Shewanella inventionis: K8B83_19130
Help
Entry
K8B83_19130 CDS
T07895
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
sinv
Shewanella inventionis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sinv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sinv02000
]
K8B83_19130
Transporters [BR:
sinv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
K8B83_19130
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAL42905
LinkDB
All DBs
Position
complement(4291575..4294148)
Genome browser
AA seq
857 aa
AA seq
DB search
MMQSKKSKFGVSSLSLAISFALAGTAISTQAFAADDEAAVKENVEKIAVVGSRAAPRSIG
DSPVPVDIISSDDLKKNGSTDMIDMLVTSVPSFNSRAQPISDAATLVRPVNLRGLPSDST
LILVNGKRRHRASVIAFQGGGINDGAQGPDISVIPGVALKQVEVLRDGAAAQYGSDAIAG
VMNFVLKDDSDGGSITVSQGEYYEGDGAATTIDGNIGLPLSDDGFVNISAQYKTADATSR
SVQRPDAAALSAAGNEFIQDPAQTWGNPEINDDFTVFVNSGYDLNDNTKLYAFGNVSSRE
ATGGFYYRNPHNRGNVYSNDGGETLLVGDVGLAENGVASCSWVGNVPANVDNVLDTPEYL
AMVADPNCFSMNQIRPGGYTPQFTGKIEDMSFFAGIKGESGEWMYDVSAGTGSNKASFGL
KNSLNPSLGLATPTDFDTGSYEQVETTFNVDMNRFVTIGGLEDISFATGFEWREESFEIG
QGDEASWIAGPYAEQGFNIGSHGFKGFGPESAGKNKRNNIGVYTDVEAYLTDEFLLGFAL
RYENFSTFGDTLNYKLTAQYMATDELSFRASHSTGFRAPTVGQENVVNTQTSIVNGDLIQ
SFIAPPTDPLAAFYGGETLNPEESVSYAAGFVYEYENLFLTVDYYNIEVTGRIAQSSQIT
VEESDYDALRAAGVEFPELISAVTYYTNDFDTTTQGVDIVGSYSMDLFSGDAKFSLAYGW
TDTNVDKYDEATTDAGKVRRLEDGIPAHRATLTWGQSWDDISTSVRANYFGEYYATHADD
TSDWGSEMAGSAVTVDLEVSYALMDNLTVSVGANNIFDQEAEKLKDGTLGELGAVYYESG
PFDYNGGFYYGRVNYRF
NT seq
2574 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgcaatcaaaaaaatctaaatttggtgtgagctcattgagtttagccatttcattt
gcacttgccggaacagcaatcagcactcaagcttttgctgctgacgacgaagcagcagtg
aaagaaaatgttgaaaaaattgctgttgtaggttctcgtgcagcacctcgttcaattggc
gactcaccagtaccagttgatattatcagcagtgatgatctaaagaaaaacggttcaact
gacatgattgatatgttagtaacttcggtaccgtcttttaactcgcgcgcgcaacccatt
agtgatgctgcaacgcttgttcgtcctgtaaacttacgtggtttaccatcagacagtact
cttattttggttaacggcaaacgtcgtcaccgcgcatctgttattgctttccagggtggt
ggtattaacgatggtgctcaaggcccagatatttctgttatccctggtgttgctttaaag
caggttgaagttctacgtgacggtgctgcggcgcagtacggttcggatgcgattgccggt
gtaatgaacttcgttttaaaagatgactcagatggcggctctattacggttagccaaggt
gaatattacgaaggtgatggcgcggcaacaaccatcgacggtaacataggtttacctttg
tctgatgatggttttgttaacatcagtgcgcaatataaaaccgcagatgcaaccagtcgc
agtgttcagcgcccagatgcggcagcactttctgcggcgggtaatgagttcattcaagac
cctgctcaaacctggggtaacccagaaatcaacgatgatttcaccgtatttgtaaactct
gggtatgacctaaacgacaacaccaaattgtacgcatttggtaacgtttcatcacgcgaa
gcaacgggtggtttctattatcgtaacccacataatcgtggcaacgtttattcaaacgat
ggcggcgaaaccttattagtgggtgatgttggtttggctgagaatggtgttgcgtcatgt
tcgtgggtaggaaatgtgcctgcaaacgttgataacgtgcttgatacacctgaatattta
gccatggtggccgaccctaactgtttctctatgaaccaaatccgtccgggcggctataca
cctcagtttactggtaaaattgaagacatgtctttctttgcaggtattaaaggtgagtca
ggcgagtggatgtatgatgtgagtgctggtacaggtagcaacaaagccagcttcggttta
aaaaattcacttaacccatcattgggtttagcgacaccaaccgatttcgatacaggttct
tatgagcaagttgaaacaacctttaacgttgatatgaatcgttttgtgactattggtggt
ttagaagacattagctttgctactggttttgaatggcgtgaagagtcgtttgaaattggt
caaggcgatgaagcttcttggattgctggcccatacgcagagcaaggctttaacattggt
tcgcatggttttaaaggctttggtcctgagtcggcgggtaaaaacaagcgtaacaatatc
ggggtttatactgatgttgaagcatacttaaccgatgagttcttacttggttttgcgctt
cgttacgaaaacttctcaacctttggtgacacgctaaactacaagctaactgcacagtac
atggctaccgatgagttgtctttccgtgcatctcacagcacaggtttccgcgcaccaacg
gttggtcaagaaaacgtagtaaatactcaaacatcgattgttaacggtgatttgatccaa
agctttattgcaccaccaacagacccgctagccgcattttatggtggcgaaacgttaaac
cctgaagagtctgtcagttatgcggcaggttttgtgtatgaatacgaaaacctattctta
accgttgattactacaacattgaagtaacaggtcgtattgcgcaatctagccaaattacg
gttgaagaaagcgactatgatgcattaagagcggctggcgtagagttccctgagttaatt
tcagcggttacttactataccaatgactttgacaccacaactcaaggtgttgatattgtt
ggttcttacagcatggacctgttttctggtgatgctaaatttagcctagcatacggctgg
actgatactaacgttgataaatacgacgaagctacaaccgatgcaggcaaagtgcgtcgt
ttagaggacggtattcctgctcaccgtgccacattgacatggggacaaagctgggatgat
attagcacgtctgttcgtgctaactattttggtgagtactacgcaactcacgctgatgac
acttctgattggggttctgaaatggcaggttctgctgtaacggttgaccttgaagtgagc
tacgcattaatggataacttaactgtttctgttggcgctaacaacatcttcgatcaagaa
gctgagaagctaaaagatggtactttaggtgagttaggtgctgtgtactacgaaagtggt
ccatttgattacaacggtggcttctactatggccgtgtaaactatcgcttctaa
DBGET
integrated database retrieval system