Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00009450
Help
Entry
MS3_00009450 CDS
T05004
Symbol
DMXL1_1
Name
(RefSeq) DmX-like protein 1, variant 2
KO
K24155
rabconnectin-3a
Organism
shx
Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
Pathway
shx04142
Lysosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shx00001
]
09140 Cellular Processes
09141 Transport and catabolism
04142 Lysosome
MS3_00009450 (DMXL1_1)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
shx04131
]
MS3_00009450 (DMXL1_1)
Membrane trafficking [BR:
shx04131
]
Exocytosis
Small GTPases and associated proteins
Rab associated proteins
MS3_00009450 (DMXL1_1)
Endosome - Lysosome transport
Acidification regulators
Rabconnectin-3 complex
MS3_00009450 (DMXL1_1)
RAVE complex
MS3_00009450 (DMXL1_1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rav1p_C
M-inducer_phosp
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24589746
NCBI-ProteinID:
XP_051064252
UniProt:
A0A922IGT2
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(3620377..3742901)
Genome browser
AA seq
2556 aa
AA seq
DB search
MTPELLDQIALMDQTVFRLLSELQHAPDVAFAIHPLDGSLIVWYIHGLDLSIPNPEGIRT
HKVIIPYESSFNRDHKFGYESSFIITPNINNRLTQVTCSIRSRLHQVIPFDAAHSLTSKL
FTYLTTDNSKNFMNYFHNENIMNQQKLQNLSDTTEITNKYLITINYQDYLNIFCHLFLLQ
YTIRQCLLKWSKISMKLMNSNNNNSDSSNQKNTLKQLKQTVLKPILSSLAQIHLNSTTFQ
ARTQNSSHVAMITMHTNGSLRYWRIDVSESSHYQWIVGVSSCARLSGHRFHTNIIVPHPI
LPLALSTSHYEHKLEKLPNNESTITTTTSPYNSINKDNKKITNYSEIILWYVSSVGPLTT
GYTSSLLSNYQFRCSQHATNNNNTDSELYNNQFTTTDIKGPGNISSNGGISEVARLIFSN
ISSNTSLTFKYIAWFPCQVTTTATSYPVALFVASLDGNHDNNSHTNNKNEQNNDRLGLFL
TFSKFKQINNKSVLDEKIKQDQQNHLLHSSLNSDTLGCIIQLNYKLPYSSQIENYKNFNA
ETLILHVFPSELIMSKSESCKPINTVLTNPTDQMESFTKSDMNSLSTFLIVRMTRYNSRD
ETANSPVILTSCNETDFCRMEMWRVCVSTNTKSSSSSNMMIDGNSSIKNCITGKSDLISD
NLTTIFNNLITDGIKVCDCKLHLPSGVSIVCAQVSAAHVSWAALSTFNAPPPYLIVTACS
DGCLRFWRCESDSNNNNFTLEGVHDQFTWEEWQMPLMQSMSSCIELQLHTNNNHNKSTRV
NDESQMNKPIILDIDCAYSGRLAVAYTSSQLCNNDNVDKHGQSNLDWIQSNKNDLTIYIT
VYECESSGGCEWILEDTIELTSEYCPFQNNIDKLSSIQLDWVNAEDGGHLLSIIIDSEIF
VFAPVCQNLSLSRNKLRGGHACQPTLMTTIGEVYVGWKPIACTRIVTADFNSSSSLSLSS
LTSIEKKKSMPTQQQESWRYSSTTALHGGSSHRCFIKQAAWLRDGLLLISAKTELQLFSQ
WPSDNLYNLFKWHVKPKLSNTKSLYNSSSANESFDATATTTTSDTVDDSTVSGSSNMSVA
RLTKAYSPYPLKSSPSRSMLHAVSGHSSLSNLHATSNNTTNTTSDTTSDNFKITRKMSQI
DLNRASGSGLDVKSNEQLLKDLELLSNLGLFEAIQIVNPILPQFHPRQLLEWMNLGHLRR
IKAILAHLTRCLTAIGNSSQRSSSQSDSHRRMTKGNLNSELTNFVIESFDSTMTSKMSTT
TTTRINNTTSKPVSSISHTSHSSNNLLEMHTIPPLPLYVLLAVDSLQVTDVNADVKSNKH
FDSINEWNNEHGLTDDSSIFEIQDDDLNLSSNNNDDDDYDVTDRSNPSKTIHHSNPSFNT
SANKSSYLYGFSIWSLKPAALARSIQFSEDDARLLADHLSTQRLPGLSSLDQMYLLGIAD
LMAKTRSDITDCLSKVHSSTNEKKLDQLPRRLSIKQDSNEGLDECGLRFLLTVQLYSYLS
KTLPPARRSQLLSSGLTNSSLVWAYHSDSQEELLSQLPIVSNQLGGSEVSGADSLELNWA
DFKRYGCGWWIRSESLLIRCAEKMARTAFQNTKDPMESAVFYLAMHKAKMVAALFKTTGN
KTLENFFRSDFTPGQPACRQAKLNAFRLLSQHKYLQAAGLFLLAGCLNDAVRVCLDTLKD
LQMGILLVRLYTSSAQGIPGQQTTTSSTYHDFLREHIIKHQDPFLRSMAFWTLGDPLAAL
QTLLEGPGILSNSEDFIISEKRDSLTDSIYQSPQHPQYLSGSQSFITSRDTSKPSSVCPS
VFKFYTYLQSHPLVLRHQRLQAPNLINSTILYRVRSLERRLYFRTAHHYFILGCPTLALE
VLTKLPPLESSGSSSIFGLHRMSVNESIESKSRRQSVFSSDAVVQSVNKQNNDDDIFTFM
TPDVPLQKCTTEDQFTIEWSDDNDDQTDHDDTIDHVKSSTVHMNQKQQMLSPSAQQRPSL
HSIGNYNIENQGVVDLMANQLKFIACLKILAEELSTLAAGAESEGVSLRQHVWQWLESEL
ASVNTLTGLTKSSMTTPTVTSAAHSTNNPVVVSDEKLNEPSFDYSEFSGPLTTTSYLLTT
RNAGTVLAGILMNLSNVSPEIRDAELKRLKTRYDWIKAHEPFLISLINFCDLYGSSGIRL
PAVRIELSLLLGELYSTSYLFTSQSTLSSQNRSDSSLLVATRTTNTNVCYPSLDSSRWPI
SPMALIDGIPLLRTLMRLPPGALLLPDSVKRIKYMVHDLITCLESLPPPFLVSVLLPFPY
QQCNCTSTTTNTTARTSKSSVTSSSPFHCPDCILAPTGDRHRRIFLLRNLCAALSGCIHQ
CLTVGGWFGLGYAVDENSMQSSDTSSPLTKKVFALPASSTINARSVDRLCVSGQIFRPNT
EPSKWPGLTCLKSYTEPQLQSNSVSTSQIIRITSTQNLSDRDLSSPSSSVTRIQSVDRRR
IIGLLSQVLAASYFGLLVYALHTRDTFTLYRLACARLDGKTWSRVFGGTYRAKPFRPPTQ
PGTTTATVTTTSNSSSNVPSNITSERKPVPPSRPKR
NT seq
7671 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactccagaattgttagatcaaatagctttgatggatcagactgtttttcgattatta
agtgaattacaacatgccccggatgtcgcatttgcaatacatcctcttgatggaagcctt
attgtttggtatatacatggtttggatttatctattcctaatccagaaggtatacgaact
cataaagtaattattccatacgaatcatcatttaatcgtgatcataaatttggatatgaa
tcttcatttataattacacctaatataaataatcgtttaacacaagttacatgtagtata
agatcacgtttacatcaagttattccattcgatgcagctcattcattaacatcaaaatta
tttacttatttaacaacagataattctaaaaattttatgaattattttcataatgaaaat
ataatgaatcaacaaaaattacaaaatttatccgatactactgaaatcactaataagtat
ttaataacaattaattatcaagattatttaaatatattttgtcatttattcttattacaa
tatacaattagacaatgtttattaaaatggtcaaaaatttctatgaaacttatgaatagt
aataataataatagtgatagtagtaatcagaaaaatacattgaagcaattgaaacagaca
gtattaaaaccgattttatcttctttggctcaaattcatttgaattcaacaacttttcaa
gcacgaactcaaaattcctcacatgtagctatgatcactatgcatactaatggttcatta
cgttattggcgtatcgatgtatcagagagtagtcattatcaatggattgtcggtgtatct
agttgtgcacgtttaagtggacatcgatttcatacaaacattatcgtaccacatccaata
ttacctctcgctttgagcacatcacattatgagcataaattggaaaaattaccaaataat
gaatccaccataacaacaacaacatcaccatataattcaattaataaagacaataagaaa
attactaattatagtgaaataattttatggtatgtttcatcagttggtccacttaccacc
ggttacacatcatctttactgtcaaattatcaatttcgctgttcacaacatgctaccaat
aataataatactgattcggaattatataacaatcaatttactacaactgatattaaagga
ccaggtaatatatcatcaaatggtgggatttcagaagtggctcgattaatcttctccaat
atatcatcgaatacatctttaacatttaaatatattgcatggttcccatgtcaggtgaca
acaactgctacatcatatcccgttgcattgtttgttgcctctttagatggtaatcacgat
aataatagtcatactaataataagaatgagcaaaacaatgatcgacttggactattttta
acattttctaaatttaaacaaattaataataaatctgtattagatgagaagattaaacaa
gatcaacagaatcatttattgcatagttcattgaattctgatacattgggatgtattatt
caattaaattataaattaccatattctagtcaaattgaaaattataaaaatttcaatgcc
gaaacattaatattacatgtatttcccagtgaattaattatgtccaaatcagagagttgc
aaaccaataaatactgttttaactaatcctactgatcaaatggaaagttttactaaatca
gatatgaattctttatcaacgtttttgattgttcgtatgacacgttataattcacgggat
gaaacagccaactctcctgttattctaacttcatgtaatgagacggatttttgtcgtatg
gaaatgtggcgtgtttgtgtttcaacgaatactaagtcttcttcttcttctaatatgatg
atagatggaaattcttccattaagaattgtataaccggcaaatcggatctaatcagtgat
aatcttacgaccatatttaacaatttaataacagacggaattaaggtatgtgattgtaaa
ctacatttaccatcaggtgtatctattgtttgtgctcaagtatcagcagcacatgtaagt
tgggctgctttatcaacatttaatgcaccaccgccttatttaattgttactgcatgttca
gatggttgtttacgattttggcgatgtgaatctgattcaaataataataatttcactttg
gaaggagtccacgatcaatttacatgggaagaatggcaaatgccattgatgcagtcaatg
tctagttgtattgaattacagctgcataccaataataatcataataagtcaactcgtgtt
aatgatgaatcacagatgaataaacccattattctagacatagattgtgcatatagtgga
cgattagctgtggcatatacttcatcacaattatgtaataatgataatgtggacaaacat
gggcaatcaaatttagattggattcaaagtaataagaatgatttaacaatctatattact
gtttatgaatgtgaatctagtggtggatgcgaatggatcttagaagataccattgaatta
acatcggaatattgtccttttcaaaataatattgataagttatcatctattcaattggat
tgggttaatgcagaagatggcggacatttactatcaatcattattgattcggaaatattt
gtttttgcaccggtctgtcaaaatctttcattaagtcgtaataaactacgaggtgggcat
gcatgtcagccaacattaatgactacaattggtgaagtgtatgtaggttggaaacctatc
gcttgtactcgtatagtcacagctgacttcaactcttcgtcatcgttatcattatcatct
cttacatcaattgaaaagaagaaatcaatgccaacacaacaacaagaatcttggagatat
tcttcaactactgccttgcatggtggtagtagtcatcgttgttttattaaacaagctgca
tggcttcgtgatggtctattactaattagtgcaaaaactgaactccagttgtttagtcaa
tggccatcagataacttgtataatttatttaagtggcatgtaaaacctaaactgagcaat
accaaatcattgtataattcatcaagtgcgaatgagtcattcgatgcaacagcaacgaca
acaacatccgacactgtggatgattctacagtttctggaagctccaatatgtcagtagca
cgtttaactaaagcttattcaccatatcctttaaagtcatcaccttcacgatcaatgttg
catgctgtttcaggtcattctagtttgtctaatttacatgctacttctaataatactact
aatactacatccgataccactagtgacaattttaaaataactagaaaaatgagtcaaatt
gacttgaatcgtgccagcggcagtggattagacgttaaatcaaatgaacaattattgaaa
gacttggaactcttgtcgaatcttggattattcgaagctattcaaattgtcaatccaata
cttcctcaattccatcctcgtcaactcttggaatggatgaatttgggtcatttacgtcgt
ataaaagcgatattagcgcatttaactagatgtttaaccgctattggcaattcatcccaa
cggtcaagcagtcagtctgatagtcatcgtagaatgacgaaaggtaatttaaattcagaa
ctaaccaattttgttatcgagtcattcgactctaccatgacatcaaaaatgtcgacaaca
acaacaacaagaataaataatacaacatctaaaccagtgtcttcaatatctcatacatct
cattcttcaaataatcttttagaaatgcatacaatacctcctttacctttgtatgtccta
ttagctgttgattcattgcaagtaaccgatgttaatgcagatgtgaaatcgaacaaacat
ttcgattctataaatgaatggaataatgaacatggattgactgacgattcaagcatcttc
gaaatacaagatgatgatttaaatctcagttcgaataataatgatgatgatgattatgat
gtgacagatagaagtaacccatcgaaaactattcatcattcaaatccatcattcaataca
tctgcaaacaaatcatcatatttatatggatttagtatatggtcactgaaacccgcagca
ttagcccgcagtatacaattttccgaagatgatgcccgtcttcttgctgatcatttgtca
actcaacgattacctggtctatcatcactagatcaaatgtatttattgggtatagctgat
ttaatggcgaagacacgttccgatattacggattgcttgtcaaaagtccattcatcaact
aatgagaagaagctggatcaattgccacgacgattatcgatcaaacaggattctaacgaa
ggtttagatgagtgtggtcttcgatttcttttaacagttcaattatattcttatttaagt
aaaacattaccacctgcacgtcgatcacaactactttcgtctggcctaactaattccagt
ctagtatgggcatatcattcggattcacaagaagaactgctatcacaattaccaatagtt
tctaatcaattaggcggtagtgaagtcagcggtgctgattcattagaattaaattgggca
gatttcaaacgatacggttgtggttggtggatacgaagtgaaagtcttctgattcgctgc
gctgagaaaatggctcgtacagcatttcaaaatactaaagatccaatggaatctgctgtc
ttttatctggctatgcataaagctaaaatggtggctgcattattcaaaaccactggtaat
aaaacattggagaatttcttccgatccgatttcacaccaggtcaaccagcatgtcgtcaa
gctaaattaaacgcattccgtttactaagtcaacataaatatcttcaagcggctggatta
ttcttattggctggatgtttaaatgatgcagtacgtgtttgtttggatactctgaaagat
ttacaaatgggtattttattagttagactttatacatcatcagcacaaggtattccaggt
caacaaacaacaacatcctcgacatatcatgattttctaagggaacatataattaaacat
caagatccatttctaagaagcatggcgttttggacattgggtgatccattagctgccttg
caaacattattagaaggacctggaatattaagtaattctgaagattttataatatctgaa
aagagagatagtttaaccgattcaatctatcaaagcccacaacatcctcaatatcttagt
ggtagtcaaagcttcataactagtagggatacttcaaaaccatcatctgtatgtccaagt
gttttcaaattctacacgtatctacaatcacatccattagttttacgtcatcaacgttta
caagctccaaatctaatcaattctactatattatatcgtgtaagaagtttagaaagacgt
ttatactttcgtactgcccatcattattttatattgggttgtccaacattagcattggaa
gttttgactaaattaccaccattggaatcttccggttcatcatctatatttggtttacat
agaatgtcagttaatgaatctatcgaaagtaaatcaaggcgtcaatcggtattctcttca
gatgctgtcgtgcaatctgtaaataaacaaaataacgatgatgatattttcacattcatg
acacctgatgttcctttacaaaaatgtacaacagaagatcaatttacaattgaatggagt
gatgataatgacgatcaaacagatcatgatgatactattgatcatgtgaagagtagtaca
gttcatatgaatcaaaaacagcaaatgttatcaccatcagcccaacaacgaccttcactt
cattcaataggtaattataatatcgaaaatcaaggtgtagtggacttaatggcaaatcaa
ttgaaatttattgcttgtttaaaaattttggcggaagaattaagtacactggctgctggc
gccgaatctgaaggtgtttcacttcgtcaacatgtttggcaatggcttgaaagtgaatta
gctagtgtcaatacattgactggtttaacgaaatcatccatgacaacaccaactgtaact
tctgcggctcattcaactaataatcccgttgttgttagtgatgaaaagttgaatgaacct
agttttgattattcagaattttccggtccactgactacaacttcttatttattaactaca
agaaatgctggtaccgttttagctggtatcttaatgaatttatcaaatgtttctccggaa
attcgtgatgccgagttaaaacgattaaaaacacgttatgattggataaaagctcatgaa
ccttttctaatatcgttaattaatttctgtgatctgtatgggtctagtggtatacgatta
ccagcagttcgtattgaattgtccctattacttggtgaattatattcaacatcttattta
tttacaagtcaatcaacattatcgtcacaaaatagatccgatagtagtctgttagtagca
acacgtacaaccaataccaatgtctgttatccttctcttgattcttcacgttggccaata
tcaccaatggctttaattgatggtatacctttattgcgtacattgatgcgtctaccaccg
ggtgcattacttctaccagattcagtaaagcgtatcaagtatatggttcatgatttaatc
acttgtctggaatcattaccacctccatttttagtaagtgttctattaccttttccttat
caacaatgcaattgtaccagtactactactaatactacagcaaggacatcgaaatcatct
gttacatcttcatcaccatttcattgtcctgattgtattttggcacctacaggcgatcgt
catcgtagaatatttttattacgtaatttatgcgctgctctttctggatgtatacatcaa
tgtttaactgttgggggttggtttggtcttggttatgcagtcgacgagaactccatgcaa
tcgtctgatacatcatctccattgacaaaaaaagtatttgctctacctgcatcaagtact
atcaatgctcgttcagttgatcgtttatgtgtatctggtcagatatttagaccaaataca
gaaccgtctaaatggccaggtttaacatgtttaaaaagttatactgaacctcaattacaa
agtaatagtgtaagtactagtcaaattattcgtatcacatcaacacaaaatctatcagat
cgtgacttatcatcgccatcgtcatctgtaacacgtattcaatctgtggatcgtcgtcga
attattggtttattatctcaagttttagctgcatcctatttcggtttattagtttatgca
ttgcatactcgtgatacattcacattatatcgattagcttgtgctcgattagatgggaaa
acatggagtcgtgtattcggtggaacatatcgagctaaaccttttcgaccaccaacacaa
cctggtactactactgctactgttactactactagtaatagcagtagtaatgtaccaagt
aatataacttcagaaaggaagcctgttccaccgagtcgacctaaacggtaa
DBGET
integrated database retrieval system