KEGG   Shewanella sp. W3-18-1: Sputw3181_2851
Entry
Sputw3181_2851    CDS       T00453                                 
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
Organism
shw  Shewanella sp. W3-18-1
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF PAS_3 5TM-5TMR_LYT PAS_9 PAS PAS_4 PAS_8 PAS_11 Diguanyl_cycl_sensor
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABM25668
UniProt: A0A6N3J735
LinkDB
Position
complement(3269242..3272298)
AA seq 1018 aa
MDNSIFFPLVQNAALLLALVFLYDAIPKKHQRQYFLLWRVIIGFLIGGIGITIMSTPWMY
QPGIIFDTRSVLLCISGLFFGGLPTLIAVALTGFYRLSIGGDAMWIGVAVIVSSGLIGVI
WRQYRKSYLANISAKEMLCFAYTVHIVMLLWFFTLPLPVALPLLAKLSLPVLTVYPLATW
LLSRLLSRRFELERDEQIRLQDDFLFRSQFTVGNIGIAITGIDQKWMKVNPHLCQMLKYT
ENELLNMTWKQLTHPDDIEADIVKFELMLAGKIDNYEMDKRFIAKDGSIVYTHMTVACKR
ANNRVLLVIAGYLDVTAQTLADREVLASREQLELVLNSSDLGVWDWDIRNDRIERNARSA
DILGCDIDMLNANSRQWMDAIVAEDRPKVLHSIEAHIRGETPQHKMEYRLNTLNRQVRWI
LDTGKVVSRDANNNALRMCGTYTDITEAKLIEESLKLSALVYDNSSEAMSVLDEKGVIIT
VNAAFSDITGYKAKEVCGQHIRLLYCDINGRDFYDKMNNAINQKGQWQGEMLQRRKNGEE
YVIWLTINTIKDKEGMPYRRVALFSDITDKKQNEHLIWKQANYDTLTGLPNRRMLLEYLG
AEIKNADRNQDHFALLFLDLDYFKEVNDTLGHEMGDLLLIETASRLKSCVRDADVVARLG
GDEFTVVLSAMADHKGIERVAEHILRRIAEPYLLGEETAYITASIGITLYPDDATSIEGL
LKHADQAMYAAKDQGRNRFNYFTPSMQEYAKYRMRLIQDLRQAVSNKEFELHYQPIVSLT
TGEVAKAEALIRWTHAERGSVSPGEFISVAEDTGLIVEIGNWVFEQAARQSAAWRDELGV
DIQISVNKSPIQFRDEGALLHNWLELLQDLNITGAGVCVEITEGLLLDASMGVTEKLLAY
RDAGVQVSLDDFGTGYSSLAYLKKFDIDYLKIDQSFTRHIDTDTNDQILCEAIIVMAHKL
GMKVIAEGVETEAQRQVLLSAGCDYGQGYLFSKPIAAIDFAQKYLATPKNLSSELAPA
NT seq 3057 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggataacagcattttttttccgttagtacaaaatgcggcattgttactggcattagtt
tttttgtatgacgcgatccctaaaaaacatcagcggcaatattttctgctgtggcgtgtc
attattgggtttcttataggtggtattggtatcactattatgagtaccccttggatgtat
caacccggcattatctttgacacccgttccgttctcctgtgtatttcaggtcttttcttt
ggtggtttaccgacattaattgcagttgcgctgactggattttaccgtcttagtatcggt
ggtgatgccatgtggattggtgttgccgtgatagtgtcatctggtttaattggagtgata
tggcgccaatatcgtaagtcttatcttgctaatatttcggcgaaggaaatgctttgcttt
gcctatacagtgcatatcgtcatgttgttgtggttttttacactaccgctgcctgttgca
ttgcccttacttgcgaaactcagtttgcctgtactgacggtttatccccttgccacttgg
ctgttgagccgcttgttgtccagacgctttgagcttgagcgtgatgaacaaattcgcctt
caggatgacttcctatttcgtagtcaatttaccgttggcaatatcggtattgcgataacg
ggtatcgatcaaaaatggatgaaagtgaatccacatttatgtcagatgctcaaatacact
gagaatgaactgctaaatatgacatggaagcagctcactcaccctgatgatattgaagct
gatatcgttaaatttgagctaatgctagcgggtaaaattgataattatgaaatggataaa
cgctttatcgctaaggatggctcaatcgtttatacccatatgacagtcgcttgtaaacgc
gccaataatagggtgctcttagtgattgcgggctacttggatgtgactgcacaaactttg
gccgatagagaagtgcttgccagtcgcgagcaacttgaactggtgttaaacagtagcgat
cttggggtatgggattgggatattcgcaatgaccgtatcgaacgcaacgcccgtagtgct
gatattctgggctgtgatattgatatgcttaatgctaatagccgccaatggatggatgcg
attgttgccgaagataggcctaaagtgctgcattccatagaggcgcatatccgcggagaa
acgccacagcataagatggaataccgcttaaatacgctcaatcgtcaggttcgttggatc
cttgataccggtaaagttgtgagtcgagatgccaacaacaatgcactgaggatgtgtgga
acttacactgatatcactgaggctaaactgattgaagaatcattaaagctctcagctctg
gtgtatgacaatagttccgaggccatgagtgtgcttgatgaaaagggcgtaatcatcaca
gtgaatgccgcttttagtgatatcacaggctacaaggctaaagaggtctgtggtcagcat
attcgtctcttgtattgcgatattaatggccgcgatttttatgacaagatgaataatgcc
attaatcaaaaaggccagtggcaaggtgagatgctacagcggcgtaaaaatggcgaagaa
tatgttatttggttaaccatcaataccatcaaagataaagagggtatgccctatcgccga
gtcgccttattttctgatattaccgataaaaagcaaaacgaacatttgatatggaaacag
gcaaactacgatacattaacgggcttacctaatcgccgaatgttactggaatacctcggg
gcagagattaaaaacgcagaccgaaatcaagatcattttgcattattatttctagactta
gattactttaaagaagtgaacgataccctagggcatgaaatgggggatctactgctgatt
gaaactgctagccgtttaaaatcctgtgtgcgtgacgctgatgtcgtggcccgtcttggg
ggggatgagttcactgttgtactcagtgctatggcggatcataagggcattgaacgagtg
gctgagcatattctcagacgcattgctgagccttatcttctgggggaggaaacggcttat
atcactgcaagtatcggtattacgctctatccagatgatgctacaagtattgaaggtttg
cttaaacatgcggaccaagccatgtatgccgcgaaggatcaaggacgtaatcgatttaac
tatttcacgccgtcgatgcaggaatatgctaaataccggatgcgacttattcaggattta
cgtcaagcggtgagcaataaggaatttgaactccattatcaaccaattgtttcgctcaca
acgggagaggtggctaaagcggaggcattaatccgttggacccatgctgaacgcggtagt
gtatcgcccggtgaatttatttccgttgccgaagacacgggtttgatcgttgaaattggt
aactgggtatttgagcaagctgcacggcaaagtgcagcatggcgtgatgaattaggtgtt
gatattcaaatcagtgtgaataaatcacccatccaatttcgcgatgaaggtgcattatta
cacaactggttggagctacttcaggatttaaatattactggggcaggggtctgtgtcgaa
attactgaaggtttattgttggatgcgagtatgggggtcactgaaaaactgctggcttac
cgtgatgcaggggttcaagtctcgttagatgattttggcacaggttactcatcgctcgct
tatttaaaaaagtttgatattgattaccttaagattgatcaatcctttactcggcatata
gatacagacaccaatgatcagatactgtgtgaggccattattgtcatggcccataaattg
gggatgaaagtcattgccgaaggggttgaaaccgaggctcagcgccaagtgctactctct
gcggggtgtgattatggccaaggctatttattttctaaacccattgccgcgattgatttt
gcacaaaagtatttagccacacctaaaaatctatcttctgagttggcgccagcgtaa

DBGET integrated database retrieval system