KEGG   Spiroplasma ixodetis: SHM_26770
Entry
SHM_26770         CDS       T08792                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase
  KO
K02335  DNA polymerase I [EC:2.7.7.7]
Organism
sixo  Spiroplasma ixodetis
Pathway
sixo03030  DNA replication
sixo03410  Base excision repair
sixo03420  Nucleotide excision repair
sixo03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sixo00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    SHM_26770
   03410 Base excision repair
    SHM_26770
   03420 Nucleotide excision repair
    SHM_26770
   03440 Homologous recombination
    SHM_26770
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:sixo03032]
    SHM_26770
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:sixo03400]
    SHM_26770
Enzymes [BR:sixo01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     SHM_26770
DNA replication proteins [BR:sixo03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    Other elongation factors
     SHM_26770
DNA repair and recombination proteins [BR:sixo03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   BER (base exicision repair)
    DNA polymerase I
     SHM_26770
   NER (nucleotide excision repair)
    GGR (global genome repair) factors
     SHM_26770
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N DNA_polI_exo1 5_3_exonuc HHH_5 HHH_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: BDT05031
LinkDB
Position
complement(1973839..1976463)
AA seq 874 aa
MKKALIIDGNNLLFKAYYATAYQGVNLHSLQGIPTNAVYAFIRMLTKYLKSNNYASVFVA
FDAGRKTFRHETLATYKGKRSETPVELIEQFNLVKIFLDLAQIPWGQINNYEADDIIGSI
VKNKVASNYQIDIMSSDKDLLQLLDNNIKILNPQKGMSDLKVITISTFQSEYELLPYQVT
DLKGLMGDSSDNLPGIKGIGQKTAISLLKEYDTLENIIENVEQLKPNVSKLIKLNFNNGI
ICKQLAQLNLNTPITGNLETFNYNVENLNNEKLQDFYKQYNMNSLLTQDTNPKTNKNSTS
HVQIINKWSQEWNCDSNYLWLEIFGDNYNRDNIIGFGIKNKKGTFYINKINAINCSNFQH
FLQNKKLQKITWDLKKVIIAGLRLKLIINNIIFDHMLAAYLLYANEKILPENIAVMLNVN
VKDNLSTDDFYGKGIKKNIPNDEKEIAIFLEKKLNFLTDSHLILIKKLKDTNNWNLYQEI
ELPAAFVLVNMECNGVNIDQKKLKLLTDKTLLKIQDLELQIKKESNSNLNPNSPKQISEY
LFKELKLPNYKKGSTAFEVLISLKNQHPIIDILLEYRKLQKLYSTYLLGLQKYIFDDGKI
HSIYNQVQTSTGRLSSLDPNMQNISIRDKEQREVRKIFIPSKPHTKILSCDYSQIELRIL
AHISEDENLIKAFQQKHDIHRETASKILNIPLAEVTNEQRQNAKAINFGIVYGISSFGLS
QQIGIKVEDAKIFINKYFSVFPKIKSYINNIIDFCEKNGYVQTIFNRRREVMEITNKNKV
IQNFGKRIAMNMPIQGSAADILKLAMNKIYKEIKKQNIDAILIAQIHDELIFEVEDNKVN
NVITKITKIMSNVTKLKVPLLINTSIGDNWFELK
NT seq 2625 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaagcattaattattgatggtaacaatttattatttaaagcatattatgctact
gcataccaaggagttaatctacattcgctacagggtattccaactaatgccgtctatgct
tttattagaatgctgactaagtacttaaaatctaacaactatgctagtgtttttgttgca
tttgatgctggtcgtaaaacatttcgccatgaaactttagcaacatataaaggaaaaaga
agtgaaactccggttgagttaattgaacaatttaatttagttaaaatatttttagactta
gcacaaattccttggggacaaataaataattatgaagctgatgatattattggcagcatt
gttaaaaataaagttgctagtaattatcaaattgatattatgagtagtgataaagattta
ttacaactattagataacaatattaaaattcttaatccacaaaaagggatgagtgattta
aaggttattactatttctacatttcaatcagaatatgaattattaccttatcaagttacc
gatttaaagggattaatgggtgatagttctgataatttacctggcattaaaggaattggt
caaaaaactgctattagtttattaaaagaatatgacacattagaaaatattattgaaaat
gtagaacaattaaaaccaaatgttagtaaactaattaaacttaactttaataatggtatt
atttgtaaacaactagcacaacttaatttaaatacaccaattactggtaatttagaaacg
tttaattataatgttgaaaatttaaataatgaaaagttacaagacttttacaaacaatat
aatatgaactctttattaacacaagacactaatcctaaaactaataaaaatagtacatct
cacgttcaaattataaataagtgaagtcaagaatgaaattgtgattcaaattacttatga
ttagaaatttttggtgataattataatcgtgataatattattggttttggtattaaaaat
aaaaaaggaacattttatattaataaaatcaatgcaattaattgttctaattttcaacat
ttcttacaaaataaaaaactacaaaaaataacttgagatttaaaaaaggttattatcgca
ggactacgtttaaaattaataataaataatattatttttgaccatatgttagctgcttac
cttctttatgctaatgaaaaaatattaccagaaaacattgctgttatgctcaatgtcaat
gttaaagataatttaagcactgatgatttctatggcaaaggtattaaaaaaaatattccc
aatgatgaaaaagaaatagctatttttttagaaaaaaaattaaattttttaacagattct
catctcattcttataaaaaaattaaaagatactaataactgaaatttatatcaagagatt
gaactacctgctgcttttgtattagtaaatatggagtgtaatggtgttaacattgatcaa
aaaaaattaaaactactaactgataaaactttactaaaaatccaagatttagaattacaa
attaaaaaagaaagtaatagtaatttaaatccaaattcaccaaaacaaattagtgaatac
ttatttaaagaattaaaattacctaattataaaaaaggtagtactgcttttgaagtttta
attagtttaaaaaatcaacatccaatcatcgatattcttttagaatatcgtaaattacaa
aaattatattccacttacttacttggtttacaaaaatatatttttgatgatggtaaaatt
catagcatttataatcaagtgcaaaccagtactggcaggttatcttcattagatcctaat
atgcaaaatattagtattcgcgataaagagcaaagagaagttcgcaaaatctttattcca
agcaaaccacatactaaaatactatcctgtgattattcgcaaattgaattaagaatatta
gctcatattagtgaagatgaaaatttaattaaagcttttcagcaaaagcatgatattcat
cgcgaaactgcaagtaaaatattaaatatacctttagcagaagttactaacgaacaaaga
caaaatgcaaaagctattaattttggaattgtttatggcatttctagttttggtttatca
caacaaataggaattaaagttgaagatgctaaaatatttattaataaatatttttcggtt
tttccaaaaattaaaagttatattaataatataattgatttttgtgaaaaaaatggatac
gttcaaacaatttttaatcgtagaagagaagtaatggaaattacaaataaaaataaggtg
attcaaaattttggtaaacgaatagcaatgaacatgccaattcaaggtagtgctgctgat
attttaaaattagcaatgaataaaatttataaagaaataaaaaaacaaaatattgatgca
atattaattgcacaaattcatgatgaattaatttttgaagttgaagataataaagttaat
aatgttattactaaaattactaaaattatgtctaatgttactaaattaaaagttccctta
ttaattaatactagtattggtgataactgatttgaattaaaataa

DBGET integrated database retrieval system