KEGG   Candidatus Sulfidibacterium hydrothermale: LA303_02325
Entry
LA303_02325       CDS       T07944                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K21573  TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
shyr  Candidatus Sulfidibacterium hydrothermale
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:shyr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:shyr02000]
    LA303_02325
Transporters [BR:shyr02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   LA303_02325
SSDB
Motif
Pfam: CarbopepD_reg_2 Plug TonB_dep_Rec_b-barrel CarboxypepD_reg CooC_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: UBM62826
LinkDB
Position
598731..601763
AA seq 1010 aa
MLKKLFKSAALLVLLFFMGGISAAMAQSGTVRGTIVDASDGSPLPGATVQVKGTTTGTVT
DMNGKYSIQVNGNAVLVFSYVGYQSQEIAVKPNTVVNVRLKPSAANLNELVVIGYGTVKK
KDATGSVTAIGSKSFNKGAITSPTDLLAGKVAGVQITTNGGAPGSGTTIRIRGGSSLSAS
NDPLIVVDGVPLDNSQTAGMRNPLNSINPEDIATFTVLKDASATAIYGSRASNGVIIITT
KKGRVGQPLRVNYSGKFSFYTTPNKVSVFDTQSYKSLVEERYAGQDDVLKLLGNSSTNWQ
DEIFQDAFGMDHYVSVTGAYKTLPYRVSAGYSNTDGILKTDNLKRTTLAASLTPTLFKDH
LKITFNVKGTFVKNHFADQGAIGAATQFDPTKPVRSDSTYTVYFNQPDGTPDSMTTNYGG
YYTWTQANGSPVKLATTNPVALLNLTDNSSDVSGVIGNLKLDYKLPFFPEMSAHLNLAYD
HSKSTGAYIVPEYASWTFDPVHGGGVYNSYEQKKKNDLLDFYLNYDKDVKSIHSTFNAMV
GYSWQHFWRRDYSENGNYSHTWNLDTIDHPTEYYLVSFFGRFNYAYKDKYLLTFTLRDDG
TSRFSPDTRWGLFPSVALAWRINEEPWLKDSKVLSQLKLRLGYGITGQQNINQGNYPYLP
RYTLSQNNAAYQLGNVFYLTLRPEGYNPNIKWEETTTYNAGIDYGFLDGRIYGSFDYYYR
KTKDLLNFIPVPAGSNLTNYLLTNIGDLENKGVEFSINAVVISKKDLSWSVGFNASSNSN
KITKLTATNNPDYLGVAVGGISGGVGNTVQIHSVGYPAYSFYVYQQVYDENGKPIEGLYV
DRNGDGQITDADRYHYEDPAPKFYFGITSNLRYKDWTFSFSGRANFGNYVYNNVSSMNGV
YDRLYRPEGPYLSNITTDVTQTGFVDPQYLSDYYVQNASFFRMDNISLGYQFKNLNKSQK
NPINLGLSFTINNAFVITDYTGLDPEVSNGIDNNIYPRPTTYVLGVNLQF
NT seq 3033 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctaaaaaagttattcaaaagcgctgctttgctggtgctcctcttttttatgggggga
atatcagcggcaatggcccagagcgggacagttcggggtaccattgtggatgcatcggat
ggttcacctttgccgggtgctacggttcaggtgaaagggacaaccaccggaaccgttacc
gacatgaacggtaaatacagcatccaagtaaatggaaatgccgttttggtgttttcgtat
gtgggttatcaatcccaggaaatagcagtaaaaccgaacactgtagtaaatgttcggtta
aaaccatctgctgctaatctgaatgaactggtggttattggttacggaaccgtaaaaaag
aaagatgctaccggttcggtaaccgccatcggctctaaaagttttaacaaaggagcaatt
acttcgcctaccgacctgttggcggggaaagtggccggtgttcaaattaccaccaacggc
ggagcccccggaagcgggacaaccattcgtattcgtggcggttcgtctctttcggccagt
aacgatcctttgattgttgtggacggtgtgcctttggataattcccaaacggccggaatg
cgtaatccgcttaactccatcaacccggaagacattgctacctttaccgtattaaaagac
gcttcggctaccgctatttacggttcgcgggcttctaacggggtaattattattaccact
aaaaaaggaagagtaggacagcctttgcgggtaaattattcgggaaaattttcgttttat
actacccctaacaaagtcagtgtgttcgatacccaaagctataaatcgttggttgaagag
cgttacgctggccaggatgatgtgctgaaactgctcggaaacagcagtaccaactggcaa
gacgagattttccaggatgctttcggtatggaccattatgtaagtgtaaccggagcttac
aaaacattgccttatcgtgtttcggccggttattccaatacagacggtattttaaaaacc
gataatctgaaacgaacgacactggcagcatcgttaacgccgaccttatttaaagatcat
ttaaaaatcacctttaatgttaaaggtacttttgtaaagaatcattttgctgaccaggga
gctattggcgctgccacgcaatttgatcctaccaagccggtaagatccgattcaacctat
accgtttattttaaccaaccggacggaactcctgattcgatgacaacgaattatggtggt
tattatacctggacacaggctaatggctcgccggtaaaactggctactaccaaccctgtg
gctttgttgaatttaacagacaacagttcggatgtaagcggggtgataggaaacctgaaa
ctggattataaacttcctttcttcccggaaatgagtgctcacctgaatttggcttatgac
cattcaaaaagtaccggtgcttacattgttccggaatatgcttcctggacatttgatccg
gttcatggtggcggagtttataatagttatgagcagaaaaagaaaaatgacctgcttgat
ttttatctgaactatgataaagatgtaaaaagcattcacagtacctttaatgccatggtt
ggatattcatggcagcatttctggagaagagattattctgaaaacggaaactattcgcat
acctggaatcttgacaccattgatcatcctaccgaatattatctggtttccttttttgga
agatttaattacgcatacaaagacaaatatttgttgactttcactttgcgtgatgatggt
acttcgcggttctcaccggatacccgttggggattgttcccgtcagtggcacttgcctgg
cgtatcaatgaagaaccctggctgaaagattcaaaagtactttcgcagttgaaactgaga
ttgggttacggaattaccggtcagcaaaatatcaatcagggaaattatccctacctgccg
cgatatacgctgagccaaaacaatgcagcgtatcagctgggtaatgtattttatctgacc
cttcgtcccgaaggatacaatcctaacatcaaatgggaagaaaccactacttataatgca
ggtattgattatggttttctggatggccgtatttacggttcatttgattactattatcgt
aaaaccaaagacctgttgaactttattccggttccggcaggttctaacctgacaaactat
ctgctgactaatattggtgaccttgaaaataaaggggttgagttttccattaatgccgtg
gtaatttctaaaaaagatcttagctggtctgtgggctttaatgcatcatccaattccaat
aaaattaccaaattaacagcaactaataatcctgattatctgggagtggctgttggcggt
atctccggtggtgtaggtaacacggttcagatccacagtgtgggatatccggcttattcg
ttttatgtttaccagcaggtatatgatgagaacggaaaacccattgaaggactgtatgtc
gaccggaacggcgatggccagattaccgatgctgaccgttaccattacgaagatccggct
cccaaattttattttggaattacttccaatttgcgttataaagactggacattctctttc
tccggaagagcaaacttcggaaactatgtatataataacgtaagttccatgaacggtgtt
tacgaccgtttgtatcgtcctgaaggaccttatttgagcaacatcactacagatgttaca
caaaccggatttgttgatccgcagtatttatcggattattacgttcaaaacgcttctttc
ttcagaatggacaatatctcattgggatatcagtttaaaaacctgaacaaaagccagaaa
aaccccatcaatctgggactctcttttaccattaacaatgcttttgtgattaccgactat
accggactggatccggaagtgagtaacgggattgacaacaacatttatccccgtccgaca
acttatgttttgggtgtaaacctgcaattttaa

DBGET integrated database retrieval system