| Entry |
|
|---|
| Symbol |
LAMA1_4
|
|---|
| Name |
(RefSeq) Laminin subunit alpha-1
|
|---|
| Organism |
shx Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
|
|---|
| SSDB |
|
|---|
| Motif |
|
|---|
| Other DBs |
|
|---|
| LinkDB |
|
|---|
| Position |
5:complement(2911822..2998585)
|
|---|
| AA seq |
2623 aa
MRMTLSVLLLIIFGANVAILQRYDGYPYEADFLDMDPDSILEENAIITANATCGINRKEY
FCRLVEHADGFITYDGRLHRTPREVLTYSQEAKSYRDPSGQWVQCGYCDDRDPNLRHPIE
YVLSGEANLWWQSPSLAQGLQYHAVTITMDFRQVYQIVYVLLRMGDSPRPANWILERSVD
GEVYHPWVFFAKTEYDCKKLYEPLIDRPLTITSGPRPWHLGDDEVYCTTFYSQPQALQSG
EIIVTLTLDRESTISTESGLESPISSKLIDFLSARFVRLRFQQLQTLSGDWMAMPNQLDS
SVYNRYYYSIRTIKVGGKCVCNSHASRCEQKVIDGVPRAVCDCQHNTCGNNCEKCCPLFN
QQPWRPGRICEECNCNQKADECIYNQTVANLRLSMRKDGVLEGGGVCLNCREDTTGVNCE
KCKQGYYRPLNVRPDSQYPCRPCECSTFGSTGDCTSNDAEIPERYPGDCICKEGYAGRRC
DECAEGYQRSNIDPQLCIPCTCDIRGSHRGPGYQCEPPCNCKINVDPDSYCNTCQKGFFN
LDVNNPEGCQSCYCSSLTDQCTGVTPTTAMMLERKGLLGPVNTLANWKIIVPSLSTPDTS
YTIPMIETSVQYDKVLFAQTRAVEGWLSSVTSTPVTRGYYWSAPEAYLGNQITAYRDTLN
IILRFNSPTMLTYRTPTINTDISGSRQFSLSMAMTDHLNYMWLHEPDIVIEGNGYRLVHM
LSPSYRESHMILNIPLSESSFRVIVEPPTSIPLDRFPISWLQGDQLRFDESTLERVGRPA
TIADIMTVLSSIDRLLIKAKYITDQTTTELMSVTLGRALRYETGGIPNIEECICPNGYSG
SSCESCAIGYYRDYQKQSTIQTNQSSFTSSTALSLWRSTMMTQLPVCVLCECHGHSDICD
EKTGVCIDCTHNTAGDKCDVCAPGFYGDPRTGDPTACKSCECPHLDYQMTTICLAHEEEV
FKEEKPYVCLDCTENTRGRYCEVCAEMYYGDPLNGVPCRPCNCGPAAIGCNSTNGACICG
FNTAGPQCDACAEGTHGDPTRGQPCRPCNCHPKGSISPSCRLEDGQCNCLSTYEGVRCDR
CISGRGNTEAGCPPCQCDPIGTRPEYLTSCDPVSGQCSCKPGVGGTLDCSTCQVGYYNLG
PNGCTECKCTSRAIDRTCNPITGQCKCGENVIGDTCDKCLPGFYWNNTGSNCLPCNCGIG
TELTRTLTQLTECDMNTGQCKCAPHVVGRDCTECELGYFGVSENGCKPCLPCPNGQVCDQ
ITGKCICPPNTEGDRCDRCVVGSWDYNPVIGCKNCNCSIDGSVIGLEDQCDLTTGQCTCK
PEFSGRACNECSKGYYGYPYCRKCNCDMRGTAWGNLSISDTVVPCNPIDGQCNCKENVEG
DQCDQCKPGTFGLNIDYPLGCYTCFCFPTGTSSRCSLLTGYRSVPGKVKGVEIISTDDPR
YPGGPLIDLKLGLKDIDINELTIGLSQFSWRFSVHRPTHLEIPELKGSLMRNYGSVLIGV
LTECLPTGDCKLGIEDAQTTNILSNREDLPGGLIIRRNDIVDARMTALNGYIEMEYQPSE
NSPTSIADGYRQIWLREQDWVITRVSGIDTRVRPTRNELMLALLNVTSFSVRLFMPEARP
KLVSVKYKIYQPRTEITTLSGIEIKTIEKCECPPTASGDHCEIASSGFYFPPIKPKPGRE
ILPPTAIIDPTLPTGHIIWEGGAQKCRCHGMSSNCDPVTGICLDCTGNTEGPDCGKCATG
YMGDPKIGQPCVKCQCPTEQTDYAITCTPSTDPSLLPHKCICKVGYAGLRCEQCAPGYYG
DPTSMIACQACDCDSGGSRSETCNQDTGQCDCWPGIKGRRCDQCEEDHVVDHGTCRDCRG
PCTGELLIKSDYVKLQIDGLNITTLAYQGLAKLKQQIDMNKKRFIPSRIQLENEILSRTK
QLFRQLIEINQSYIRIFNNYQVFDQSNCDILEQINTLYNQSNLIENQLNNWINRLMKQEY
GQSMNLHELKNWQEHSKQIYTNLSNIQLNETIIWLNEIEIEIQRIIQRINELIQSIINQN
HIQIDLNQLNRYQELQKFLIDYQTNQIYRISNGTKLAINELDIALKKANTLVDTVKTTTS
LTTLQSFNKQSHNLNEQLSQLEQLHPNQEQLNRIDTLNNLLYQLNQIQLPDSKQISIPSE
LYTNIIEPIEQESQLIHDKLIPTEQLNRTYLAYNAYQLMIDNIKLAENATNEAENAFLNS
TTTIDGQQITWQNRLQFIINKRDSITNRLNNQSIIYNSHNETLNLIDKQLETTDNDLSTL
NQIALNNLKLTKNIVNKVDSIQQFLKDTKPLVQNASDKLQVQLGRYNGLHDRLQEMENRF
SQIQGTAKTLVDRANITQSYLIKSIDEVEHVARQLDSKLLNLRRLADEARSMLDVNYGSL
SHDPVPLQLGQDCVYTLVPYSLTKSRVFDVEFWFNLNNLPTLSSISSVLMVGRRAFEGHT
QMFAFTVEAPDNRLRFSWNTPNGILELGPIAKNTWYHTRVTSVGGETRMILMERSFQDHG
DVFPEMKQTSTTNGTLDQEANLIMDRQMELRIGGVMQPSSRLSNPEAWGDNGAEEFWSRL
MSMESIKFCMFNLRLSGTPISIANFADANPECSKPREYQCQLP |
|---|
| NT seq |
7872 nt +upstreamnt +downstreamnt
atgagaatgaccttatcagtcttattgcttattatttttggtgcaaatgtagcgattttg
cagagatatgatggttatccatatgaagcagatttcctggatatggatcctgattcgatt
ttggaagagaacgctataattacagcaaatgccacatgtggtataaaccgtaaagaatat
ttctgccggcttgttgaacatgctgatggctttatcacatacgatggtcgcctacaccga
acaccaagggaagttttgacttacagccaggaagccaagtcttatcgtgacccaagtggg
caatgggtgcaatgtggttattgtgatgatagagatcctaatttacggcatccaattgaa
tacgttctcagtggtgaggccaatttgtggtggcaaagcccatctttggcacaaggttta
caataccatgcggttacaatcactatggactttcgtcaggtatatcaaatagtctatgtt
cttctacgtatgggtgatagtcctcggccagccaattggatcctagaacgttcagtagat
ggtgaagtatatcatccatgggtatttttcgctaaaactgaatatgactgtaagaagtta
tacgaaccgttaattgatcgaccactaactattacaagtggaccaagaccatggcatttg
ggtgatgatgaagtttactgtacaacattttacagtcaacctcaagcattacaatcaggt
gaaattattgtaactttaacattagatcgtgaaagtaccatatctactgaatcgggtctt
gaaagtcctatatcatcaaagttaattgatttcttgtctgcacgatttgtacgattacgt
tttcaacaattacaaacactttctggtgattggatggctatgccaaatcaattagacagt
tcagtttataataggtattattactcaattcgaacgattaaagttgggggaaaatgtgta
tgtaatagtcatgctagtcgatgcgaacagaaagtaattgatggtgtacctcgagccgtg
tgtgactgtcaacataatacatgcggaaacaattgtgaaaagtgttgtccattgttcaat
caacaaccatggcgtccaggaagaatatgtgaagagtgtaactgtaatcaaaaggcagat
gaatgtatttataatcaaacagtcgctaatcttcgtttaagtatgcgtaaagatggtgtt
ctagaaggtggaggagtctgcttaaactgtcgtgaagatacaactggtgtaaattgtgaa
aaatgtaaacaaggttattatcgcccattaaatgtccgacctgactcacaatatccttgt
agaccatgtgaatgtagtacttttggttcaactggtgactgtacatctaatgatgctgaa
ataccagaacgatatcccggagattgcatctgtaaagaaggttatgcaggtagacgttgt
gatgaatgtgctgaaggttatcaacgttctaacattgatcctcaattatgtataccatgt
acatgtgatattagaggaagtcatcgtggtccaggatatcaatgtgaaccaccatgtaat
tgtaagattaatgttgatccagattcttattgtaatacatgtcaaaaaggatttttcaat
ttagatgttaataatccagaaggttgtcaatcatgttattgttctagtcttactgatcaa
tgtactggtgttacaccaactactgcaatgatgctggaaagaaaaggattacttggtcca
gtcaacactttagcgaattggaaaattattgtaccaagcttatctacaccagatacaagt
tacacaataccaatgatagaaacatctgtacaatatgataaagttttatttgctcaaaca
cgtgcagttgaaggttggctttcatcagttacttcaacaccagttacacgcggttattat
tggtctgcaccagaagcatatttaggcaatcaaataacagcttatcgtgatacattgaat
attattttacgttttaattcacctactatgttaacatatcgtacaccgacaataaacacg
gacatatcaggcagtagacaattttctttatcaatggctatgactgatcacttaaattat
atgtggctacatgaaccagacatagtaattgagggtaatggttatcgactagttcatatg
ctatcaccatcctatcgtgaaagtcatatgattttaaatattccattaagtgaatcatca
tttcgtgtaattgttgaaccgccaacctctataccattagatcgtttccctataagttgg
ttacagggtgatcaattaagatttgatgaatcaacattggaacgagttggtcgaccagca
acaatagctgatataatgactgtgttatccagtatagacagattattgattaaagctaaa
tatattactgatcaaacaacaactgaattaatgtctgttacacttggtcgtgcattacgt
tatgaaactggtggaataccaaatattgaagaatgtatttgtccaaatggatattcagga
tcatcttgtgaatcatgtgcaattggttattatcgtgattatcaaaaacaatcaacgata
cagactaatcaaagttcttttacttcatcaacagctttatcattatggcgttcaactatg
atgacacaattacctgtttgtgtactatgtgaatgtcatggacattcagatatttgtgat
gagaaaactggagtatgcattgattgtactcataatactgcaggagataaatgtgatgta
tgcgcaccgggattttatggggatccacgaaccggtgacccaacagcatgtaaatcatgt
gaatgtcctcatttagattatcaaatgactacaatttgtttggcacatgaagaagaagta
tttaaagaggaaaaaccttatgtttgtttggattgtacagaaaatactcgaggtcgatat
tgtgaagtatgtgcagaaatgtattatggtgatccactgaatggagtgccatgtcgtcca
tgtaattgtggacccgctgctataggttgcaattcaacaaatggagcttgtatctgtgga
tttaatacagctggaccgcaatgtgatgcatgcgctgaaggaacgcatggagatccaact
agaggacaaccatgtagaccttgtaattgtcatccaaaaggcagcatctctccatcatgt
agacttgaagatggtcaatgtaattgtttatcaacatatgaaggtgttagatgtgatcgt
tgtatatctggtcgtggtaatacagaagctggttgtccaccatgtcaatgtgatcctatt
ggtaccagaccagaatatttaacatcatgtgatcctgtctctggacaatgttcttgtaaa
ccaggagttggtggtactttagactgttcaacatgtcaagtaggatattataatctaggt
ccaaatggatgtacagagtgcaaatgtacttcaagagcaatcgatcgaacatgtaatcca
atcactggtcaatgtaaatgtggtgagaatgtaattggggatacatgtgataaatgtttg
cctggattctattggaataacactggatcaaattgtttaccatgtaattgtggaattgga
actgaattaactagaacattaactcagttaactgaatgtgatatgaatactggtcagtgt
aaatgtgctccacatgtagtaggacgagactgtacagaatgtgaattaggatattttggt
gtttctgaaaatggttgtaaaccttgtttgccttgcccaaatggtcaagtttgtgatcag
attacgggaaaatgtatttgtccaccaaatactgaaggtgatcgatgtgatagatgcgtt
gttggttcatgggactataatccagtgattggttgtaaaaattgtaattgttcgatagat
ggttccgttataggccttgaagatcaatgtgatttaaccacgggacaatgtacatgtaaa
ccagaattttcaggtcgtgcatgtaatgaatgcagtaagggttattatggttatccttat
tgtagaaaatgcaactgtgatatgcgtggtactgcatggggaaatctatccatatcagat
acggttgtaccatgcaatccaattgatggacaatgtaactgtaaagaaaatgtcgaaggt
gatcaatgtgatcaatgtaaacctggaacttttggtttgaatattgattatccacttggt
tgttatacatgtttctgttttccaactggtacatcatctcgttgtagtctattgacaggt
tatcgttcagttccagggaaagtgaaaggagttgaaataatttctactgatgatccacgt
tatccaggtggaccgttaattgatttaaaacttggtttaaaagatattgatataaatgaa
ttaactattggtttaagtcaattcagttggcgtttctctgtgcatcgtccaactcattta
gaaataccagaattaaagggttcattaatgcgtaattatggaagtgtacttataggtgta
ttgacagaatgtctacctactggtgattgtaaacttggcattgaagatgcacaaactact
aacatattgtcaaatagagaggatttacccggagggttaattatacgtagaaatgatatt
gtagatgctcgaatgacagcattaaatggttatatcgaaatggaatatcaaccatctgaa
aattcacctacatctattgcggatggttatcgtcaaatttggcttcgtgaacaagattgg
gtaataacacgtgtatctggtattgatacacgtgttcgaccaacacgtaatgaattaatg
ttagctttacttaatgttacatcattcagtgtacgtttatttatgcctgaagcaagaccc
aaacttgtgagtgtaaaatataaaatttatcaaccacgtacagaaataacaacactatct
ggaatcgaaattaaaacaatcgaaaaatgtgaatgtccaccgactgcatccggtgatcat
tgtgagattgcttcgtctggattttatttcccaccaattaaaccgaaacctggacgtgaa
attctaccaccaactgccataattgatcctactcttccaacaggacacatcatttgggaa
ggtggagcacagaaatgccgttgtcatggtatgtcctcaaattgtgatccagtcactgga
atatgcttggattgtaccggtaacacagaaggcccagactgtgggaaatgtgctacaggt
tatatgggcgatccaaaaattggacaaccatgtgttaaatgtcaatgtcctaccgaacaa
accgattatgcaatcacatgtacaccatcaactgatccttcacttttaccacataaatgt
atttgtaaagtaggctatgctggtttacgatgtgaacaatgcgctcctggctattatggt
gatccaacaagcatgattgcttgtcaagcatgtgattgcgatagtggaggatcaagatcg
gagacatgtaatcaagacactggacaatgtgattgttggcctggtattaaagggcgtaga
tgtgaccaatgcgaagaagatcatgttgttgatcatggaacatgtcgtgattgtcgtggt
ccatgtaccggtgaattacttattaaatctgattatgtcaaattacaaattgatggatta
aatattaccactttagcttatcaaggtttagctaaattaaaacaacaaatagatatgaat
aagaaacgttttataccatcacgtattcaattagaaaatgaaattctatcacgtacaaaa
caattatttcgacaattgattgaaatcaatcaaagttatataagaatatttaataattat
caagtatttgatcaatcgaattgtgatattttagaacaaatcaatacattgtataatcaa
tctaatttaatagaaaatcaattaaataattggattaatcgattaatgaaacaagaatat
ggacaatcaatgaatttgcatgaattaaaaaattggcaagaacattccaaacaaatttat
actaatttaagtaatatacaattaaatgaaactataatatggttaaatgaaatagaaata
gaaattcaaagaattattcaacgaattaatgaattaatacaatcaataattaatcaaaat
catatacaaattgatttaaatcaattaaatcgatatcaggaattacaaaaatttttaatt
gattatcaaaccaatcaaatatatcgtattagtaatggtaccaaattagcaataaatgaa
ttagatatagcattaaaaaaggcgaatacattagtcgatactgttaaaacgacaacaagt
ttaacaacattacaatcctttaataaacaatcacataatttaaatgaacaattatcccaa
ttagaacaattacatcctaatcaagaacaattgaatcgaattgatacattaaataatctt
ctttatcaattaaatcaaatacaattaccggattccaaacaaatttctatcccatccgaa
ttatatacaaatatcattgaaccaatagaacaagaatcacaacttattcatgataaatta
atcccaacagaacaattaaatcgtacttatttagcttataatgcctatcaattaatgata
gataatataaaattagctgagaatgcaacaaatgaagcagagaatgcatttttgaatagt
actacaacaatagatggtcaacaaattacatggcaaaatcgtttacaattcattattaat
aaacgtgattctattacaaatagattaaataatcaatcaataatttataattcacataat
gaaacattaaatttaattgataaacaattagaaactactgataatgatttaagtacttta
aatcaaattgctttaaataatttaaaattaactaaaaatatagttaataaagttgattca
atacaacaatttttgaaagatacaaaacccctggttcaaaatgcctcggataaattacaa
gtacagttaggacgttataatggattacatgatcgtttacaagaaatggagaatcgattt
tctcaaatacaaggaacagctaaaactctagttgatcgagcaaatattactcaatcctat
ttaattaaatcaattgatgaagttgaacatgttgctagacaattagattcaaaattgtta
aatttacgacgattagctgatgaagcacgttcaatgcttgatgtgaattatggatcatta
tctcatgatccagtacctttacaattaggtcaagattgtgtatacacattggttccttat
agtctaacaaaatctcgagtgtttgatgttgaattttggtttaatttgaataatttacca
actttatcgagtataagtagtgtattaatggttggacgtagagcttttgaaggacataca
caaatgtttgcattcactgttgaagcacctgataatagactacgcttttcatggaatact
ccaaatggaatcctagaattaggtccaattgcaaaaaatacttggtatcatacacgtgtt
acatcagttggtggtgagacaagaatgatacttatggaacgatcatttcaagatcatggt
gatgtatttcccgagatgaaacaaacttctacaacaaatggaacacttgatcaagaagca
aatcttattatggatagacaaatggaattacgtattggaggagttatgcaacctagtagt
cgtttaagtaacccggaagcatggggtgataatggtgctgaggaattctggtcacgactt
atgtcaatggaatcaattaaattttgtatgttcaacttaagattaagtgggacacctatt
agtattgctaattttgctgatgctaatcctgaatgttctaagccaagagaatatcagtgt
cagttaccgtga |
|---|
