Shewanella japonica: SJ2017_1281
Help
Entry
SJ2017_1281 CDS
T04959
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
sja
Shewanella japonica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sja00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
sja02044
]
SJ2017_1281
02035 Bacterial motility proteins [BR:
sja02035
]
SJ2017_1281
Secretion system [BR:
sja02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
SJ2017_1281
Bacterial motility proteins [BR:
sja02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
SJ2017_1281
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
T4P_PilY1
Catalase_C
DUF3678
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD21606
LinkDB
All DBs
Position
1510348..1513854
Genome browser
AA seq
1168 aa
AA seq
DB search
MFKKISTFTLSFMTIALAATSIADDTELYVAESSARSNDNPQVLLILDTSGSMGDNSFTA
PRFHDQGSIGGSTKLYFSNDGAVVPELSSNQYILNSINGCASSKTFLEEYGIYTGYFRQY
EGNVWSKFPLTDGSAVSTVDCYEDIYEQNTTNASGVSAGYPVDALASPYDSDIEKAKLTD
FGLGDPIHFYTQEYVTWYHNDSKPNGKANGSSYTRMDVAKRILEELIVSTPGIDFGLLIF
NKNDSTSKDGGRIISGIKEASVANKNSVITSIQDSDSIHGNYTPLCETLFEAYSYLYGKP
VKFGHKTSGSTSNPSYDTAIESNGNYISPFVNKDCQSNASIIYVTDGIPNLDVSADSAIA
LLPGVDLTLGEDINEWGTMKTNYLASLSNWMYNNDVNPNAPSDQVVSTYTIGFSSGADAA
EALLEKTAEKAGGEYYKANSAEALKASLLQAVTAIQGTDSSFTSPSVVLDKTQTGDDAYF
AMFLPDKGPRWSGNLKKFKVTADGTVVDKNGNDAFDSSGTIAAEACPYWTTDCTGDSYRG
YHVSDGGVAGVMKSTYSSSVSSRKVLINAGSSGDLVAFTPANAKLNSYLSTDADLADYMG
VDISGIDDNFDWAKGVNVDDEDHDDKADTAPLYLRQDIIGDPLHSRPLVINYGNSSEPDN
RILMGTNHGFLHMFKDDETADVPVSESWAFMPAELLKNIKGLRDNPQTGVHSIYGMDSSP
VAYIERDSSDKVSKAWLFIGMRRGGTSYYALDITNPDSPSLKWISQVSDFTLQGESWSEP
VITKVPGWPSGATTAADADPVLIIGAGYNPTTKDGSNVGSSDSIGTGVYIIDADNGTKVY
TFGLTGSDTVMPGLSDSIPNKVAILDSNNDQLTDRVYATDTGANVWRLDMPGLPNDTSNP
WSAFKFATLGGGTTTTDIRFYSEPVVAQTTFSNIAEHTHTDGSGTSTTTMTYQSIPYDAV
VIGSGHRPHPLDKARADKFFTLQDRNIVTKSYSSAASNTAPDLLELTDLYNVTTESPSSD
SELVTFGAKRGWYYNFSDAGEKSLSAATIVSGRVFFTSYVPETGASETACLVPGQGRLYG
FDLHKGARTYSHSEDYFVMGEQVPDTPTLVVPKNGDSDSYMYLIGIGDAANDMIKNDVLG
DDGCPEGDDKCIGGGLGVNRIYYHQNEN
NT seq
3507 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaagaagatatccacttttactttaagttttatgactattgctctagctgcgaca
agtatcgctgatgatactgagctatacgtagcagagtcttcagcaagaagtaacgataat
ccgcaagtattacttatattagatacatccggctcaatgggtgataattcttttactgct
cctagattccatgatcaagggagtattggaggcagtactaagttatatttttcgaatgat
ggtgccgttgttccagaactaagtagtaatcaatacatcttaaactcaattaatggctgt
gcgagttctaaaacgttccttgaagaatatggaatatatacgggttattttcgtcagtat
gaaggcaatgtttggagtaaatttccattaacagatggtagtgctgtatcgacagtagat
tgttatgaagatatatatgagcaaaatacaaccaatgctagtggtgtttctgctgggtat
cccgtcgacgcgcttgcctctccttatgattcagatattgaaaaagctaaactgactgat
tttggcttaggtgatccaatacatttttatactcaagaatacgtaacttggtaccataat
gatagcaagccaaatggcaaggcaaatggcagctcatatacacgtatggatgtggcaaaa
cgaatcttagaagagcttatagtcagtactccaggtatagactttggtttattaatattt
aacaaaaacgacagtacttctaaagatggcggtcgtattatttctggtattaaagaggca
tcggttgcaaacaaaaatagcgtaattacgtctattcaagattctgattctattcacggc
aactatacgcctttatgtgaaaccttatttgaagcttatagttacttatatggtaaacca
gtcaaatttggccataaaacatcaggctctacctctaatccttcctatgatacagctatc
gagtctaacgggaattatatttcgccatttgtgaataaagattgccagtctaatgcatca
attatttacgttaccgacggaattccaaatttagatgttagtgccgattctgctatcgcg
ttattaccaggtgtagatttgacattaggtgaagatattaacgagtggggtactatgaaa
accaattatttagcttcactatctaattggatgtacaacaacgatgtcaacccaaatgca
ccgtctgatcaagttgtatcgacttatacgattggctttagttctggtgctgatgccgct
gaagctttattagaaaaaacggccgaaaaagctggtggtgaatattataaagcaaactct
gctgaagcattgaaagcttcgcttttacaagctgtaacagcaattcaaggaacggattct
agttttacttctccttcagtagtgcttgataaaacccaaactggcgatgacgcatatttt
gcaatgtttttgcctgataaaggacctcgttggtcaggtaatttaaagaagtttaaagtg
actgctgatgggacggtagttgataaaaatggcaatgatgcatttgatagttcaggtact
atcgctgcagaagcttgtccgtattggacaactgattgtactggcgattcataccgtggc
tatcatgtttctgatggcggtgttgcaggggtcatgaagtcaacttatagctcgtctgtt
agctcaagaaaggtattgattaacgcaggtagcagcggtgacttagttgccttcacgccg
gcaaatgccaaattgaatagctatttatctacagatgctgatttagctgattacatggga
gtcgacattagcggaatcgatgacaattttgattgggcgaaaggcgtcaatgttgatgat
gaagatcatgatgataaagctgacacagcacctctctatttacgtcaagatatcatcggc
gacccgctgcactcaaggccgcttgttattaactatggcaactcttcagagccggataac
cgtattttaatgggaacaaaccatgggttccttcatatgttcaaggatgatgaaactgct
gatgtacccgtttctgaatcttgggcatttatgccagccgaattgcttaaaaatataaaa
ggtttacgtgataaccctcagacaggtgttcactctatatacggcatggatagttcgcca
gttgcttatattgagagggattcaagtgataaagtctcaaaagcatggttatttattggt
atgagacgaggtggaacttcatattatgctttagatattacaaatccagattcaccttca
ttgaagtggatttctcaagttagcgactttactttacaaggtgaatcgtggtcagagcct
gtaatcactaaggttcctggttggccttctggcgcaacaactgcagctgatgctgatcct
gtattgattatcggcgcaggttataaccctacgacaaaagatggctcaaatgttggaagt
tcagatagtattggcactggggtctatattatcgatgccgataatggaacaaaagtatac
actttcggactaactggcagtgatacggtaatgccagggctttcggacagtattccaaat
aaggtcgcaattcttgatagtaataatgatcagttaaccgatagagtttatgcgacagat
actggtgccaatgtatggcgtctagatatgccaggtttgccaaatgatacttcaaaccct
tggagtgctttcaaatttgcaactctcggtggtgggacaacaacaactgatattcgtttc
tactcagagcctgttgtggcacaaacgactttcagtaacattgcagaacatacgcatacg
gacggtagtggaacctcaacaactacaatgacttatcaaagtattccttatgatgctgtt
gtaataggaagcggacatagaccccaccctcttgataaggcaagagctgataagttcttt
acattgcaagatagaaatattgtcactaaatcttatagctctgcagccagtaatacagca
cctgaccttcttgaactaacagatctctataatgtgacaactgaatcaccttcttcagat
tctgagcttgtaacatttggtgccaagagaggctggtattataactttagtgatgcaggt
gagaaatcattatcagcggcaacaattgtatcaggaagagtcttttttacttcatatgtg
cctgaaactggagccagcgaaaccgcatgtttagtccctggtcaagggcgcttatatggg
ttcgatttacataaaggtgcgaggacgtatagccatagtgaagactattttgtaatgggt
gaacaagtacctgatacgccaacattagtagtaccaaaaaatggcgattcagacagctat
atgtatttgataggtattggtgatgctgctaatgatatgattaaaaacgatgttttaggc
gacgatggttgtcctgaaggcgatgataaatgtatcggtggtggcttaggtgtcaatcga
atttactaccatcagaacgagaattaa
DBGET
integrated database retrieval system