Shewanella sp. W3-18-1: Sputw3181_1022
Help
Entry
Sputw3181_1022 CDS
T00453
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
shw
Shewanella sp. W3-18-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
shw02000
]
Sputw3181_1022
Transporters [BR:
shw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sputw3181_1022
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
OMP_b-brl_3
OMP_b-brl_4
Pom
BBP2
DUF2490
DUF481
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM23872
LinkDB
All DBs
Position
1166669..1168813
Genome browser
AA seq
714 aa
AA seq
DB search
MTYLAFPKRVALLLGAFVAFNSPMVFAAKELQSNEQITDSDIERLSIHYRQAYRGNVPAE
ALPQAISVLDEQLIKDAGLTRFQDVLDYSASVARQNNGGGLWDSFSLRGFPGNENMPSGY
LINGFNGGRGFSGHRDLSNVAYVEILKGPGSALYGRSEPGGTVNIVTKKPQYESSGYLKA
SAGSFDQYRLEGDVTSGLTESVAFRINGAWQEYDSFRDYVFSDKKIVTPSVRWQVSDKAS
LLYELEYLKQEQLFDRGFIVLNNDIKTVPRSRYLGEPNDGATKVNATGHQLTYDYELNDD
WSLTAGYNYRDSTLKGFSSDAELAAGRQSLFDDGRTLTRQHRYRDYASEDNSLRLELSGH
LDTGFIRHNLLLGADAYHYNLKTGLYRYRGKKGEYAIDIFEPQYGSVQPEVSLLYENEET
QKAWGTYLQDQMDLTEKWKLHLGLRFDSYQQDIRETAKETLSEQTDNRVSPKVGLVYLWS
DALNFYSSYSEGFLPLSGTDYAGNPFEAEESQSVELGMKFNAAWLNDLAINGSLAVFDAK
KSNILTSDPVNVGFSATLGEAKSTGLELDIAADLTESLQGRLSYAYLNTRTANDTLNVDF
GVQIPAGSPLVNVPKQTASILLKQDLNDFSIDGHLGLSWRYIDSRLGDSADPSFQLPSYQ
LVGLFMNTHLSDNLSLGVNLDNLLDEHYIASSYSALWAVPGEPRSIKVSVSYEF
NT seq
2145 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacttatttagctttcccaaagcgcgtagcgcttttactgggcgctttcgttgcgttc
aattctccaatggtgtttgccgcgaaggagcttcaatcgaatgaacaaattaccgattca
gatattgagcgtttaagtatccattatcgtcaagcctaccgtggtaatgtacccgcagag
gcacttccccaagcgattagtgtgctggatgaacaattaataaaagatgcgggcctgaca
aggtttcaggatgttctggattattctgccagtgtagcgcggcaaaataatggtggtggt
ttatgggatagtttttctttgcgcggttttccgggcaatgaaaatatgccatcgggttat
ttaattaatggctttaatggtggacgaggctttagtggccatagggatttgtctaatgtc
gcctatgtggaaatattaaaaggcccaggttctgcgctttatgggcgttctgaacctggt
ggcacagtcaatatcgtgactaagaaaccccaatatgaaagcagtggttatttaaaggca
tcggctgggagtttcgaccaatatcggttagaaggcgatgttacctctggtttaaccgag
tctgtggcgtttcggatcaatggcgcttggcaggaatacgatagttttcgtgattatgtg
tttagtgataagaaaatcgttacgccttctgtacgttggcaggtttccgataaagcctca
ttactctatgagcttgagtatcttaaacaggagcagttatttgaccgcggttttatcgta
ctcaataacgatatcaagacagtgccgcgttcacgttatctaggtgagcctaatgatggc
gcaacgaaggtgaatgccactgggcatcaactgacctatgactatgaattaaatgatgat
tggtcattaacggcgggttataactatcgcgattccaccttaaagggattttcctccgat
gctgagctggcagcggggcgtcaatccttgtttgatgatggccgaacactgactcgccag
catcgatatagggattatgcctcagaggataattcccttcgtcttgaattaagtggtcat
cttgatacgggttttattcgtcataatttgctgcttggtgccgatgcctaccactacaac
ctgaagacggggctttatcgctatcgaggcaaaaaaggcgaatatgccatcgatattttt
gagccgcaatatggcagcgttcaacctgaggtaagtttactgtatgagaatgaggaaact
cagaaggcatggggcacttatcttcaagatcaaatggatttaactgaaaagtggaaatta
catttaggactgaggtttgatagttatcagcaagatattcgtgaaacggctaaagagacg
ctatcggaacaaaccgataatcgggttagccctaaagtgggtctcgtctatttgtggtca
gatgcattaaatttttatagttcttactctgaaggatttttaccgctttcaggaactgac
tatgcggggaatccatttgaagctgaagaaagtcaatctgtagagctgggcatgaagttt
aatgctgcttggcttaacgaccttgccataaatggtagtttagccgtgtttgatgccaaa
aagagcaatattttaacctcagatcctgtgaatgtagggttttcggctactttgggggaa
gcgaaaagtacaggacttgaattagatatcgcggccgatctgactgagtcattacaaggc
agactatcctatgcctatcttaatacgcgtacagccaacgatactttgaatgttgacttt
ggcgtacaaatacccgcaggaagtccactggttaacgtgcctaaacaaaccgcaagtatt
ctgttgaaacaagatctcaatgatttttccattgatgggcatttgggattaagttggcgc
tatattgattcgcgcctcggcgattctgccgatcctagctttcaattgccttcttatcag
ttagttgggttgtttatgaacacccacttaagcgacaacttaagccttggtgtgaatctg
gataacttactggatgaacattacatcgcgagtagctattccgctctttgggccgtgccg
ggtgagccacgtagcattaaagtgagtgtcagctatgaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
