Spiroplasma ixodetis: SHM_00220
Help
Entry
SHM_00220 CDS
T08792
Name
(GenBank) protease
Organism
sixo
Spiroplasma ixodetis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DJ-1_PfpI
GATase_3
GATase_5
ThiJ_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDT02376
LinkDB
All DBs
Position
complement(17065..17646)
Genome browser
AA seq
193 aa
AA seq
DB search
MNWKEIMSNNEKFKVAIFLATGYEMGEVIITIDLLRRANIVIDLVSIENDLKIKSSHNVF
ILCEKKISDIDLLSYKMLILPGGKVGVENLSKNELLKSILVIFAKDSNKFIAAICAAPQI
LGQLNLIDNKKITHYPGTNIGLNKSIILDEKVVVDNNIITGKSIGAAFEFGLKLIEVLES
KEISEQIKKQLVF
NT seq
582 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattgaaaagaaataatgagtaataatgagaagtttaaagtagctatttttttagca
acaggctatgaaatgggtgaagtaataattactattgatctattaagaagggctaatatt
gttattgatttagtaagtattgaaaatgacttaaaaatcaaatcaagtcataatgttttt
attttatgtgaaaagaaaatcagtgatattgatttgttaagttataagatgctaatttta
ccgggtggtaaagttggagtagaaaacttaagcaaaaatgaattattaaaatcaatatta
gttatttttgctaaagatagtaataagtttattgctgctatttgtgcagcaccccaaatt
ttaggtcaattaaatttaatagataacaaaaaaattacgcattatccaggcactaatatt
ggtttaaataaaagtattattttagatgaaaaagtagtagttgataataatattataact
ggaaaatcaattggtgctgcatttgaatttggtttaaagttaattgaagttttagaaagt
aaagaaatttctgaacaaattaaaaaacaattagttttttaa
DBGET
integrated database retrieval system