Spiroplasma ixodetis: SHM_19440
Help
Entry
SHM_19440 CDS
T08792
Symbol
pheT
Name
(GenBank) phenylalanine--tRNA ligase beta subunit
Organism
sixo
Spiroplasma ixodetis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA_synthFbeta
FDX-ACB
B5
tRNA_bind
B3_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDT04298
LinkDB
All DBs
Position
1421637..1424042
Genome browser
AA seq
801 aa
AA seq
DB search
MIVSRKIISQWLNINSIKDYEIVDALNSLGFEVDQVKNLMFSNTNLVVGQITKITKHPKS
NKLNICEVTVGTEMLTIVCGAPNVVIGIKVVVARIGSVLGNGLTIVERTIQDVVSSGMLC
SLTELGLSGIVQNKEELSGIIHLPDDAMIGNINPLQYLNLDDTIFFIDLTVNRSDCLGIY
SIARELSGYFKIPLKNMEVSSIGKFDNKSQVSVLNGKIQALATLKIEFDDKSVITPIWIR
RTLQLANIVPKTLSEDIIHLVMLELGQPLITFSADVLKKPSLNISPKSYPEGNLQIKEGD
ILLHDKYLAFSVLGVSHNIEYEVKPSSKEVFIFSINPDVTLMSKQAKRHGALINTLLERL
TRPVVPDYYLIALQRYLFILGQLQVKYEITGFSNDVPYQVKTKVINFNFNFINKILGTKF
EVNEIINYLTIIGCQIEIDAKNQEILKVTVPNHRSDLNNANDFSEEVARVFGYDKLPVIK
PQFNVSFKSPTALENLMMKWRQHLTSYGFNQVKTYSLTSMQRLNDFNFFKYKIPVKLEAP
LTLTREVMRFSLTDSLLRICQYNYARKETQLKIFTDETVYTGDETDDNHHLAFMIMDNFW
PKINANKITNSTYYFIKGFLDGFLAKVMPNLFNSIVYKNNNNSLMHPYLSADIFYEQEHI
ATIGALHPQTEKIMNVEKIFLAEINCSKLVKIIEEQQKVVSKFKLWSKFNTLSRDISIIV
NSDIQFSDVKNAIMFANIDFLEQISLVDFYNDEKLKSQHQHSLTFNLKFNSQEEQLDETK
VSGQISNIQEILKKKFQAIIR
NT seq
2406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagtttcacgtaaaatcatttcgcagtgattgaatattaatagcattaaagattat
gaaatcgttgatgctttaaatagtttaggttttgaggttgatcaagtaaaaaatttaatg
tttagtaatacaaacttagttgttggtcaaattactaaaattaccaaacatcctaaatcg
aataaattaaatatttgtgaagtaacagtaggtactgaaatgttaactatagtttgtggt
gcaccaaatgtagttattggtattaaagttgttgtagcaaggataggaagtgttttaggt
aatggtcttactattgttgaaagaacaattcaagatgttgtttcttcaggaatgctttgt
tcattaacagaattaggattaagcggtattgttcagaataaagaagaattaagtggtatt
attcatttaccagatgatgcaatgattggtaatattaatccgttacaatatttaaattta
gatgatacaattttttttattgatttaacagtaaatcgtagtgattgtttggggatttat
agtattgctagagaattaagcgggtattttaaaattcctttaaaaaacatggaagttagt
agtataggaaaatttgataataaaagtcaagttagcgttcttaatggtaaaattcaagct
ttagcaacattaaagattgaatttgatgataaatctgtaataacaccaatttgaattaga
agaacactacaacttgcaaatattgtacccaaaactttatcagaagatattattcattta
gtaatgttagaattgggtcaacccttaattacttttagtgctgatgttttaaaaaaacca
tctttaaatatttcgcctaaatcatacccagaaggtaatttgcaaattaaagagggcgat
attttattacacgataaatatttggcttttagtgttttaggagttagtcataatattgaa
tatgaagttaaaccaagttccaaagaagtttttatattttcaattaatcctgatgttacc
ttaatgagtaaacaagcaaaacgacatggtgctcttattaatacattattagaacgttta
acaagaccagttgttcctgactattatttaattgctttacaacgttatttgtttatttta
ggacaattgcaagttaaatatgaaattaccggttttagtaatgatgttccttatcaagtt
aaaacaaaagtgattaactttaattttaattttattaataaaattttaggtacaaaattt
gaggttaatgaaataattaattatttgactattattggttgtcaaattgaaattgatgca
aaaaatcaagaaattttaaaagtaacagttcctaatcatcgtagtgatttaaataacgct
aatgattttagtgaagaagttgccagagtatttggatatgataaattaccagttattaaa
ccacaatttaatgtatcatttaagtcaccaacagcattggaaaatttaatgatgaaatga
agacaacatttaacaagttatggttttaatcaagtaaaaacatatagtttaacaagtatg
cagagattaaatgattttaatttttttaaatataaaatacctgtaaaattagaagcaccg
ttgacattaacaagagaagttatgcgttttagtttgacagatagtttattaagaatttgt
caatataattatgcacgtaaagaaacacaattaaaaatttttactgatgaaactgtttat
acaggtgatgaaactgatgataatcatcatttagcttttatgattatggataatttttga
ccaaaaattaatgctaataaaattactaatagtacttattattttattaaaggtttttta
gatggttttttagcaaaagttatgccaaatttatttaactctattgtttataaaaataat
aataattctttaatgcatccgtatttaagcgcagatattttttatgagcaagaacatatt
gctactattggcgcactgcatccacaaactgaaaaaataatgaatgttgaaaaaatattc
ttagcagaaattaattgtagtaagttagttaaaatcatagaagaacaacaaaaagtagtt
tctaaatttaagctttgatcaaaatttaatactttaagtcgtgatatatcaattattgtt
aatagcgatattcaattttctgatgtaaaaaatgctataatgtttgcaaatattgatttt
ttagaacaaatatctttggtagatttttataatgatgaaaaattaaaatcacaacatcaa
cactcattaacttttaatttgaaatttaatagtcaagaagaacaattagatgaaacaaaa
gtaagtggacaaataagtaatattcaagaaatattaaagaaaaaatttcaagcaattatt
cgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
