Shewanella japonica: SJ2017_2374
Help
Entry
SJ2017_2374 CDS
T04959
Name
(GenBank) Endonuclease/exonuclease/phosphatase
KO
K07004
uncharacterized protein
Organism
sja
Shewanella japonica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sja00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09194 Poorly characterized
99997 Function unknown
SJ2017_2374
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
LTD
PKD
Exo_endo_phos
K319L-like_PKD
Bact_surface_Ig-like
He_PIG
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD22664
LinkDB
All DBs
Position
complement(2825584..2828502)
Genome browser
AA seq
972 aa
AA seq
DB search
MFLNAKPNNVKQYIKQYIKPSQVALSLGLLSCTAISSASFADDLIISEYIEGSSNNKAIE
LYNPTESDIDLTGYQLQFYFNGNTTSGTSIDLVGQVQAGATFVLADNDASSEILDKAQQT
STSSFFNGDDAIVLLNQSEIIDSLGQVGVDPGSQWGEGELSTKDNTLRRDHDGVVADVVV
DDEVTLANWFGFAQNDFSDLGSFNGSVTDPTDPTDPTDPTDPVELICGETATAIHAIQGA
TDISPLLGETVVVEAIVTADMQAGLKGFYLQMADAESDADPMTSEGIFVYTENASIAVNA
GDRVRLQAEVKEYNNLTELADVSAWTICQTQQNLPTPAMVTLPTLEGVGLEPYEGMRVSF
EQTLVVNSVSNLGKYGEAQLGSSRHFIGTQIMSPGADALALEASYQYDRVILDDGITASN
PDVVPYPAPQLSATNTLRAGDSVSSLTGVLHYGFNEYRVMPTEMVNVVSTNPRTVSPVRS
LAADVTIASYNVLNYFNGDGAGQGFPTSRGADSVSEFERQQAKIVSALLNIDADIVGLME
IENDGFGANSAISTLVAELNAAVGEAKYQFISATNSIIGTDQIAVGLLYQADKVSPVGEA
KILSSANSPLDESGAVFFDSSKNRPMLAQVFVDDASGEAFVVAVNHLKSKGGSCSSIGDP
DMNDAQGNCNVTRTRAAQGLAIWLAQEFTDNGEELKALVIGDLNAYAKEDPITALKQAGY
IELFEHTGQSNAYSYLYNGKAGQLDHALANSALIEHVLNVSEWHINADEPVVIDYNEENK
SQAQLSDYYQADAYRSSDHDPMIVELQFLPSNQAPIADFTWALQGGVVNVVSTSTDDNDE
QLTHEWSWGDGATSSGNVAGYEYSSNGTYTITLTVTDSQGLLSSKSQVVEVVDLIENIPP
VANIRHIDLWFVDLFISFSTDEDGYITSQQWLFNDGHMVNRRLVLRRAGTANSVQLTVTD
NQGATDSQSTAF
NT seq
2919 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttaaatgctaaaccaaataacgttaagcaatacattaagcagtacattaagcca
agccaagtcgcattatcgctggggctattatcttgtacggcgatatcttcagcatccttt
gcagatgatcttattatttctgaatatattgaaggtagcagtaacaataaagcaattgag
ctttataacccgacagaaagcgacattgatttaacgggttatcagttacagttttacttt
aatggaaatacaaccagtggcacaagtatcgacttagtcggccaagtgcaagctggggcg
acgtttgttcttgctgataatgatgctagcagcgaaatactagacaaggcacagcaaacg
tcaacgagtagttttttcaatggcgatgatgccattgttttacttaatcaatcagagatt
attgactcgcttggtcaagttggggttgatcccggttcgcaatggggagaaggtgagtta
tcaactaaagacaatacgttaagacgtgatcatgatggcgtagtggctgatgttgttgta
gacgacgaggtgacgttagccaattggttcggttttgctcaaaatgacttttcagattta
gggagctttaatggctcagttacagacccaacagacccaacagacccaacagacccaact
gatcccgtggagttaatttgcggcgagacagcaacagctattcatgcgattcaaggtgca
accgatattagcccactactgggtgagactgtcgttgttgaggcaattgttacggctgat
atgcaagctggtttaaaaggcttttacttacaaatggcagatgctgaatctgatgccgat
ccgatgacgtcagaaggcatatttgtttataccgaaaatgcatcgattgcggtgaatgca
ggtgaccgtgtccgccttcaggcagaagtgaaagagtataataacctaactgagctcgcg
gatgtctcagcatggacaatttgtcaaacccaacaaaatttaccgacgccagcaatggtg
acattacccacattagaaggtgtgggactggaaccgtacgaaggtatgcgagtgagtttt
gagcagaccttagtggttaattcagtcagtaatttaggtaaatatggtgaagctcaatta
ggtagcagcaggcattttattgggacacaaataatgagtcctggcgctgatgcgcttgca
ctagaagctagctaccaatatgaccgggtgatacttgacgatggaataacggcttcaaac
cctgatgttgtcccttatcctgcaccgcaattatccgcaacaaatacactgcgtgcaggt
gattctgtatcgagcttaacgggtgtacttcattatggttttaatgaataccgagtgatg
ccgaccgaaatggtcaatgtcgtgtcgaccaaccctcgtacagtatcgcctgtgcgctct
ttggcggctgatgtcacgatagccagttataacgtattgaattattttaacggtgatggc
gcaggccaaggatttccaaccagccgtggcgctgatagcgtcagtgagtttgagcgtcag
caagctaaaattgtcagtgcgttattaaatattgatgcagatattgttggcttaatggaa
attgaaaatgatggctttggcgcaaactcagctatctctaccttagtcgctgagcttaat
gctgcagtgggggaagcaaaatatcaattcattagcgcaactaactctattattggtact
gatcaaattgcagtagggctgttgtatcaagcggataaggtaagccctgttggtgaggcg
aaaatcctttcaagtgctaattctccattagatgaaagtggcgctgtattttttgatagt
agcaaaaaccgcccaatgttagcgcaagtatttgttgatgatgcatctggcgaagcgttt
gtggttgcggtgaatcatttaaaatctaaagggggcagctgcagtagtattggcgatcca
gatatgaatgacgctcaaggcaattgcaatgtaactcgtactcgtgccgctcaaggttta
gctatttggttagcacaagagtttacggacaatggtgaagagttaaaggcattagtgata
ggcgatttaaatgcttacgctaaagaagatcctattacggcattgaagcaagctggttat
attgagttgtttgaacacactggccaatcaaacgcttattcgtatctatataatggtaaa
gcagggcaattagatcatgcattagcaaatagtgcattgattgaacatgtactaaatgtg
tcagagtggcatataaatgccgatgaaccagttgtgattgattacaatgaagagaacaaa
tcacaagcgcaactaagtgattattatcaagctgatgcatatcgctcttcggatcatgat
cctatgattgttgagttacagtttttacccagcaatcaagcgccaatagctgattttact
tgggctctgcaaggtggtgttgtcaatgttgtttctacatcaactgacgataatgatgag
caactaacgcatgaatggtcatggggggatggagcgacatcttcaggtaatgtggctggt
tatgagtacagcagtaatggcacgtataccatcacgttgacagtgacagattctcaaggg
ttacttagcagcaaaagccaagttgtcgaggtggtagatcttatcgagaatattccacca
gttgcgaatattcgtcatatcgacctttggttcgttgatctgttcatttcatttagtacc
gacgaggatggctatatcacatctcagcagtggctatttaatgatggccatatggttaat
cgtcgcttggttttaaggcgtgcaggaacagcgaatagtgtgcagctaacggtaactgat
aaccaaggtgctactgacagtcaatcaactgctttttag
DBGET
integrated database retrieval system