Shewanella sp. W3-18-1: Sputw3181_1461
Help
Entry
Sputw3181_1461 CDS
T00453
Name
(GenBank) polysaccharide export protein
KO
K01991
polysaccharide biosynthesis/export protein
Organism
shw
Shewanella sp. W3-18-1
Pathway
shw02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shw00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
Sputw3181_1461
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
shw02000
]
Sputw3181_1461
Transporters [BR:
shw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sputw3181_1461
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLBB
SLBB_2
Poly_export
Caps_syn_GfcC_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM24303
UniProt:
A0A6N3J330
LinkDB
All DBs
Position
1650150..1652636
Genome browser
AA seq
828 aa
AA seq
DB search
MLQQIKKFIIVGLSATILMGAQAQAVTPSPQMIEQFKQLPKSEQERLARQYGIDPSMITG
ASATSTVIENPAVVTPRAATNNVVDQSEDDKLNQATKTEAKVEAIEDKKENQLKRFGYDL
FAGSPSTFAPVSDVPVPAEYMMGPGDTLNVQLFGKENNQFTLTVGRDGAVQFPNLGPISL
VGLTFAETRELLQQKISQSMIGIESNITMGELRSIRIFVAGDAYKPGSYTVSSLSTITQA
LFISGGVNQIGSLRDIQLKRSGRTIGRLDLYDLLLRGDASGDMRLQSGDVVFIPSSGGTV
SVMGEVRRPAIYELKNNETMADVINMASGLNPGAYPKASTVERYSKDSVKTVISVDLTEN
SGLSTQAKNGDLLNVRSASSRIDNAIALSGAVIRPGKYQWTNGLTVADLLPSIWGDLTIS
ADLDYSLLVREINQRGDIEVERINLGRAIGEPKSHYNPKLKPRDSIIVFDYADREALLKP
IIQKLREQSRFGDAAKLVNINGNVRFPGQYPITVNADVKELLIAAGGLEEGAYTLSAELT
RQQVSEQNGVTVEHMQLSLDRVMQNDPAANIKLQSRDVLTVRTLPDWQDTRWITIKGEVK
FPGTYSIQRGETLKDVLARAGGLTSDAAPRSAVFLRQSIKEKEQLEIAKLADELRREIAA
KALTKDTPTVGYNDAQMMLNQLENVKTVGRLVVDINAIQLGIESANLKLEDADALFIPAT
NQTVSVMGQVQHPSTHRYKQGLTFDQYLALSGGARKRADESRSYILRADGSVEMPSSSFW
FNGGSVIEPGDTIVVPLDTEYKDNLTLWTQVTGIIFNTAVAVSAIAGI
NT seq
2487 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgttacaacaaatcaaaaaattcatcatagttggccttagcgccacgatattgatgggc
gcgcaggcgcaagccgttacgccctctccgcaaatgattgaacaattcaaacaactacct
aaatcagagcaagaacgtttagctcgccagtacggtatcgatccgtcaatgattacggga
gcctcggcgacctctacagttattgaaaacccagccgtggttaccccacgtgcagcaaca
aataatgtggttgatcaatctgaggacgataagcttaatcaagcaactaaaactgaagcg
aaagttgaagcaattgaagataaaaaagaaaatcaactcaagcgttttgggtatgatctt
tttgcgggctctcccagtacctttgccccagtttccgatgtgccagtgcctgccgaatat
atgatgggcccaggtgacaccttaaatgtgcaactttttggcaaagaaaataatcagttt
acattaaccgtaggccgcgatggcgcagtgcaattccccaatctgggccctatttcacta
gtcgggttaacctttgctgaaacacgcgagttactacaacaaaaaatcagccaaagcatg
ataggcattgagtccaatatcactatgggtgagttgcgttcaattcggatttttgtggcg
ggcgacgcttacaagccaggatcctacacagtgtcaagcttatcaactattacccaagcc
ctgtttatctcgggtggcgtaaaccaaatcggtagtttgcgtgatatccaattaaagcgc
tccggtagaactattggccgattagacttgtatgatttattgctccgcggcgatgcttcg
ggggatatgcgtttacaatctggtgacgtagtctttattccatcatctggtggtacagtc
agtgtgatgggggaagttcgtcgcccggcgatttacgagcttaaaaataacgagaccatg
gccgatgttattaacatggccagtggcttaaaccctggtgcataccctaaagccagcacg
gttgaacgttacagtaaagactctgttaaaacagtaataagcgttgatttaactgaaaac
tcaggcctaagcacacaggctaaaaatggcgacttactcaatgtgcgctcagcatcaagc
cgtattgacaatgctattgcgctttctggcgccgtaattcgcccaggtaaataccaatgg
actaatggcttaactgttgccgatttattgccttcgatctggggtgacttaaccatctct
gcggacttggattacagtttgttggtgagagaaattaaccaacggggcgatattgaagtt
gagcgcattaatctaggtcgtgctattggtgaaccaaaatcccattacaatcccaagcta
aaaccacgtgattcgattattgtgtttgactatgctgaccgtgaagcgttgctaaaaccg
ataattcaaaaactaagagaacaaagccgttttggtgatgcggccaagctggttaatatc
aatggtaatgttcgcttccctggtcagtacccaataacggttaatgcggatgttaaagag
ttactcatcgccgctggtgggctagaagaaggggcatataccttatccgcagagctgact
cgtcaacaagtatctgagcaaaatggtgtaactgttgagcatatgcagctaagtttagac
cgtgttatgcaaaacgatccagcagcgaacataaagctgcaaagccgtgatgtattaacg
gttcgtaccttgcccgattggcaagatacacgttggataactattaaaggtgaagttaag
ttccctggtacttatagtattcagcgcggtgaaaccctcaaagatgtgttggcccgtgcg
ggtggcttaacatccgacgccgcaccgcgtagtgcagtatttttacgccaatcgattaaa
gaaaaagagcaacttgaaattgctaaacttgctgacgaactacgccgcgaaattgcggct
aaagccttgaccaaggatacgccaacggtaggttataacgatgcacagatgatgcttaat
cagctagaaaacgtcaaaacagtgggccgcctagtggttgatatcaacgctattcagctc
ggtattgaaagtgcaaatttaaagcttgaagatgccgatgcgttgttcattccagcaacc
aaccaaaccgtttctgtgatgggccaagttcaacacccaagcactcacagatacaagcaa
gggttaacttttgaccaatatttagctttatccggtggtgcgcgtaagcgtgctgacgag
tcacgctcatatatcctaagggccgatggctcggtcgaaatgccaagttcctctttctgg
tttaatggcggtagcgtcatagagcctggtgatactatcgtcgtgccattagataccgaa
tacaaagataacctaacgttgtggacgcaagttacgggcattatctttaataccgcagtt
gctgtatctgctattgcaggaatctag
DBGET
integrated database retrieval system