Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00004463
Help
Entry
MS3_00004463 CDS
T05004
Symbol
FER1L6_1
Name
(RefSeq) Dysferlin, limb girdle muscular dystrophy 2B (Autosomal recessive)
Organism
shx
Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
C2
Ferlin_C
FerB
dsrm_Ferlin
FerI
ELH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24593791
NCBI-ProteinID:
XP_051072566
UniProt:
A0A922LSR8
LinkDB
All DBs
Position
ZW:78699211..78817025
Genome browser
AA seq
2154 aa
AA seq
DB search
MSLILDLKYLVGLTGKGDRRIKVLFREAKLNSRIATGHDSVYFGQRISWPVSRSLDDKDV
LILKAYQIRKGLPDSLLGSLSINLYPLTRDVHSIFRENLVDSSNHPTGILLLFELRYQSP
DSTHGDLDDDLANYPLGDTDYGLEDAEYEIHQDQPPPFSSYVELNGDFNQIIDRELALAA
GDEWEVESQLSAPERKDPRIISMLGPTVYKSNQFQLGINVVEARKLVGTNINPMITVTVG
KSVQKTVTKYSTNCPFYDNYFAFDFARPKISVLTEIIRIRVFNMRSHPLARLLPGKLIGE
FITDVQTVYNEKDHAVLNKWAVIIDPKDPWKGPTGYVKLDMHVIEEGHQVKRIRREKPDH
DEIIENHLLLPRYTGMTQKRIMLSMKVSIYQAEDLPPMNTEISNKIRKAFVGENTPNLDS
YVEVSYAGHTARTKTERYNYNPIWNETIEFCDYFPTFTRTIRINVRNGGIKGELIATRLI
DIRDIMCHITGRNFPHFGPSWINLYGTPRIYTYAQMLRPEVELNQALGEGVAYRGRLLLA
IRSMEDEDVVRIGTSKVVASPVSETVAGKKSLYFLFACFSEASVIEKKLGVKNKPISYEI
SFGLYGNQLDGKRGGVELQTIELAQPNNTRERVDWCYSTTTPLNPTTDDKEYYYLNFGNK
KPCLYLTGYYEDHRSRMCIPNILEKLSEELYYQIQRVKHLFIRRKITEAKNYLRTVFLTM
AKKFSLAQESIKSCRDTASTTLLDREYSRRIRRDLRRMAMLMIHLSKHIHRNTLGEKIKD
ANALHNRLCNLSNCPQDGLPDVFISMILEHQRVGFVRIPARDIYYSAVDCERGKWSGQMA
TLYLRKQGREGVGPKGWRIQSQIRVYLWLGLIKDFTAYTFGLPGGYDKNIFKTPKPPNEL
IYLESSRFQFRCYIFIARDLIASDSSGMSDPMARVLIGPHVLQTQALYQTMSPMWDVVLY
KQVTFYQNAQSVKQNLQEVIVEIFDIDPGNDLEFMGRCFCEVNVTLDGEKYKPPRLQWWP
IFRGQTPGGELLAAFDLIQDDPQVPYENLPTFEELAAYTKEFDDRVILKSIPGMYLDDED
DLNKDSDDDDNDNELDTVDEFDDLIFDADSVLLLDNSNDIQINNTRRKQIKIGMAPPKLV
LVRRKGDYRIPDNIRPPLQRFRMEVMFWSVWGMVRQHLLPVKRPRVVVEIGGHKLESEII
NDLSKMPLFETPLKAMDIYLPVDERYWPPLVFTCFDNRILGTKITIGSHTISNARDYLVF
DNDNQSSDSASTIYMDSESDSPRKLNFNFDKTDYFNENGPSLEMLTNPSMAAAATTTTTT
TTMGPTPMKLNDNDLESKKSMETGLSSVELLADMNPNFQKYNLHYKLPDNAGDLDLVSMD
GDNFGQINIDKKPTDALPGKAHLVTTHSGPTPEQLAAADWWTRFYVTIRSGETNFDDSRY
KGEVNPLTESEDSDIEEKLEKVDVKSEKDSEEEIDMTTGTGTKLNHLNYKLKKKCWQRTH
KAEKKKLTALEKRQLEIAKRRARIEKRKKNKKNLKAKIKARFIDSKGLFLKEFIDLNYDV
ETHEDQSWVETILVYPVALEEVPDFNGFNSPFLNLPFYKGKQLEDHASESRITGFFKGNL
VIYPVNDDEPLPTEMSQLKLYKTLPIKAKFKLTVRLYVIRAIKLHPTDPNGKSDPYLIVS
LGKCVINDRDDYKPKTLNPVFGKYYEFVAHLPMDSLLSIQMMDHERVGADTLIGETHIDI
ENRFHSAHRATCGLMPKYYAHGYCQWKDNQQPTEILAKLCEKYGIEQPVYNILENKITIG
NESFFANTEIRNETGITVKSVEPLALEALHNWSLITNKDVKLVSEHVETRSLKHPDNPGL
IQGRLQMWIDMFEREVAVPPPAINISPRVPAGYELRVIVWNTADVKLTDTSLFSSERSSD
IYVKGWVKGVGIDDQKTDVHYRSLSGEGNFNWRFIFPFDYIKAEDRIIYPIKGTFDIEPH
MIKANCELTLQVWDADIITRDNFIGSLTMRLSSLPRCAKTAKSCGLHQLEPDCPRFSMFK
NRTARGWWPVTDEEDEEIVVQGKVECQLEMLNSAEAESNPAGLGREEPNGLPKPDRPDAS
FMKFLGPLNTLRYLVKYRLKWILIKIFVIFLVCLIVFLFLYSFPGAIVQKMVNG
NT seq
6465 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctttaattttggatcttaaatatttagttggattaactggtaaaggggatcgtaga
attaaagttttatttcgagaggctaaattgaattcaagaattgctactggacatgatagt
gtttattttggacaacgtattagttggccagttagtcgttcattggatgataaagatgta
ttaattttaaaagcttatcaaataagaaaaggtttaccagatagtttactaggatccttg
tcaatcaatttatatccactgactcgagatgtacattcaatatttcgagaaaatcttgtg
gatagttcaaatcatccaactggcatattattattatttgagttacgttatcaatcacct
gatagtacacatggtgatctagatgatgatcttgctaattatccgctaggagacacagat
tatggacttgaagatgcagaatatgaaattcatcaagatcaacctccaccttttagttca
tatgttgagttgaatggtgatttcaatcaaataatagatcgagaacttgctcttgctgca
ggtgacgaatgggaggtagagagtcaactatctgcaccggaaagaaaagatccgcgtatt
atatccatgcttggtccaactgtctacaaatcaaatcagttccagctaggaatcaatgta
gttgaagctcgaaaattagttggaactaatatcaatccaatgattactgtaaccgttgga
aaatctgtacagaaaacagttactaaatattcaacgaattgtccattttatgataattat
tttgcatttgattttgctcgacctaaaataagtgtacttacagaaataattcgtattcga
gtatttaatatgcgatctcatccattagcccgtcttttacctggtaaattgatcggtgaa
tttattactgatgtacaaacagtttataatgaaaaagatcatgcagtattaaataaatgg
gcagtgattatcgaccccaaagatccatggaaaggtcctacgggctatgttaaacttgat
atgcatgtcatagaagaagggcaccaagttaaacgaattcgaagagagaaacctgatcat
gatgaaataatcgaaaatcatttactattaccacggtatactggtatgacacaaaaacgt
attatgctctccatgaaagtcagtatatatcaagctgaagatttgcctccaatgaataca
gaaataagcaataaaattagaaaagcatttgttggagaaaatacaccaaatcttgattca
tatgtggaagtttcttatgctggacatacagctagaactaaaacagaacgatataattat
aatccaatatggaatgaaacaattgaattttgtgattattttccaacattcactcgaact
attagaattaatgttagaaatggtggaataaaaggtgaactaattgctacacgtttaatt
gatatacgtgatattatgtgccatattactggtcgtaattttccacattttggaccatct
tggattaatctttatggaactccacgaatctatacatatgcacaaatgttacggccagaa
gtagaattaaatcaagcacttggagaaggagttgcctatcgtggtcgactacttctagct
atacgatcaatggaagatgaagatgtagttcgaattggtactagtaaagttgttgcaagt
cctgtttcagagactgtagcagggaaaaaaagtttatactttttatttgcttgtttctct
gaagcaagtgtaattgagaaaaaacttggtgttaagaataaaccaatctcttatgaaatc
agttttggattatacggtaaccagctggatggaaaacgaggtggagttgaattacagaca
atagaacttgcacaaccaaataatacacgagaacgagtagactggtgttattcaaccaca
acaccactgaatccaacaacagatgataaagaatattattatttaaactttggtaataaa
aaaccatgtttatatttaactggttattatgaagatcatcgttccagaatgtgtatacca
aacattttagagaaattaagtgaagaattgtattatcaaatacaacgtgttaagcacttg
tttattagaaggaagataaccgaagctaaaaattacctacgtacagtttttttgacaatg
gcaaaaaaattcagtttagctcaagaatcaattaaatcatgtcgtgatactgccagtaca
acattacttgatcgagaatattcacgtagaatacgtcgtgatttaagaagaatggctatg
ttaatgattcatttatcaaaacatatacacagaaatacattgggtgaaaaaattaaagat
gccaatgcattacacaatcgtttgtgtaatttaagtaattgtccacaagatggtttaccg
gatgtttttatttcaatgatattggaacatcaaagagttggttttgttagaattccagca
cgagatatatattattcagctgtagattgtgaaagaggcaaatggagtggacaaatggca
actttatacttacgtaaacaaggtcgtgagggtgttggacctaaaggatggagaattcaa
agtcaaatacgtgtgtatttatggcttggtttaattaaagattttaccgcttacacattt
ggtttacctggtggatatgataagaatatatttaaaacaccaaaaccaccaaatgaatta
atttatctagaaagtagtcgttttcagttcagatgttatatattcattgcacgcgatcta
atagcctctgattcatctggtatgtcagatccaatggcaagagttcttattggaccacat
gttcttcaaacccaagcattatatcaaactatgagtccaatgtgggatgttgtcttatat
aaacaagtaacattttatcaaaatgctcaatcagtaaaacaaaatcttcaagaggttatt
gtagaaatatttgatattgatccaggaaatgatttagaatttatgggacgttgtttttgt
gaagtaaatgttactttggatggtgaaaagtataaaccaccacgtttacaatggtggcca
atatttcgaggacaaactcctggtggagaattacttgctgcttttgatctaattcaggat
gatcctcaagtgccatatgaaaatttacctacgtttgaagaattagctgcatacacaaaa
gaatttgatgatcgtgttatattaaaaagtattccaggaatgtacttagatgatgaagat
gatttgaataaagattcagatgatgatgataatgataatgaattggatacagttgatgaa
tttgatgatttaatatttgatgctgattctgtcttattattagataattctaatgatatt
caaataaataatacaagaagaaaacaaatcaaaattggtatggcaccaccaaaacttgtt
ttagttagacgaaaaggggattatcgaataccagataatattagaccacctttacaacga
tttagaatggaagttatgttttggagtgtatggggtatggtgcgtcaacatttattacca
gtgaaaagaccacgtgtagtcgttgaaattggtggacataaattagaatctgaaattatc
aatgatttatctaaaatgccactttttgagaccccattgaaagcaatggatatttattta
cccgtagatgaacgttattggccacctttagtttttacatgttttgataatcgtatactt
ggtacaaagatcacaattggaagtcatacaatttctaatgcacgtgattatttagtgttt
gataatgacaatcaatcatccgatagtgcaagtacaatatatatggatagtgaatcagat
agtccaaggaaattaaattttaattttgataaaactgattattttaatgaaaatggacca
agtctagaaatgttaacaaacccttccatggcagcagcagcaacaacaacaacaacaaca
acaacaatgggaccaactccaatgaaattaaatgataatgatttagaaagtaaaaaatca
atggaaactggtttatcatcagtagaattattagctgatatgaatccaaattttcaaaaa
tataatttacattataaacttccagataatgctggtgatttagatttagtatctatggat
ggtgataattttggtcaaattaatattgataaaaagccaacagatgcattacctggaaag
gctcatcttgttacaacacactctggaccgacacctgaacaattagctgcagctgactgg
tggacccgattctatgttactatacgaagtggtgaaacaaatttcgatgattctcgatat
aagggtgaagttaatccattaactgaatcagaagatagtgatattgaagagaaactagag
aaagttgatgtaaaatcagagaaagactcagaagaggaaattgatatgacaactggtact
ggtacaaaattaaatcatttaaattataaattaaaaaagaaatgttggcaaagaactcat
aaagctgaaaagaaaaaattaaccgctttagaaaaacgtcaattggagattgcaaaacgt
agagctagaattgaaaaaagaaaaaaaaacaaaaaaaatttaaaagctaaaattaaagca
agatttatcgattcgaaaggattatttttaaaagaatttattgatttaaactatgatgtt
gaaactcatgaagatcaaagttgggtagaaacaatactggtgtatccagtggcacttgaa
gaagttccagatttcaacggttttaattcaccttttctaaatcttccgttttacaaagga
aaacaattggaagatcatgcatctgaaagtcgcattacaggatttttcaagggtaattta
gtcatatatccggtgaatgatgatgaacctttaccaactgaaatgtcacaattaaagtta
tataagacattgccaattaaagcaaagttcaaactaactgtacgattatatgttataaga
gcaatcaaattacatccaaccgatccaaatggcaaatctgatccatatttgattgtatca
ttgggtaaatgtgttattaatgatcgtgatgattataaaccgaaaacattaaatccggta
tttggaaaatattatgaatttgtagcacatttaccaatggattctttacttagtatacag
atgatggatcatgaaagagttggagcagatacattgattggagaaacacatattgatatt
gaaaatcgtttccatagtgctcatcgtgctacttgtggattaatgcctaaatattatgct
catggctattgtcaatggaaagacaatcaacaaccgacggaaatattagctaagctatgt
gaaaaatatggtattgagcagcctgtttataatatattggagaataaaatcaccataggc
aatgagtcgttttttgctaatacagaaatccgaaatgaaactggtataacagttaaatca
gtagaaccattggccttagaagcattacataattggtcattgattacaaacaaagatgtg
aaattagttagtgaacatgtggaaacacgttctttaaaacatcccgataatccaggttta
attcaaggtcgactacaaatgtggattgatatgtttgaaagagaagttgctgttccacca
ccggctataaatatttcaccacgtgtaccagctggatatgaattacgtgttattgtgtgg
aatacagctgatgtaaaacttactgacacttcattattctcttctgaaagaagttctgat
atttatgttaaaggatgggtaaaaggtgttggaattgatgatcaaaaaactgatgttcat
tatagatcattatctggtgaaggaaatttcaattggcgttttatatttccatttgattat
attaaagcagaagatagaataatttatccaattaaaggaacattcgatattgaaccacat
atgattaaagctaattgtgaattgacattacaagtatgggatgctgatattattacaaga
gataattttattggatcactgacaatgcgtctttcatccttgccacgatgtgcgaaaact
gcaaaaagttgtgggttacatcaattagaaccagattgtccaagattttcaatgtttaag
aatagaactgcacgtggttggtggccagttactgatgaagaagatgaagaaattgtcgtt
caaggtaaagttgaatgtcagttggaaatgttgaatagtgctgaagccgaaagtaatcct
gctggcttaggccgtgaagaaccaaatggactgccaaaaccagatcgaccagatgcatca
tttatgaaattccttggaccattgaatactcttcgttacttagtcaaatatcgtttaaag
tggatattgatcaaaatctttgtcatattcttggtttgtttaattgtcttcttatttcta
tacagtttccctggtgctattgttcaaaaaatggttaatggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
