Spiroplasma kunkelii: SKUN_001026
Help
Entry
SKUN_001026 CDS
T04056
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha (PolC)
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
skn
Spiroplasma kunkelii
Pathway
skn03030
DNA replication
skn03430
Mismatch repair
skn03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
skn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
SKUN_001026 (polC)
03430 Mismatch repair
SKUN_001026 (polC)
03440 Homologous recombination
SKUN_001026 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
skn03032
]
SKUN_001026 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
SKUN_001026 (polC)
Enzymes [BR:
skn01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
SKUN_001026 (polC)
DNA replication proteins [BR:
skn03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
SKUN_001026 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
SKUN_001026 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
DNA_pol3_a_NII
RNase_H_2
DNA_pol3_a_NI
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALA97912
UniProt:
A0A0K2JHL4
LinkDB
All DBs
Position
complement(862837..867198)
Genome browser
AA seq
1453 aa
AA seq
DB search
MMDQQLIKLFTANNLEFIGNYFDDAKVIKAEYSISEGFFRVVIEINDFLPLEVLLKLEQT
LLENETLPTKISLRVRKEQYELETIFSYLEYIRLNKSELKNSFFSKLSPERFALTDNILK
ITVHSESEQKLVGEHCNYYQKKLRRYGFSDLQLALVIHLRENNILEINEQELMKYQEIVQ
KTEQLISKPTNVTNPVRRELNSYQRAKNGKASYERLIDIDQDAPNVTIYGKILSKKRQLI
STKKFIYVITITDYSDTIGAKFFTRTEQPDDFIEELKTNEWVSLFGDIRYDTYANEQMFF
IKKIYRLESEDLYREDNAPEKRVELHLHTKMSVMDGVTDLTMLFKTLAHWNHKAIAFTDH
LNVQAYPEIYNLNKKYPDVKVIYGVEADVLNDKVWYVKNPHHHNLWTAKYVIFDLETTGL
SSRYDEIIEFGAVIMDGISGERQTINHLFKPSVKLSSFTTELTGITDELLADKPTFIEWI
DQILEYFKDAILIAHNAEFDLGFIQSWLKKAGRSEINNTVIDTLQLSRILEPHLKNYRLG
TIACCYNVIYNEEVAHRGDYDAIVLTDIYEHQLRKMINTYNIEFDDDIEKIHDPAVYKKL
RPKHMTILAKNQVGLLELFKLITAAHTKYFYLSPKLLRSVIEQHRSNLLIGSSCVNGDVF
EVAQNKDASELAETIKFYDYVEIQPPNVYKHLVQMGNLSEERLLTVIKDIIFTAKKLNKL
VVATGDVHYLNPEDKIFREVYINAKGIGGRLHPLYDYKQRVTDNPDQFLRTTMEMMNEFK
FLNNDELIYEIVVTNPNLISDQIEKVEIIKDKLYTPKIEGSDQLLKELCYKNAYKIYGKS
LPEIVASRLERELNAIIKHGFAVIYWIAHKLVDKSLQDGYLVGSRGSVGSSFVATMSNIT
EVNPLQPHYLCSYCSYSEFIVDGSVKCGYDLPVRTCPKCQKLLKGEGHDIPFETFLGFEA
DKVPDIDLNFSGEYQPIAHDFTKEMFGERSVYRAGTISTVAEKTAYGYVKGYFESKNILH
LKRRAELERIAKGCEGVKRTTGQHPGGIVVIPNEYEVEAFTPVNFPADDIKSNWLTTHFD
FHAIHDNVLKLDILGHVDPTALRMLQDLTGVDPKTIPTNDEAVLSLFRSLDVLNIKSEDI
NDEKTGAIGIPEFGTFFVRKMLLDTKPTSFADLVQISGLSHGTDVWIGNAQELIRNQNIS
ISEVIGCRDDIMVNLIYKRLPAQSAFKIMEDVRKGKGLTTEHEQLMRDNNVEQWYIDSCN
KIKYMFPKAHATAYVLMAWRVAWYKINYPVEYYATFFSTRTDVFDIKTILKGAETIKQVL
HDIQTRLDNKDFNAPNKPTQKEKDLIPVYEVALEMYARGIKMSNIDLKTSRNKNFTVITN
ENNEKIILPPFSAIDGLGGAVGDSIINARHEKPFLSIVDLQKRTNITKAHLESFEELGIL
KDLSLDDQIAFEF
NT seq
4362 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatggaccaacaattgataaaactatttacagcaaataatttagaatttattggaaat
tattttgatgatgctaaagtcattaaagcagaatatagtattagtgaaggcttttttcgt
gttgtgattgaaattaatgattttttaccactagaagttttactaaaattagaacaaact
ttattagaaaatgaaacattacccacaaagatttctttacgggttcgcaaagaacaatac
gaattagaaactatttttagttatttagaatatattcgattaaataaatcggaattaaaa
aatagtttttttagtaaattatccccagaacgttttgctttaactgataatattttaaaa
attactgttcattcggaaagtgaacaaaaattagtgggtgaacattgtaattattatcaa
aaaaaacttcgccgctatggttttagtgatttacaattagccctagtaattcatttacga
gaaaataatattttagaaattaatgaacaagaattaatgaaatatcaagaaatagtgcaa
aaaacagaacagttaatttctaaaccaaccaatgtgactaatccagttcgaagagaatta
aatagttatcagagagcaaaaaatggaaaagcaagttatgaacggttaattgatattgat
caagatgctccgaatgtgacaatttatggaaaaattttaagtaaaaaacgacagttaatt
tcaacaaagaaatttatttatgtaataacaattactgattatagtgatacaattggcgca
aaattttttactcgaacagaacaaccagatgattttattgaagaattaaaaacgaatgaa
tgagttagtctttttggcgatattcggtatgatacttatgctaatgaacaaatgtttttt
attaaaaaaatttatcgtttagagagtgaagatttatatcgtgaagataatgcgcctgaa
aaacgcgtggagttacatctccatactaaaatgagtgttatggatggagtaacagatctt
acaatgctttttaaaacattagcacattggaaccataaagcaattgcttttactgaccat
ttaaatgttcaagcttatccagaaatttataatcttaataagaaatatcctgatgttaaa
gttatttatggtgttgaagcagatgttttaaatgataaagtctgatatgttaaaaacccg
catcatcataatttatgaactgcaaaatatgttattttcgacttagaaacaactggctta
agtagtagatatgatgaaatcattgaatttggtgcggttattatggatggtattagtggt
gaacgtcaaacaattaatcatttgtttaaaccatccgttaagttatcatcatttacaact
gaattaacaggaattacagatgaattattagcggataaaccaacttttattgaatgaatt
gaccaaattttagaatattttaaggatgcaattttaattgcacataatgctgagtttgac
cttggttttattcaatcgtgattaaaaaaagctggacgctcagaaattaataacacagta
attgatactttacaattatcacggattttagaaccacatttgaaaaattatcggttggga
acaattgcttgttgttataatgttatttataatgaagaagttgctcaccgtggcgattat
gatgcaattgttttaacagacatctatgagcatcagctacggaaaatgattaatacttat
aatattgagtttgatgatgatattgagaaaattcatgaccctgctgtttataaaaaactg
cgaccaaaacatatgacaattttagcaaaaaatcaggtaggtttattagaattatttaaa
ctaataactgctgcgcatactaaatatttttacttatcaccaaaattattacgaagtgta
attgaacaacatcgtagtaatttattgattgggtcatcatgtgttaatggtgatgttttt
gaagtggcacaaaataaagatgcatcggaattagcagaaacaattaagttttatgattat
gttgaaattcaacctcctaatgtatataaacatttagttcaaatggggaatttatcagaa
gaacgattattaacagtcattaaagatattatttttacagcaaaaaaattaaataaatta
gttgttgctactggtgatgtgcactatcttaacccagaagataaaattttccgtgaagtt
tatattaatgcaaaaggaattggtggccgtctccatcctttatatgattataagcaacga
gtaactgataatcctgatcagtttttaagaacaacaatggaaatgatgaatgaatttaag
tttttaaataatgatgaattaatttatgaaattgtagtaacaaatccaaatttaatttct
gaccaaattgaaaaagttgaaattattaaagataaattatatacacctaaaattgagggt
agtgatcaattattaaaagaattatgttataaaaatgcttataaaatttatggtaagtca
ttaccagaaattgttgcatcacgcttagaacgtgaattaaatgctattattaagcatggt
tttgctgttatttactgaattgcacataaattagttgataaatcattgcaagatggctat
ttagtcgggtcgcggggaagtgttggtagtagttttgttgcaacaatgagtaatattact
gaagtaaatccattacaaccacattatttatgttcttattgtagttatagtgaatttatt
gttgatggttcagttaagtgtggatatgatttaccagttcgtacttgtccaaagtgtcaa
aaactattaaaaggggaaggacatgatattccctttgaaacatttttagggtttgaagca
gataaagttccggatattgatttaaacttttcaggagaatatcagccaattgcacatgac
tttactaaagaaatgtttggagaacgtagtgtttatcgtgccggaacaatttcaacggtg
gcagaaaaaactgcatatggttatgtgaaaggttattttgaaagtaaaaatattttacat
ttaaaacgtcgcgcagaattagaacgaattgccaagggttgtgagggagttaaacgaaca
actggacaacatccaggtggaattgttgttattccaaatgaatatgaagttgaggcattt
acaccagttaattttcctgctgatgatatcaaatcaaattgattaacaactcattttgat
ttccacgcaattcatgataatgttttaaagttagatattttaggtcatgttgacccaact
gctttgcgaatgctgcaagatttaacgggagtggatccaaaaacaattccaacaaatgat
gaagcggttttaagtctttttcgaagtttagatgttttaaacattaaatcagaagatatt
aatgatgaaaaaactggtgcaattggtatccctgaatttggtactttttttgttcgtaag
atgttattagatacaaaaccaacttcatttgcagatttagtccaaatttcaggattgtca
cacggaacagatgtttgaattggcaatgcccaagaattaattcgaaatcaaaatattagt
atttcagaagtaattggatgtcgtgatgatattatggttaatttaatttataaaaggtta
cctgctcaaagtgcttttaagattatggaagatgttcgaaagggaaaggggttaacaact
gaacatgaacaattaatgcgggataataatgttgaacaatgatatattgattcgtgtaat
aaaattaagtatatgttcccaaaagcccatgcaacagcctatgtcttaatggcgtgacga
gtagcatgatataaaattaattatccagttgaatattatgcaacatttttttcaactcga
acagatgtttttgatattaaaacaattttaaaaggagcagaaacaatcaaacaagtttta
cacgatattcaaactcgtttggataataaagattttaatgctcccaataaaccaacacaa
aaagaaaaagatttaattcccgtttatgaagtagcattagaaatgtatgccagaggaatt
aaaatgagcaatattgatttaaaaacaagtcgaaataaaaattttaccgttattacaaat
gaaaataatgaaaaaattattttaccgccattttctgcaattgatggtttgggcggagct
gttggcgatagtattattaatgctcgccatgaaaaaccatttttatcaattgttgattta
caaaaacgaacaaatattacaaaagctcatttagaatcatttgaagaacttggaatttta
aaagatttatcattagatgatcaaattgcttttgagttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
