Schistosoma haematobium (urinary blood fluke): MS3_00010380
Help
Entry
MS3_00010380 CDS
T05004
Symbol
ABCA3_16
Name
(RefSeq) ATP-binding cassette sub- A member 3
Organism
shx
Schistosoma haematobium (urinary blood fluke)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC2_membrane_3
R1_ABCA1
AAA_21
SMC_N
AAA_23
AAA_22
AAA_29
SPC12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24596350
NCBI-ProteinID:
XP_051071355
UniProt:
A0A922S2R0
LinkDB
All DBs
Position
ZW:38468025..38519106
Genome browser
AA seq
1812 aa
AA seq
DB search
MARTCSNFVWVTKKNILLFWRSWFQAIFVIVVPLLLVSVLVFLRGRATREVVKQPLNWSS
FRVDSGFYFSHKYVAYAPNDTLNLQLMNAVHMYTNLQPFGFKTEGDAIAFFQSNDVRSKE
TLGAVIFDPFSNLSVASYTIRLRSKNDWSTRVLFPMFFKGGPRSKDIAASPPNYKEEFLV
LQYAIDRSLININCKVNDSSQKLKVVLQRMPFPPYIKDEFIIIIQKQLALMLILGFIFPT
LYCTRLILIEKQRGMKEMLKLLGLGESTYWFSWLITNLFVFTLISLFLSILLCFQLSGNG
PILGLSNPFLIFLSLLLYGISIFTFGFALSTLFNSAHTGVAIVCTVMIVISLPYPLLERH
YNELNIFIKMFACLLPSLGMGFLCILIGQFEGAGLGVQFSSYFKPASPDDSLSIHLLCSM
FIFDSIVFLILTHYISAVWPGKYGIPKPWYFPFLCLCRRKLTFEVLLDNPKPNELTRNVK
ETTRLLSLPNTDGRNEELQTDQQININNTEFIPSDPFPEKNEPLLEHNDDGDDTLERLSA
PSSDMHEYFESEPIGLQVGIAIDHLCKVYSNKQSTVVAVSGLTMNIYEGQITVLLGHNGA
GKTTTLSILTGLYPPTSGTAYIYGHDIRNNIEGIHGNLGFCSQHDVLYDTLTVEEHLYLS
AHLRGCDNSTVEQQVERTLRKIYLRDKKSEYTKTLSGGMKRRLSIGMALIGDSKVLILDE
PTSGLDPDARRQVWDMLQAERQQKTILVTTHYMDEADHLGDRIAIMAGGELKCCGSPLFL
KAKYGAGYLLSIVKQSSCPSDYVLKQVKHHIPNAFTRSDYGEEIRILLPLESIDKFGNLF
EDLESNKISLGISSFGVSVTTMEEVFFQVSKQTNIVSCCSRETRERRCKTTEQSRCTPET
KVGHKQLRNQGFLFYRQQFCALMIKRYIFTKRNLIFVLSQIIVPIAFTLIALFIFHHLLN
KNNSLDPRLDLLLKPYGKDLLLTLSNEAEGWEKRQNTDKFIQSYMRQFDNKQVTPIEFNT
STGSYEDHLLKQIAIPHLFYFRLKSIIGLVVDTKSTLKDQIISLRAYFQGESFHAAPISL
NAVVNGFLQYLTSVNQTICPGLTTKNSPPQIYVSNQPLPETKEERAKQIDEIEGLMRVVV
AGFPLASNILFAASYLASCFGFFPVYETVTKAKHLQFVSGVKLALYWISIYVWDLCIFFL
SVGSILLCFMAFNLEQFALGERFHNLVILFGLFIWAVLPQTYLLSRLFRSPTSGLVWITT
INVFTASIGLIMVGLLSHPMIHQQAVGVCLMYFWIAISPSFCLSHGIFQLFINYQFRQVC
DSPLVQFLCLVDQVNACCLKTCDPFCAYWTNNELSYKLGGVGAHLTALSIHGFLYFSLVL
ISDSSIGRNLKICLIVLYRRFRYRHHNPELLLLNQYHDDLSFDDSNLPAEDVDVRQHRHL
VESLPYARLKEQTSLALCRVSKTYGSINPQCKQNKKPAVDRLSLAIPPSECFGLLGVNGA
GKTTTFRMITGDLEPSSGHIIVVGHDLNRNLRKAQQSLGYCPQFDALLPYLTGYETLQLF
ARLRGIQEGLLNTEIDQLLSDLKLTDLAHVLVSRYSGGNRRKLSVAIALVGETPLICLDE
PTTGVDPISRRHIWNLLLKYRRQGRTLVLSSHSMEECEALCSRVSIVVNGRMKCLGTCQH
LKSRFGHGYSLNIQVMIPMVNHHLSSLNAEPTVPSTSSSRVPHQLSLINAVNNVDSFIKR
EFPDARLVDRHQGVLQYHLPTDGRNQIRLSHIFHLMESNKTRLGLLNYSINQTTLEQIFI
DLIKLQEEPVNQ
NT seq
5439 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctcgtacttgctctaattttgtttgggtgacaaagaaaaatattctgcttttttgg
cgttcgtggttccaggctatctttgtaattgttgttcctttgctcttagtaagtgttctt
gttttcttacgtggaagggcaacaagagaggtagtaaagcagcctttaaattggtcttcc
tttcgtgtagatagtggtttttatttttctcataaatatgtggcatacgctcccaatgat
acactaaatctccaactcatgaacgcggttcatatgtatacgaatttacaaccttttggc
tttaaaacggaaggtgatgctattgcgttctttcagagcaatgatgtcagatccaaagaa
acattaggagccgtgatctttgatcctttttccaatttgagtgtggcaagttataccata
agacttcgctcaaaaaatgactggtctacgagagtgttattcccaatgtttttcaaaggc
ggcccaaggtctaaggatattgcagcgtctcctccaaactataaggaggaatttttagtt
ttacaatatgctatagatcgctccttaatcaacataaattgcaaagtgaatgattcttcc
caaaaattgaaggtcgtattacaacgaatgccgtttccaccttatatcaaagatgagttt
ataattatcatccaaaagcaactggcacttatgttgatattgggcttcattttcccaaca
ttgtattgcactcgacttatcctgatcgaaaaacaacgaggaatgaaagaaatgttaaag
ctcctgggattaggagaatcaacgtattggttttcctggctgattacaaacttgtttgtg
tttactctcattagcctctttcttagtattttactctgtttccaattatcaggaaatggc
cctattttggggctatcaaatccattccttatttttttgtcattgctcttatacggtatc
agtatttttacctttggatttgctctttctactttattcaactctgctcatactggtgtg
gcaatagtttgtacagttatgattgttatctcattaccttacccacttttggaacgacat
tataatgaactaaacatattcattaaaatgtttgcttgtttattacccagtttaggcatg
ggtttcttatgcattttaattgggcaattcgagggcgcaggtttgggtgtacaattctca
tcttatttcaaaccagcttctccagatgacagtctatctattcatctcctctgctcaatg
tttattttcgattctattgtatttctgatacttactcattatataagtgctgtttggcct
ggaaaatacggtattcccaaaccatggtacttcccatttctctgtttatgtaggcgaaaa
ctaactttcgaagtcctgcttgataacccaaagccgaatgagctgacaagaaatgtaaaa
gaaacaacaagattactctctttaccaaatactgatggtagaaatgaagagttgcaaaca
gaccaacaaataaacattaataatactgagtttattccatcagatccatttcctgagaaa
aacgaacctttacttgagcataatgatgatggcgatgacacacttgaacgactatctgca
ccaagttcggacatgcatgaatatttcgaaagcgaacctattggtttacaagttgggatt
gcaattgatcacttatgtaaagtctattctaacaagcaatctacggttgttgctgtgtct
ggtttaacaatgaacatttatgaaggccaaataactgtacttctagggcataatggggct
ggtaaaactacgactctatccatactgaccggtttatatccacccacttctggtacagct
tatatatatggtcatgatattcgtaataatatagaaggtattcatggaaatcttggtttt
tgttcacaacacgacgttttatacgacacattaactgttgaagaacatctttatctgtct
gctcacctcagaggctgtgataattccactgtcgaacaacaagtggaaagaactttgaga
aagatttatttgcgtgacaaaaagagtgagtacacaaaaacattgtctggtggaatgaaa
cggagactatctattggaatggccctaataggtgattctaaagttcttatattagacgaa
cctacctcaggattggatcctgatgcacgtcgtcaagtgtgggatatgctgcaagctgag
cgtcaacagaaaacaatcctagttactacacactatatggatgaagctgaccatttaggt
gaccgtatcgcaatcatggctggcggtgaactcaagtgttgtggatcaccattgttcttg
aaagcaaaatatggtgccggttacttactatctatcgtcaaacaatccagttgtccatct
gattatgtattaaaacaagttaaacatcacatccctaatgcatttacacgcagtgattat
ggtgaagagatccgcatactgctaccattagaatcaatagataaatttggaaatttattt
gaggatctggagtcaaataaaattagtttgggcatttcaagttttggtgtatctgtcaca
acaatggaagaagtattctttcaagttagtaagcagacgaatatagtcagttgttgcagt
cgtgaaactcgtgagagaagatgcaaaacaactgaacaaagccgatgtacaccagaaact
aaagtcggtcataaacaactacgcaatcagggctttttattctaccgccaacaattttgt
gctttaatgatcaagcgttacatattcacaaaacgcaatttaatattcgttctcagtcaa
attattgtacccattgcgttcaccttgatcgctttattcatatttcatcatttactaaat
aaaaacaattcactcgatccacgtttggacttgttattaaagccttatggtaaagatttg
ttacttacattaagcaatgaagctgagggttgggaaaaacgtcaaaacactgataagttt
attcagtcctatatgcggcagtttgataataagcaagttacgccaattgaattcaataca
tccacaggaagttatgaagatcatctactaaaacaaatagccattcctcacttgttttac
ttccgtctcaaatcaattatcgggctagtggttgatacaaaatcaactctcaaagaccaa
atcatttcattacgtgcttactttcaaggtgaatcatttcatgctgctccaatttctttg
aatgcagtcgtgaacggatttttacagtacctaacttcagttaatcagacaatatgccct
ggtctaactactaaaaacagtccgccacaaatttatgtatctaatcaacctctgcctgaa
accaaagaggaacgtgccaaacagattgatgaaatcgaaggtcttatgcgcgttgtagta
gcaggctttccattagcgtccaatattctattcgctgcgtcctatttggcctcttgtttt
ggtttctttccagtttatgaaactgtgactaaggcgaagcatttgcaatttgtttctgga
gtaaaattagcactctactggatatctatctatgtgtgggatctgtgcatattttttcta
tccgttggttctatattattgtgctttatggcattcaatttggaacagtttgctcttggt
gaaaggtttcacaatttagttatattatttggattattcatttgggctgtattaccgcaa
acatatttgttgtctcgactattccgatcacctacatctggtttggtttggattacaact
atcaatgtattcactgcttctatcggtcttataatggttggtttactatctcatccaatg
attcatcaacaagcagttggggtttgtctaatgtatttttggattgctatttctccatca
ttttgtctttctcatggtatattccaattatttattaattatcagtttcgtcaagtttgc
gattctccacttgttcaattcttatgtcttgtggaccaggtaaacgcttgctgcttaaaa
acctgcgatccattctgtgcatattggaccaataatgaattatcctataaattgggtggt
gttggcgctcatcttactgctttatctatacatggctttctctatttttcccttgtatta
atttcagattcgtcaattggaagaaatttaaagatctgtctcatcgtattgtatagacgt
tttcgttatcgacatcacaatcctgaattattgttattaaatcagtatcacgatgactta
agcttcgacgatagtaatttgccagctgaagatgttgatgtacgccaacacaggcatcta
gttgaatcgttaccgtatgcacgactaaaagaacaaacttctcttgcactatgccgcgtt
agtaaaacttatggatcaattaatccacagtgtaaacaaaacaaaaaacctgcagtagac
cgcctatccttagctattcctccatcagaatgctttggtttattaggcgtaaatggtgcg
gggaaaacgacaacctttcgaatgataacgggggatttagaaccttcttctggacatata
atagttgttggacatgatttaaatagaaatttacgaaaagcacaacagtctttgggttac
tgtccacaatttgatgcactcttaccgtatcttactggatatgaaacattgcagttgttt
gctcgtctacgtggaattcaagaagggcttttaaatacagaaatcgatcaactattaagt
gatctgaagttaactgatcttgctcacgttttagtcagtcggtacagtggtgggaatcga
cgaaagttaagtgtagcaatagcgcttgttggtgaaactccgcttatttgtttagatgaa
cctaccaccggtgtagatcctatatcacgtagacatatttggaatttgctcttaaaatat
agacgtcaaggacgtacactggtactcagctcacatagtatggaagaatgtgaagcatta
tgttctcgtgtcagtattgttgtcaatggtagaatgaaatgtttgggaacgtgccaacac
ttaaaatcacgtttcggtcatggctatagtcttaatatacaagtgatgattccgatggta
aatcatcatctcagttcacttaatgctgaaccaaccgtgccatcaacatcaagttcccgt
gtcccacatcagttgtcattaattaatgcagtaaataatgtggatagttttatcaaacgt
gaatttcccgatgcacgtttagttgatcgacatcagggtgtactacaatatcatttacca
acagatgggagaaatcaaatacgcttaagtcatatattccaccttatggaatcgaataaa
acacgtctcggactactaaattattcaattaatcaaacaactctagaacaaatatttata
gatttaattaaactacaagaagaacctgtaaatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system