KEGG   Streptococcus iniae ISET0901: DQ08_05770
Entry
DQ08_05770        CDS       T03285                                 
Name
(GenBank) ATP-dependent helicase
  KO
K16899  ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:5.6.2.4 3.1.-.-]
Organism
siq  Streptococcus iniae ISET0901
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:siq00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:siq03400]
    DQ08_05770
Enzymes [BR:siq01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     DQ08_05770
DNA repair and recombination proteins [BR:siq03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    AddAB pathway proteins
     DQ08_05770
SSDB
Motif
Pfam: PDDEXK_1 ADDB_N TTC3 ATPase_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHY15967
UniProt: A0A3L8GIA6
LinkDB
Position
complement(1157664..1160900)
AA seq 1078 aa
MRLLYTDISQSLTEILVNQAASFAKSGYRVFYIAPNSLSFEKERAVLEHLEEEASFAITV
TRFTQMARYFTINSKRSGKTLTDNALTMFFYRALLLIAPKDLSIYGPLKRDLTFIKQLVD
LYKELKTSNISILDLHLDNEERKNDLIAIFAMVSDLIRQDQFEDQTPLAYFAQAICSREL
EKELSKTVVVIDGFTRFTAEEDYLVSLLNDKCHQVVIGTYISQKAFQKSFVKGNVYQASI
EFMGQLSKDYHCKAEFMSSSMVYPETFSKLSRLFEAKNDFSELDIVLEEDDKSAIAIWQN
PNQKEEIEHVAKAIRQKLYEGYRYKDILVLLGDVEAYQLQIGPIFDKYDIPYYFGKSESM
SHHPLVHFMESLERSKRYNWRREDIINLLKSGLFGHFENTSIDQFEYYLDYADINGFTKF
SRPFSINPKGKQDLPIFHLESLNHLRKQLFDPLATLFKSQQQLGKSLMKKLVFFFETIDL
TGNFQQLSEEESENDREKNDEVWKVFISILEEFQLIFAEEKLSLDDALSLLKVAMQAAEY
RAVPATLDVVTVTSYDLVQAHSNAFVYALGLTQTHFPKHSKNSSLISDDERLMTNDRQDQ
FHRLEIASYENGKKNHYTALSLFNAATKELVLSQPSLINEMSDHSSPYLLDLIHFGVPLI
EKGKNQFSNRETDIGHYKSLLSQLIDINRQALDQEFSPEDNNFWTVMLRYLKKRLKENKI
SFQEQKNHLQTKKLAPEVLARRFPEDKPLSLSSSALSVFYNNQYKYYLQYVLGLEEKGSI
HPDARQHGTYLHKVFEVIMSDHSAASFDAKVQKAIEEVNQETSFKTFYQQDAQGEFSLRQ
LEAIVKSTARILDLSQSIKVLKQEDHFKIALGKELLINGTIDRIDQLPDASVGIVDYKSS
AQAFEIDQFYNGLSPQLVTYLTALKDNNPDGKLFGAMYLHMQDPKFDLKKYKQLDEKVLT
DFYSEMTYKGIFLETEKEYLSNGLYKTSKNLYSEQEIDLLIQFNKHLYYKALEQIKSGHF
LINPYSKDGRSVQGDQLKAITGFESDLDLGQARLLVKGSSNEKRQEFLSLMEKEVRSK
NT seq 3237 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagattattatacacagacattagtcaatctttaacggaaatattagtcaatcaagca
gctagttttgctaaatctggctatcgggttttttatattgctcctaattctctctccttt
gaaaaagaaagagctgttttagaacatcttgaagaagaagcttcatttgctattacagtt
acacgtttcacacagatggcaaggtatttcaccattaattcaaagagatctggaaagacc
ttaactgataatgccctaaccatgtttttttaccgtgcactcttgctgattgcgccaaaa
gatttatctatttatggtcctctaaaaagggatttgactttcatcaaacaactggttgat
ctatataaggagttgaaaacatccaatatcagtattttagacttacatttggacaatgag
gagcgtaaaaatgaccttatcgccattttcgctatggtttcagatctgattaggcaagat
caatttgaagaccagaccccattagcttattttgcgcaagctatttgttcaagagagctt
gaaaaagaattgtcaaagacagttgttgtcattgatggttttacccgtttcacagcagaa
gaggattatttggtttctctacttaatgacaagtgccatcaggttgttattggaacttat
attagtcaaaaagcctttcaaaaatcgtttgttaaaggcaatgtttatcaggcgagtatt
gagtttatgggacaattgtctaaagactatcactgtaaagctgaatttatgagcagttcg
atggtttatccagagacatttagtaaattaagtaggctctttgaggcaaaaaatgatttt
tcagaactagatatcgttttagaagaagatgataaatcagccattgctatttggcaaaat
ccaaatcaaaaagaagaaatagagcatgttgcaaaagcaattcgtcagaaattgtatgag
ggttaccgctataaagatatcttagttttacttggagatgtagaggcttatcaactgcaa
attggccctattttcgacaagtatgacattccttattactttgggaagtcagaatccatg
agtcatcaccctctggttcactttatggagtctttggagagaagtaaacgctataattgg
cgtcgtgaagatattattaatcttttaaaatcaggtctgtttggtcattttgaaaacact
agtattgatcagtttgagtattatttagattatgcagatatcaatggttttacgaaattt
tctcgcccctttagcataaatcctaaaggaaaacaggacttgccaatttttcaccttgaa
tctttaaaccatcttcgcaaacagttatttgatcccttggctactctttttaagagtcag
caacaattagggaaatccttgatgaaaaaattagtgttcttctttgaaacaatagactta
acaggaaatttccagcagctttctgaagaagaaagtgaaaatgatagggagaaaaatgat
gaggtatggaaggtatttattagcattcttgaagagttccagcttatttttgcggaggaa
aaactcagtttagatgatgccttatccctgttaaaagtcgccatgcaagccgcagagtat
cgtgcagttccggcaacccttgatgttgtaacggtgacatcttatgatcttgttcaagca
catagtaatgcttttgtttacgcacttggattaacccagactcatttcccaaagcacagt
aagaatagctctttaattagtgatgacgaacggttaatgaccaatgataggcaagaccag
ttccaccgtttggaaatagctagttatgaaaatggtaaaaaaaatcactatacagcctta
tcactttttaatgctgctactaaagaattggttttgagccagccaagtcttattaatgag
atgtctgatcactcgtcaccttatttgttggatctcattcattttggcgttcctttgatt
gagaaaggtaaaaatcaattttccaatagagaaacagatattggtcactacaagtctttg
ttgagccaacttattgacattaacagacaagcattagatcaagagtttagtccagaagac
aataatttttggacggtcatgttgcgttatttaaaaaagagacttaaagagaataagatt
tcttttcaggaacagaaaaatcatctgcaaaccaaaaaattggcaccagaggttttggca
aggcgtttcccagaagataagccattgtcgctatcaagttcggcactatcagttttttac
aacaatcagtataagtattatttacagtatgttttgggattagaagagaagggctcaatt
catcctgatgcaaggcaacacggcacttatctccataaagtgtttgaagtaatcatgtcg
gatcattcagctgcctcttttgatgctaaagtgcaaaaggcaattgaagaggtaaaccaa
gaaacttccttcaaaaccttttatcagcaggatgctcagggagaatttagtctaagacaa
ttagaagccatcgttaaatcaactgctaggattctagatttgtctcagtctattaaagtt
ttaaaacaagaagaccattttaaaattgccttgggtaaggagttattgattaatggaaca
attgatagaatagaccagttgcctgacgctagtgttgggattgttgactacaaatcaagt
gcacaagcttttgagattgatcagttttataatggtttaagcccacaattagtgacttac
ttgacagcattaaaagacaataatcctgatgggaaactttttggagccatgtatttgcat
atgcaagatccaaagtttgatttgaaaaaatataaacaattagatgagaaagttttaaca
gatttttatagtgaaatgacttataaagggatttttcttgagacagaaaaagaatacctg
tctaatggtctttacaaaacaagtaagaacctttatagtgagcaagaaatcgatttatta
attcaatttaataaacacctttattataaagctttagagcaaattaaatctgggcatttt
cttatcaatccttatagtaaggatggtaggtctgtacaaggtgaccaattaaaggctatt
acaggttttgaatccgaccttgatttaggtcaagctagacttttggttaaaggctcaagt
aacgaaaaacgtcaagaatttttaagtttaatggaaaaagaggttaggtcaaaatga

DBGET integrated database retrieval system