Shewanella sp. W3-18-1: Sputw3181_2400
Help
Entry
Sputw3181_2400 CDS
T00453
Name
(GenBank) Endonuclease/exonuclease/phosphatase
KO
K07004
uncharacterized protein
Organism
shw
Shewanella sp. W3-18-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shw00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
Sputw3181_2400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
LTD
K319L-like_PKD
Exo_endo_phos
DUF4131
PLipase_C_C
Bact_surface_Ig-like
InlK_D3
ChitinaseA_N
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM25224
UniProt:
A0A6N3J5V4
LinkDB
All DBs
Position
complement(2768856..2771690)
Genome browser
AA seq
944 aa
AA seq
DB search
MFNTKTLLALAISSVCGLAHGADNLIISEYVEGSGNNKAIELYNPTTDVIDLSQYQLRFY
FNGSTNVGTTIALTGSLAAGATYVVADNDASADILAVTNQQSTASFFNGDDAIVLTYQNQ
VIDSLGQVGVDPGAEWGSGLLSTQDNTLRRNPNLLIADTIIDDEVNFSTWLGFAKDDISD
LGKFSAGTPTDPVDPPPSSLVCGEDATAIHTLQGAGAVSPLNGQTLVVEAVVVSNQEAGL
KGIFMQMADHEVDNDPLTSEGVFVYTGNAPTAYVAGDRIRLKAKVTEYQGLTELTTVSEH
KLCATGQALPTAAVVTLPVNSSDDFEPFEGMRVRFSQDLVVNEVYNLGRYGEISLGSQRH
FIGTQVAAPGADALAVSAANQRDSILLDDGLTVQNPDPVQFPAPGLSASNTVRVGDSVTS
LTGVMHYGFNLYRIMPTETVSFVAENPRPVAPTLVDGGNLKVASFNVLNYFNGDGQGAGF
PTARGANTLSEFERQKAKIVSAMVGISADVFGLMEIENDGFGANSAIADLVAGLNAAVGE
ARYAYIAPTGINAIGTDAITVGLIYRRDKVTPKGAARILSSANSPLDDNQQPLFNDTRNR
PMLTQAFSVNGSDEGVVVAVNHLKSKGSECAGDPDLNDGQGNCNSTRTRAATAVGQWLGE
QYPEQGVLLIGDLNAYAKEDPLTALANAGFSELFAELRKPNPYTYVFSAESGQLDHALAN
AELLDKVVDVTQWHINTDEPRVLDYNEEFKTPAQIQDLYSTDAYRSSDHDPVVISLLLEA
EKVAPVASFTQVVNGATVQLTSTSSDSDGHIVSAEWNLGDNTVAVGNVVTHSYRQSGEYQ
VTLTVTDNDGLTHSISQKVTVVVENVKKPPVAQIQRINLWLVDMFISTSYDTDGVIKQHK
WTFDNGTRANGQVVLRLARRGQHTVELTVKDNDKLTDTTTLTYR
NT seq
2835 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaacacgaaaactttgctggcgttagccatcagcagcgtctgtgggcttgcccat
ggcgcggataatttaatcatttctgaatacgtcgaaggcagtggcaacaataaagccatc
gaactgtataacccaactacagacgttattgatttaagccaataccaattgcgtttctat
ttcaatggcagcaccaatgtcggtacgactattgcgctcactggctcattagcagcggga
gcgacttatgtggttgccgataatgacgcgtctgccgatattcttgcggtgacaaatcaa
cagagtacagcaagtttttttaatggtgatgatgccattgttctgacatatcaaaatcaa
gtgattgatagcttaggtcaagtgggcgttgatccgggagcagagtggggcagtggtttg
ctttccacccaagacaataccctgcgtcgtaatcctaatttattgattgcagataccatt
attgatgatgaggtgaactttagtacttggctgggctttgctaaggatgatatctcggat
cttggtaaattcagcgcaggcacgccaaccgatccagtcgaccctccaccaagttcttta
gtgtgcggtgaagatgccacggcgattcatacgcttcaaggcgctggagctgtaagcccg
cttaatggccaaaccttagtggttgaggcggttgttgtcagtaatcaagaagccggtctt
aaaggcattttcatgcaaatggctgatcatgaagtcgataacgacccactgacctcggaa
ggtgtgtttgtgtatacggggaatgcaccaaccgcgtatgtggcgggcgatcgtattcgt
ttaaaagcaaaagtcaccgaatatcaaggtttaacggaattaacgaccgtctctgagcac
aagttatgtgccacaggtcaagcactaccaacggctgcggtagtgactttacccgttaac
agcagtgatgatttcgaaccttttgaggggatgcgtgttcgttttagccaagatttagtg
gtgaacgaagtctataacctcggtcgttatggtgaaatttcattaggcagtcagcgtcac
tttattggtacgcaggtcgctgcaccgggcgcagatgcgctggcggtgagcgcagccaac
caacgggacagtattttattggatgatggtttaacggtgcagaatcccgaccctgtgcaa
ttccccgcccctgggcttagcgcatcaaacacagtgcgtgtgggcgatagcgtcacatcg
ctcacaggtgtgatgcactatggctttaatttgtatcgcattatgccaacggaaacggtg
agctttgtggcggaaaatccacgccctgttgcgcccacattggttgatggcggcaattta
aaagtcgctagttttaacgtgcttaactacttcaatggcgacggccaaggcgctggtttc
ccaaccgcgcgtggtgccaataccttaagcgagtttgagcggcaaaaggccaagattgtc
agtgccatggtgggcattagtgccgatgtattcggcttgatggaaatcgaaaacgatggc
tttggcgctaattcagctattgctgatttagtcgcaggtttaaatgccgcagtgggtgag
gcgcgttatgcgtatatcgcgccaacaggcataaatgcaattggcaccgatgccatcact
gtcggcttgatttatcgtcgtgataaagtcacaccgaagggtgctgcgcgcattctttcc
agtgccaattcacccttagatgataatcaacaacccctgtttaacgataccagaaaccgt
ccaatgttgacgcaagcctttagtgtgaatggcagtgatgagggggtggttgtcgcggtg
aatcaccttaaatctaagggcagtgagtgtgcgggcgatcctgatcttaacgacggtcaa
ggcaactgtaatagcactcgtacccgtgcggcgactgctgttggtcaatggttaggcgag
caatatccagagcaaggcgtgctgctgattggtgatttgaacgcctatgcgaaggaagat
ccattaacagccttggctaatgcgggctttagtgaactgtttgctgagcttagaaaaccc
aatccatacacttatgtgttctccgccgaatcgggtcagttagaccatgctttagcaaac
gccgagttactggataaagtggtggatgtaacacagtggcatattaataccgatgaacca
cgcgtattggattacaacgaagagtttaagacgcccgctcaaatccaagatttatactca
accgatgcttatcgctcatcggatcacgatcctgtggtgatttcactcctgcttgaagcg
gaaaaagtggcgccagttgccagtttcactcaagtggtgaatggtgcgactgtgcaactg
acatccacttccagcgacagtgatggacacattgtttctgcggagtggaacttgggtgat
aatactgtggcagtagggaatgttgtcactcacagttaccgccaaagcggtgagtatcag
gttacactcactgtgacggataatgatggtctcacccatagcatctcccaaaaggtgaca
gtggttgttgaaaatgtgaaaaaaccgccagtcgcgcaaattcagcgtattaatttatgg
ttagtcgatatgtttatttcgacgagctacgataccgatggtgtgatcaaacaacataaa
tggacgtttgataatggcacccgcgctaacggtcaagtggtattgcgccttgcccgtcgt
ggacaacacacagttgaactgaccgttaaagataacgacaagttaaccgataccacgaca
ctgacttaccgttaa
DBGET
integrated database retrieval system