| Entry |
|
|---|
| Symbol |
ERCC3
|
|---|
| Name |
(RefSeq) TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit
|
|---|
| KO |
|
|---|
| Organism |
shx Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
|
|---|
| Pathway |
|
|---|
| Brite |
KEGG Orthology (KO) [BR:shx00001]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03022 Basal transcription factors
MS3_00003304 (ERCC3)
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
MS3_00003304 (ERCC3)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:shx03021]
MS3_00003304 (ERCC3)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:shx03400]
MS3_00003304 (ERCC3)
Enzymes [BR:shx01000]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
MS3_00003304 (ERCC3)
Transcription machinery [BR:shx03021]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Basal transcription factors
TFIIH
MS3_00003304 (ERCC3)
DNA repair and recombination proteins [BR:shx03400]
Eukaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TFIIH complex
MS3_00003304 (ERCC3)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
ZW:32057910..32106970
|
|---|
| AA seq |
948 aa
MGRSDSRKRGRNTKSVKESDSKRTRTTICRPEDEDSTMSGSLDFDNESNEDAYDNNEVND
FNIRKIGKVSSEIDDDLDDNVEHNDNDDEDADIDEYESGIMDADELRVASRAQMTKTRQQ
HDSSVNKPTETTVVCTPKDEFGAKDMRNILKLRLDHPSRPLWIGPDGHIFLETFNPLARQ
AQDFLIAISEPVCRPLHIHEYKLTSYSLYAAVSVGLRTGEIIGCLRRLCKTNLPEGIIAY
IRSCTLSYGKAKLVLKGGRYFVESPHRQFLHQLANDKTVQQCLNKTKIITEDDDIKQQVV
EVVKLYNAASLVIQPQHQQEDSREIPADKETGMQDEMLRLYARLDADEEAGETNSILVDT
TKKSGNNFWEQPSDTVNINAIGIESDVADREGELMDIKDNGNTAGIKLVFDSSVPNDTKT
SAVLALEVNQDQIEILQRRCIELEVPLLTEYDFRLDRANKDILIDLKASTTLRPYQEKSL
RKMFGNGRARSGVIVLPCGAGKTLVGVTAACTIRKPTFVLCTSGVAVEQWRAQFKLWSTI
EDGQILRFTSDAKDRPNINSHICISTYSMIAHSAKRSYEADRMMSWIRSQEWGLMILDEV
HTIPAKMFRRVLTLVQAHCKLGLTATLVREDDKITDLNFLIGPKLYEANWLELQQRGFIA
RVQCAEVWCPVTPEFYREYLNMKSMKKLLLAAMNPNKFRVCEYLIRYHERRNDKIIIFSD
NVFALKYYATKMGRPFLYGPTGQAERMQILQNFQHNPNVPAIFVSKVADNSFDLPEATVL
IQISAHGGSRRQEAQRLGRILRAKRGMDAEAYNAFFYSLVSQDTMEMQYALKRQRFLVNQ
GYSYKVITRLSGMETESLKLSTKQEQAELLNRVLASTDEDAMEEKLPTDPDSFNYTNIST
GISGLIRKSSKMSSLSGADDAIYVDTSSSAARKDKLKERHPLFRLFKR |
|---|
| NT seq |
2847 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgggtcgttcagacagtcgtaaacgtggacgtaatacaaaatctgtcaaagaatcggat
tcaaaaagaactagaacaactatttgtcggcctgaagatgaagattctacgatgtcagga
tcattggattttgataatgaatctaatgaagatgcttatgataataacgaggtcaatgat
tttaatatcaggaaaatcggtaaggtcagctcagagattgatgatgatttggatgataat
gttgaacataatgataatgacgatgaagatgctgatatcgatgaatatgaatcgggtata
atggatgcagatgagttacgtgttgcttcaagagcgcaaatgacaaaaacccgtcagcaa
catgattcttcagtgaataaacctacagagacaacagttgtttgtacaccgaaagatgaa
tttggtgctaaagatatgaggaatatattaaaattacgtttagatcatccatctcgtcca
ttatggataggtccagatggacatatttttctcgaaactttcaatccattggctcgtcaa
gctcaagattttttgattgctatttcagaaccagtctgtcgacctttacacatacacgag
tacaaactcacctcttattcattatatgcagctgtttcagttggtttacgtactggtgag
ataattggttgtctacgtcgtttatgcaaaactaacctaccagaaggtattattgcatat
attcgtagttgtacattatcatacggaaaggcgaaattagttttaaaaggtggtcgttat
tttgttgaaagtccccatcgtcaatttttacatcagttagcaaatgataaaactgtacaa
caatgtttgaataaaacaaagattattacagaagatgatgatattaaacaacaagtagtg
gaagttgtaaaattgtataatgctgcgtcattagtaatacagccacaacaccagcaagaa
gatagcagagaaattccagcagataaagaaactggtatgcaagatgaaatgttacgtctt
tatgctcgtttggatgcagatgaagaagcaggtgaaacaaattctatccttgttgataca
acaaaaaaatcagggaataatttctgggaacaacctagcgatactgtaaatattaatgca
atcggtattgaatcagatgttgctgatcgtgaaggtgagttgatggatataaaagataat
ggaaacactgctggtataaaattggtttttgactcatctgttccaaacgatacgaaaacc
tcagctgtacttgctttggaagtgaatcaagatcaaattgaaattcttcaacgaagatgt
attgaattagaagtaccattattaacagaatatgattttcgtttagatcgtgctaataaa
gacattttaattgatttaaaagccagtacaacattaagaccatatcaagaaaaaagttta
cgaaaaatgtttggtaatggtcgagctcgttctggtgttattgttttaccctgtggagct
ggtaaaacattggttggtgtcacagctgcatgtacaataagaaagccaacatttgtttta
tgcacaagtggtgttgctgttgaacaatggcgtgcacaatttaaattatggtctactatt
gaagatggccaaattttacgttttactagtgatgcaaaagatcgtccaaatataaactca
cacatatgtatcagtacatatagtatgattgcacattcagctaagcgttcatatgaagct
gatcgtatgatgagttggatcagaagtcaagaatggggacttatgattttagatgaagtc
cacacaattccagctaaaatgtttcgtcgtgttttaaccctagtacaagcacattgtaaa
cttggtttaacagcaacattagttcgtgaagatgataaaataaccgacttgaatttttta
attggacctaaattatatgaagctaactggttagaattacaacaacgtggttttattgca
cgtgttcaatgcgcagaagtatggtgtcctgttacacctgaattttatagagaatattta
aatatgaaaagtatgaagaaattattattagctgctatgaacccgaataaatttcgtgta
tgtgaatatctcatacgttatcatgagcgtagaaatgataaaattatcatattctctgat
aatgtatttgcattaaaatactatgcaacaaaaatgggacgtccatttttatacggtcca
actggtcaagcggaacgtatgcaaatattacaaaattttcaacataatcctaatgttccg
gcaatattcgtttctaaagttgctgacaattcatttgatttacctgaagcaacagttctc
atacagatcagtgctcatggaggtagtcgtcggcaagaagctcaacgtttaggacgtatt
ttaagagcaaagaggggtatggatgctgaggcttacaatgcatttttctattcgttagtc
tctcaagatactatggaaatgcaatatgctttaaaacgtcaacgtttcttagttaatcaa
gggtattcttataaagttatcacaagactatcaggaatggagactgaatcattaaaattg
agtacaaaacaagaacaagcggaattattaaatcgggtattagctagtacagatgaagat
gctatggaagagaaattaccaactgatccggatagttttaattatacgaacatttctaca
ggcatatctggtttgattcgtaaatctagtaaaatgtccagtttatctggtgcagatgac
gctatttatgttgatactagctcgtctgctgcaagaaaagacaaactgaaagaaaggcat
ccattatttcgtttgttcaaaagatag |
|---|
