KEGG   Shewanella inventionis: K8B83_20735
Entry
K8B83_20735       CDS       T07895                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
sinv  Shewanella inventionis
SSDB
Motif
Pfam: CarboxypepD_reg TonB_dep_Rec_b-barrel Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: UAL43188
LinkDB
Position
complement(4646357..4649530)
AA seq 1057 aa
MLLSHKMSRLALATCFAMGVALPASAADTASDIRGQITGPAGNAVSDAKVTIIHQPTGTV
TEVPVTANGQFSARGLRVGGPYIIKVDSDQFADTVEEDVYLQLGETFRFNRTLQDASAME
RIGVVGSAGYYRTAGSNSDFGEQDIANAPGISRDLKDVLRQNPMAVVGTDGVSMSVAGMN
PRFNTFVVDGISQNDDFGLNSNGYPTQRSPISIDAVESVALNVSPYTARNGGFTGAQINA
VTKSGTNDLSGSVFWETTNDSLAGDGKNQDTGDKIEQDFEETTFGGTVGFPLIEDKLFFF
GSYENFDAPQSAEWGPNGAGYANDSDVTADELALIEQIAQTVYGLDSIGGYTTTPQEKDE
KILAKLDWNINDQHRASFTYQSTVGNLTNNMSSSASSLKLSSTWYDKEEILETYAANLYS
DWTDDFSTEIKLAYKDTTSKSKTIDDLGIGMVSVQTYDRASDYVIFGTDKSRQANELNNQ
NLELRFVGDYYLGDHEIGFGTQYNNVEVFNLFAQNVMGNWSFNTIEDFENGDVDQFFYAN
AMSGNPDDVGASFNMDTLALFVEDAWAITPDLTLTYGMRYETISMSDSPALNQNFVERYG
FANNETLDGQDIWLPRVGVNYKLTEDVSLHGGVGRYTGGSPTVWISNSFSNDGNSLLSYN
DGWDAAWGTPDFANVPSQAQDGLVGGDGNVNAIDPNFKLPSDWRASIGFDSTWDFGALGD
DWFVGAEFLYVKKENDLAWVDLARRQVTTDDTGRVVYETWDPLANNGAGGNTDRYDIMLT
NADKDGSSKTFSLSLAKNWDMGLSMRAGYAYNSVEEGNQGSSSTATSNYQYTPVQYDRNG
TTMGTGYYETPHRFTFSLGYDVEFVAGYNSSFNLFYEAREGNPMTWVLGSYRDGNLGDQA
SFANASYYLPYIPTGADDANVEYADGLTYEALKAALDDIGLSQYAGGIAPKGTDNQPWVH
QLDFRFTQELPGFSDEHKGILYFDIKNVLNLVNDDWGVVEYQSYGTSTLVDHAYNATTGV
YTYSVPYGQDGIETDNQNTYDINKSAWQLKVGVKYQF
NT seq 3174 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttactaagtcataaaatgagtcgccttgcgctagcgacgtgttttgcaatgggggtc
gcactacccgcatcggcagctgatactgcatctgatattcgtggtcaaattaccgggcca
gcaggaaatgctgtctcagacgcaaaagtgaccattattcaccaaccgaccggtacagtt
accgaagtgcccgtaactgctaatggtcagttttctgcgcgcggtttgcgtgttggtggt
ccttacattattaaagttgattctgaccagtttgctgacaccgttgaagaagatgtttac
ttgcaactgggcgagacattccgctttaatcgtactctacaagatgcaagcgcaatggag
cgtattggtgttgtgggcagtgcaggatattaccgaacagcgggcagtaatagtgacttt
ggcgagcaagacattgccaatgcgccaggtattagtcgtgatttaaaagatgtactacgt
caaaacccaatggcagtcgtgggtactgatggcgtttctatgagcgtggcgggtatgaac
ccacgtttcaatacttttgtggttgatggtatatctcaaaacgatgattttggtcttaac
tcaaatggttacccaacacagcgttcgcctatttctatcgatgcggtagaaagtgtcgcg
ttaaatgtgtcgccatacacggcaagaaacggtggttttaccggtgcacaaattaatgct
gtgactaagtcgggtactaacgatttatctggttcagttttttgggaaaccaccaacgat
agcttggccggtgacggtaaaaatcaagacacgggtgataaaattgagcaagattttgaa
gaaaccacgtttggcggtactgttggcttcccgctaatagaagataagttatttttcttt
ggctcttacgagaacttcgatgcgcctcagtctgcagaatgggggccaaatggtgcaggt
tatgccaatgattcagacgttactgcagatgaattagcattaattgagcaaattgcgcag
acagtttatggccttgatagtattggtggttacactacgacgccacaagaaaaggatgaa
aaaatcttagccaagctggattggaacattaacgaccagcatcgcgccagtttcacttac
cagtcaacggtaggtaacttaaccaataacatgagctcaagtgcatcgtctttaaagtta
tcaagtacttggtacgataaagaagaaatattagaaacctacgctgctaacttatatagc
gattggactgatgattttagcactgagattaaactggcttataaagataccacttcaaaa
tcaaaaaccattgatgatttaggcattggtatggtgtcggtacaaacctatgaccgtgcc
agcgattatgtgatttttggtaccgataagtctcgtcaagccaatgagttaaacaaccag
aatcttgaactgcgttttgtgggcgattactacttaggcgatcatgaaatcggttttggt
acccagtataacaatgttgaagtatttaacttatttgctcaaaacgtaatgggtaactgg
tcatttaataccattgaagattttgaaaatggcgacgtagaccagttcttttatgctaat
gcgatgtcgggtaatcctgacgatgtgggtgcctcttttaatatggacaccttggcatta
tttgttgaagatgcctgggcgatcacccctgatctaaccctaacttacggcatgcgttat
gaaaccattagcatgtctgattctcctgcactgaaccaaaattttgttgagcgttatggt
tttgctaataacgaaaccctagatggccaagatatttggttaccgcgtgtaggcgttaat
tataaacttaccgaagacgtcagcttacacggtggtgtagggcgttatactggtggttca
cccacagtgtggatttctaacagtttctcaaacgatggtaacagcttattaagctataac
gatggctgggacgcagcatggggcacccctgattttgctaatgtaccatcacaagcacaa
gatggtttagtgggtggcgatggcaatgtgaacgcgatagatcctaactttaaactgccg
tcagattggcgcgcaagtattgggtttgatagcacctgggattttggtgcgctaggtgat
gactggtttgttggcgctgagtttttgtatgttaaaaaagaaaatgacctcgcctgggtt
gatttagctcgtcgtcaagtaaccacagatgacactggccgtgtcgtgtatgaaacatgg
gaccctcttgctaataatggcgcgggtggaaacactgatcgttacgacattatgttaacc
aatgcagacaaagatggttcaagtaaaaccttcagtttatcgttagcgaaaaattgggat
atgggcttaagcatgcgtgcaggttatgcttataactcagtggaagaaggcaaccaaggc
tcgtcttctaccgcgacctcaaactatcaatatactccagtgcaatatgaccgtaatggc
acaaccatgggcactggctattatgaaacacctcaccgttttacctttagtttaggctat
gacgtagagtttgttgcaggatataactctagctttaacttattctacgaagcgcgtgaa
ggcaatccgatgacatgggtgttgggctcttatagagacggaaacttaggcgaccaagcc
agttttgccaatgcgtcatattacctgccatatattccaactggagctgatgatgccaac
gttgagtatgcagatgggttaacttatgaagcacttaaagctgctcttgacgacattggt
ttgagccaatatgccggcggtattgcaccaaaaggcactgataaccaaccttgggtgcat
cagcttgattttcgctttactcaagagcttcctggctttagtgatgagcacaaaggtatc
ttatattttgatatcaaaaacgtacttaatttagtcaatgatgattggggcgtggttgaa
tatcaaagctatggtacatcaacgttagttgatcatgcttataatgctaccactggagtt
tatacttactcagtgccgtacggtcaagatggtatcgaaacagataaccaaaatacctat
gacattaacaaatcagcttggcagctaaaagttggtgttaagtatcagttctaa

DBGET integrated database retrieval system