KEGG   Shewanella japonica: SJ2017_0527
Entry
SJ2017_0527       CDS       T04959                                 
Name
(GenBank) hypothetical protein
  KO
K21449  trimeric autotransporter adhesin
Organism
sja  Shewanella japonica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sja00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:sja02000]
    SJ2017_0527
Transporters [BR:sja02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   SJ2017_0527
SSDB
Motif
Pfam: Big_2 Lcl_C InvE_AD HL_N-beta
Other DBs
NCBI-ProteinID: ARD20865
LinkDB
Position
complement(611359..615861)
AA seq 1500 aa
MLLKKLLTLLCLSSCLLLSSCYLDNDSDQEFVSLRIYIDSMEGDVSTNEIPKGFSRTAVA
ILSFANGKSVNVSELVTWHNSAQDILQIVDNKITGLNTGSTSIHASYNKLISHDILIEVT
PAVSTSIQLTPASTSLPIGLSQSFQAIATFSDLSMLNITNDVNWNLSDDSIANIDKGELT
TLQTGNTEINVSFENLTSNTVQLEVTDALLESIQITPSVISIARGLHTTYVATGTYTDNS
TQDLTSLVSWSSTNNDIVTISDGIATSINKGNTIIIANFNGISSNSASLTVTDAELVNIQ
VTPATLSLAKGTISNYVAKGTYTDSSTQDITDSVSWSSTDTDIATIINGSAMTFAVGSTT
ITAKLNEISSNDAALTVTDAELVSIQITPATISLAKGTSTSYVATGTYTDNTTQDITTSV
AWSSSDTDLATIISGSATAVKEGIASISASLNGISSNSASLTVTAEELVSIQITPATISL
AKGTSTSYVATGTYTDNTTQDITTSVAWSSSDTDLATIISGSATAVKEGIASISASLNGI
SSNSASLTVTAEELVSIQITPATISLAKGTSTSYVATGTYTDNTTQDITTSVAWSSSDTD
LATIISGSATAVKEGIVSISASLNSISSNSASLTVTTEELVSIQITPATISLAKGTSTSY
VATGTYTDNTTQDITTSVAWSSSDTNVATILSGVAITVNEGIVSISASLNSISSNSASLT
VTTEELVSIQITPATISLAKGTSTSYVATGTYTDNTTQDITPSVAWSSSDTNVATILSGV
ATTISEGMTSISVNLSGINSNVASLTVTSEELVSIQITPAITSLAKGINTDYVATGTYSD
NSTLDITALVSWSSSDTNVATILSGLATTVNEGIVSISASLNGINSNSATLTVTAEELAS
IQITPAIISLAKGINTDYVAMGTYTDNSTLDITASVSWNSSDTNVATILNGSTTTINMGI
TTINASLNGINSNSATLTVTAEELVSIQITPATISLAKGINTDYVAIGTYTDNTTQNITN
SVAWSSSDTNVATILDGSATAVNEGIASISARLNSISSNSASLTVTTEELVSIQITPATI
SLAKGINTDYVATGTYTDNSTLDITASVSWNSSDINVATILDGSATTVNVGMTDISASSN
SITSSLASLTVTPAELISVQLSPTSVSLAKGLNTSFVATGTYTDNSTQNLTSSVSWNSSD
TSVATILSGSAATLAEGNTTISASLSGFSINTANLLVTPAALQSIQITSLTNTLLVGRST
IYTAEGTYTDGTSLDINSTVSWSSSDTSLVTILSGTATAVSSGLAQITASQNGISSNENL
SLVNEVSVCGADLAAAAGVCIKTLIGLTSDAKDKEFTNTPSLAVLNSMGYTKMSGASNTG
TTYSRTFEGTGTFDPVGTFILMQQFGDSTSQHTRYCNDLNTVSFNSKTNWRQATSDELRA
LYFDYPNSTLYTTHGWAINKGYWSSTPYNISQFILVAMHSGSIFSSDPVGHRSVSCVSEL
NT seq 4503 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctcctcaaaaagctgctgacattattatgcttatcaagctgtcttttactgtcttct
tgttatcttgataacgatagcgatcaagaatttgtcagcttacgtatttacattgactct
atggaaggagatgtttctactaacgagattcctaaagggtttagtcgaactgcagtcgct
attttaagttttgcgaacggtaaaagtgtcaatgtttcagagttggttacttggcataac
agtgcgcaggatatattacaaatagtcgataataaaattacaggcttaaataccggcagc
accagtattcatgcaagctataacaaacttattagtcatgatatcttaattgaggtcaca
ccagctgtttctacgagtattcagctaacccccgcatcgactagccttccaattggccta
agccaatctttccaagcaatcgcgacgttttctgatttgagtatgttgaacattaccaat
gatgtgaactggaatctttcagatgactctattgctaatattgataagggggagctcaca
accttacaaactggaaacactgaaatcaatgttagtttcgaaaacctgaccagtaatacc
gtccaattagaagtaacagatgcactattagaaagtattcaaattacaccttcagtaatc
agtattgctaggggtcttcataccacttatgttgcgactggcacatacaccgataacagc
actcaagatctcacctcattggtatcatggagcagcacgaataacgacatagtcaccatt
tcagatggcatagccacaagcattaataaaggcaacaccataataattgccaacttcaat
ggcatcagtagcaatagtgccagcttaacagtaaccgacgcagaattagtcaacattcaa
gtgacacctgctacgttaagcctcgctaaaggcacgattagcaattatgtggctaaagga
acgtatactgacagtagtacacaagatattactgactcagtatcatggtctagtactgat
acagatatcgcaaccattatcaatggctcagccatgacttttgcagtaggtagtaccact
atcactgccaagttaaatgaaatatccagtaatgatgcagccctaacggtaaccgatgca
gagttagtcagtattcaaatcacccctgcaacaatcagcttagctaagggcacaagtacc
agttatgtcgccactggaacctacactgataacacaacacaagacatcacgacctcggta
gcctggagtagtagtgatacagatttagccactattataagtggctctgcaacggctgtt
aaagaaggtattgccagcataagtgccagcttaaatggcattagcagtaatagcgcaagc
ttaactgtaacagctgaagagttagtcagtattcaaatcaccccagcaacaatcagttta
gctaagggcacaagtaccagttatgtcgccacaggaacctacactgataacacaacacaa
gacatcacgacctcggtagcctggagtagtagtgatacagatttagccactattataagt
ggctctgcaacggctgttaaagaaggtattgccagcataagtgccagcttaaatggcatt
agcagtaatagcgcaagcttaactgtaacagctgaagagttagtcagtattcaaatcacc
ccagcaacaatcagtttagctaagggcacaagtaccagttatgtcgccacaggaacctac
actgataacacaacacaagacatcacgacctcggtagcctggagtagtagtgatacagat
ttagccactattataagtggctctgcaacggctgttaaagaaggtattgtcagtataagt
gccagcttaaatagcatcagtagtaatagcgcaagcttaacagtaacaactgaagagtta
gtcagcattcaaatcacccctgcaacaatcagtttagctaaggggacaagtaccagttat
gtcgccactggaacctacactgataacacaacacaagacatcacgacctcggtagcctgg
agtagtagtgataccaatgtcgccaccattttaagtggcgtggcaatcacagttaacgaa
ggtattgtcagtataagtgccagcttaaatagcatcagtagtaatagcgcaagcttaaca
gtaacaactgaagagttagtcagcattcaaatcacccctgcaacaatcagtttagctaag
ggcacaagtaccagttatgtcgccactggaacctacactgataacacaacacaagacatc
actccctcggtagcttggagtagtagtgataccaatgtcgccaccattttaagtggcgtg
gccacgacaattagtgaaggaatgaccagcataagtgtcaacttgagtggcattaacagt
aatgttgcaagcttaacagtgacatctgaagagctagtcagcattcaaatcacccctgca
ataaccagcttagcgaaaggcattaataccgattatgtggctacggggacttacagcgat
aatagcaccttagatatcacagctttagtgtcatggagcagtagtgataccaatgttgcc
actattttaagtggcttggcaaccacagttaacgaaggtattgtcagtataagtgccagc
ttaaatggtatcaatagtaatagcgcaactttaacagtgacagctgaagagttagccagc
attcaaatcacccctgcaataatcagcttagcgaaaggcattaataccgattatgtggct
atggggacttacaccgacaatagcaccttggatatcaccgcttcagtgtcttggaacagc
agtgataccaatgtcgccaccattttaaatggctcaactacgacgattaatatgggcatt
accaccataaatgccagcttaaatggcatcaatagtaatagcgcaactttaacagtgaca
gctgaagagttagtcagcattcaaatcacccctgcaacaatcagcttagcgaaaggcatt
aataccgattatgtggccataggaacctacactgataacacaacacaaaacatcactaat
tcggtagcgtggagcagtagtgataccaatgtcgctacaattttagatggctcagccacg
gcagtgaacgaaggtattgccagtataagtgccagattaaatagcatcagtagtaatagc
gcaagcttaacagtaacaactgaagagttggtcagtattcaaatcacacctgcaacaatc
agtttagcaaaagggattaataccgattatgttgctacggggacttacaccgacaatagc
accttagatatcaccgcttcagtgtcttggaacagcagtgatatcaatgtcgccaccatt
ctagatggctcagccacgacggttaatgtgggcatgactgatataagtgccagttcaaat
agcataaccagcagtttagcaagcttaacagtaaccccagctgagttaatcagtgtgcaa
ttatcgccaacctcagtaagtttagcgaaaggactgaatacctcttttgttgcaactgga
acttataccgataatagcacccagaacttaacctcttcagtgtcatggaacagcagcgat
acgagtgttgctaccattttgagcggttctgcggcaacattagctgaaggcaataccacc
ataagtgccagcttgagtggcttcagcattaatacagcaaatttattggtcactcctgca
gcgttacagagcatacagataacatcactcacgaatacattattagtaggtcgttcaact
atttataccgcggaagggacttatactgatggtactagtttagatatcaattcgacagtt
tcatggagcagtagtgatactagtttagtaacaattctatccggaactgccacagcggtt
tccagtggtttagctcaaataaccgcaagtcaaaatggtatatcttccaatgaaaactta
agcctagtcaatgaagtatctgtatgtggagcagatttagcagctgctgctggtgtctgc
ataaaaacactgattggattaactagtgatgctaaggataaagaatttaccaacacaccc
agccttgcggtactaaactccatgggctataccaaaatgtcaggagcctctaatacagga
acaacttatagcaggacatttgaaggaacgggtacttttgaccctgtaggcacctttatc
cttatgcaacaatttggcgactcaacttcgcaacacacccgatattgcaacgatttaaat
actgtatcatttaactcaaaaacaaattggcgccaagccacctctgatgagttacgagct
ttgtattttgattatccaaacagcacactttatacaactcatggttgggcgataaataaa
ggttattggagttctactccctataatatttcacagtttattctcgtggcaatgcatagc
ggcagtattttttcctctgatccggttggccatcgctcagtatcttgtgtttcagagtta
tga

DBGET integrated database retrieval system