Shewanella japonica: SJ2017_0488
Help
Entry
SJ2017_0488 CDS
T04959
Name
(GenBank) MFS transporter
Organism
sja
Shewanella japonica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_1
Sugar_tr
YajR_YAM
MFS_1_like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD20826
LinkDB
All DBs
Position
569749..571116
Genome browser
AA seq
455 aa
AA seq
DB search
MAKNGLSGIEKKVAFSLASVFGLRMMGLFMIMPVFALYGQHLEGFSPLWVGIAIGAYGLT
QACLQIPMGMLSDKYGRKPIILGGLVIFAIGSIVAAMSDHIYGVVLGRALQGMGAIAAAV
LALAADLTRDEQRTKVMAIIGMCIGFSFALSLLAGPIVAQYAGLEGLFFLTAILAVLGMV
IVQVLVPNPVSQAPKGDTVATPTKLKRMLMDPQLFRLDAGIFILHLVLTAVFVALPLDLV
DAGLVKEKHWMLYFPAFVGAFFLMVPLIIIGVKRNNTKTMFQISLLIMMLSLAAMGIYAD
NLWVLSGAVVLFFTGFNYLEASLPSLIAKFCPMGDKGSAMGVYSTSQFLGAFCGGMLGGG
AYQLVGASGVFYVALALMFVWLLLTIGMEKPVLLKSYTLEAEAKDRNHAQDMATQLSQLT
GVAEAIVVIEEKAAYLKVDDQFDLREARAVLGSVS
NT seq
1368 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccaagaatggactatccggcatagagaaaaaagtcgctttttcgttagccagcgtg
tttggtttacgaatgatgggcttgtttatgatcatgcctgtgtttgcgctttacggccaa
cacttagaaggattctcgccattatgggtcggtattgccataggggcatacggcttaaca
caagcttgtttgcaaattcccatgggcatgttgtctgacaaatatggccgaaagcctatc
attttaggtggtttagtcatttttgctattggtagtattgtcgctgcgatgtctgatcat
atttacggtgtggtgctgggccgtgctttacagggcatgggagccattgctgcggcggta
ttggcactcgctgccgacttaacccgtgatgaacaacgaaccaaagtcatggcaatcatt
gggatgtgtattggcttttctttcgctttatctttacttgctgggccgatagtcgctcaa
tatgctggccttgaaggtttattctttttaactgccattttagctgtgttaggcatggtg
attgtgcaggtcttagtaccaaaccctgtgtctcaagcccctaaaggggatactgttgct
acgccgaccaagcttaaacgtatgctgatggaccctcagttatttcgattagatgcgggc
atttttattcttcatttagtattaacagcggtgtttgtcgcattacctttagatttagtt
gatgcaggcttagtcaaagaaaagcactggatgttgtacttccccgcttttgttggcgca
ttctttttaatggtgcccttgatcattattggcgttaagcgcaataacactaaaactatg
ttccaaatctcattgcttataatgatgctatcactcgctgctatgggaatttatgctgat
aatttgtgggtgctcagtggcgctgtggtgttattttttaccggctttaactatttagag
gcatcattacctagcttaatcgcaaagttttgtcctatgggcgataaaggttctgcgatg
ggggtttactcgaccagtcaattcttaggtgctttttgtggtggcatgttaggtggtggc
gcttatcaattggtcggcgcttcaggtgtcttttatgtcgcgttagcgttgatgtttgtg
tggttattattgaccattggcatggaaaaaccagtgcttcttaaaagctatacgcttgaa
gctgaagcgaaagatagaaatcatgcccaagatatggcaactcagctatcacaacttaca
ggggttgctgaggcaattgtcgtgattgaagagaaagctgcttatttaaaagtagatgat
caattcgatttaagagaagcccgagctgtgttaggctctgtcagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
