KEGG   Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00008213
Entry
MS3_00008213      CDS       T05004                                 
Symbol
VPS18
Name
(RefSeq) Vacuolar protein sorting-associated protein 18 like protein
  KO
K20181  vacuolar protein sorting-associated protein 18
Organism
shx  Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
Pathway
shx04140  Autophagy - animal
shx04142  Lysosome biogenesis
shx04145  Phagocytosis
shx04148  Efferocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:shx00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04145 Phagocytosis
    MS3_00008213 (VPS18)
   04142 Lysosome biogenesis
    MS3_00008213 (VPS18)
   04140 Autophagy - animal
    MS3_00008213 (VPS18)
   04148 Efferocytosis
    MS3_00008213 (VPS18)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:shx04131]
    MS3_00008213 (VPS18)
Membrane trafficking [BR:shx04131]
 Endosome - Lysosome transport
  Tethering complex
   CORVET complex
    MS3_00008213 (VPS18)
   Hops complex
    MS3_00008213 (VPS18)
SSDB
Motif
Pfam: Pep3_Vps18 VPS18_solenoid_2nd VPS18_solenoid_1st VPS18_RING_C zf-RING_5 NRD1_2 zf-RING_16 zf-RING_Vps41 zf_RING_Vps8 zf-rbx1 zf-Vps39_C zf-RING_UBOX
Other DBs
NCBI-GeneID: 24594790
NCBI-ProteinID: XP_012798828
UniProt: A0A922IPD3
LinkDB
Position
4:complement(46291239..>46340714)
AA seq 1259 aa
MQKGTLNTGEQQSSAEFFAHDGIFTLDSAQWFRVVNSLTNLQVCNNYLVGATSKNTLIRT
STVPPYNISEIEISRLSDDRVHNIFLDPMGWHTVISMQSGTNFYINKGMKKVRPLNKTKD
HLFDSIAWNHHNVNELSTQEILIGTNDGLIFETMLMFNEDSFFSSGTIEQYWIQMINLGH
SVTGVEVIRFPIGSPNVLVGEPQRCVVFATTPCRMYQFAGWINTNSSTTGSILSHLAANT
ATSGISNAINAYTGGHRSSLVNEYNQQQSVGIQNTTIFPIITGLFSSVFNSDDKLPVGSK
VTEFPGSFGYSDLKLYRNVKDELPSKFAWMTGPGVYFGYIRTEQLSMPPFTKLSTNDQPI
DVKSFPNEVVSLLPTATDNTDDPNRPKDIFSGRGVNLTRNTKLIPYPIIHMLERPGVPLG
ICLTEFHLIIIYVDRIKAVNTLDGRAVYSMPLNNIIGCERALGISRDSLSNHIWIFSNNH
LARLNMKNELCRIWQIYLDRLQFDEARQFCQDPGQMDTINIREAEYNFDNENYGLAAKLF
ARSSIPFEQIALRFFRLSSSSSSSTTTHTIDLSSTIIPSTLIQQGYEINDDHDIMEALII
QSKQQYPINDKLTGLIDSSIKQCKSFITSIHSYSSTLTPLKIFLSSKLDYLIEQNNQIIS
NINKQSVVNLSGQIILLAIWLIELLITELSVIRDRLKMITKLDHNNDDVDEIVNDNDQNN
KMISDGNVTVNNNDNCDDKVKLTLQNRLASVRREFRTIIVLPEVLNFLPEAKSLIYDLLE
NHGENDELVYFMELMKDYPRLVDHYIRQCMYSDALKILATYPNCLNRLYDHASCLASKCP
EEFVNVCLRLNNKLDINRLLPSIMLLPNNYAINYLEDTIGIYTNKNISNQAVHHMLISLY
ANEYHLNHNDDRLMKYLEKFSIQAIHIRRLKQQHQQNIVDNGDLFNDYQLMNMDLTELSL
LEHDNDTVNDCSTGIVMNKLKCLTNQHQEQDIQSLLPYDPGYVLRLCKEVDHLKGVLYIL
QLLDMHQEALQLAIELNNIPFAKEIAQSEFLNSNVRRQLWIQLAQHIISTDGSMQEAINL
LRDCPLLKLEDILPYFHQFVTIDQFKDVICSSLDSYNERIDNVKNEIQSTMKTIDELRTQ
SNNLRYRYEIIENDSRCTHCNHLLTLRAFYVFPCGHNFHISCLTELVKPYLSAEEKSQLS
KVVESQNLGNNPSVTNVEDLFDEIIANDCALCGHIAIENLSKLYYENQVNYDNELSIWQ
NT seq 3780 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcagaagggtactctaaatactggtgaacagcaatcttctgctgaatttttcgcacat
gacgggatttttacactcgattcagcgcagtggttcagagtagtgaattccttgacgaat
ctgcaagtttgtaacaattatctggtcggtgctacttctaaaaacaccctaataagaacg
tccactgttcctccctacaatatatctgaaattgaaattagccgcctttcagatgaccga
gtccataatatttttctggatcctatgggttggcatactgtaataagtatgcagtctggc
acaaatttctacatcaataaaggtatgaaaaaggttcgccctttaaacaagacaaaagat
catttgtttgactctatagcttggaatcatcataatgttaatgaattgtctacacaagaa
attttaatcggtacaaatgatggactaatatttgaaacaatgcttatgtttaatgaagat
agcttttttagttcgggaactattgaacagtattggatccagatgattaatttaggacat
agtgtaacaggtgtagaagtgattcgctttcctattggttcgcctaatgtactagttggt
gaaccgcaacgatgtgtagtctttgctacaacaccttgtcgtatgtatcaattcgctgga
tggataaatactaacagttcaacaaccggttcaattttatctcatctagcagcaaatact
gctacatccggtatatccaatgcaataaatgcttatactggaggtcataggtctagttta
gtgaatgaatataatcaacaacaatctgttgggatacaaaatacaactatatttccaatt
atcactggactattctctagtgtattcaactcagatgataaactacctgttggatccaaa
gttactgaatttcccggaagttttggatatagtgatttaaaactttatcgtaatgtaaaa
gatgaactccctagtaaatttgcttggatgacaggtccaggtgtttacttcggttacata
agaacagaacaattaagtatgcctccatttacaaaactgtcaacaaatgatcaaccaatt
gatgtaaaatcatttccaaatgaagttgtttcccttctacctactgccactgataataca
gatgatccgaatcgaccgaaagatatattctctggtcgtggtgttaatttaacgcgaaat
acaaaacttatcccgtatccaattattcatatgcttgaacgacctggtgtaccattaggc
atttgtttgacagaatttcatcttatcattatctatgtggatcgcattaaagctgtgaat
actttagatggtcgagcagtttattcaatgccgttaaataatatcattggctgtgaacgg
gctttggggatatcgcgtgactcattatctaatcatatttggatattcagcaataatcat
ttggctcgactaaatatgaagaatgaattatgtagaatatggcaaatctatttggatcgt
ctacagtttgatgaagcgcgccaattttgtcaggatcctggtcaaatggataccatcaat
atacgtgaagcggaatataattttgataatgaaaactatggacttgcagctaaattattt
gctcgtagttctataccgtttgaacaaattgcattacgtttttttcgtttatcatcatca
tcatcatcatcaacaacaacacatacaatagatctttcatcaaccattataccatctaca
ttaattcaacaaggttatgaaattaatgatgatcatgatattatggaagcattaattatt
caatcaaaacaacaatatccaatcaatgacaaactaacaggactaattgattcatctata
aaacaatgtaaatcattcataacatcaatccattcatatagtagtacattgacaccattg
aaaatatttttatcatcaaaattagattatttaatagaacagaataatcaaataataagt
aatatcaataaacaatcagtagtaaatttatcaggtcaaataattttattagcaatttgg
ttaatagaattattaataactgaattgagtgtgatacgtgatcgtcttaaaatgataaca
aaattggatcataataatgatgatgttgatgaaatagttaatgataatgatcaaaataac
aagatgattagtgatggaaatgttaccgttaacaataatgataattgtgatgataaagtt
aaattaacattacaaaatcgtctagcttctgtacgacgtgaatttcgtacaatcatagta
ttaccggaagtattgaattttttaccagaagcaaaatctttgatatacgatttactagaa
aatcatggggaaaatgatgaacttgtttattttatggaattaatgaaagattatcctcgt
ttagtggatcattatatacgtcaatgtatgtacagtgatgccttaaaaatattagccacc
tatccaaactgtttaaatcgactatatgatcatgcatcatgcttagctagtaaatgtcca
gaagaatttgtcaatgtatgtcttcgtttaaacaataaattggatattaatcgacttcta
ccttcaattatgttgttaccaaataattatgcaataaattacttagaagatactattgga
atatatactaataaaaatatatcaaatcaagctgtacatcatatgcttatttcattgtat
gctaatgaatatcatttaaatcataatgatgatagattaatgaaatatttagaaaaattt
agtatccaagccattcatataagacgtttaaaacaacaacatcaacaaaatattgtcgat
aatggagatttattcaatgattatcaattaatgaatatggatttaactgaattatcattg
ttagaacatgataatgatacagtgaatgattgttctaccggtattgtaatgaataaatta
aaatgtttaacaaatcaacatcaagaacaagatatccagtcattgttaccctatgatcct
ggttatgtgcttcgtttatgcaaagaagttgatcatttaaaaggtgtactttatatacta
caattattggatatgcatcaagaagctttacaattagccattgaattgaataatattcca
ttcgctaaagaaattgctcaaagtgaattcttgaattctaatgtacgtcgtcaattatgg
attcaattagcacaacatattattagtactgatggaagtatgcaagaagctatcaattta
ttacgagattgtcctctattgaaattagaggatattcttccatattttcatcaatttgtt
actattgatcagtttaaagacgtgatctgttcatcactggattcgtataatgaacggatt
gataatgtgaaaaacgaaatacaaagtacgatgaaaactattgatgagttacgtacacag
tcgaataatctacgatatagatatgaaattatagagaatgattcacgttgtactcattgc
aatcaccttttaactttacgtgcattttatgtatttccttgtggtcataattttcacata
agttgtctcactgaattggtgaaaccatatttatcagcagaggaaaaatcacaattgtca
aaagttgtcgaatctcaaaatcttggaaataatccatctgtaactaatgttgaagatcta
tttgatgaaatcattgctaatgattgtgctctatgcggtcatatagccattgaaaattta
tctaaattatattatgaaaatcaagtgaattatgataatgaattatcaatttggcaatag

DBGET integrated database retrieval system