Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00005152
Help
Entry
MS3_00005152 CDS
T05004
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K14550
U3 small nucleolar RNA-associated protein 10
Organism
shx
Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
Pathway
shx03008
Ribosome biogenesis in eukaryotes
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shx00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes
MS3_00005152
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
shx03009
]
MS3_00005152
Ribosome biogenesis [BR:
shx03009
]
Eukaryotic type
90S particles
U3 small nucleolar RNA-associated proteins
MS3_00005152
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
U3snoRNP10
Picorna_P3A
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24588310
NCBI-ProteinID:
XP_035585772
UniProt:
A0A6A5D8Y2
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(18164642..18197740)
Genome browser
AA seq
2278 aa
AA seq
DB search
MGSTSQSYVPENSIYAHLQLSVIMFLLLFIYLLIFFKHKHRYKKMSLTDQLRALAVPITS
SYVVDSVNRKSLIYEDASKIDTQSCYSSCLKSFEKLCEMEKAFTSFASTLFSVTSCQLEM
CNLLRQEKAKLDNEISKFLCYISSFLKHFVAVQALEWLVFKFQIHIHYVEDFIRCIIPYH
ETGLFVKFIQILNFQQLPSCFQWLKPYAESGKGISRQEFARLCIREHTLIPFICTAILNY
TECCRDLVPTRLNDMTNFFLGIVTALCDSGVPEKKLIKILDSFQDVIKHGLQSTNIVPFQ
CATFLVVIRFSLKLLINRELVLDWISCILKKTRPSCEWESMRIVIQLMRNQRIPLLPPKL
TERQNVLLSKLSPEEQRIIEDEQSALVNEYNDPNKLAAECMQKFDYVQKATQFVDVDIKS
LGSKITEQKNSDDILLKEELKLKIDEIHAFLSSIPNVGCCVMNCTLSCPSGPLPNTECWL
SDVLLEIFSDECFSNNNSDQHKIHYKKVEIRHYIRLLRLVKSSIKVHVDSSKYAQGMVVA
SGTPKPKCSRKSMSSSCGLLQKGIDKVLPLLVACLSHPAATIRVEAYDILHFWLKNDLSK
DLERMPNFSTFCSNFDLTSDFSAHIDELFPEEVRELLLGDPLYSLNKVASVLIKAVVRLL
FSQTLNLGTSEACPERKFSIVCWKIGLRLLNEDTVGDILLIPSSSSEEFVRGWSGFLNLI
QCSNIHLIDLHHICLSRLSPALFASLEHSPLSMDSIKERTSILRKSTGCLQTLNRNVSST
DPYQGPQFSILDALYKLGHNNVQTDFDSVHKVFSRLHLNAVHFDYMFIRSDPSRTVGGDS
RSLFARVTEARESRRRSLRLRKTREADLELLNDDKKAYSERIRLRFLSMLLSILTEAVPR
LQSYEIASTVQNKSKSVDLSTSLTTVDTKSLNIGVKKIKDHNLPMNDLITPLVNHLTSIL
NIERNLKQIEANTNQTNVLPESGTDSDLESLPDLSDIHMDQEAADMSPVNENSCIRPLLR
QCIYKLLICITTIFAEGNRCKRPHRKRSHRKTPTDQTGLLYGLTSAQVAVDPIFLCLTVY
PDWISLHQQVLLCFIELSVMFPGALCHHLVSLVQWVACNRQLMRLDNAHNLSILGRLILV
TVPALIRASSEQISAGLYVLYLFVIRFAEFTNLARRRLALYTVLIRGLSQVTGPFITDSE
LNQSITQKQITDEIKPFKKVEAAAHGNECKISLRPKESWIGSWLWVTSLVFLNKNWQIQS
VADEVGPFLIELFCHFGWDHQVLGLCECIDFLTYLCMNSCDYKLPQVDVSENSGSVYIEI
GHSQKRLKLSSSFANPSKSPTSDLSIGVTGPLSNYVNQNTPTSFSQLASFIFNSDNTIQT
SEQIQTSLNNSTVVTLKEIWPLVNRTIQFIIALIRNPDYCDKVQTAFSDPSGLSAVYGRL
VEHIVQLMLVVATFLTKVKKSDEKMTDVVSCADETLSGLQSILVQILDSVPGRVFISMIL
DLFSCENRGLRRKALDLLSAKLTSLTANVQPVPILIDFTKMNYKSFLKSHKHLVSRNFVD
LNRTMEAGLVQFTGKLISFYNLKSDKTDGSLRSKHSTVFGSGFSRQCLACLRSLTKLLAY
HYPGEFMRALDSLMTVPSNWWINVGVTDAHQASVNSTDKPLVESNPHGHHFGSSLAESRS
LACLFFVECLQRLPPQSLYPEASATTSRLSWLLSFALDHGYTCTSFASSPKLSVKQCCSV
NSPCKSDRYMKLVTGTMHSRDQHLLASLTLVSNLLELAIIHRLCQQSKGDYSPDNTESAI
GKWLEFESTTKKNANNSAYQEPVAVTLLSFVFQLRKDNLSTLTGCNPERSSSVFRQISNL
VEHIHKLLRHVTEVSYLLTSIRIVIEKASKTNSNTLLHGALSFLSDFGESMAPIKENGVF
ASKDENQLHSFATMHATQPDITWRLIHTCLCTVVNKLNEADLRNTTELRNNDILSCLYRS
VASLISSLPDDSARLRICQQLFTWVNVQDNEKETVDQIKDITDQMLLRLSVVFRIMERIP
DYLNTEEFSELSKQLYLVDYIVLIFIIAVGNKFKGAKKLSNRLGFGRSLQCYSDGATSCV
LICIHASLSCLHKWLIGEVENVGCLDAASIGESVQYIPSVLIGLLDISCPSSDAPPINET
DIQDVLGSYLNAICGDEAYLRPLGSALTERIMHSTYWRTRLAAIRLLKFVFNHSNDHEID
NDKDITMDSKLSGPISCIVSDSLLALSEALEDDRPEVETEANKLFAELEQMGLTATKT
NT seq
6837 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaagtacttcacagtcatatgtgcccgaaaactcaatatatgcacatcttcaactc
tcagttatcatgtttttgttactttttatttatttacttattttttttaaacacaaacat
aggtacaagaagatgtcattaacagaccagctaagggccttagcagtcccgattacatcc
agctatgtagttgacagtgttaaccgcaagtctttgatttatgaagatgcttcaaaaatc
gacactcagtcttgttattcaagctgtttaaagtcgtttgaaaaactatgtgaaatggaa
aaggcttttacctcatttgccagtacattgttttctgtgacgtcatgtcaactggaaatg
tgcaatctcttacgtcaagaaaaagcaaaactcgacaacgaaatctccaagttcctatgt
tacatttcttctttccttaagcattttgttgctgtacaagctttagaatggctagtattc
aaatttcagattcatatacattatgttgaagattttattcgctgcatcattccatatcat
gaaactggtctatttgttaaatttattcaaattctaaattttcagcagttaccttcttgt
ttccagtggttaaaaccatatgctgaaagtggtaaaggcatatcacggcaagaattcgct
cgactatgtatccgagaacataccctaattccatttatatgcacagccattcttaattat
acggaatgttgccgcgatttggtgccaacaagacttaacgatatgactaatttttttttg
ggaattgtaaccgcgttgtgtgattctggtgtgcctgagaaaaaacttatcaagatattg
gactcttttcaggatgttataaaacacggattgcaatctacgaatatagttccttttcaa
tgcgccacatttttggtcgtaatacgtttcagtttgaagttgttaattaatcgagaacta
gttctcgattggatatcttgtattttgaagaaaactcgaccttcttgtgagtgggaatca
atgcgtattgtaatccaactgatgcgaaatcagcgtattcctttgttacctccaaaactt
actgagcgtcagaatgtcttactttccaaactatctcctgaagaacaacgcataattgaa
gacgaacagtcggcgctagtcaatgaatataatgatcccaataagttagcggcggagtgt
atgcagaagtttgattatgttcaaaaagctacacagtttgttgatgttgatataaaaagc
cttggatcaaaaataacggaacaaaaaaattctgatgatattttattgaaagaagagctc
aagttgaaaatcgatgaaattcatgcattcttgtcgagcatccctaatgtaggctgctgt
gtaatgaattgcactttatcttgtcctagcggacctttaccaaatactgagtgttggtta
tctgatgtgttacttgaaatattttctgatgaatgttttagtaacaataattctgatcag
cataaaatacattataaaaaagtagaaatacgacattatattcgattactaagattggtt
aagtcttccataaaggttcacgtcgattctagtaaatatgctcaggggatggtagttgca
tcaggtacaccgaagccaaaatgttcccgtaaatcaatgtcgtcttcatgtggtttgtta
cagaaaggcattgacaaagttttaccactcttggttgcttgcttgtcacatcctgctgct
actattcgcgtagaggcgtacgatatcttacacttttggctcaagaatgatttatcaaaa
gatctggaacgcatgccgaatttttctactttttgctcaaatttcgatttgacttcggat
ttttcagctcacatagatgagctgtttcccgaggaagtaagagaattgctcctaggcgat
ccactctactcattaaacaaagtagcttctgtcctgatcaaggctgttgttcgcctgtta
ttcagtcaaacattgaacttgggtacatcggaggcttgcccagaacgtaaattttccata
gtttgctggaagattggcctacgtttactaaatgaggataccgtcggtgatattcttctt
attccgagtagttcaagtgaagaatttgtcagaggctggtctggatttctaaatttgata
cagtgctccaacattcatttaatcgatttacatcatatatgtttatcacgtcttagtcca
gcattatttgcatctttagaacattctcctctttcaatggattctattaaagagagaaca
tcgattttgcggaaatcaactggctgtttgcaaactctcaatagaaatgtgtcaagcaca
gatccttatcagggaccccaatttagtatccttgacgctttatataagcttggtcataat
aatgtgcagactgatttcgattccgttcacaaagtattttctcgtcttcatctaaatgca
gtccatttcgattatatgttcatcagatcagacccgtcaagaacagttggtggcgacagc
aggtcattatttgctcgagttactgaagcccgagaatctcgtcgacgtagtttacgacta
cggaaaaccagggaggctgatttggaattattaaatgatgataagaaagcctattcagaa
agaattcgcttacgatttcttagtatgttattgtctattttaactgaagctgtgccacgg
ttacaatcatatgaaattgcatctacggttcagaataaatcgaaatctgttgatttgagt
acatcactaacaactgtagatacaaaatcactaaatattggcgtaaagaaaataaaagat
cacaatttgccgatgaatgatctgatcactccattagttaatcatcttacaagcatatta
aacatcgaacggaatttgaaacaaatagaagcaaatacaaatcaaacaaatgttctccca
gagtctggtacagatagtgatctagaatcgctacctgatttgtctgatatccatatggat
caagaagcagcagatatgtcgcccgttaatgaaaactcttgtattcgaccactgttacgt
cagtgcatttataaacttctgatttgcatcacaactatatttgccgaaggaaatcgttgt
aagcgacctcatagaaaacgttctcatcggaaaacaccaacggaccagacaggtttactt
tatggtttaacatcggcacaagttgctgtagatccaattttcctttgcctcactgtttac
cctgactggatatccttgcatcaacaagttctgctttgctttatcgaactttctgtcatg
tttcccggtgcattatgtcaccatttggtgtccttggtgcaatgggttgcgtgcaatcgt
cagcttatgcgtttggataacgctcataatcttagtattttgggacgtctgatattagta
actgtcccagcgcttattcgagcgtcttctgagcaaatttctgctggtctttatgtgcta
tatctctttgttatcagatttgctgagttcactaatttggctcggcgtcgcttagcactt
tatactgttctaattcgtggtttgtctcaagtaactggaccattcataacagatagtgaa
ctaaatcagtctattacacaaaaacaaattacagatgaaataaaaccattcaaaaaagtt
gaggcggctgcacatggaaatgaatgtaaaatctcattacggcctaaagaaagttggatt
ggaagttggttgtgggttacatcacttgtattcttgaacaaaaattggcaaatacaatca
gttgctgatgaagttggaccttttcttatcgagttgttctgtcattttggatgggatcat
caagtgcttggactatgtgaatgcatagattttctgacatatttgtgtatgaattcttgt
gattataagcttcctcaagttgacgtttcagagaacagcggtagtgtctacattgaaatc
ggtcattctcaaaagcgactaaaattgagttcgtcatttgcgaatcccagcaaatcacca
accagcgacttatcaattggtgtcaccggacctctgtcaaattacgttaatcagaacacg
ccgacttcttttagccaactcgcgtcttttattttcaattcagataacacaattcagaca
agtgaacaaatccaaacatctttgaacaattctacagttgtgacgttgaaggaaatatgg
cccttagtcaatcgaactatacagtttattatagccctaataagaaatcctgattattgt
gataaagttcaaacagcttttagcgatccatcaggtttaagtgctgtttatggtcgatta
gtggaacatattgttcagctaatgctcgttgtggctactttcttgacgaaagtaaaaaaa
tccgatgaaaaaatgacggatgtagtctcttgtgctgatgaaacattgtccggtttgcaa
tcaattttagtacagatcttggattcagtgcctggtcgagtattcatttccatgatctta
gatttattctcctgtgaaaaccgtggacttcgtcggaaagctctcgacttgttatctgct
aaattgacaagtttaactgcaaatgttcaaccagttccaattttaattgattttactaaa
atgaattacaaatctttcctaaagtcgcataaacatttagttagccgaaattttgttgat
ctaaatcgtaccatggaggctggtttagttcaatttactgggaagctaatttcattctat
aatttgaaaagtgacaagacggatggttccctgaggtcaaaacatagtaccgtttttggt
tcaggattttcacgccaatgtctagcttgtttgaggagtttaacgaaattattggcctac
cattatccaggggaattcatgagggctttggacagtttaatgacagttcctagtaattgg
tggattaatgttggtgttacagatgctcatcaagcttcagtaaactcaactgataaaccg
cttgtggaaagcaatccgcatggacatcatttcgggtcatctcttgctgagtcaagatcc
ttagcctgcttgttttttgttgaatgtttacaacgtttaccaccacagtctttatatccg
gaagcgagcgcaactacatcccgccttagttggttgctttcttttgcattagaccatggt
tatacttgtacatcatttgcttcttcaccaaagttgtctgtaaaacaatgttgttctgtg
aactcaccatgtaaatcagatcgttacatgaaattggtgactggtactatgcactcaaga
gatcagcacttattggctagtttaacgctggtcagcaatctacttgagttagccatcatt
catcggttatgtcaacagtctaaaggtgactattctccagacaatactgaatcggctatt
ggaaagtggttagaatttgagagtacaactaagaaaaatgcgaataattctgcctatcaa
gaacctgttgcagtaacacttctaagttttgtgtttcagctccgcaaagataacttgtca
acactaacaggttgtaatccggaacgttctagttctgtatttcgtcagatttcaaacctt
gttgaacacatacataaacttctccgtcacgtaacagaagtcagttatttactcacatca
attcggattgtaattgaaaaagcctctaaaacgaatagtaacactttattacatggtgct
ttgtctttcttgtctgattttggcgaatccatggcacccattaaagagaacggtgtgttt
gcttctaaagatgagaatcagttacattcttttgcaacaatgcatgctactcagcccgac
ataacatggcgcttgatccatacttgtttgtgtacagtcgtgaataaactaaatgaagct
gatcttcgaaatactacagaattaagaaataacgatatactttcatgtctctaccgttct
gtcgctagtttaatcagttcattaccagatgatagtgctcgcctgagaatttgtcaacag
ttgtttacatgggtcaatgttcaagataatgaaaaagaaacagttgatcaaatcaaagat
atcactgatcagatgcttttacgtttatcagttgtattcaggataatggaaagaattcca
gattatctgaacacagaagaattttctgaactaagcaaacagttgtatttagttgattat
attgttctaatattcatcatagctgtcggtaataaatttaagggtgctaaaaaactgtcc
aatcggttaggttttggccgatcgcttcaatgctattctgatggagctacatcttgtgtt
ttaatttgtattcatgcttcattgtcatgcttgcataaatggcttattggagaggtggaa
aacgttggatgtctggatgctgcctcaattggagaatcagtacaatatattccttctgtt
ttaattggattactcgatatatcttgtccatcttctgatgcacccccaataaatgaaact
gatattcaagatgtattaggctcatatttgaatgcaatatgcggtgatgaagcctatctt
cgtccactcggttccgcactgactgaacgtattatgcactccacgtactggcgtactagg
ttggctgcaatccgattgttaaagtttgtctttaatcattcaaatgatcatgaaattgac
aatgataaggatattacaatggattcaaaactttctggtcctatcagttgtattgtatca
gattcactcttagctctatcagaagcgttagaagatgaccgaccagaagttgaaactgaa
gctaataaactatttgctgaattagaacaaatgggtctgactgctacaaaaacgtaa
DBGET
integrated database retrieval system