Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00010109
Help
Entry
MS3_00010109 CDS
T05004
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
shx
Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PDZ
PDZ_6
PDZ_2
DUF6288
RET_CLD3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24597717
NCBI-ProteinID:
XP_051073851
LinkDB
All DBs
Position
1:35049069..35105838
Genome browser
AA seq
1139 aa
AA seq
DB search
MSETAISMSENNQNNIQDSDKFYPITTNTIQSNMCPDKLLNTSPIYSVKNLIHELNSSSS
VTSNKTVVKTSFCPNVTLNGEINLFTISNYNTNSSTNETISFCTKQSDSIISTNVSNSNS
LDRSTYIILSQNNCIPFYTLQRNSFYKSAYRPQLSLSCQPSPNISYNRTFSNDINNNLIS
FKRKQNTLFSDIAVYSINVTETLKYPSENINNSSLSVKYGLKNSCQSPNESSSFKLKNHF
HRFLKYSSKFGGFTRSENNSPALLSSSTSPVHPNQQPLKNAYTSRYSAWDPMISSSSVKL
IDTCLIKKSSGFGLTLSGVITFIPNGILDVNVISNLSDKQEGFYQRLLQIRSVSDDVMTY
ENDLVQSRGKNNSIRPGDILLAAGGCRLAGCTPEYAVQLLAKVPVGSAVQVTLLRGLGIP
GIYSVNEDRNYAKHFYEPRSFSLCSSMSSSSELSPKKITSDFESQNGSKFARSYMEHFCS
NCCNSLRTVNLIKKENDYGFTYFYTNYGCLVNQVTRSSINQLNKTKLQPGDLIVKIGNFD
VVKLTKTQFSQLLNVYLKSKSIQFTVIHVCSSCLKQVNQASIHLNSNKSTNNYLNLNKTT
IIPTKETVTETNKDEMISFLRTLLNKNCHGKKSTNHNLQTKHKNTSLNTSELNNVNNLLM
KRTPESWLPEKCSTPGIGKSGPCDTPDYIPISQLLNTSKTNNHQINNSSYLYNMPQSDVF
KQNQINEQQQSFTNYKHCDDSLLDRITSPCLSPSIQMKNSHNPVLNIPEINTSNTNCNNF
TEENVKIRYSTKDGKLKFVKENAEQNLPCIIPMEDNGSSGESSQNLVVGDLLVAIENHSV
LSCKPSEIEELLRLAAKNNNGFVTLTVRRIHSSDKAECMKISEIPTKDSISSNIINVKLL
KEKDEGFGFVIVSSLNKEKASEIGRIIPGSPADKCGQLEVGQRILAINGYCLLGINHMDI
VNLIRQSQQQLILTIEKPGSLSNDQHKSRTNSFDTDENLIPPATSTMICSNPTVCFRPTN
GLKTTELLDENCVVKPSLNNISTRSLYSITLQRGPNGFGFSVRSGFDSNTSPLIVYRIAD
NGPAFQEGQMKVGDEILEINGISTFTMTHQQAVTLIRSSGSTLRILLQRFRENQYEYSF
NT seq
3420 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccgaaacagcgatttcaatgagtgaaaataatcaaaataatatacaagatagtgat
aaattctatccaatcacaacaaacactatacaatcaaatatgtgccctgataaactactg
aatacatcaccaatatattcagttaaaaatctaatacatgaattaaattccagttcatca
gtgacttcaaataaaactgtagtaaaaacatcgttttgtccaaacgttaccttaaatgga
gagataaatttatttactatttctaattataacacaaattcttctacaaatgaaactata
tcattttgtacaaaacaaagtgacagcatcatttctactaatgttagtaatagtaatagt
cttgaccggtcaacttatataattctatcacaaaataattgtataccgttttatacatta
caaagaaattcattttataaatcagcttatcggccacagttatcattatcttgtcaacca
tcaccaaacatctcatataatcgtacattttctaatgatattaataacaatttaataagc
tttaagagaaaacaaaacactttatttagtgatattgcggtgtactctatcaatgtcact
gaaactttgaaatatccttcagaaaacataaacaatagttcactctcagtcaaatatggt
ttaaaaaatagttgtcaatcaccaaatgaaagttcatcatttaaattgaaaaatcatttt
catcgatttttgaaatattcatcgaaatttggaggttttacaagatcagaaaataattca
cctgcattattatcatcctcaacatcaccggttcacccaaatcaacaaccacttaaaaat
gcttatacatctagatacagtgcttgggatcctatgatatcatcgagtagtgttaaacta
attgatacgtgtttaattaaaaaatcttctggctttgggttgacgttgagtggagttata
acatttattccaaatggtatattagatgtcaacgttatatctaatttatcggacaagcaa
gaagggttctatcaacgtttattacagatacgaagtgtgagtgatgatgtaatgacatat
gagaatgatttagtccaatcacgtggaaagaataattcgatacgacctggtgatatatta
cttgctgccggtggatgtcgtttagccggctgcactcctgaatatgctgtacagttgtta
gccaaggttccagtaggcagcgctgttcaagttactttacttcgaggactaggaattcct
ggaatttattctgtaaacgaagatcgtaactatgccaaacatttttatgaaccgagatca
ttcagtttgtgttcttcaatgagcagttcctcagaattgtcgccaaaaaagataacttca
gattttgaatctcagaacggatcgaaatttgcgagatcctacatggaacacttttgttca
aattgttgcaattctctacgaactgtaaatttgattaaaaaagaaaatgattatggattc
acttatttttatacgaattatggatgtttggttaatcaggtaaccagaagtagcatcaat
cagttaaataaaacaaaattacaaccaggtgatttgatagtgaaaattggcaattttgat
gtggttaaactgaccaaaactcaattttcacaattattaaatgtatacttaaaatctaaa
tcgatacagtttactgtgattcacgtttgctcaagttgtttaaaacaagtaaatcaagca
agtattcatttgaattctaataaatctacaaataattatttgaatttaaacaaaactact
atcataccaactaaagaaacagtaacagaaacaaataaagatgaaatgatctctttccta
cgaacactattaaataaaaattgtcatggaaaaaaatccacaaatcataatctacaaaca
aagcataaaaacacttctttgaatacttctgaattgaacaatgtaaataatttattaatg
aagaggacacctgaatcatggttacctgaaaaatgtagtactccaggtataggtaagagt
ggtccttgtgatacgccagattatatacctatatcacaattattaaatacatcgaaaaca
aacaatcatcaaatcaataattcttcttatttatataatatgccacaatctgatgtgttc
aaacaaaatcaaataaacgaacaacaacaatcatttacaaactataaacattgtgatgat
tctttattagatcgaatcacttcaccttgtttatctccatcaatacaaatgaaaaattct
cataatccagtgttgaatattcctgaaatcaatactagtaatacaaattgtaataatttc
actgaagaaaatgtgaaaattcgttatagtacaaaagatggaaagttaaaatttgttaaa
gaaaatgctgaacaaaatttaccatgtattatacccatggaagacaatggaagttcagga
gaatcaagtcaaaatttagtggtaggtgatctgttagtggctattgaaaatcattctgta
ctgagttgtaaacctagtgaaattgaagaattacttagattagcagcgaagaataataat
ggttttgttacgttgactgttcgtagaatacattcatcagataaggctgaatgcatgaaa
atatcagagataccgacaaaagattcaattagttcaaacataatcaatgtgaagttatta
aaagagaaagatgaaggttttggttttgtgattgtcagctctttgaataaagaaaaagca
agtgaaataggtcgtataattccaggtagtccagctgataaatgtggacaattagaagtt
ggacaacgtatactggctataaatggttattgtttattaggaattaatcatatggatatt
gtaaatcttatacgtcaaagtcaacaacaattaattttgacaattgaaaaacctggttct
ttgtctaatgaccaacataaaagccgtactaacagtttcgatacagatgaaaaccttatc
ccaccagctacttctacaatgatttgttccaatccaactgtatgttttcgtcctacaaat
ggtttaaaaactacagaactgctggatgaaaactgtgttgtaaagccaagcttgaataat
atttcgactagaagcttatattcaattacattacaacgtggtccgaatggttttggcttc
tccgtccgcagtggattcgactcgaacacatctccgttaattgtatatcgaatagcggat
aatggaccagcttttcaagaaggacaaatgaaagtcggagatgaaattctagaaattaat
gggattagtacatttacaatgacacatcaacaagctgtcacattgattagatcaagtgga
tcaactctaagaattctattgcaacgtttcagagaaaatcaatatgaatattcattttaa
DBGET
integrated database retrieval system