Stenotrophomonas indicatrix: DAIF1_34180
Help
Entry
DAIF1_34180 CDS
T07128
Name
(GenBank) SNARE associated protein
Organism
sinc
Stenotrophomonas indicatrix
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
VTT_dom
PAP2
LssY_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBR45831
LinkDB
All DBs
Position
3768815..3770812
Genome browser
AA seq
665 aa
AA seq
DB search
MDSSWIDATLAWIAAHPVLAGAVIFLIAFCDAVIILGAIVPALPLLFAVGVFIGLGQISG
PYAVAAAALGAFAGDGISYWIGRRWGDRLRGVWPFSRYPQLLDRGENLFRRNAFKSILIA
RYVGAIRPFVPAIAGMMKMPASRYVQASGIASISWAVLFLAPGWILGEAYDAVAAVAGRL
VVVVGLLAVILSLVWAIVLYGYRWSAARMDSWLARLLDWSNRHPTLGRYTVGVLDPKRRE
SVPLAMLALMLLLLGWGWFALLTVVVAHGEPLAVDLLVHQAMLALRNPLADYPMAALASL
GAWQVLLPATAAAMGYLVWRRRWMAAAHWLAALAFGLALTKLLGATVDVVRPIDASSGFG
FPSVSVTMATITFGFFAVLIAREMPGRTRVWPYLVSGIVVSLIGFARLYLGAHWLSDVIG
GMLFGTFWLLVLGIAYRRRFNRSFWVKPVAWLFYGVFVVAAMWYAPRNIAIKLERFEPTL
PAPLAMDAQAWWQHDWAKLPARRNEFDDDQRWPLDVQVAGALAPLQAQLEARGWQVQAQA
GWQEALLMLDKNTGANELPVLPATLDTRVEALLMVRQGAQADERYVLRLWQAPAQLQPGD
TPLWLGSAQTLRYERHFQWIGMWHPVRGIDPALNAVKEAVQSLPQREDVQPETGLPVLRL
KTATP
NT seq
1998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggactcttcatggatcgacgccaccctcgcgtggattgccgctcatcccgtgttggcg
ggtgcggtcatctttctgatcgccttctgcgatgcggtcatcattcttggcgccatcgtg
ccggcgctgccgttgctgttcgccgttggcgtgttcatcggcctgggccagatctccggg
ccgtatgcggttgccgccgcggcgctgggtgcgttcgccggtgatggcatcagctactgg
ataggccggcgctggggcgaccgcctgcgtggcgtctggccgttcagccgctacccgcag
ctgcttgaccggggcgagaacctgttccgccgcaatgcgttcaagagcatcctgatcgcc
cgctatgtcggtgccatccggccgttcgtgcccgccattgccggcatgatgaaaatgccc
gccagccgttacgtgcaggccagtggcatcgccagtatttcctgggctgtgctgttcctg
gcaccgggctggattcttggcgaagcctatgatgccgtcgctgctgttgccggccggctg
gtggtggtggtgggcttgttggccgtgatcctcagcctggtctgggccatcgtgctgtac
ggctatcgctggtcggccgcgcgcatggacagctggctggcgcggctgctcgactggtcc
aaccggcacccgacgctgggccgctacacggtgggcgtgctcgacccgaagcgccgcgaa
tcagtgccgctggcgatgctggcgctgatgctgctgttgttgggctggggctggttcgcg
ctgctgacggtggtggtcgcccatggcgagccgttggcggtggacctgctggtgcaccag
gcgatgctggccctgcgcaatccgctggccgactacccgatggccgcgttggcctcgctc
ggcgcatggcaggtgctgctgccggcaaccgctgccgcgatgggctatctggtctggcgc
cggcgctggatggcggccgcccattggctggccgcattggccttcggcctggccctgacc
aaactgctcggcgccaccgtcgatgtggtgcgcccgatcgatgccagcagcggcttcggc
ttcccgtcggtgtcggtgaccatggccaccatcaccttcggcttcttcgcggtgctgatc
gcccgcgaaatgcccggccgcacccgcgtctggccctacctggtgtcgggcatcgtggtc
agcctgatcggctttgcgcgcctgtacctgggtgcgcactggctgagcgatgtcatcggc
ggcatgctgttcggcaccttctggctgctggtgctgggcatcgcctaccgccgccgcttc
aaccgctcgttctgggtaaagccggtggcatggctgttctacggcgtcttcgtggtggcg
gcgatgtggtacgcgccgcgcaacatcgccatcaagctggaacgcttcgagccgaccctg
cccgcgccgctggcgatggacgcgcaggcctggtggcagcacgactgggcgaagctgccg
gcgcgtcgcaacgaattcgacgatgaccagcgctggccactggacgtgcaggtggccggt
gcgttggcgccgctgcaggcgcagctggaagcgcgcggctggcaggtgcaggcccaggcc
ggctggcaggaagcgctgctgatgctggacaagaacaccggcgccaatgaactgccggta
ctgccggcgacactggatacgcgcgttgaagcgctgctgatggtgcgccagggcgcgcag
gccgacgagcgttacgtactgcgcttgtggcaggcgccggcgcagctgcagccgggcgac
accccgttgtggctgggcagcgcacagaccctgcgctacgagcgccacttccagtggatc
ggcatgtggcacccggtgcggggcatcgacccggcgttgaatgcggtcaaggaagcggtg
cagtcgttgccgcagcgcgaggatgtgcagccggagaccgggctgccggtactgcggttg
aagaccgccacgccgtaa
DBGET
integrated database retrieval system