Spiroplasma ixodetis: SHM_24240
Help
Entry
SHM_24240 CDS
T08792
Symbol
deoA
Name
(GenBank) pyrimidine-nucleoside phosphorylase
KO
K00756
pyrimidine-nucleoside phosphorylase [EC:
2.4.2.2
]
Organism
sixo
Spiroplasma ixodetis
Pathway
sixo00240
Pyrimidine metabolism
sixo01100
Metabolic pathways
sixo01232
Nucleotide metabolism
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sixo00001
]
09100 Metabolism
09104 Nucleotide metabolism
00240 Pyrimidine metabolism
SHM_24240 (deoA)
Enzymes [BR:
sixo01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.2 Pentosyltransferases
2.4.2.2 pyrimidine-nucleoside phosphorylase
SHM_24240 (deoA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glycos_transf_3
Glycos_trans_3N
PYNP_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDT04778
LinkDB
All DBs
Position
complement(1770239..1771546)
Genome browser
AA seq
435 aa
AA seq
DB search
MYMIDLISKKKLGQSLNKEELKFLTEGIANETIPDYQISAWAMAVYFQGMTNDELVEYTK
DIINSGETMDLSQITGFSIDKHSTGGVGDKTSLVFAPIAAACGLKVAKISGRGLGITGGT
IDKLEIIPNFKCDLAISDFIKVVNKVGMSIISQTSNLVPADKKLYALRDVSGTVDSLPLI
AASVMSKKIAMGADLILLDIKCGKGAFVQDIVTARELAKLMVHIGKAFNKKIYAIISDMN
KPLGRTIGNALELQEVILSLKNKGPEDLKILVSNLVALALLGAKKVKTLKEGIDKVNAMF
TSEKPLQIFYDFVKSQGGDTKYLDNIDKLPPAKYIIKVKAQLLGYLDFTNNYALGELSVI
LGAGRTTKTDIIDPVAGIYLKQIHGQKVEKNSVIMELHTNKDQHFHQQFLDLAISTFQIT
NKKYDIKPIILEIIM
NT seq
1308 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatatgattgatttaatttctaaaaagaaattaggacaaagtttaaataaagaagaa
ctaaaatttttaacagaaggtattgccaatgaaacaataccagactatcaaattagtgct
tgagcaatggctgtttattttcagggaatgactaatgatgaattagtagaatatacaaaa
gatattattaatagtggtgaaaccatggatttatcacaaattactggttttagtattgat
aaacattcaactggtggtgttggtgataaaactagtttagtatttgctccaatagctgct
gcttgtggattaaaggttgcaaaaatttctggaagaggattgggtattactggtggtact
attgataaactggaaataattccaaattttaaatgtgatttagcaatatcagattttatt
aaagttgttaataaagttggtatgagtattattagtcaaactagtaatttagtgcctgct
gataaaaaattatatgcattacgtgatgtttcaggaacagttgattcattaccattaatt
gctgctagtgttatgtctaaaaaaatagcaatgggcgctgatttaattttactagacatt
aaatgcggaaaaggtgcctttgttcaggatatagtaactgcaagagagttagcaaaatta
atggtacatattggtaaagcttttaataaaaaaatttatgctattattagtgatatgaat
aagcctttaggacgaacaattggtaatgcactagaattacaagaagttattttaagttta
aaaaataaaggaccagaagatttgaagatccttgttagtaatttagtagctttagcctta
ttgggagctaaaaaggtaaaaaccttaaaagagggtattgataaagttaatgctatgttt
actagtgaaaaaccactacaaattttttatgattttgttaaaagtcaaggtggagatact
aaatatcttgataatattgataaattaccaccagctaaatatattattaaagttaaggcg
caattattggggtatttagattttactaataattatgctttaggtgaattatcagtaata
ttaggagcaggaagaactacgaaaactgatatcattgatccggtggcaggaatttattta
aaacaaattcatggtcaaaaagttgaaaaaaatagtgtaattatggaactccatactaat
aaagatcaacatttccatcaacaatttttagatttggcaatttctacatttcagattact
aataaaaaatacgatattaaaccaataattttagaaataataatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system