Spiroplasma ixodetis: SHM_00240
Help
Entry
SHM_00240 CDS
T08792
Symbol
mnmE
Name
(GenBank) tRNA modification GTPase MnmE
KO
K03650
tRNA modification GTPase [EC:3.6.-.-]
Organism
sixo
Spiroplasma ixodetis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sixo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
sixo03016
]
SHM_00240 (mnmE)
Transfer RNA biogenesis [BR:
sixo03016
]
Eukaryotic type
tRNA modification factors
Other tRNA modification factors
SHM_00240 (mnmE)
Prokaryotic type
Methyltransferases
SHM_00240 (mnmE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MnmE_helical
TrmE_N
MMR_HSR1
FeoB_N
Dynamin_N
GTP_EFTU
AIG1
Ras
RsgA_GTPase
Roc
ABC_tran
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDT02378
LinkDB
All DBs
Position
complement(18484..19839)
Genome browser
AA seq
451 aa
AA seq
DB search
MLNDTITAIATAPLNQAISIIRISGKDTYELLNKVFDKDILNQKGHTLITGYIIDHNKNK
IDQVVLACYRAPKSFTGEDTIEINCHGGVLITQKILQLLLSTGMRIATRGEFTRRAYLND
KIDLIEAEAINDLIMAENNTILKTAINSLSGKTRVLIDELSSELLTLIANITVNIDYPEY
DGVEEKTINNVIPLVEKFLNKIKVIKEHSKITKTIKEGINTVIIGKPNVGKSSLLNVLLN
EDKAIVSNEEGTTRDLVEGKINLGDISLNLIDTAGIRHTLNDIEKAGIDKSHKALNEADL
IILVLDGSKDLSVEDKQLLEKIKHKNYLIAINKTDLRLKLKLDIKNNFNVVKVSAIMAEI
ENLILGIKNKIITTEINFDKELLFANTRQLAYLDEIELSISEALKDLKKNISIDLIIVHL
QTAWNKILEMQGKKFETDLLDEIFKRFCLGK
NT seq
1356 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaatgatactattactgcaattgcaaccgcacctttaaatcaagcaatcagtatt
attagaatttcaggaaaagatacttatgagttattaaataaggtttttgataaagatatt
ttaaatcagaaaggtcacactttaataacaggatatattattgatcataataagaataaa
attgatcaagttgttttggcatgttatcgcgctcccaaatcttttacaggtgaagataca
attgaaattaattgtcatggcggagtgttaataacacaaaaaattttgcaattattacta
tctacaggtatgagaatagcaacaagaggagaatttacgagaagagcttatttaaatgat
aaaattgatttaattgaagcagaagctattaatgatttaattatggctgaaaataatact
attttaaaaaccgctattaatagtttaagtggtaaaacaagagtactaattgatgaatta
tcttcagaattactaactttaattgctaatataacagttaatattgattatcctgaatac
gatggagttgaggaaaaaacaattaataatgttattccattagttgaaaaatttttaaat
aaaataaaagttattaaagaacatagtaaaattactaaaactataaaagaaggaattaat
acagttattattggaaaacctaatgttggaaaatcttccctattaaatgtgcttttaaat
gaagataaagctattgtttctaatgaagaaggaacaacaagagatctggtagaaggcaaa
attaatttgggtgatattagtttaaatttaattgatacagcaggtatacgtcatacttta
aatgatatcgaaaaagcaggtattgataaatcacataaggctttaaatgaagcagattta
ataatattagtacttgatggttcaaaagatttaagtgttgaggataaacaattattagaa
aaaataaaacataaaaattaccttattgctattaataaaacggatttaaggttaaaatta
aaattagacattaaaaataattttaatgtggtaaaagttagtgcaataatggccgaaatt
gaaaatctaattttaggaataaaaaataaaattataactactgaaattaattttgataaa
gaattactttttgctaatacaagacaattagcatatttggatgaaattgaacttagtatt
tcagaagcattaaaagatttaaaaaagaatatttcgatagacttaattattgtacactta
caaactgcatgaaataagattttagaaatgcaaggtaaaaaatttgaaactgatttatta
gatgaaatttttaaaagattttgtttaggaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
