Shewanella inventionis: K8B83_20735
Help
Entry
K8B83_20735 CDS
T07895
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
Organism
sinv
Shewanella inventionis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CarboxypepD_reg
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAL43188
LinkDB
All DBs
Position
complement(4646357..4649530)
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MLLSHKMSRLALATCFAMGVALPASAADTASDIRGQITGPAGNAVSDAKVTIIHQPTGTV
TEVPVTANGQFSARGLRVGGPYIIKVDSDQFADTVEEDVYLQLGETFRFNRTLQDASAME
RIGVVGSAGYYRTAGSNSDFGEQDIANAPGISRDLKDVLRQNPMAVVGTDGVSMSVAGMN
PRFNTFVVDGISQNDDFGLNSNGYPTQRSPISIDAVESVALNVSPYTARNGGFTGAQINA
VTKSGTNDLSGSVFWETTNDSLAGDGKNQDTGDKIEQDFEETTFGGTVGFPLIEDKLFFF
GSYENFDAPQSAEWGPNGAGYANDSDVTADELALIEQIAQTVYGLDSIGGYTTTPQEKDE
KILAKLDWNINDQHRASFTYQSTVGNLTNNMSSSASSLKLSSTWYDKEEILETYAANLYS
DWTDDFSTEIKLAYKDTTSKSKTIDDLGIGMVSVQTYDRASDYVIFGTDKSRQANELNNQ
NLELRFVGDYYLGDHEIGFGTQYNNVEVFNLFAQNVMGNWSFNTIEDFENGDVDQFFYAN
AMSGNPDDVGASFNMDTLALFVEDAWAITPDLTLTYGMRYETISMSDSPALNQNFVERYG
FANNETLDGQDIWLPRVGVNYKLTEDVSLHGGVGRYTGGSPTVWISNSFSNDGNSLLSYN
DGWDAAWGTPDFANVPSQAQDGLVGGDGNVNAIDPNFKLPSDWRASIGFDSTWDFGALGD
DWFVGAEFLYVKKENDLAWVDLARRQVTTDDTGRVVYETWDPLANNGAGGNTDRYDIMLT
NADKDGSSKTFSLSLAKNWDMGLSMRAGYAYNSVEEGNQGSSSTATSNYQYTPVQYDRNG
TTMGTGYYETPHRFTFSLGYDVEFVAGYNSSFNLFYEAREGNPMTWVLGSYRDGNLGDQA
SFANASYYLPYIPTGADDANVEYADGLTYEALKAALDDIGLSQYAGGIAPKGTDNQPWVH
QLDFRFTQELPGFSDEHKGILYFDIKNVLNLVNDDWGVVEYQSYGTSTLVDHAYNATTGV
YTYSVPYGQDGIETDNQNTYDINKSAWQLKVGVKYQF
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttactaagtcataaaatgagtcgccttgcgctagcgacgtgttttgcaatgggggtc
gcactacccgcatcggcagctgatactgcatctgatattcgtggtcaaattaccgggcca
gcaggaaatgctgtctcagacgcaaaagtgaccattattcaccaaccgaccggtacagtt
accgaagtgcccgtaactgctaatggtcagttttctgcgcgcggtttgcgtgttggtggt
ccttacattattaaagttgattctgaccagtttgctgacaccgttgaagaagatgtttac
ttgcaactgggcgagacattccgctttaatcgtactctacaagatgcaagcgcaatggag
cgtattggtgttgtgggcagtgcaggatattaccgaacagcgggcagtaatagtgacttt
ggcgagcaagacattgccaatgcgccaggtattagtcgtgatttaaaagatgtactacgt
caaaacccaatggcagtcgtgggtactgatggcgtttctatgagcgtggcgggtatgaac
ccacgtttcaatacttttgtggttgatggtatatctcaaaacgatgattttggtcttaac
tcaaatggttacccaacacagcgttcgcctatttctatcgatgcggtagaaagtgtcgcg
ttaaatgtgtcgccatacacggcaagaaacggtggttttaccggtgcacaaattaatgct
gtgactaagtcgggtactaacgatttatctggttcagttttttgggaaaccaccaacgat
agcttggccggtgacggtaaaaatcaagacacgggtgataaaattgagcaagattttgaa
gaaaccacgtttggcggtactgttggcttcccgctaatagaagataagttatttttcttt
ggctcttacgagaacttcgatgcgcctcagtctgcagaatgggggccaaatggtgcaggt
tatgccaatgattcagacgttactgcagatgaattagcattaattgagcaaattgcgcag
acagtttatggccttgatagtattggtggttacactacgacgccacaagaaaaggatgaa
aaaatcttagccaagctggattggaacattaacgaccagcatcgcgccagtttcacttac
cagtcaacggtaggtaacttaaccaataacatgagctcaagtgcatcgtctttaaagtta
tcaagtacttggtacgataaagaagaaatattagaaacctacgctgctaacttatatagc
gattggactgatgattttagcactgagattaaactggcttataaagataccacttcaaaa
tcaaaaaccattgatgatttaggcattggtatggtgtcggtacaaacctatgaccgtgcc
agcgattatgtgatttttggtaccgataagtctcgtcaagccaatgagttaaacaaccag
aatcttgaactgcgttttgtgggcgattactacttaggcgatcatgaaatcggttttggt
acccagtataacaatgttgaagtatttaacttatttgctcaaaacgtaatgggtaactgg
tcatttaataccattgaagattttgaaaatggcgacgtagaccagttcttttatgctaat
gcgatgtcgggtaatcctgacgatgtgggtgcctcttttaatatggacaccttggcatta
tttgttgaagatgcctgggcgatcacccctgatctaaccctaacttacggcatgcgttat
gaaaccattagcatgtctgattctcctgcactgaaccaaaattttgttgagcgttatggt
tttgctaataacgaaaccctagatggccaagatatttggttaccgcgtgtaggcgttaat
tataaacttaccgaagacgtcagcttacacggtggtgtagggcgttatactggtggttca
cccacagtgtggatttctaacagtttctcaaacgatggtaacagcttattaagctataac
gatggctgggacgcagcatggggcacccctgattttgctaatgtaccatcacaagcacaa
gatggtttagtgggtggcgatggcaatgtgaacgcgatagatcctaactttaaactgccg
tcagattggcgcgcaagtattgggtttgatagcacctgggattttggtgcgctaggtgat
gactggtttgttggcgctgagtttttgtatgttaaaaaagaaaatgacctcgcctgggtt
gatttagctcgtcgtcaagtaaccacagatgacactggccgtgtcgtgtatgaaacatgg
gaccctcttgctaataatggcgcgggtggaaacactgatcgttacgacattatgttaacc
aatgcagacaaagatggttcaagtaaaaccttcagtttatcgttagcgaaaaattgggat
atgggcttaagcatgcgtgcaggttatgcttataactcagtggaagaaggcaaccaaggc
tcgtcttctaccgcgacctcaaactatcaatatactccagtgcaatatgaccgtaatggc
acaaccatgggcactggctattatgaaacacctcaccgttttacctttagtttaggctat
gacgtagagtttgttgcaggatataactctagctttaacttattctacgaagcgcgtgaa
ggcaatccgatgacatgggtgttgggctcttatagagacggaaacttaggcgaccaagcc
agttttgccaatgcgtcatattacctgccatatattccaactggagctgatgatgccaac
gttgagtatgcagatgggttaacttatgaagcacttaaagctgctcttgacgacattggt
ttgagccaatatgccggcggtattgcaccaaaaggcactgataaccaaccttgggtgcat
cagcttgattttcgctttactcaagagcttcctggctttagtgatgagcacaaaggtatc
ttatattttgatatcaaaaacgtacttaatttagtcaatgatgattggggcgtggttgaa
tatcaaagctatggtacatcaacgttagttgatcatgcttataatgctaccactggagtt
tatacttactcagtgccgtacggtcaagatggtatcgaaacagataaccaaaatacctat
gacattaacaaatcagcttggcagctaaaagttggtgttaagtatcagttctaa
DBGET
integrated database retrieval system