Shewanella japonica: SJ2017_1551 Help Entry SJ2017_1551       CDS       T04959                                  Name (GenBank) TonB-dependent receptor   KO K02014   iron complex outermembrane recepter protein Organism sja  Shewanella japonica Brite KEGG Orthology (KO) [BR:sja00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02000 Transporters [BR:sja02000]     SJ2017_1551 Transporters [BR:sja02000]  Other transporters   Pores ion channels [TC:1]    SJ2017_1551 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  TonB_dep_Rec_b-barrel Plug Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ARD21868 UniProt:  A0ABN4YCT6 LinkDB All DBs Position 1846442..1849291 Genome browser AA seq 949 aa AA seqDB search MHKNLLAKSVRLAMISGAAAAAFTTPVAFAAEEGEKVERIEVTGSRIKRVDMEGANPVQV ITREDLVESGISNIGDILQEIPAVAGAATNTAINNGGSGAVRVSLRGLGSARTLVLVNGR RMVNSGTGANASADLSTIPVAIIKRVEVLKDGASAVYGSDAIAGVVNIITRNDFEGFEAN VSYDGSTENWDGETKTVDFTVGVSSDKANAVVSAYYTEQTEQMSGDRDWSAFEYDLNPAT GELDKGGSSAPPWGRYNGVNNGIDDATCNSFTHGAANGPGQSDPSDFTNPTGYDCWDWDK DTYNYAPANYHLTPQERYGMYASAEYRFNDSVRFFSEVSFNRRTPKTKLAPLPLAPLAFF GWTDATYSADNYWNQQLGPKNDNGETVDIADWRRRMVETGGRDSTFEVDTVRGVFGIAGE FADTWGYEVSYVYGQNSSSTAGAGGVNFEKVSLAVGPSFMDANGDIVCGTADAPIADCVS LNTFGVPGTDTQVSQEMLDYITFEAHDLGSNEQTVLSASVFGDAFELPAGPVGMVFGAEH REEEGADLPDALIALGITSGSSRQKTQGSYEVDELYAEMNFPLLSGVVGAESLEIDGAIR YSDYSTFGDTTNYKLGLRWLPIDGLMFRGTVSTAFRAPSTSELFAGNSDNSPLVSDKCAT NPTSFCIADGVPAGGFEPIGDQLSSTLGGNEDLTPEEADTVTIGAVWSPSFVDNLSFTLD YWDIDLDNAISTIGEQLILDKCAEEGTYCDLITRYGPEFPGLYGNSSDIDNRNINVGGVH SSGYDFNAQYSIETGIGDLSFVLDTTYYDTYEITQADGSTIENAGWFRRTSGDGNFPEWK TNFNINLAQDNWSANWKIRYIGEALEPFDANNDGSTDLDDLSDSRTVDSQTVHDARFTYY FDNVSTTIGVSNVFDQDPPYAATGFNDNTDPRTYATTGRHLYLGVGVKF NT seq 2850 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgcataagaatttattagctaaatcagtgcgtctagcaatgattagcggtgcggctgcg gcggcattcaccactccagtagcatttgctgctgaagaaggtgaaaaagttgaacgcatc gaagttaccggttcacgaatcaaacgtgttgacatggaaggtgctaaccctgtccaagtt attacgcgtgaagatcttgttgaatcaggtatttctaacatcggtgatatcttacaagaa attcctgcagttgctggtgcagcaactaacactgctattaacaacggtggttctggtgca gtacgtgtttctttacgtggtttaggtagcgcaagaacattggtacttgttaacggccgt cgtatggttaactcaggtactggtgctaacgcatctgctgacttaagtactattccagtt gcaatcattaaacgtgttgaagtgttaaaagatggtgcttcagctgtttatggttctgat gcaattgctggtgttgtaaacatcatcactcgtaatgattttgaaggtttcgaagctaac gtttcttatgacggttctactgagaactgggatggcgaaactaaaactgtagatttcaca gttggtgtaagtagtgacaaagcaaatgcggtagtaagtgcatattacacagagcaaaca gagcaaatgtctggtgaccgtgattggtcagcttttgaatatgacttaaacccagccact ggcgagttagataaaggcggttcttctgcgccaccatggggtcgttataacggcgtaaat aatggcattgatgacgcaacttgtaattcatttactcatggtgcagctaatggcccaggt caatctgacccttctgatttcacaaaccctacaggatatgattgctgggattgggataaa gatacttataactatgcacctgcaaactatcacttaacgcctcaagagcgttacggtatg tatgcatctgctgaatatcgctttaatgattctgtgcgtttcttctcagaagtttcattt aaccgtcgtacacctaaaactaaacttgctccattaccattagcacctcttgcattcttc ggttggacagatgcaacttattctgctgacaactattggaaccaacagttaggtcctaag aatgacaatggcgagacagttgatattgcagattggcgtcgtcgtatggttgaaactggt ggacgtgattcaacattcgaagttgatactgtacgtggtgtatttggtatcgctggtgag tttgctgacacttggggttatgaagtgtcttacgtttacggtcaaaactcatctagcaca gccggtgcgggtggtgttaactttgaaaaagttagcttagctgtaggtccatcatttatg gatgcaaatggcgatattgtttgtggtactgccgatgctcctatcgctgattgtgtttct ttaaatacatttggtgttccaggtacagatactcaagtatctcaagaaatgcttgattat attacgttcgaagcacatgacttaggttctaatgaacaaacagtgttaagtgctagtgta tttggtgatgcattcgagcttcctgctggtccagtaggtatggtatttggtgctgagcac cgtgaagaagaaggcgcagatttaccagatgcattaattgcacttggtattactagtggt tcaagccgccaaaaaactcaaggtagctacgaagttgatgagctttatgcagaaatgaac ttcccattactatctggtgtagttggtgctgaaagcttagaaattgatggtgctatccgt tattctgattacagtacatttggtgacacaactaactataaacttggtcttcgttggctt ccaattgatggattaatgttccgtggtactgtttctacagcattccgtgcaccatctacg agtgaattgttcgctggtaactctgataacagtcctttagtttcagataagtgtgctaca aacccgacttctttctgtatcgctgatggcgttccagctggcggttttgagcctattggt gaccaactatcttcaactctaggtggtaatgaagatttaacacctgaagaggcagatact gtaactatcggtgctgtttggagcccaagttttgttgataatttatcatttacgcttgat tactgggatatcgatttagataacgcaatttctacaattggtgaacagttaattctagat aaatgtgctgaagaaggtacttattgtgacttaattactcgttatggacctgaattccca ggtttatatggtaactcaagtgatattgataatcgtaacattaacgtgggtggagtacat tcatcaggttatgatttcaatgctcaatacagtattgaaactggtatcggtgatctaagc ttcgttctagatactacatactatgacacatacgaaatcactcaagctgatggttcaacg attgaaaacgctggttggttccgtcgtacaagtggtgatggtaacttccctgagtggaaa actaacttcaacattaacttagcacaagataactggtcagctaactggaagatccgttac attggtgaagcattagagccatttgatgctaacaatgatggttctacagatcttgatgat ttaagtgattctcgtacagttgatagtcaaacggtacatgatgcacgctttacttattac tttgataacgtaagtactactattggagtcagcaacgtatttgaccaagacccaccatat gcggcgactggtttcaatgacaatactgacccacgtacatatgctacaactggtagacac ttgtacttaggtgttggcgttaagttctaa

DBGET integrated database retrieval system