Streptococcus iniae YSFST01-82: SI82_00030
Help
Entry
SI82_00030 CDS
T03674
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
siz
Streptococcus iniae YSFST01-82
Pathway
siz03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
siz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
SI82_00030
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
siz03400
]
SI82_00030
Enzymes [BR:
siz01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
SI82_00030
DNA repair and recombination proteins [BR:
siz03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
SI82_00030
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
UvrB_inter
TRCF
CarD_TRCF_RID
ResIII
MFD_D3
Cas3-like_C_2
UB2H
AAA_22
nSTAND_NTPase5
adh_short
RecG_dom3_C
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJG25082
LinkDB
All DBs
Position
5127..8627
Genome browser
AA seq
1166 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3501 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
