Spiroplasma kunkelii: SKUN_001146
Help
Entry
SKUN_001146 CDS
T04056
Symbol
recD
Name
(GenBank) putative exodeoxyribonuclease V alpha subunit
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
skn
Spiroplasma kunkelii
Pathway
skn03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
skn00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
SKUN_001146 (recD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
SKUN_001146 (recD)
Enzymes [BR:
skn01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
SKUN_001146 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
skn03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
SKUN_001146 (recD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
SH3_13
UvrD_C_2
Viral_helicase1
OB_YrrC
AAA_11
HHH_RecD2
UvrD-helicase
SLFN-g3_helicase
AAA_12
AAA_22
Helicase_RecD
nSTAND3
PhoH
AAA_29
RsgA_GTPase
PIF1
AAA_5
AAA
AAA_28
DEAD
Mg_chelatase
NPHP3_N
T2SSE
AAA_16
Cac1_C
SMC_N
Phage_T4_Ndd
NACHT
ABC_tran
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALA98032
UniProt:
A0A0K2JHX7
LinkDB
All DBs
Position
970125..972287
Genome browser
AA seq
720 aa
AA seq
DB search
MAEKIRGYLKLIVFESNNGYRICKFQLENDKTHFIFIKGFLSTLQPEQLYELQGDFVYNE
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NGDVGIIVDIKKDKNLNDVILVKYDNVIPYSKELYYDITLAYACSVHKLQGSEYDNIIFV
ITKSFWMMLKRNLIYTAITRAKTKLYLIGEPSAFLYGVNNLPQKRRTTLQEKIKTFLKEQ
NT seq
2163 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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taa
DBGET
integrated database retrieval system
