Shewanella sp. W3-18-1: Sputw3181_4050
Help
Entry
Sputw3181_4050 CDS
T00453
Name
(GenBank) TonB-dependent siderophore receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
shw
Shewanella sp. W3-18-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
shw02000
]
Sputw3181_4050
Transporters [BR:
shw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Sputw3181_4050
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM26852
LinkDB
All DBs
Position
complement(4655062..4657167)
Genome browser
AA seq
701 aa
AA seq
DB search
MVFKYSIVGLAVGAALMAMPVLADDATDANIERIKVTGRTFNDYKVGSASGAMRGDINLM
DTPQSVNVIPDFVTDEQLATNLAEVLVNDSSVTAGTTRWNRQVFSIRGFEIDSGNGYLIN
GHQQWSHYVQPIETLQQVEVLKGPSSMLYGQSGPGGLVNMVTKKPTYDSMLDLGFDTDGY
GSTRAQLDAGGSLNDAQSIRYRGVLVKQDTKYWREYSTTEENQERDRWLGYLNLEFDVSD
DVTLSVKYDHTQDKAGIDAGGWLDAQGNVIGGRKTVWDAPWAFTDNTISNLGADITWQMT
DDWKVKVGYNDQQFDRQRFDSAPVYTADPFTNGYRISPFDRYDDWQHKTAFVDFTGEFSL
AGMEHQFLIGANYLDYFYQQQIKRGTAQTVIPGQVVIKPELDYHQGNLSIPSEYKYYGFY
LQDLMTLNEQWKLLAGVRYDEQKKDGVGGNSYAVSPKFGVIYSPMSNGSIYVNYSKSFAP
KGSVTSSEDVNEGDNLKPEYGTQYELGTKWELFNDSLLLTAAVFDITVSNVVIELDSPIP
SKKTMTTQGGEQHHRGFEIGAQGQLGDSWFVTSSMMYLDAEYNTGAGKIGGKSLDGKTPI
DAPEWSANIWTRYEVTDNFAMNFGAIYVGERFADDVNTITKDGYVRFDIGAAYTMDIMGK
DVSLRANVRNLFDTEYLDGGSDRMVTIGQDRNFSVAVEAKF
NT seq
2106 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtatttaaatattcaatcgtaggtcttgctgttggcgcagcattaatggctatgcct
gttttagctgatgatgcaacagatgccaatattgaacgtattaaagtcactggccgtact
tttaacgactataaagtgggttctgcatcgggtgctatgcgtggtgatatcaacttaatg
gatactccacagtccgttaatgttatccccgattttgttacagatgaacagttagccact
aacctcgctgaagtcttagtcaacgactcaagcgtaactgctggtacaacgcgttggaac
cgccaagtctttagtatccgtggtttcgagattgattccggtaatggttatcttatcaat
ggccatcagcagtggtctcactatgtacaacctattgaaaccctacagcaagttgaggtg
ttaaaaggcccttctagcatgctttatggtcagtctggtcctggtggtttagtgaatatg
gtcactaaaaagcctacctatgactccatgttggatcttggttttgataccgatggctac
ggctcaacccgcgcacaattagacgctggtggcagcttaaatgatgctcaaagtattcgt
taccgtggtgtgttagtgaaacaagacactaaatactggcgtgagtattcgaccactgaa
gaaaaccaagagcgtgaccgttggttaggttacctaaacctagagtttgatgtcagcgac
gatgttactctgtcggttaaatacgatcatacccaagataaagcgggtattgatgctggt
ggttggctagatgctcaaggtaatgtgataggtggacgtaaaaccgtttgggatgcgcca
tgggcctttactgataatactatttcaaatttaggtgccgatattacttggcaaatgact
gacgattggaaagttaaagtaggttataacgatcaacaatttgaccgtcaacgtttcgat
tctgcgcctgtttatacggcagatcctttcacaaatggttatcggatcagcccatttgat
cgttacgatgattggcaacataaaacggcttttgtggactttacaggtgagttttcttta
gcaggtatggagcatcaattccttattggtgctaactacttagactatttctaccaacag
caaattaagcgtggcacagcacaaaccgtcattcctgggcaagtggtgattaagccagag
cttgattaccatcaaggaaacttgagtattccaagtgaatacaaatattacggtttctat
ctgcaggatttaatgaccttaaatgaacaatggaaattgcttgctggtgtgcgttatgac
gagcagaagaaagatggtgtaggcggcaacagttatgccgtatcgcctaagtttggggtg
atctactcaccaatgagcaatggtagtatttacgttaactattcaaaaagcttcgcacca
aaaggttctgtcaccagttctgaagatgttaatgaaggtgataaccttaagcctgagtat
ggaactcaatatgaattagggactaagtgggagttatttaatgatagcttactattaact
gctgctgtgtttgatattacggtttcaaacgttgtcattgaacttgacagccctataccg
agtaaaaaaacaatgacaacccaaggtggtgagcaacatcaccgtggctttgaaattggt
gcccaaggtcagttaggtgatagctggtttgtgacttcatctatgatgtatttagatgcg
gaatataatactggtgcaggcaaaatcggtggcaagagcttagatggtaaaacccctatt
gatgctcctgagtggtcagccaatatttggactcgctatgaagtgacagacaactttgcg
atgaactttggtgctatctatgtcggagagcgttttgctgatgatgtaaatactatcacc
aaagatggctatgtacgttttgatatcggtgcggcctacactatggatatcatgggtaaa
gatgtgagccttcgcgccaacgtcagaaacctctttgatactgagtacctagacggtggc
agtgatagaatggtcactatcggccaagaccgtaacttcagtgttgctgttgaagctaag
ttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
