Shewanella japonica: SJ2017_3374
Help
Entry
SJ2017_3374 CDS
T04959
Name
(GenBank) MATE family efflux transporter
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
sja
Shewanella japonica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sja00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sja02000
]
SJ2017_3374
Transporters [BR:
sja02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and toxin extrusion (MATE) family
SJ2017_3374
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARD23625
UniProt:
A0ABM6JNF0
LinkDB
All DBs
Position
complement(3998239..3999582)
Genome browser
AA seq
447 aa
AA seq
DB search
MHVKNTAPLSLFSLTWPLFFDFALHFLTAALNTLMISRVSYQGVAALSVGNMVFELSITL
FSFVSIGASVVITQYLGAKNRATASDVVYSSIGFNLMVGVAAALGVFFGAGLILHLMNLP
VELIPDAKLYLQIVGICLIPEAMAMCLAAGMRAHGFTQQAMWVTLLMNVITFAGNLLLLY
GWFGIPQMGVAGVAISTVVGRLIGMTLMAYLFVKYTHIPIKLSEIIKPKKHLLAKVFHIG
LPAAGENVSWMLQFMVVTAFVGLMGDKALAAQSLYFQICMFILLFGLSIGIGNEIMIGHM
IGAKQFKSAETQMYRALKIGLILTTIVAALAAIFGEKLVAFFTQDEDILLMVGQLFLLTL
LMEPGRTFNLVVINALRASGDARFPFFAGMISMWCIAVPLAYLFGIHWDMGLVGVWCALA
IDEWTRGLTMLWRWRSGRWRTKSLILA
NT seq
1344 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcacgtaaaaaacactgctcccttatcgcttttctcactgacttggccactctttttt
gattttgcgctgcactttttaacagccgcattaaatacactaatgattagccgagtatct
taccagggtgttgctgcactatcggtcggtaacatggtatttgagctttcaattacgcta
tttagtttcgtcagtatcggcgcgagtgtggtgataacgcaatatttgggcgccaagaat
agagccactgcgagtgacgtggtttactcttctattggttttaacctcatggttggcgtg
gctgcggctttgggtgtgttttttggggcaggtttgattttgcacctaatgaatttaccc
gtagagctaattcctgatgcaaagctataccttcaaattgttggtatctgtttaattcct
gaagcaatggcaatgtgtttagctgcagggatgcgtgcccatggatttacccaacaagcg
atgtgggtgactttactcatgaatgtcatcacattcgcaggtaatttgttgttactttat
ggttggttcggaatcccgcaaatgggggtggcaggtgttgccattagtacggttgttggg
cgcttaatcgggatgacattaatggcatacttgtttgttaagtacacccatattccaatt
aagttgtctgaaatcattaaaccgaaaaagcacttacttgctaaggttttccatatcggt
ttaccggctgctggcgagaacgtttcttggatgttgcagtttatggttgtgactgcattc
gttggcttaatgggtgataaagcgcttgctgcccaatccttatattttcaaatctgtatg
ttcatattattgttcggtttatccatagggattggtaacgaaattatgattggtcacatg
attggtgccaaacaatttaaatcagcagaaacacagatgtatcgtgcattaaaaattggc
ttaattttaacgacgattgtagcagctttagcggcgatatttggcgaaaagttagtggcc
ttttttactcaagatgaagatatcttgttgatggtaggccagttattcttattaacttta
ctgatggaacccggtagaacatttaatcttgttgtgattaatgcgctacgtgcaagtggt
gacgctcggttcccattttttgctggcatgatttctatgtggtgtattgctgtgccgtta
gcttatctattcggtattcattgggatatggggttagtaggggtttggtgtgcgttagcg
attgatgaatggactcgaggtttaacaatgttatggcgttggcgaagtgggcgttggcgg
acaaagagtctaattcttgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
