Saccharolobus islandicus M.16.4: M164_0757
Help
Entry
M164_0757 CDS
T00906
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
sid
Saccharolobus islandicus M.16.4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Vps54_N
ARM_KNTC1_1st
UVR
TPR_12
SHNi-TPR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACR41375
UniProt:
C4KFF9
LinkDB
All DBs
Position
704801..710794
Genome browser
AA seq
1997 aa
AA seq
DB search
MIFQRKIFESLLTCLFRIKIVNSMSEDNLTVIETIKSLIKQNKFEEALKLAKENNLDPQS
INYIKALIYVQEALEDIRADRSTEAINKLNLAQKLAPTLDLSYYFAVANMQELLSEAENE
LRNENYNTALQNLQQALQIAQQYNLTKMVEKISRQINRVNAYLQIENLKNEMKKAVRNFN
FAEAYNLISQAVNIANQYDLYDQKLENMQKAFFYLAKIPPIPQPPQQQNLTLSILYNYIN
ELYNYFTNAYNLAVEAVKYNDKISFLAEEFAKTAKILEVTSSAMSLLLEAQKLAEQKNVD
AVKTAIANIQNAIQQLENINAENSIVESLYSAVVELAKKMYNEYTAYLYVLENLKKSNEL
IENGDFSEAVQLLQNAQQIAQRAGLQLNLANYIQGFSILENLKPLPQPPKEADFSSLASY
FSQLTDTLKSNYNTLQQASKYITINNLQDISADVTVAQLLANAMQDLANAQSLLEQKPEQ
VLQNKQQITQYITNAIQLLQQAQGTSSDLQQTAKQLFEEAQQYQDTVNVYLNGLQYAVNA
MNAIDTVNKILAQKPNAQTPSQYFAQFSNNYATALKTIRDAIYLASNANQLFESIKLQPP
FDLSELEKDQVEIAEFTHLFATASSAYADIENAESEKHDNSPGGLANYYRNIASAMANAI
SDIENVSTQQGDVEKTKEELLNNLKKQYYTFDALSHAYQIVANAQTNDPQTLYAVYNSAS
RYLRTASEQFNSEQLAQLAGQFENVAQFYRNIAIAQTEVAQANNTQSINDKIAYLQSAIN
YLTRAEEYVPQESGEINKKKAQIEQAIKTLQTIQAYRQNVTSSLQSGNYASALAYYNELL
KNTTHTNIDNVLNDIAQNNYFQAIQDIQSNSSLTPEQKQFLSGLVATIGINDYYIPLMNY
ALQNAHMQAQNFLQALSETVNFTQQMQPVLQNLGLALQYAQSAYQLSQYVPSPQVQNSLA
NITSQIQQQYYSVQEQVQKAQSNPVLNVFEGIANTINTGLSNMFNFINNEIYSHLGRNIF
TEVLAGIADGAIFVLISLIPVVGEAFDWATFTAFLGQTVFNLTAGSASAQEEINSLKQMF
LNPANLSSLITTVVGLFIAHRLNIDDTIRAKLLGTLKDVKVDVKAVSDSMAKNVDVKNVD
TTLKDVTDFSKVNELVKQVDLKQLDIKALKGFKDKIVSIESQGYKFFKVDAQELSTRIEE
FLSFKDVKIRLINAVKDVKIDINKSESGIELNVEPKLSDEVIATIEGNKVKLTTLSEESI
KNALANNDLGAVLDTLKLNLASQIAKQLFDSLKTQDGNLIMLTNDEGLAFFNGKIYDVLY
KDGKISNMQIIPDAEALAKLVKFAEDKVGSYITLNKSSIEQLIKNNNIQSLEYTLTNEIK
GNAVRNEYLQIKDALGNMTKLTSKTEINPNEIKTTTTIQGKIPNISPNIQFLSPHDVDEL
LSFSNRFSDIFKQLVDAHPEVKDLLEKLASEGKLPNDLNALNDIASKIANFYNAVTKDAE
SIRNELAGTGLFDGVDVTSIINNIIRKYILNHASDVLNGETPKISISDILDNLSTADKAK
VVLNYLKREDPNAYNSVLQKLSGLSQDAKDYVLASAYDELKIALENKLPLSGGVESIVNS
INDTLEKIGVNQQINIQTNNNVLNNGTQNTTNVPSNGQITITKPPENIQSAKTTENIITT
LSNALQKIYPDFDKLNSTEKDLLLYILSRKLEEKGELTPEDIKNTIEEMKGEIDQLLENM
KDYIDNIEKEKQPDEAVLEYDKGIKELADKVSFDKLIYFTSLISNIANKFNVPTAIELLN
QINTLTPEELQNTIILTQPQIQLLNEKVAPLLKDILVSLQKGTSPKDLLGKISQLRDLLG
KMSVTIDVTTLVQLITSLNSIVSELNIKLSSLSALIATPVNGTLKVIPITFQSVLNISSS
ISTNNVQVLENEINISNVNTTPQVIQQLQELLNLPNLPPPSTGTIEQNNNSPGTSIPPSI
NNQQSAEYVSRRQYLIL
NT seq
5994 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatctttcaacgaaaaatatttgaaagtttattaacctgtttgttcaggataaaaata
gtgaatagtatgagtgaagataatctaactgtaattgaaactataaaatctctcataaag
caaaataaatttgaagaagcattaaaactagcaaaagaaaataatttagatccgcaatca
attaattatataaaagcattaatatatgttcaagaggcacttgaagatattagagcggat
agatcaactgaagcaataaataaattgaatctagctcaaaaattagccccgacgttagat
ttatcgtactattttgctgtcgcaaatatgcaggaattattaagcgaagctgaaaacgaa
ttaagaaatgagaactataacacagcgttacaaaatcttcaacaagcattacaaatagca
caacaatataatttaacgaaaatggtagagaagatatctagacaaataaatagggtaaac
gcgtatcttcagatcgagaatttaaagaatgaaatgaagaaagcggttagaaatttcaat
tttgctgaagcatataatttaatttctcaggctgtgaatatcgcaaatcagtatgatctg
tatgatcagaaacttgaaaatatgcagaaagcgtttttctatttagctaaaataccgcct
atcccgcagccaccacagcaacaaaacctaactttatctattttatataattatataaat
gaattatacaactactttactaacgcgtataatttagccgttgaagcggtgaaatataac
gataaaatctcatttttagctgaagaattcgcaaaaactgcaaaaatattggaagttaca
tcatctgcaatgtctctgcttttagaagctcagaaattagcagaacagaaaaatgttgat
gccgtaaaaaccgctatcgctaacattcaaaacgcaattcaacaattagaaaatattaat
gcagaaaattcaattgttgaatctctctattctgccgttgtcgaattagcaaagaaaatg
tataatgagtacacagcttatctttatgttttagagaatctaaaaaaaagcaacgaacta
atagaaaatggagatttttctgaagcagttcaactacttcagaatgctcagcaaatagct
cagcgtgcgggcttacaactaaaccttgctaactatattcagggtttttcgattttagaa
aatttaaagcctttacctcaaccgcctaaagaagccgacttttcctctttagcatcttac
ttttcgcaacttacagatacactgaagagtaactataacacccttcagcaggcttcaaaa
tacataactataaataatttgcaagacatttcagccgatgttaccgtcgcccaactgtta
gctaatgcgatgcaggatttggctaacgcacaatcgttgttggaacagaaaccagagcaa
gttttgcaaaataaacagcagattacacagtacataactaacgctatccaactgcttcag
caggctcagggtacgagtagtgacctacagcagactgcaaaacagctgtttgaggaagct
cagcaatatcaggacactgtaaacgtttaccttaacggtttgcaatatgcggtaaacgct
atgaacgcgatagatacagtaaataagatattggcacaaaagcctaatgcacaaacgcca
tcccaatacttcgctcagttttctaacaattacgccacagcgttaaagaccatacgcgat
gcaatttatttagcctcaaacgctaatcagctgtttgagagtattaagctacaaccgcct
ttcgatttatctgagttggagaaggaccaggtggaaatagctgaattcacacatctgttt
gcaactgcctcttcagcttatgctgatattgaaaatgcggagtctgaaaagcacgataac
tcgcctggtgggttggcaaattattataggaatatagcgtcagctatggcgaatgcaata
agtgatattgagaacgtaagtacacaacaaggtgacgttgagaagactaaagaggaattg
ttaaataacttaaagaagcagtactatactttcgatgctctctctcacgcttatcagatt
gtcgcaaacgctcagactaacgaccctcaaacactttatgcagtttataattcagcgtca
cggtacttaagaaccgcgtcagagcaatttaactcagagcaattagcacagttggcaggg
caattcgaaaacgttgcacagttttacaggaacatagcaatcgcacaaactgaagtcgct
caggctaacaatacacagtctattaacgataaaatagcgtatctgcagagtgcaataaac
tatctaacaagggctgaggaatacgtcccgcaggaaagtggtgagataaataaaaagaaa
gcacagatagagcaggcgataaaaacgcttcaaactatacaggcgtataggcaaaacgtt
acctcttcgttacaaagcggtaattacgccagtgctttagcttattataacgaattgctg
aaaaacaccactcatactaacatagataacgtattgaatgacattgcacagaataactac
ttccaggcaattcaggatatacaaagcaattcttcattaacaccagaacaaaaacagttc
ctaagcgggctagtcgcaactataggcatcaacgattattacatacctttaatgaactac
gctttgcaaaacgcccacatgcaggcacagaactttttgcaggcgttgagcgaaaccgtc
aatttcacacagcaaatgcaaccagttttacaaaacctgggcttagcactacaatacgcc
caaagtgcatatcagttatcgcagtacgtaccctcaccccaggtgcaaaacagtttagca
aatataacttcgcaaatacagcaacaatactattccgtacaggaacaagtgcagaaagcc
caatccaatccagtgcttaacgtatttgaagggattgcaaatactataaacactggtcta
tcgaacatgttcaactttatcaataatgagatttacagccacttaggaagaaacattttc
accgaagtgctggcgggaattgcggacggtgccatattcgttttaatttccctaattccc
gttgtaggagaagccttcgattgggctactttcacagcgttcttagggcaaacagtgttt
aacttaacagcaggttcagcatcggcacaggaagaaataaattccctcaaacagatgttt
ttaaaccccgcaaacctctcatcccttataacaaccgtcgtagggttgttcatagcacac
aggcttaacatagacgatacaataagggcgaaacttttaggtacgctaaaagacgttaaa
gtggatgttaaggcagtaagcgacagcatggctaaaaacgttgatgtgaaaaacgttgat
accacactaaaagacgtcactgatttctctaaagtaaacgaattagtaaagcaggtagat
ttaaagcaattagacattaaggcattaaagggctttaaggacaagatagttagcatcgaa
agccaggggtataaattctttaaagttgacgctcaagaactttcaacaagaattgaagag
tttttatcgtttaaagatgtaaagataaggctaataaatgcggtaaaagatgtaaaaatt
gatattaataaaagtgagagcggaatagagcttaatgttgagccaaaattaagcgatgaa
gttattgcaactattgagggcaataaagttaagctaaccactctgtcagaggaatcaatt
aagaacgctttagctaacaacgacttaggggcagttttagatacgctgaagctgaaccta
gcctcacagattgcaaaacagctgtttgacagcctcaaaacgcaggacggcaacttaata
atgctcacaaacgatgagggtttagcgttctttaacggcaaaatctatgacgtgctttac
aaagacgggaagataagcaatatgcaaataataccagacgcggaagcattagccaaacta
gttaagttcgccgaagataaggttgggagctacatcactctaaacaaatcgtcaatcgaa
cagttgataaagaataataacatacagagcctggagtacacacttacaaacgaaattaag
ggcaatgctgtgaggaacgagtatttacaaattaaggacgctttaggcaatatgactaag
ctcacttctaagactgaaatcaacccgaatgagataaaaactacaacaactatacagggc
aaaatacctaacatatcgcccaatatacaattcctttcacctcatgatgttgatgaacta
ttatctttcagcaatagattcagcgatatattcaaacagctggttgacgcacatccagag
gtaaaagacttattagaaaaattagctagcgagggtaaactacctaatgacctaaatgcg
ttaaacgatatagcgagtaagatagctaacttctacaatgcagttacgaaagacgcggaa
agcataaggaatgagttagctggcactggtctgtttgacggtgttgatgtaacttctatt
attaataatataataaggaaatacatactgaatcacgcgtcagacgtcttaaacggcgaa
acgcctaaaataagtatttccgacatccttgataatctaagcaccgcagataaggcgaaa
gttgtgcttaactatttaaagagggaagatcccaacgcgtataatagtgttttgcaaaaa
ctaagcggtttatcgcaggacgctaaggattacgtgctagcgtcagcttatgatgagtta
aaaatagctttagagaataaattaccgctaagcggtggggtagaaagtatagtaaattca
atcaatgatacgttagaaaaaataggagttaatcaacaaatcaacattcagacaaataat
aatgttttgaataatggcacacaaaacactactaatgttccatcaaacgggcaaataaca
atcactaaaccccccgaaaatattcaatctgctaaaactactgaaaatataatcacgacg
ctgagtaacgctttacaaaagatatatcctgattttgataaattaaacagtacagaaaaa
gatctattactatatatattatcgcgtaaattggaagaaaaaggggaactaacgcctgag
gatataaagaatacaattgaagagatgaagggcgaaatagatcaattactagaaaatatg
aaagattatatcgataatattgagaaagaaaaacaaccagacgaagcggtcttagaatat
gataaaggaattaaagaattagccgataaggtcagtttcgataagttaatatatttcacg
tcactgatatccaatatcgcgaataaatttaacgtgcctacggcgatagaactgcttaat
caaatcaatacattaacgcccgaagagttacaaaatacaataatattaacacagccacaa
atacagctgttgaatgagaaagtagcaccattgttgaaggacattttagtcagcctgcag
aaaggtacaagtccaaaagacctattgggcaaaataagtcagcttagggacttattgggt
aaaatgagcgtaacgattgacgtaactactttagttcagcttattaccagtttaaacagt
atagtaagtgagcttaacattaaactaagctcattgtcagctttaattgccacaccagtg
aacggaacgttaaaagtaattcctataactttccaaagcgtgttaaatatttcatcctcg
atttcaactaataatgttcaagtgcttgaaaacgagattaatatctcgaacgtgaatact
acgccacaagtcatccaacaattgcaagagttattgaatttgccaaatttaccgcctcct
tccactggtactatagaacagaataataatagtcccgggacttcgataccgccttctatt
aataatcaacaatcggctgaatatgtatcacgcagacaatacctaattttataa
DBGET
integrated database retrieval system