KEGG   Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00005405
Entry
MS3_00005405      CDS       T05004                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K16573  gamma-tubulin complex component 6
Organism
shx  Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:shx00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:shx03036]
    MS3_00005405
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   04812 Cytoskeleton proteins [BR:shx04812]
    MS3_00005405
Chromosome and associated proteins [BR:shx03036]
 Eukaryotic type
  Centrosome formation proteins
   Microtubules and associated factors
    gamma-tubulin ring complex
     MS3_00005405
Cytoskeleton proteins [BR:shx04812]
 Eukaryotic cytoskeleton proteins
  Microtubules
   Tubulin-binding proteins
    Gamma-tubulin complex components
     MS3_00005405
SSDB
Motif
Pfam: GCP_C_terminal NOT1_connector DUF7833 FtsK_SpoIIIE
Other DBs
NCBI-GeneID: 24593474
NCBI-ProteinID: XP_051069461
UniProt: A0A922S051
LinkDB
Position
3:27256487..27285333
AA seq 1650 aa
MSVCDLSVFSFIDRLISKSTSRLTIHGLSNKKLKRILRIQSYDLNFNFQKGPHKYSSGKV
FHPRNGIFEKLHEIIKFELEKSGNEKQARRLDGLVNTLPEIKEFTSQLVFIYLIANRTCK
FYGDSEMYEHSETYLNPESSVSYSKLTGLSNFGCISPFSSVKMPYLSTTSVNAYTFPSEN
IALSNHCASSVLLKTIRTTAYSNNMFNVDPTGVPSSIHMNNNWMRFNIPKASRCPTISSD
IDCTRPLPRALDEEDEGYCESFVRIDYRLLNNEDIENAIFRLFSQYSTAIGQMLVNEIFY
SSFEPYFKGIRSDTTLLANKTLDTILPPVSPSYVQNFSWESRGIGCLNKELPYLSETGPI
SAEAVLAAKKSRFGFLSSNSEAEEAQSTVKLQSTTIKSPLTYNDNFLHDLLVLRLGIQSD
RFQFLGTSRPSQTENVKHSFSYPLTGHFLWIPHKCDPITLGVSSQCLSHFVTDHIKVGTK
YRQLCWFAHHSISLIPTCEYDKSVWLGQIWACFIQGLKTWLRTYENSVHSVLSKLSNIGE
SKLLLITESLHYLSKQIEFVSDLCMLNYDQSDVSTYPLTKLHGIALLAYLMSKTDGCMSH
GCEPIVRLLFKEAARPFIKFLEVFALDGIYDDIGNEFSLIVSSEHLFKQDSSFWTESFHF
STYDQILNIDIGTEKLIRVALSQLLPSGFKEEILCCAKSVLLLRSICPKHFLFQTRSKFP
TLCFLETIEEMSDYNDAFKKYQKLLQDTAYEHTATRKQKITQMIIERQNFLKYVSQVQSS
RVAAIEAKRRERLEAYLTKQQTEFADLKFAAENAAKQRQEAIEAEKKADQMLLESISMSN
KYREEVIAETKAELEAFYTNLIQQADERRFSFEKHIKNDHILIEALEPSAIKALEFKANR
FAPMGKDKWNENSINEKSSVEITPSMFNQPSEMCILSSEMIQQENNDHQPQLQFHTVQNE
RENNLVKPDNLLSDDPLTILRIKFRQRNKDGCIFKDQMSEIIYGAHEKCSDEKSIQPKFT
KSADVNNLNTLTSMKSFRERNTFGHSSDSTIQHILYGKGLGPSSRPSVWEAEREKEDAVR
LATELPEPDAVTFYKEALEFSDNTSPVKPFTKEFPLLDQNCLSVSSIFKNSDSSVQSSNE
LDNLFKNSNGSLLMPLSVLINRSLIWPLSIHMKHVNKTLCNYFIFDLRLCDHFYCLYETY
FLNNGSFAQPLLNALFHKASGTVYDRASIFDTHYLQQLLKSVSSEMSNQQILSNFNSDLN
NSDKHDDISVNSPLLNTTNLIKNYLDLISLSSISTTKQLSTIDSLNNDFDVESNHSIADN
SSSIIDQYEYISFKNLHLMYNAPWPINLCFNVNIIKKYNCIFQRLIQCQFALWALNSCII
QLKNDHNYCLNHLLNLRNISSSSTLSSSSSSSPSSFITLFDQLSKSFHCIYLWLHELHQV
IHSLNMHLSNHVNACWSKFMKYLGLSNTFYNFMSEGNSFRMYKHIIENIIDNEESIKSEQ
INNLNVLFNAHENYLNEILSGLLLDVSDSELNLLFQGLLTCAHQFHRALLTGRWNVKSSH
HQFSDIDGTQQQLLSNEQIKHTEWRQLYAVHASFRSYSQFLRRRVNRLLVHDTTDGGSSV
RSARSKLAQLTIIFGLNDFYTSTNAELNIS
NT seq 4953 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagcgtgtgcgatttgtcggtctttagttttattgatcgcttaatatcgaagtcaaca
tctcggttaactattcatggactcagtaataaaaagctgaaaaggattctgcggattcag
tcctatgacctgaatttcaatttccagaaagggccacacaaatattcaagtggcaaggtt
tttcatccccgaaatggtatctttgaaaagttgcacgaaattataaagttcgaattggaa
aagtccggaaatgagaaacaagctcgtcgtcttgatggtttagttaatacccttccggaa
attaaagaatttacgagtcaacttgtttttatatatcttattgccaacagaacttgcaaa
ttttacggtgattctgagatgtatgaacattccgagacttatttaaatcctgaatcatct
gtttcatacagcaaactcacaggtcttagtaattttggatgtatcagtcctttctcatca
gtgaaaatgccatatttgtctacaacttcagttaatgcttatacgttcccatcggaaaac
atagctcttagtaatcactgtgcatcaagtgttctattgaagaccattcgcaccaccgct
tattcgaataacatgtttaacgttgaccctactggtgttccgagtagcattcacatgaat
aacaattggatgaggttcaacattccaaaagcttcacgatgtccaacaatttctagtgat
atagattgtactcgccctttgcctagagcattggatgaagaagatgaaggttactgtgag
tcatttgttaggatagattaccgtttactgaataatgaagacatagaaaatgccatattt
cgtcttttttctcaatattctacggccatcggtcaaatgctggtcaatgaaatattctac
tcatcttttgaaccatatttcaaggggattcggagtgatacaactcttctagccaacaaa
actttggatactattttgccaccagtatctccaagttatgtccagaacttttcttgggaa
tccagagggatcggatgtttaaacaaggaactaccttatttgagtgaaactggtccaatt
tctgccgaagctgttctcgctgccaaaaagtcgagatttggttttttgtcgagcaatagc
gaagcggaagaggcccaatcaactgtaaagcttcagagtaccacaataaaatcgccactt
acatacaatgataactttctgcacgatcttttggtgttgaggttaggcattcagtctgat
agattccagttcttgggaacttccagaccaagtcagactgaaaatgttaagcactctttt
tcatatccactaactggtcatttcttgtggataccacataaatgtgatcctattacgttg
ggcgtttcatcccagtgcttatcacatttcgtcactgatcatatcaaagttggaactaaa
tacagacagctgtgttggtttgcccatcactctatttcgctcattccgacttgtgaatat
gataagtctgtttggctcggacagatatgggcttgctttattcagggattaaaaacttgg
ttacgtacgtacgaaaactcggttcactcagtgttatcgaagctatcgaacattggcgaa
tctaaacttcttcttattacagagagcttacattatctttcaaaacagattgagtttgtc
tccgacttatgcatgctcaattatgatcaatcagatgtttccacatatccgctgactaaa
cttcatggcatagcgttattggcctacttaatgtcaaagacagatggttgtatgtctcat
ggatgtgaaccaattgtaagattgttatttaaagaagctgctcgaccgtttatcaaattt
cttgaagtgtttgctttagacggaatttacgatgatattggtaatgagtttagtttgatt
gtttcaagtgaacatttatttaaacaagatagttcattttggactgaaagctttcatttt
tcaacgtacgatcaaatactgaacattgatattgggaccgagaagcttatacgagttgca
ttgagtcagcttttaccatccggatttaaagaggaaatcttgtgttgtgctaagtctgtg
ctgttattgaggtcaatctgtccaaagcattttctatttcaaactcgctcaaaattccca
acactttgttttctggagactattgaagaaatgtcggattataatgatgcattcaaaaaa
taccaaaaattattacaagatacagcctatgaacatacagctacaagaaagcaaaagatt
acccaaatgattattgaacgacaaaatttcttgaaatatgtgagtcaagttcaatcatca
agagtcgcggccattgaagctaaacgacgtgaacgattagaggcatatttaactaaacag
caaactgaattcgctgatttaaagttcgcggctgaaaatgcggctaaacaacgtcaagaa
gcaatagaagctgaaaagaaagctgatcaaatgctgttggaatcaatttctatgtctaat
aagtatcgagaagaagtgatagctgaaaccaaagctgaattagaagcattttacacgaat
ttaatacaacaagctgatgaacgtagattcagttttgaaaaacatattaaaaatgatcat
attcttattgaggcattggaaccaagtgctattaaagcattagaatttaaagcaaatcgt
tttgctcccatgggtaaggataaatggaatgaaaattcaattaatgaaaaatcttcagtt
gaaattactccaagtatgtttaatcagccctctgaaatgtgtatcctttcatctgaaatg
attcaacaagaaaataatgatcatcaaccacaattacaatttcatactgtacaaaatgaa
agagaaaataacttagttaaacccgataatttattgagtgatgatcctttaacaattcta
cgtattaaatttcgtcagcgtaataaagatggatgcatattcaaagatcaaatgtcagag
ataatttatggagctcatgaaaaatgttcagatgaaaaatcgattcagcctaaatttacc
aaatctgccgatgtaaataatttgaatactttaacatctatgaaatcctttcgggaacgt
aatacttttggtcattcttctgattcaactattcagcatatactctatggtaaaggtctt
ggtccatcatctaggccgtcagtttgggaagcagaacgtgagaaagaggatgcagttcgc
ttagctacggaactgcctgaaccggacgcagtcacattttataaagaagccttagaattt
tcggacaatacgtcaccagtaaaaccgtttaccaaagaattcccattacttgatcaaaat
tgtctttctgtgtcgtcaatattcaaaaactcggattcatctgtacagtcttcaaatgaa
cttgacaatttgtttaaaaattcaaatggttcactattaatgcccttaagtgtactaatc
aaccgttccttgatttggcctctcagtattcacatgaaacatgttaacaaaacactgtgc
aattatttcatatttgatcttcgtctatgtgatcacttttattgtttgtatgaaacttat
ttcctaaacaatggaagttttgctcaaccattattgaatgctttatttcataaggcttct
ggaacagtttatgatcgtgccagcatatttgatacacattatcttcaacagcttttaaaa
tcagtcagttcagaaatgtcaaatcaacaaatattatcaaattttaattcagatcttaat
aatagtgataaacatgacgatatttctgttaattctccactgttaaacactacaaacttg
attaagaattacttagatttgatctccttatcgtcaatatcaacaacaaaacaactatca
actattgattctttaaataatgatttcgatgtagaatcaaatcattctatagctgataat
agttcatctattattgaccaatatgaatatatatcttttaagaatttacatttaatgtat
aatgctccatggccaattaatctttgttttaatgttaatataataaaaaaatacaattgt
atatttcaacgtttaatccaatgtcaatttgctttatgggcattgaattcatgtattata
caattaaaaaatgatcataattattgtttaaatcatttattaaacttaagaaatatctct
tcatcttcgactttatcatcatcatcatcatcatcaccatcatcattcattactctattt
gatcaattatcaaaatcatttcattgtatctatttatggttacatgaattacatcaagtt
attcatagtttaaatatgcatttatcaaatcatgttaatgcatgttggagtaaatttatg
aaatatttaggattatctaatacattttataattttatgtccgaaggtaattcatttaga
atgtataaacatatcatagaaaatattatagataatgaagaatctattaaaagtgaacaa
attaacaatttgaatgtgttgttcaatgcacatgaaaattatttgaatgaaattctatct
gggcttttgctggatgtatcagatagtgaattaaatttacttttccaaggtttgctgaca
tgtgcacatcagtttcatcgtgctttattaacaggaagatggaatgttaaatcatcgcat
catcagtttagtgatattgatggtactcaacaacagttattgagtaatgaacagattaag
catacagaatggaggcagttgtatgcggttcatgcaagttttcgaagttacagtcaattt
ttaagacgtcgtgttaatcgattacttgttcatgatactactgatggaggtagcagtgtt
agaagcgctaggtcaaaattggcacagttaactataatatttggtttaaatgatttttat
acttcgacaaatgctgaattaaatattagttga

DBGET integrated database retrieval system