Spiroplasma ixodetis: SHM_24790
Help
Entry
SHM_24790 CDS
T08792
Symbol
hisS
Name
(GenBank) histidine--tRNA ligase
Organism
sixo
Spiroplasma ixodetis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_His
tRNA-synt_2b
tRNA-synt_2d
tRNA-synt_2
Rho_GDI
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDT04833
LinkDB
All DBs
Position
complement(1812490..1813782)
Genome browser
AA seq
430 aa
AA seq
DB search
MQFQKPRGTRDMYNEEVIIYRNIIKSLTQCAIKYNYQEFITPIFENAQLFLRAVGDTTDI
IQKEIYQFNDKNDRLLALRPEGTAGIVRAIIENKLYKSKQTLKYFYYGSMFRYERPQKGR
QRQFNQFGIETVGVKHPLVDVEVMMMALEMIKSFSIPNLTLNINYFGSNETKNKYQIALK
EQLLNQSKQLCENCQIRVNVSPLRVLDCKICTKLNLEIPYLNVFLTNEEKTYFTTIINSL
KNNKVNFIIDEHLVRGLDYYNGIIFEITTIDSRIGESQNTLLGGGRYDNLFNELGSPLKI
PAIGFAIGIERLMLLLVENKNINKPPIIDLQIIALSELGLIMASDLLLQLRKENYHIDME
YNLYQDKNKSQIIDRSLAKNILFLKEKNQVSFYSFVKKEMIKLIFDTEQQLLSKVKNLLL
EENEEYGKTL
NT seq
1293 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatttcaaaagccaagaggaacacgtgatatgtataatgaagaggttattatatat
cgtaatattattaaatctttaacacagtgtgcaattaaatataattatcaagaatttatt
actcctatttttgaaaatgctcaactatttttacgagctgtgggagatacaactgatatt
attcagaaagaaatttatcaatttaatgataaaaatgatagattattagctcttcgtcct
gaaggaacagcaggtattgttcgtgctataattgaaaataaattatataaatctaagcaa
acgttaaagtatttttattatggttcgatgtttcgatatgaaagacctcaaaaagggcgt
caacgtcaatttaatcaatttggtatcgaaactgttggtgttaaacatcctttagttgat
gttgaagtaatgatgatggccttagaaatgataaaaagtttttcaataccaaatttaact
ttaaatattaattattttggatctaatgaaacaaaaaataaatatcaaatagcacttaaa
gaacaattattaaatcaaagtaagcaattgtgtgaaaattgtcaaattagagttaatgta
tcaccactaagagttcttgattgtaaaatttgtactaaattaaatttagaaataccatat
ttaaatgtttttttaactaatgaagaaaaaacatattttacaactattattaatagttta
aaaaataataaagttaattttattattgatgagcatttagttcgtggtttagattattat
aatggtattatttttgaaataactactattgattcacgaattggtgaaagtcaaaatact
ttacttggtggtggtagatatgataatttatttaatgaattgggctcaccattaaaaatt
cctgctattggttttgcaattggtattgaaagattaatgttattattggtagaaaataaa
aatattaataaaccaccaattattgatttacaaattattgctttaagcgaattaggatta
ataatggcttccgatttattattacaattacgtaaagaaaattatcatattgatatggaa
tataatttatatcaagataaaaataagtcacagattattgatcgtagtttagccaaaaat
atactatttttaaaagaaaaaaatcaggttagtttttattcttttgttaaaaaagaaatg
ataaaattaatttttgatactgaacagcaattgcttagtaaggttaaaaatctattatta
gaggagaatgaagaatatggaaaaactctttag
DBGET
integrated database retrieval system