Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00009565
Help
Entry
MS3_00009565 CDS
T05004
Symbol
HCN1_2
Name
(RefSeq) anaphase-promoting complex subunit Hcn1
KO
K04955
hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 2
Organism
shx
Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
shx00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04040 Ion channels [BR:
shx04040
]
MS3_00009565 (HCN1_2)
Ion channels [BR:
shx04040
]
Voltage-gated cation channels
Cyclic nucleotide-gated channel (HCN)
MS3_00009565 (HCN1_2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ion_trans
Ion_trans_N
cNMP_binding
Ion_trans_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24589304
NCBI-ProteinID:
XP_012793161
UniProt:
A0A922LDE0
A0A095AHG3
LinkDB
All DBs
Position
7:9620182..9722491
Genome browser
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MNRKLLSFQTSTINDTNDITFNRPSEICELQNLNSNEHIDDMNDIPTEQKMEMPEQPENI
KVSRETSDKKLSAGKDKSNNTKKLNNKLRFRYYSVGLLNSLHLLTANSNCNIDTTNKMYT
PIKHLKQPRTRRYTINLPEENDELQSLTFNDAASYMDIGGDNSILNEIEEPLSLDTKTPY
SHQRQSVINNNINNKSGFRERGWSLYNLKEQFISFFQPSDNKLALKLFGNKVALACEKRR
QREQGKWIIHPCSNFRFYWNVIMLILLMANLIMLPVIISFFNDDLPGNWLIFNSISDTLF
ILDIIVNFRTGIIRNDFVDDIILDPTEIAREYLKTWFILDMISSIPMDYVLFAFKGYEQG
ERAEHLVQAGRALRILRLAKLLSLLRLLRLSRLVRYITQWEEFINIASKFMGICNLVLIM
LILGHWNACLQFLVPMLMDFPIDSWVSKARLQNAHWFEQYTWALFKALSHMLSIGYGRYP
PSTLPEAWITIISMMTGATCYALFVGHAAALIQSFDASKRKYREMLKQVEEYMAYKKYPR
ALRRRIAGYYEHRYKGKMFNEKEILGELSECLREQIINYNCRALVASVPIFANADQNFVS
EVIVKLKQEVFQPGDLIIKEGTYGTKMYFIQEGVVNIITKDGILATRLSDGCYFGEICLL
TNARRVASVEAETYCTLYSLDQKNFYDVLENYPEMRVTLEKVAAERLQSLGRRASIIQAS
NNKSDWSDYALKMADEHNANYSTKDTCCGKAQINNESNKSIIQKNRSLASMDFSNAFLET
GLKTKVSNPVIVQSTELLNIQNDHFDKEIRLKMQQPIITTTQIHLSNEFESSITNG
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagaaaacttttaagttttcagacatcaacaataaatgatacaaatgatatcaca
tttaataggccatctgaaatttgcgagctacaaaacttgaattcaaatgaacatatagat
gatatgaatgatatacccacggaacaaaaaatggaaatgcctgagcaaccagaaaatata
aaagtatccagagaaacgtcagataaaaaattatcagccggtaaagacaaaagtaataat
acgaaaaaactcaacaataaattgcgatttcgttattattcagtaggattgttaaatagt
ttacatttgctgactgctaactcaaattgcaacattgacacaactaacaaaatgtacaca
ccaataaaacatttaaaacaaccgcgtacacgcagatatactatcaaccttccagaagaa
aatgatgaattacaatctctaacatttaatgatgcagcatcatatatggatattggtggt
gacaattctattttaaatgaaatcgaagaaccattatctttggatactaaaactccatac
agtcatcaacgtcaaagtgttattaataataatataaacaataagagtggttttcgtgaa
agagggtggtctttgtacaacttaaaagaacaatttatttcattctttcaaccatcggat
aataaattagcgcttaaattatttggcaacaaagtagctttagcatgtgaaaaacgtagg
cagcgtgaacaaggtaaatggattatacatccatgcagtaattttcgattttactggaat
gtaattatgctcatcctacttatggctaatcttataatgttgccggtgataatttctttt
tttaatgatgatctacctggaaattggcttattttcaacagtatctcagatacacttttc
atattggatattattgtgaattttcgtactggtattatcagaaatgattttgtagatgat
attatacttgacccaacagaaattgctcgcgaatatttgaagacatggtttattttagat
atgattagttctataccaatggattatgttttattcgcattcaaaggatatgaacaaggt
gaaagggctgaacatttggtgcaggcaggtcgtgcgctacgaatactgcgattagcaaaa
ctcctgagtttattaaggcttctacgtctttcgcgtctagttcgttatataacacagtgg
gaggaatttatcaatattgcaagcaaatttatgggaatatgtaatttagtactaattatg
ctaatattgggccattggaatgcatgcttacaatttcttgtaccaatgttgatggatttt
ccaatagacagttgggtcagtaaagcacgattacaaaatgctcattggtttgaacaatat
acatgggctttgtttaaagcactatcacatatgctgtcgattggttatggacgttatcct
ccaagtacattgccagaagcatggattactattataagtatgatgacaggtgctacatgt
tacgctctatttgttggtcatgcagcagcactgatacaatcatttgatgcatctaaacgt
aaatatcgagagatgttaaaacaagttgaagaatatatggcttataaaaaatatcctcga
gcgttaagaagacgtattgctggttattatgaacatagatataaaggtaaaatgttcaat
gaaaaagaaattttaggtgaattatcagagtgcctaagagaacaaattataaattacaac
tgtcgtgccttagtagcatctgttccaatatttgctaatgccgaccaaaatttcgtgtca
gaggttattgttaagttaaaacaggaagtatttcaacccggtgatttaattattaaagaa
ggaacgtacggcacaaaaatgtatttcatacaagaaggtgttgttaatatcattactaaa
gatggtatactagctacaaggttgtcggatgggtgttatttcggagaaatatgcttatta
acaaatgcacgacgtgtagctagtgttgaggctgagacttattgtacactttactcactg
gaccaaaaaaacttctacgatgttttagaaaattatccggaaatgagagtaacattggaa
aaggtagctgcagaacgcctacaatctcttggtcgtagagcatcaattatacaggcctca
aacaataaaagtgattggtcagattatgctctaaaaatggctgacgagcataatgcaaat
tattccacaaaggatacctgctgtggaaaagcccagattaataatgaatcaaataaatcc
attattcaaaaaaatagatctttagcatccatggatttcagcaatgcttttttggaaact
ggtctgaaaacaaaagtgtcaaatcctgttattgttcagtcaactgaattgctaaatatc
caaaatgatcattttgataaagaaatcagattgaaaatgcaacaacctattattactaca
acacaaatacatttgtcaaatgaatttgagagctcaataacaaatggatag
DBGET
integrated database retrieval system