq
DB search
MMRRISKSNYCINSSIAQFNRTATNGGSLFSAYCRYCNDATGVTGATGVTGVTGVTGPTG
VTGATGITGATGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGATGATGPTGVTGVTGAIGITGATGVTG
VTGVTGATGVTGATGVTGTTGATGVTGPTGVTGATGVTGTTGATGVTGPTGVTGATGVTG
VTGVTGVTGVTGITGATGVTGVTGVTGATGATGPTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGVTGITG
ATGVTGITGVTGATGVTGVTGVTGATGATGVTGVSGATGATGVTGVTGATGATGATGVTG
VTGATGVTGPTGATGVTGVTGVTGATGVSGVTGATGATGVSGVTGATGPTGVTGVTGVTG
VTGVTGVTGVTGITGATGVTGITGVTGATGVTGVTGVTGATGATGVTGVSGATGVTGVTG
ATGVTGVTGATGATGATGVTGVTGATGVTGPTGATGVTGVTGVTGATGVSGVTGATGATG
VSGVTGATGATGVSGVTGATGPTGVTGATGATGVTGVTGVTGATGVTGVTGVTGATGVSG
VTGATGATGATGVTGSTGITGATGATGVTGVTGATGVTGVTGITGATGATGATGVTGSTG
ITGATGATGVTGATGITGSTGATGATGATGPTGATGVTGSTGITGATGATGVTGSTGITG
ATGSTGITGATGSTGITGATGSTGITGATGVTGATGITGSTGATGATGATGVTGVTGATG
VTGVTGVTGVTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATGATGATGATGIIGATGATGPTGVTG
VTGVTGVTGVTGATGVTGSTGVTGVTGATGITGATGVTGATGVTGPTGATGVSGVTGATG
PTGVTGPTGPTGATGVTGVTGATGITGSTGATGATGATGVTGVTGATGVTGVTGVTGVTG
ATGGTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATGATGATGITGATGATGPTGVSGATGVTGVTG
ATGVTGVTGATGATGATGVTGVTGVTGVTGATGVSGVTGATGATGATGVTGSTGITGATG
ATGVTGVTGATGVTGVTGVTGVTGATGGTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATGATGATG
ATGATGATGITGATGATGPTGVTGVTGVTGVTGVTGATGVTGSTGVTGVTGATGITGATG
VTGATGVTGPTGATGVSGVTGATGPTGVTGPTGPTGVTGATGATGVTGATGVTGATGVTG
ITGATGPTGPTGATGVTGATGITGATGATGATGVTGSTGITGATGATGVTGATGITGSTG
ATGATGATGPTGATGVTGSTGITGATGATGVTGSTGITGATGVTGPTGATGPTGPTGDTG
VTGITGATGVTGVTGATGVTGATGPTGPTGATGVTGSTGITGATGATGATGVTGATGITG
STGATGATGATGPTGATGVTGSTGITGATGATGVTGSTGITGATGATGVTGATGITGSTG
ATGATGATGVTGVTGATGVTGVTGVTGVTGATGGTGATGVTGVTGVTGATGVTGATGATG
ATGATGITGATGATGPTGVSGATGVTGVTGATGVTGVTGATGATGATGVTGVTGVTGATG
VTGATGVTGPTGATGVSGVTGATGPTGVTGPTGPTGATGVTGVTGSTGITGATGPTGATG
ITGSTGATGVTGVTGATGVTGVTGVTGPTGATGVTGVTGATGATGVTGATGVTGATGITG
ATGVTGATGVTGATGVTGITGATGVTGATGVTGATGPTGPTGVTGITGATGVSGPTGVTG
ATGATGVTGATGVTGATGPTGATGVTGSTGVTGPTGVTGATGATGSTGVTGVTGSTGVTG
PTGVTGATGATGPTGATGITGATGATGVTGPTGVTGITGATGVTGPTGVTGITGATGATG
ATGVTGATGITGATGVTGATGPTGVTGATGATGPTGATGVTGATGPNVSLFGFSAVKSSA
TISASGQLTAWTTDSPFYTGTGFDPVTGNYTVPATGRYSIKSIINYRTTAALAAQIGTGV
NPSFTIQRISPNPTTITTGLIPILDVNILLLLTLRVILGSGEVTLVTDVQLNAGDVLGVF
YVSSGLTINLSIGTFVPAGTIWSVHRIT
NT seq
6207 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgagaagaatatctaaatctaactattgtataaattcaagcattgcccaatttaat
agaacagcaaccaatggaggatctttattcagcgcctattgtaggtattgtaacgatgcg
actggagttactggtgccactggagtcactggtgttactggggttactggacctactgga
gttaccggagccactggcattactggggctactggggttacaggagttactggggttaca
ggagttaccggggttacaggagttaccggggttactggtgctactggagccactggacct
acgggggttactggagttaccggagccattggcattactggggctactggtgttacagga
gttaccggagtcactggagcaactggtgttactggggctaccggggttactggtaccact
ggagccactggcgttactggtcctactggcgttactggggctaccggggttactggtacc
actggagccactggcgttactggtcctactggcgttactggggctaccggggttacagga
gttactggggtcactggtgttactggagttactggcattacaggtgctaccggggttact
ggagttacaggagttaccggagctacaggagccactggacctacgggtgttactggggtt
accggtgttaccggtgttactggggtcactggtgttactggagttactggcattacaggt
gctaccggggttactggaataacaggtgttaccggagctacaggagttactggggttact
ggagttacaggagccaccggagctactggagttactggcgtttctggtgccactggagct
actggagtaacaggagttaccggagctactggtgctaccggagctactggcgttaccggg
gttactggagccactggtgttactggtcctactggtgctaccggggttactggagtaaca
ggtgttaccggagctactggcgtttctggtgtcacaggagctacaggagctactggcgtt
tctggtgtcacaggagccactggacctacgggtgttactggggttaccggtgttaccggt
gttactggggtcactggtgttactggagttactggcattacaggtgctaccggggttact
ggaataacaggtgttaccggagctacaggagttactggggttactggagttacaggagcc
accggagctactggagttactggcgtttctggtgccactggagtcactggtgttactgga
gctactggagtaacaggagttaccggagctactggtgctaccggagctactggcgttacc
ggggttactggagccactggtgttactggtcctactggtgctaccggggttactggagta
acaggtgttaccggagctactggcgtttctggtgtcacaggagctacaggagctactggc
gtttctggtgtcacaggagctacaggagctactggcgtttctggtgtcacaggagccact
ggacctacgggtgttactggtgctacaggagccacaggagttaccggggttactggagtc
actggtgctaccggggttactggagtcactggtgttaccggagctactggcgtttctggt
gtcacaggagctacaggagctactggggctacaggtgttactgggtccactggcattaca
ggtgctactggggctactggtgttacaggagttaccggagctaccggtgttactggggtc
actggcattacaggtgctactggggctactggggctacaggtgttactgggtccactggc
attacaggtgctactggggctactggtgttactggtgccactggcattacaggatctaca
ggtgctacaggagctactggggctactggacctactggtgctaccggggttactgggtcc
actggcattacaggtgctactggggctacaggtgttactgggtccactggcattacaggt
gctactgggtccactggcattacaggtgctactgggtccactggcattacaggtgctact
gggtccactggcattacaggtgctactggagttactggtgccactggcattacaggatct
acaggtgctacaggagctactggggctactggtgttacaggagttaccggagctaccggt
gttactggggtcactggtgttactggcgttactggtgctactggggtcactggtgttact
ggagttaccggagctactggggttactggagccactggggctactggggctactggggct
acaggtgctactggcattataggtgctacaggagctactggacctactggagttacgggt
gttacgggtgttactggtgttactggcgttactggtgctaccggggttactggttctacg
ggtgttactggtgttactggggccactggcattacaggtgctactggagttaccggtgct
accggtgttacaggtcctactggagctactggcgtttctggtgtcacaggagctactggt
cctactggagtcactggacctacaggtcctactggtgctacaggagttaccggtgttact
ggtgccactggcattacaggatctacaggtgctacaggagctactggggctactggtgtt
acaggagttaccggagctaccggtgttactggggtcactggtgttactggcgttactggt
gctactgggggtactggtgctactggggtcactggtgttactggagttaccggagctact
ggggttactggagccactggggctactggggctacaggtgctactggcattacaggtgct
acaggagctactggacctactggcgtttctggtgccactggagtcactggtgttactgga
gctactggagtaacaggagttaccggagctactggtgctaccggagctactggcgttacc
ggggttactggagtcactggtgttaccggagctactggcgtttctggtgtcacaggagct
acaggagctactggggctacaggtgttactgggtccactggcattacaggtgctactggg
gctactggtgttacaggagttaccggagctaccggtgttactggggtcactggtgttact
ggagttacaggagctactgggggtactggtgctactggggtcactggtgttactggagtt
accggagctactggggttactggagccactggggctactggggctactggggctactggg
gctactggggctacaggtgctactggcattacaggtgctacaggagctactggacctact
ggagttactggagttacgggtgttactggtgttactggcgttactggtgctaccggggtt
actggttctacgggtgttactggtgttactggggccactggcattacaggtgctactgga
gttaccggtgctaccggtgttacaggtcctactggagctactggcgtttctggtgtcaca
ggagctactggtcctactggagtcactggacctacaggtcctactggggttactggcgct
actggagctacgggtgttactggagccaccggtgttactggagccaccggtgttactggg
attactggagctactggacctactggacctactggtgctaccggggttactggggccact
ggcattacaggtgctactggggctactggggctacaggtgttactgggtccactggcatt
acaggtgctactggggctactggtgttactggtgccactggcattacaggatctacaggt
gctacaggagctactggggctactggacctactggtgctaccggggttactgggtccact
ggcattacaggtgctactggggctacaggtgttactgggtccactggcattactggggct
acaggagttacaggacctactggagccactggacctacgggtcctactggtgatacagga
gtaactgggattactggagctactggagttacgggtgttactggagccaccggtgttact
ggagctactggacctactggacctactggtgctaccggggttactgggtccactggcatt
acaggtgctactggggctactggggctactggtgttactggtgccactggcattacagga
tctacaggtgctacaggagctactggggctactggacctactggtgctaccggggttact
gggtccactggcattacaggtgctactggggctacaggtgttactgggtccactggcatt
acaggtgctactggggctactggagttactggtgccactggcattacaggatctacaggt
gctacaggagctactggggctactggtgttacaggagttaccggagctaccggtgttact
ggggtcactggtgttactggcgttactggtgctactgggggtactggtgctactggggtc
actggtgttactggagttaccggagctactggggttactggagccactggggctactggg
gctacaggtgctactggcattacaggtgctacaggagctactggacctactggcgtttct
ggtgccactggagtcactggtgttactggagctactggagtaacaggagttaccggagct
actggtgctaccggagctactggcgttaccggggttactggagtcactggtgctactgga
gttaccggtgctaccggtgttacaggtcctactggagctactggcgtttctggtgtcaca
ggagctactggtcctactggagtcactggacctacaggtcctactggtgctacaggagtt
accggtgttactgggtccactggcattactggggctacaggtcctactggagctactggc
attacaggatctacaggtgctaccggggttactggggtcactggtgctactggggttact
ggagttactggagttactggacctactggggctactggagttacaggagttacaggagct
accggagccactggggttactggggctactggcgttacgggtgccactgggattaccgga
gctactggcgttactggggctacaggagttaccggagctactggtgttactggcattaca
ggtgccactggggttactggcgctactggcgttacgggtgccactggacctacaggtcct
actggtgttactgggattaccggagctactggcgtttctggtcctactggtgttactggg
gctactggtgctaccggggtcactggtgctacgggggttactggcgctactggacctact
ggtgctactggtgttactgggtccactggcgttactggtcctactggtgttactggggct
actggtgctactgggtccactggtgttactggtgttactggttctactggcgttacaggt
cctactggcgttaccggagccactggggctacaggtcctactggagctactggcattaca
ggagctacaggtgctaccggggttactggacctactggagttactggcattacaggtgct
accggtgttactggacctactggagttactggcattacaggtgctaccggagccactgga
gctactggcgttactggggccactggcattacaggagctactggagtcactggagcaact
ggacctactggggttactggggccactggtgctacaggtcctactggagccaccggtgtt
actggggctactggtccaaatgtttcattgttcggtttttctgctgtgaaaagctcggca
acaataagtgcttctggtcaacttacagcatggacgacagatagtccattctatacaggt
acgggatttgatccggtaacaggaaattatacagttcctgctactggtaggtattcgatt
aagtcaatcattaattaccgaacaacggctgcattagccgctcagataggaacaggagtt
aatccgtcttttaccattcaaagaatctcgccaaatccaacaactatcactacaggacta
attcctatacttgatgtaaacatattactattattgacactccgagttatattggggagt
ggtgaagtcacgcttgttacagacgttcaactcaatgcaggtgatgtcctaggggtgttt
tatgtttcaagtggtttgactattaatttaagcatcggtacttttgtacctgctggaacc
atttggtctgtacaccgtattacgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
