KEGG   Spiroplasma ixodetis: SHM_21240
Entry
SHM_21240         CDS       T08792                                 
Symbol
parC
Name
(GenBank) DNA topoisomerase 4 subunit A
  KO
K02621  topoisomerase IV subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
sixo  Spiroplasma ixodetis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sixo00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:sixo03032]
    SHM_21240 (parC)
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:sixo03036]
    SHM_21240 (parC)
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:sixo02048]
    SHM_21240 (parC)
Enzymes [BR:sixo01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     SHM_21240 (parC)
DNA replication proteins [BR:sixo03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   SHM_21240 (parC)
Chromosome and associated proteins [BR:sixo03036]
 Prokaryotic type
  Chromosome partitioning proteins
   Other chromosome partitioning proteins
    SHM_21240 (parC)
Prokaryotic defense system [BR:sixo02048]
 Toxin-antitoxin system (TA system)
  Type II TA system
   Type II TA system related factors
    SHM_21240 (parC)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDT04478
UniProt: A0ABM8BX76
LinkDB
Position
1551899..1554412
AA seq 837 aa
MNSKEEIQQNNEQILSYPIDDIVAERFGRYAKYIILERALPDVRDGLKPVQRRILHAMND
LGLTNDKAYKKAARVVGEVIGKYHPHGDTAVYAAMCRMAQEWKVAWPLVQMHGNKGSIDG
DNPAAMRYTEARLSLISELLLKDIKKNTISLIKNFDESETEPTVLPAYFPNLLVNGASGI
AVGMATNIPPHNLQEVINAIVMRINNPQCNLSELMRVIKGPDFPTGGIIQGIKGIKEAYR
SGKGRIAIRAKTHINNEGEIPQIIITEIPFEVIKQDLIKKIDDVKTLAKIHGIKEVRDET
DRFGLRIVIDLVEDSKPQEILNYLFKNTNLQIYYNFNLVAIANKKPVQMSLINMLDFYIN
HQIDVVTKRSQYDLAQLERRLEIVNGLVIALSEVDKVIKIIRTSTDRMQAKLNLISAFNF
TDIQAEAIVQLRLYRLTATDIQSLVLEKADIESKIIVLQEILNNENSLRQVIITELEQIN
SNFSGLRKSQIQGEISEITIDEKATLRQENVFVSISYDGWIKVISSKVFLQNLDYQDFGR
KPNDVIIGGAMFNNFNNLLFFTNKGNYFLIPIFKLEENKWKDNGIHVNTLCKLEGNEKII
SVAQVNSFEQPNVNIVVATRYGLIKRMPLLELATTRFNKTAKYVKLKENDSVISVNSTTG
HDFIVISTRKGMTLKYLETKVPLLTKTATGVKALKINSEEDEVVGMACGNSNDIYAMLTS
VGTIKRMLFNTIEQTSRTTKGNKVIKVPKSKSISIIKTFLSPATSFINILTKKEKWLVIK
ASDINLSKVNEGTGKVVADDIIAGGSNLVIDLKTDVIDADISSISENFDGKESNNGI
NT seq 2514 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatagtaaagaagagattcaacaaaataatgaacaaattttatcttatcctattgat
gatattgttgcagaacgttttggtcgatatgccaaatatattattttagaacgagcattg
cccgatgtccgtgatggtttgaagccagttcaacgtcgaattttgcatgctatgaatgat
ttgggtttaaccaatgataaagcatataaaaaagcagctcgtgttgttggagaagtaatt
ggtaaatatcatcctcatggtgatacagcagtttatgctgcgatgtgtagaatggcacaa
gagtgaaaggtagcatgaccattagtacaaatgcacggtaataaaggttcaattgatggt
gataatcctgctgcgatgcgatatacagaagcacgtttatcattaatttcagaattatta
ttgaaggatattaagaaaaatactattagtttaattaaaaattttgatgaatcagaaaca
gaaccaacagttttacctgcctattttccaaatttattagtaaatggtgcttctggaatt
gccgttggaatggcaactaatattccacctcataatttacaagaagtaattaatgcaatt
gtcatgagaattaataatccacaatgtaatttaagcgaattaatgcgtgttattaagggt
cctgactttccaaccggaggaattattcaaggtattaaaggtattaaagaagcttatcgt
tctggtaaggggcgaattgcaattcgtgccaaaactcatattaataatgaaggtgaaatt
ccacaaataattattaccgaaattccatttgaagttattaaacaagatttaattaaaaaa
attgatgatgttaaaacattagcaaaaattcatggtattaaagaagtacgtgatgaaacg
gatcgttttggtttacgaatagttattgatttagtagaagatagtaaaccacaagaaatt
ttaaattatttatttaaaaataccaatttacaaatttattataactttaatttagtagca
attgctaacaaaaaaccagtacaaatgagtttaattaatatgttagatttttatattaat
catcaaattgatgttgttactaagcgttcacaatatgacttagcacaattagaacgaaga
ttagagattgttaatggtttagttattgcattaagtgaagttgataaagtaattaaaatt
attagaacatcaactgaccgtatgcaagcaaaattaaatttaatatcagcttttaatttt
actgatattcaagcagaagcaattgtacaattgcgtttatatcgtttaactgctactgat
attcaatcattagttttagaaaaagcagatattgaaagtaaaattattgttttacaagaa
attcttaataatgaaaattcactacgtcaagttattattactgagttagaacaaattaat
tctaatttttctggattaagaaaatcacaaattcaaggtgaaatttctgaaattacaatt
gatgaaaaagcaacattgcgacaagaaaatgtatttgttagtattagttatgatggttga
attaaggtaataagtagtaaagtatttttacaaaatcttgattatcaagattttgggcgt
aagccaaatgatgttattattggtggagcaatgttcaataattttaataatttattattt
tttacaaataaaggtaattattttttaataccaatttttaaattagaagaaaataaatgg
aaagataatggtattcatgttaatacgttatgtaaacttgaaggaaatgaaaaaattatt
agtgttgcgcaagttaatagttttgaacagccaaatgtaaatatagtagtcgctactaga
tatggtttaattaaaagaatgccacttttagagttagcaactaccagatttaataaaacc
gccaaatatgttaagttaaaagagaacgatagtgttattagtgttaatagtactaccggt
catgattttattgttattagtactcgcaagggtatgactttaaaatatttagaaacgaaa
gttccattattaactaaaactgcaacaggtgttaaagctttgaaaattaattctgaagaa
gatgaagtggtaggaatggcttgtggtaatagtaatgatatttatgcaatgttaacatca
gttggaacaattaaacgaatgttattcaatactattgaacaaacttcacgaacaacaaaa
ggtaataaagtaataaaagttcctaaaagtaaaagtattagtattattaaaactttctta
tcaccagcaacatcttttattaatatattaacgaaaaaagaaaaatgattagtgattaaa
gcaagtgacattaatcttagcaaggtaaatgaaggaactggcaaagtagttgctgatgat
attattgctggcggtagtaatttagtgattgatttaaaaactgatgttattgatgctgat
atatcatcaatatcagaaaattttgatggaaaagaaagcaacaatggtatttaa

DBGET integrated database retrieval system