Shewanella inventionis: K8B83_20210
Help
Entry
K8B83_20210 CDS
T07895
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K16090
catecholate siderophore receptor
Organism
sinv
Shewanella inventionis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sinv00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sinv02000
]
K8B83_20210
Transporters [BR:
sinv02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
K8B83_20210
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAL43091
LinkDB
All DBs
Position
complement(4515297..4517606)
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MKSNRYSKLSLGAQAVAAALVFGSPAVYAADTNNETCDKDILAKCKPAETDESIERIRVH
GVQNSVYMFNSSADKRRLAELVDTPQVITVLTQDQIQESGNTDLKDILSAQAGVTLGTGE
NGNAFGDRYIIRGHEARSDVFVDGLRDPGMTTRESFATERVEITKGPSSTFAGRGSSGGA
INSVTKKASVAYDFGRVDVGVGSDDHSRVTIDYNLPLSEKVAVRLNGLTAQEDKPGREGI
SRDRNGVQLSGVYETTDALSFIADVYHIKAEDVPDLGSYFDQTTRKPLEDIPVYAQEGDF
LDSEVTTFTLRTEYELNSDITLYNATRVGHTENGYITTGMGGTTRADTDATAPGASTLTL
STHQGNQDVDYVSTQFNLFWNTKIFGFNNKLVFGLEYTDENVDNGVYTITNNNPTNCTTN
GRRGVSESYCIIDGDGNTVDNISQLMGRSYVDGGSDAVYDIETVSAYMMDNVELTEQLSM
FYGLRLDSFDYSNDTTNALYEYSDTMYNYNFGLVYDLYEDANIYANYSTATNINGGESDL
GANCGYGGICGTEEQATEADAEIVENIELGTKWMLFDDKMMFSASIFQITKSDVMESVGD
SYSTLGTLNTGENRVKGIEFGMVGNITEQLSIQFSAAKMDSEILDSYDPANIGLALSNFA
DESAYLQLRYQISDSFVFGGSYTYQSEMYGGQPDTAAGYDTTNERYSIVVPNYQVVDLFA
SYNATEALTFRINVGNVLNEEYWTAAYRSGSFMYLGDARNSRLSMTYEF
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatcgaaccgttacagtaagttatcattgggtgcccaagctgttgctgctgcgtta
gtgtttggtagtcctgcggtttatgctgcagataccaacaatgaaacttgcgataaggat
atattagctaaatgtaaaccagctgaaacagacgagtctattgagcgcattcgtgttcat
ggtgtacaaaattcagtttacatgtttaacagttcggccgacaaacgccgtttggctgag
ttagtcgatacgccacaggtcatcacggtattaacccaagatcaaatccaagagtcagga
aacaccgaccttaaagacattttatctgctcaagcaggtgtaactcttggtacaggtgaa
aacggtaacgcatttggtgaccgttacattattcgtggtcacgaagcccgcagcgacgtg
tttgttgatggccttcgtgacccaggcatgacaacccgcgaaagttttgccactgagcgc
gttgaaattactaaaggcccaagctcaacatttgctggccgtggttcatcgggcggtgcc
attaacagcgtaaccaaaaaagcctctgttgcctatgactttggccgagtagatgttggg
gtaggcagtgacgaccacagccgcgtaaccattgactacaacttaccattatcagaaaaa
gtcgctgtgcgcctaaacggtttaactgcacaagaagataagcctggccgcgagggtatt
agtcgcgaccgtaatggtgtgcaattatcgggtgtgtatgaaaccacagatgccttatcg
tttattgccgatgtgtatcatattaaagcagaagatgtgcccgatttaggcagctatttt
gatcaaaccactcgtaagccattagaagatattccggtatatgcacaagaaggcgacttt
ttagactcagaggtgaccacctttactctgcgcacagagtacgagcttaatagcgacatt
accctgtacaacgccacgcgagttggccataccgaaaacggctatattacaacggggatg
ggcggtacaacccgtgccgataccgatgccacagcaccaggcgcaagtacgttaacatta
agtactcaccagggtaatcaagatgtggattatgttagcactcagttcaatttattctgg
aacactaaaatctttggttttaataataagttagtgtttggtttggaatacacagacgaa
aatgtcgataacggtgtgtacactattaccaataacaacccgacaaactgtactaccaat
ggtcgtcgcggtgtgtctgagtcttattgtattatcgatggtgatggtaatacggttgat
aacatcagccaacttatggggcgcagttatgttgatggcggctcagatgcagtatacgac
attgaaactgtgtcggcgtatatgatggataacgttgagttaaccgagcaattgtctatg
ttttacggtttaaggctcgacagctttgactacagcaacgacacaaccaatgcgctttat
gaatattcagacaccatgtataactacaacttcggtttggtttacgacttgtatgaagac
gctaacatttatgctaactacagcacggctaccaacatcaatggtggcgagtctgaccta
ggagcaaactgtggttatggcggtatttgtggtactgaagagcaagccacagaagccgac
gctgaaatcgttgaaaacatcgaacttggcaccaagtggatgttatttgatgacaaaatg
atgttctcagcatcgattttccaaatcacaaaaagtgatgtaatggaaagcgttggtgac
agctactcaaccttaggtacgctcaacacaggtgaaaaccgcgtaaaagggattgagttt
ggtatggtgggtaacattactgaacagctcagcattcaattctctgccgctaaaatggat
tcagaaatattagattcttacgacccagcaaacattggcttagcgttaagtaactttgca
gatgaaagcgcgtatttacaattacgttatcaaatatcagactcatttgtatttggtggt
agctacacttaccaaagcgaaatgtacggcggccaaccagatactgcggcaggttatgac
acgactaatgagcgttacagcatcgtagtgcctaactatcaagtggttgatttatttgcg
agttacaatgctactgaagccttaacattccgcattaacgtgggtaacgtgttaaacgaa
gaatactggacagcggcatatcgttcaggttcatttatgtaccttggtgatgctcgtaat
tcaagactgtcgatgacatacgaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
