Spiroplasma ixodetis: SHM_00390
Help
Entry
SHM_00390 CDS
T08792
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
sixo
Spiroplasma ixodetis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sixo00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
sixo03032
]
SHM_00390 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
sixo03400
]
SHM_00390 (gyrA)
Enzymes [BR:
sixo01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
SHM_00390 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
sixo03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
SHM_00390 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
sixo03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
SHM_00390 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDT02393
LinkDB
All DBs
Position
30599..33088
Genome browser
AA seq
829 aa
AA seq
DB search
MSEITKKNETFISNKYVRNISDEMRTSFLEYSMSVIVSRALPDARDGLKPVHRRILYSLA
ILGMTYDKPYKKAARIVGECIGKFHPHGDIAVYETMVRMAQEFNYRYPLADGQGNFGSID
GDSAAAMRYTEVRMSKMAGELVKDLNKNTVTFVENYDGAEKEPSVLPAYFPNLLVNGTTG
IAVGMATSIPPHNLREIVDSIIFVAQNPDCDIMEILDIVKGPDFPTGAMILGVNSFKNAY
LNGRSTITVRSKTKVEKLSNGKPAIIVEEIPYQTNKTNLINNIVKAVQEKKVNYITDLRD
ESNREGIRLVLEIKNIDYAELILNQLYKFTSLQTTFTINLLALHNKQPKVMNLKEMIEIY
IEHQIEIILNKSNFELKKYEHQYHIIFGLVKALQNIDEIIKIIKESKKTEEALTNLQNKF
EFSEKQAKAILEMKLQRLTDLEQEKLNNELSFINEEIIRLRTLINEPSKQIELMISQLTT
IKENYGDDRRTEIIENYEGEIIDEDLIKEEQVVITLSKSGYIKRLPLDTYRTQHRGGIGV
KGAGGTDINTDDIDKVLITSTHSDLLIFSNKGKVYRIRAHKLPNYSRTAKGTPIVNLIAT
EKNETIKTIIAISEDYDINANLFFVTKKGIIKRSTLDQFKSIYQNGKIAIKLRSNDQLVD
VLKTTGNNEIIIAVANGRAVRINENQVRVMSRIASGVKGIDTKGTHVIGMCSNKDGDLVV
SISEKGYGKISRFEEYRLANRGGKGVISMKLAQKTGKLIGINSINNTNNSNDLLIMTLKG
TVIRFSLEDIRTTSRNTIGVKLIRFKTEEDAISSIVTIPITKEKTIFID
NT seq
2490 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtgaaataactaaaaaaaatgaaacatttatttctaataaatatgttcgtaatata
tctgatgaaatgagaactagttttttagaatattcaatgtcagttattgtttcaagagct
ttaccagatgcaagagatggattgaaaccagtacatcgtcgaattttatattctttagca
attttaggtatgacatatgataaaccttataaaaaagcagcacgtattgttggagaatgt
attggaaaatttcatcctcatggtgatattgcagtttatgaaacaatggtaagaatggca
caagaatttaattatcgttatcctttagctgatggccaaggtaattttggttcaattgat
ggtgatagtgctgctgctatgagatatactgaagttagaatgagtaaaatggcaggagag
ttggttaaagatttaaataaaaatacagttacttttgttgaaaattatgatggtgctgaa
aaagaacctagtgttttaccagcttattttcctaatttattagttaatggaacaacaggt
attgctgttggaatggcaacaagtattccaccacataacttaagagaaatagttgattca
attatttttgtagctcaaaatcctgattgtgatattatggaaatattagatattgttaaa
ggacctgactttcctacaggtgcaatgattttaggtgtaaattcatttaaaaatgcttat
ttaaacggaagatcaacaataacagttcgtagtaaaactaaagttgaaaaattatcaaat
ggtaaacctgcaattattgttgaagaaataccttatcaaactaataaaactaatttaata
aataatatagttaaagcagttcaagaaaaaaaagtaaattatataactgatttgcgagat
gaatctaatcgtgaaggaataagattagtattagaaattaaaaatattgattatgctgaa
cttattttaaatcaactatataaatttacttcattacaaacaacattcacaataaattta
ttagcattacataataaacaacctaaagtaatgaatttaaaagaaatgattgaaatttat
attgaacatcaaattgaaattattcttaataagtctaattttgaattaaaaaaatatgaa
catcaatatcatattatttttggtcttgttaaagcattacaaaatattgatgaaattatt
aaaataattaaggaatcaaagaaaacagaagaagcattaactaatttacagaataaattt
gaattttctgaaaagcaagctaaagcaattttagaaatgaaactgcaacgtttaacagat
ttagaacaagaaaaattaaataatgaattatcatttattaatgaagaaattattcgatta
agaactttaattaatgaaccttctaagcaaatagaattaatgatttctcagttaacaaca
attaaagaaaattatggtgatgatagaagaactgaaattattgaaaattatgaaggtgaa
attattgatgaagatttaattaaagaagaacaggtggttataactctttcaaaaagcggt
tatattaaacgtttacctttagacacatatagaactcaacatcgtggtggtattggtgtt
aaaggtgctggtggcactgatattaatactgatgatattgataaagttttaattacttca
actcattctgatttgttaatatttagtaataaagggaaagtttatcgaattcgtgctcat
aagctaccaaattattcaagaacggctaaaggaacaccaattgttaatttaatagcaaca
gaaaaaaatgagactattaaaacaataattgctatatcagaagattatgatataaatgct
aatttattttttgttactaaaaaaggaattattaaacgttcaactttagatcaatttaaa
tctatttaccaaaatggtaaaatagctattaaattgcgttcaaatgatcaattagtagat
gtgctgaaaactacaggtaataatgaaataattattgctgtggctaatggacgagcagtt
agaatcaatgaaaatcaagttagagtaatgtcaagaatagctagcggagtaaaaggaata
gatacaaaaggtactcatgtaattgggatgtgttctaataaagatggtgatttagttgtc
tctattagtgagaaaggttatggaaaaatatcacgatttgaagaatatcgtttagcaaat
cgtggtggtaagggtgtaatttcaatgaaattagctcaaaaaacaggaaaattaattggt
ataaattcaataaataacactaataatagtaatgatttattaattatgactttaaaaggt
acagttattagattttctttagaagatataagaactacaagtagaaatactataggtgtt
aaattaattagatttaaaacagaagaagatgcaatttcttcaattgtaacaatcccaatc
actaaagaaaaaactatttttattgattaa
DBGET
integrated database retrieval system
