Spiroplasma ixodetis: SHM_12090
Help
Entry
SHM_12090 CDS
T08792
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
sixo
Spiroplasma ixodetis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MoaF_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDT03563
LinkDB
All DBs
Position
complement(885138..887072)
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MKKVFTKLGIILIASATILPLSACTFNFYVNRVTNSIAKSFADQTSALIKSMVMSKELGA
DTSSTNDDIMGKIKNNSINNLTKNTSLNNWGDLQTRWGENGKIDVNNFDPDNFFKASGTG
ELTKTINSKKQVNDVFSSLDYIRTISIMANPQLENIVVGAGMDPISSFLKSLQGDLSSLP
AGLQLVANLINNYGPNFLNPLTRIFGNLVNGSWSDQQTSTPTDEETLTKFMNNWKDDSGQ
PYSAWNDDGKWKISPSFGQFPGHKVENWKSKQDYDLYHGGTLINYLFWKMSEDNKIFGKD
GKTPRYLGNILSEYITVNGINPPDVQFDDKGFFADIEKYFPYLLTNPLYILTIIEAIIPV
IKKWILDMPDITESVKNLTIGNGYPSKPSAGSYNLLDIINTIKSLISQPEKLKQILLTVF
GKTTEETRGFDTFLYDVKLNLKVKIGPLPISANLTLGGLIGDSAYDPSPLIDTIIKAINT
DSVKNIITSITDLITKISEQYPGNESINIDLQDLENFLFNNITGLLIILKNDTIVTLKNI
INKSDVTATDVEELYKSLGGHINKDDPEYPTFTQGSILDILQKTMLEPNSQLNNILNLLL
GTTYESHKLGIKNIITANNNQWIKDNYEVYFDADNTTGINKKNR
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagtatttaccaagttaggaattatcttaatagcaagtgccactattttacct
ctatcggcttgtacctttaatttttatgttaaccgtgtaactaatagtatcgctaaaagt
tttgctgaccaaacttctgctttaattaaaagtatggttatgtcaaaagagttaggtgct
gatactagtagtactaatgatgatattatgggaaaaattaaaaataatagtattaataat
ttaactaaaaatactagtttaaataattgaggtgatttacaaacacgttgaggggaaaat
ggaaaaattgatgtaaataactttgatcctgataatttttttaaagcttctggaacaggt
gaattaactaaaaccatcaatagtaaaaagcaagttaatgatgttttttcatcacttgat
tatattagaactatatcaattatggctaacccacaattagaaaatatagttgtaggtgct
ggtatggaccccatttctagttttttaaaatcattacaaggtgacttaagcagtttacca
gctggattacaattagttgctaatttaattaataactatggtcctaattttttaaatccg
ctaactagaatatttggtaatttagtcaatggcagttgatctgatcaacaaacttctaca
cccactgatgaagaaacattaactaagtttatgaataattgaaaagatgatagtggtcaa
ccttatagcgcttgaaatgatgatggaaaatgaaaaataagtccaagttttggtcaattt
cctggtcataaagttgaaaattgaaaatcaaaacaagattatgatttatatcatggtgga
actttaattaattacttgttttgaaaaatgagtgaagacaataaaatttttggtaaagat
ggtaaaactccaaggtatttaggtaatattctttcagaatatataactgttaatggtata
aatccaccggatgttcaatttgatgataaaggattttttgctgatattgaaaaatacttt
ccctatcttttaactaacccactttatatcttaacaattattgaagcaattattccggtt
attaaaaaatgaatattagatatgcccgatattactgaaagtgttaaaaatttaacaatt
ggtaatggttatccatcaaagccaagtgctggtagctataatttacttgatattatcaat
actataaaatctttaattagccaaccagaaaaattaaaacaaatacttctaaccgtattt
ggtaaaactacagaagaaactcgtggtttcgatacatttctttatgatgttaaacttaat
ttaaaagttaaaattggtcctttacctatatcagcaaatttaaccttaggcgggcttatt
ggtgatagtgcatatgatcctagtccattaattgataccattatcaaagcaattaataca
gatagtgttaaaaacattattactagtattactgatctaattaccaaaatttcagaacaa
tacccaggtaatgaaagtattaatattgatctacaagatttagagaattttttatttaat
aatattactggtctcttaataattcttaaaaatgatactattgttactctaaaaaacata
attaataaaagtgatgtaacagcaaccgatgtcgaagaattatataaatcattaggtgga
cacattaataaagatgatccagaatatccaacttttactcaaggttcaatacttgatatt
ttacaaaaaactatgcttgaaccaaacagtcaactaaataatatcttaaatttattactt
ggtactacttatgaaagtcataaattaggaattaaaaatattattactgctaataataat
caatgaattaaagataactatgaagtttattttgatgctgataacacaaccggcattaat
aaaaaaaataggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
