Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00005374
Help
Entry
MS3_00005374 CDS
T05004
Symbol
ZRANB1_1
Name
(RefSeq) Ubiquitin thioesterase Zranb1, variant 2
KO
K11862
ubiquitin thioesterase ZRANB1 [EC:
3.4.19.12
]
Organism
shx
Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
shx01002
]
MS3_00005374 (ZRANB1_1)
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
shx04121
]
MS3_00005374 (ZRANB1_1)
Enzymes [BR:
shx01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.19 Omega peptidases
3.4.19.12 ubiquitinyl hydrolase 1
MS3_00005374 (ZRANB1_1)
Peptidases and inhibitors [BR:
shx01002
]
Cysteine peptidases
Family C64
MS3_00005374 (ZRANB1_1)
Ubiquitin system [BR:
shx04121
]
Deubiquitinating enzyme (DUB)
Ubiquitin-specific proteases (UBPs)
OTU
MS3_00005374 (ZRANB1_1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
OTU
Zn_ribbon_RanBP
AnkUBD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24594738
NCBI-ProteinID:
XP_012798773
UniProt:
A0A095C9M6
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(26276047..26312855)
Genome browser
AA seq
937 aa
AA seq
DB search
MDVGAKWPCAVCTYDNWPAAFKCTLCGTPRSSTLIEDEMQRLHLSSKDSEKIDESCAEAV
FDSTQLIKCQSCTYLNQRQNFKCEQCFQVLCDSPVLDAEVFKQASSTWLSSSTTTSLSPS
GKWTCIECTYENWPKSKHCVMCFASPPQPICVVDYEDTESKNSNSTCVSSNSSSLNCNRR
PKSNISYNTPLTSRDRLWLSACVAVVNGDLAPIERYILGNGRIERKLTKHECRYLNSYMQ
STTICDISTTFSSIDHSPKRFDDANLSQLPGSSCYSHKTTIPSCESGIVCSNLDYTSSGY
KFRSGWTLVDLALRFCRTDLINLFIALIGLQATSSAISVGSGSKHSTLPVNSSSIASVIT
SSNSTTITTNVTVSVTTSNTFSSNNLRNSTLNPPFQDTQQTHSKNIQVNRKLSSPLTGNQ
IHPSLQLILNRTPGNINKTQVTRSKWMPCQASPHIAGELRDLLAKTVKHCKGDFPCAYFS
EWGTFALPYSITKFPAPVKQLLLSELCDMQAQSELEDEAKAINWWFIPGQKQSSRLFALW
NRTAGDCLLDSVLQACWGVFDRENCLRRTLADSLQNCEANFYPRWRDYEALQAACHYILD
EDQCRRDWENVLTAACQPHEALEQIHIFALSHVLRRPIIVYGVKYIKNYRGEPIGIANFQ
GIYLPLLWEKCSCSRNPIVLGFTRGHFTALVPIEPCPLSSSGVSNESNADTNQTTGVTFS
PHASPPTSSRKHSPTPLDETSNYTQVPLTTVPLSTSLSETQLVSSTEPSLASCGTTLPGA
IAQQNAFVYLPLVDKQGVLLPIHFTTEKEARMSHTLLQEWLDVVCTRRGLPLARLRLHAK
HTLVDNMVEEWLDSYRSLAKLSTNSNPITLTTPSNINNINAATTTISSITGSTTIQHAHL
VSEHSSSSNSISSDTDQVEYTSKSTSSSLDALRSSSP
NT seq
2814 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgttggcgctaagtggccttgtgccgtatgtacgtatgacaattggccagcagca
tttaagtgtactttgtgtggtacaccaagaagctcaactcttatcgaagatgaaatgcaa
cgtttgcatttgtcgtctaaagattctgaaaaaattgacgagtcttgtgccgaggctgtc
ttcgattctacgcaacttataaagtgccagtcatgtacttatcttaatcaacgacaaaac
tttaagtgtgaacagtgttttcaggttctctgtgactcaccagttttagatgctgaagtt
ttcaaacaagcttcttcaacatggttatcctcttctactacaacatctttgtcaccatcc
ggtaaatggacatgtattgaatgtacatatgaaaactggcctaaaagtaagcactgtgtg
atgtgctttgcatctccaccacagccaatatgtgtagttgactatgaagatactgagagc
aagaatagtaattcaacatgcgtttcatctaattcatctagtttaaattgtaatcggcgc
ccaaaatcaaatatttcatataatacgccattaacttctcgtgatcgtttatggctgtca
gcatgcgttgctgtggtaaacggtgatctagcaccaattgagcgttacatacttggtaat
ggtagaatagaacgaaaactaacaaaacatgagtgccgctatttgaattcgtatatgcaa
tcaactaccatttgcgatatatcgacaactttttcaagtattgatcattctccaaaacga
tttgatgatgcaaatttgagtcagctacccggcagcagctgctattctcataaaacaact
attccgagttgcgaaagtggaattgtttgcagtaacctggactacacatcatcaggatat
aaatttcgatctggttggacattggtggatctagcacttcgattctgtcgtacggattta
atcaacttatttattgctttaattggtctacaagctactagtagcgctatatctgtcggt
tctggatctaagcattccacactacctgtgaattcgtcgagtatcgcttcggtcattact
tcatcgaatagtactaccattacaactaacgtcacagtgtccgttacaacttcaaatact
ttttcaagcaataatctacgtaactccacattaaatcctccatttcaagatactcagcaa
actcacagtaaaaacattcaagtaaatcgtaaattaagcagtccactaacaggaaatcaa
atacatccctcacttcaattaattttgaatcgaacaccaggtaatataaataagactcaa
gtcactagaagtaagtggatgccgtgtcaagctagccctcatattgctggtgaattacga
gatctattggcgaaaacggtaaaacattgtaaaggagactttccatgcgcttatttttct
gaatggggaacttttgctttgccttattcaattacaaagtttcctgctccagtaaaacaa
ttgctgttatcggaattatgcgatatgcaagctcaatcagagttggaagatgaggctaaa
gcaattaattggtggtttattcctggacaaaaacaatctagtcgtctatttgccttgtgg
aatcgaacagcaggtgattgtctgctagatagcgttttacaggcttgttggggagtattt
gatagagaaaattgtctacgtcgcacactcgctgacagtcttcagaattgtgaagcaaat
ttttatccacgctggcgcgactacgaagcattacaagctgcatgtcattatattttagat
gaagatcaatgccgaagggactgggaaaatgtactaacagcggcatgtcaaccacatgaa
gctttagaacaaatccatatattcgctttaagtcatgtccttcgccgaccaattattgta
tatggtgtaaagtacataaaaaattatcgtggtgaaccaatagggatagctaattttcaa
ggtatttacctcccacttctctgggaaaaatgctcttgttctcggaatcccattgttttg
ggctttactcggggtcattttactgcgcttgtacccattgaaccgtgccccttatcctcg
agtggtgtaagcaatgagtcaaatgcagataccaaccaaacaactggggttaccttttca
ccacatgcttctcctcctacatcttcacgtaaacatagtcctacacccctggatgaaaca
agtaattatactcaagtgccactcactactgttcctctttcaacatctctttcagaaacg
caactagtttcttcaacagaaccatcgttagccagctgtggaacaaccttacctggtgca
atagctcaacaaaatgcttttgtatatcttccactcgttgacaaacaaggagttttgtta
ccaatacatttcactacagaaaaagaggctagaatgtcccatacacttcttcaagaatgg
ttagatgtggtatgtacaagacgggggttaccgcttgcccgattacgattacatgcaaaa
catacacttgttgataacatggtagaagaatggctagattcctatcgttcgttagcaaaa
ttatctacaaatagtaatcctattacattaactacgccatctaatatcaataatatcaac
gccgccacaactactatttcttctattactggctctacaacaattcagcatgctcatctc
gtcagtgaacattcatcatcatcaaattccatatcatctgatacagatcaagttgagtat
acttcaaaatcaacatcatcatctttagatgcactacgcagctctagtccctaa
DBGET
integrated database retrieval system
